斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP，少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物，确认实际基因组序列与理论匹配情况，如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入，需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件，以备后用，如不能正常扩增需要重新设计，并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录，完成后需测定浓度（不得低于400 ng/μl） 和OD......阅读全文
Cell：新研究开启自闭症基因治疗时代
自闭症（别称“雨人”）是受基因和环境因素影响，由大脑神经系统失调导致的发育障碍，其病征表现为社交能力、沟通能力、兴趣和行为模式出现异常。从第一例自闭症患者——美国男孩唐纳德于1943年被确诊开始，人们就开始了针对自闭症的研究。然而，不管治疗方式怎样“更新换代”，自闭症的病因却一直是科学界无法达成
生物显微镜的保养是怎么做的
生物显微镜 的安放应选择干燥清洁的房间，以避免光学部件发霉、金属部分生锈以及粘满灰尘。显微镜使用完毕后，即放回箱（柜）内，或用玻璃罩、塑料套罩住，并放入干操剂。 不要自行拆卸生物显微镜各部件;镜筒要插上接目镜或益上镣苗盖，避免灰尘从镜筒上部进入;透镜表面不要用手指碰触或拭擦，如有灰尘，先用
用CRISPR构建诱导性基因敲除人类干细胞系
来自威斯康星大学的研究人员报告称，他们开发出了一种新策略来快速构建诱导性基因敲除（iKO）人类多能干细胞（hPSC）系。相关研究论文发布在7月2日的《细胞干细胞》（Cell stem cell）杂志上 威斯康星大学的张素春（Su-Chun Zhang）教授及助理研究员Yuejun Chen是这
邻苯二甲酸二丁酯对水生生物产生遗传毒性
近日，山东农业大学资源与环境学院教授王军团队在《危害性材料学报》（Journal of Hazardous Materials）连续发表“姊妹篇”研究论文，揭秘邻苯二甲酸二丁酯（DBP）对斑马鱼肝脏和脑组织生态毒理效应新机制，使得评价其对水生生物毒理作用有了新的理论支撑。邻苯二甲酸二丁酯是工业生产中
基因敲除（KO）在验证抗体特异性的应用
抗体作为基础科学研究和临床试验常用的工具之一，主要通过抗原-抗体的反应揭示蛋白质在生命活动中的变化。尽管它们被广泛的使用，但是没有相关标准以确保商业抗体特异性和质量上的一致性。这使得科学界一直存在“重现危机”，浪费了科学家们大量的时间和金钱，妨碍生命科学研究的快速发展。因此，对抗体进行敏感性和特异性
药物作用靶点筛选与基因敲除技术的关系
2018年一对双胞胎婴儿的CCR5基因敲除的事件在社会上引起了轩然大波，抛开这次事件而言，作为一项生物研究技术，基因敲除在药物研发领域应用也很广泛，今天我们来看一下它在药物作用靶点筛选上的作用吧！ 通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索，每年都会有作用于新靶
药物作用靶点筛选与基因敲除技术的关系
2018年一对双胞胎婴儿的CCR5基因敲除的事件在社会上引起了轩然大波，抛开这次事件而言，作为一项生物研究技术，基因敲除在药物研发领域应用也很广泛，今天我们来看一下它在药物作用靶点筛选上的作用吧！ 通过药物作用的靶点来设计开发创新药物是目前创新药制剂开发的一条重要线索，每年都会有作用于新靶
港企：革命性生物测毒技术获日内瓦发明展大奖
4月15日-19日，第43届日内瓦国际发明展在日内瓦Palexpo展览馆举行。4月17日，组委会公布了各项大奖的得主，其中香港水中银(国际)生物科技有限公司的生物测毒技术从来自48个国家和地区的千余件新发明中脱颖而出，获本届日内瓦发明展大奖。 48至72小时测逾千种毒 该项技术利用转基因工程
两篇Cell文章发现精子的作用远不止DNA遗传
一般认为胚胎早期发育过程中，精子仅仅提供DNA遗传信息，其它方面主要由卵细胞决定，然而最新一期(5月10日)Cell杂志上接连公布了两项研究成果，指出精子的表观遗传学信息也会影响子代胚胎发育，这颠覆了传统上认为早期胚胎发育主要是由卵子决定的观念，也对于发育生物学和癌症生物学具有重要的意义。
两华华裔学者获美国医学研究成就奖
以表彰他们在医学研究领域取得的创新成就 据美国华裔教授专家网10月1日报道，美国国家卫生研究院日前宣布了16位“先锋奖”得主和31位“创新者奖”得主，以表彰他们在医学研究领域取得的创新成就，两位华裔学者榜上有名。 报道说，美国斯坦福大学的华裔学者陈詹士(音译)荣获了“先锋奖”，并得到250万美元
模式动物研究进展
在生命科学与人类健康领域中，实验动物在生命活动中的生理和病理过程,与人类有很多相似之处, 建立人类重大疾病的动物模型，对分析疾病的发病机制，解答特定人群对某种疾病的易感性，及新药研发等过程发挥着至关重要的作用。然而，由于各种模式动物在基因水平以及体内微生物组成等方面都与人类有着相当大的差别，而疾
近期最热门的基因组测序成果
大千世界无奇不有，这都是进化的功劳。大航海时代，科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今，科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，华大基因参与的两项测序研究格外引人瞩目。 种属：长颈鹿和okapi 基因组
2016热门基因组测序，华大基因风头劲
大千世界无奇不有，这都是进化的功劳。大航海时代，科学家们扬帆远航去探索大自然的神奇造化。如今，科学家们正在测序技术的帮助下进一步揭示生命的奥秘。The scientist杂志对近期最热门的一些基因组测序成果进行了盘点，华大基因参与的两项测序研究格外引人瞩目。 种属：大西洋鲑 基因组：2.97
孕期补“酸”已成为共识，上海海洋大学团队发声：需谨慎
叶酸是B族维生素的一种，孕期补充叶酸已成为共识。那么，叶酸是不是补充得越多越好？近日，上海海洋大学水产与生命学院副教授祖尧团队研究发现，其答案是否定的。通过斑马鱼研究，作者发现叶酸摄入不足或过量补充均可能导致胚胎心脏发育异常。它首次阐明了叶酸对早期心脏发育的作用机制，为叶酸的合理补充的剂量提供了科学
Nature：CRISPR技术开拓新的疆域
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR-Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大的基因组
水生所构建出能标示肝脏全程发育的转基因鱼
脊椎动物的器官形成是一个复杂而又难以看到的发育过程。然而，依赖于转基因技术发展起来的细胞命运追踪和组织特异呈像就像黑暗中的灯光，可以照亮器官发生难以观察到的细节。就肝脏器官发育研究来说，本世纪以来虽已获得过几个标示肝脏发育的转基因斑马鱼品系，但迄今还没有报道过能标示肝脏全程发生特别是前期发育的转
北京大学Cell－Res基因编辑研究新成果
来自北京大学的研究人员报告称，他们利用一种RNA导向的Cas9核酸酶在哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎中有效实现了位点特异性基因编辑。相关论文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”发表在3月26日的《细胞
中国台湾研究人员发现：调控特定基因－改写再生记忆
台湾研究人员陈振辉及其研究团队日前公布的最新研究成果发现，经由调控特定基因的活性，可以改写动物的“再生记忆”。 该项研究发现，当“再生记忆”受到影响后，斑马鱼再生的新尾鳍可以出现不同的大小和形状。这是科学家首次证实“再生记忆”可以被改写。此研究已于11月27日刊登于国际期刊《当代生物学》。
研究人员发现动物“再生记忆”可被改写
台湾研究人员陈振辉及其研究团队日前公布的最新研究成果发现，经由调控特定基因的活性，可以改写动物的“再生记忆”。 该项研究发现，当“再生记忆”受到影响后，斑马鱼再生的新尾鳍可以出现不同的大小和形状。这是科学家首次证实“再生记忆”可以被改写。此研究已于11月27日刊登于国际期刊《当代生物学》。
科学家利用天然基因“敲除”人类探索未知基因功能
人类有大约20000个基因，但实际上大多数基因的功能还未得到了解。了解基因功能的一种方式就是找到缺失特定基因的人，观察一下他们是否存在健康问题。但在大众群体中这样的人很罕见。最近一项新研究指出发现基因功能的一种更加有效的方法：在近亲结婚情况比较常见的人群中进行DNA筛查。 这项研究的基因组数据
Science揭示惊人的癌症起源
波士顿儿童医院的研究人员第一次在活体动物中，显影了癌症起源于第一个受累细胞的过程并观察了它的扩散。他们的研究工作有可能会改变科学家们认识黑色素瘤及其他癌症的方式，促使开发出一些新的早期治疗方法阻止癌症扎根。相关论文发表在1月29日的《科学》（Science）杂志上。 论文的第一作者、波士顿儿童
日发现促使肿瘤生长新基因－有助于癌症新药物开发
肿瘤为了获得营养，会不断产生新血管，作为补充营养的通道。日本研究人员日前宣布，他们发现了一个能促使肿瘤产生新血管的基因。这一成果将有助今后开发出新的癌症治疗药物。 研究人员曾发现血管内皮生长因子基因与肿瘤新生血管有关，且已开发出数种阻碍这种基因发挥作用的药物，不过有时患者会产生抗药性，有时还会
糖尿病研究重大进展－肠道细菌蛋白BefA促进β细胞增殖
在一项新的研究中，来自美国俄勒冈大学的研究人员说，一种新发现的在斑马鱼肠道中产生的细菌蛋白在幼体发育早期诱导胰腺中产生胰岛素的β细胞发生增殖。相关研究结果发表于2016年12月13日在线发表在eLife期刊上，论文标题为“A conserved bacterial protein induces
德国科学家解开动物肢体再生之谜
德国康斯坦茨大学的科学家11月24日宣布，他们经过30年的研究，成功解开动物肢体再生之谜。 康斯坦茨大学贝格曼研究小组通过对斑马鱼的研究，证明视黄酸是再生过程中必不可缺的物质。斑马鱼是肢体再生能力最强的动物之一，它的鳍、鳞和部分心脏都可以再生。 贝格曼称这项成果是“一个巨大的成功”。
遗传学新动向：人类基因敲除研究
数十年来，生物学家们一直在小鼠或其他动物模型中，通过失活目的基因来进行功能研究。现在这种基因敲除(knockout)研究有了更理想的模型，那就是人类。 当然，这并不是说像处理小鼠那样，对人类进行遗传学改造。事实上，研究者们是通过分析成百上千的人类基因组，在其中寻找失活某个基因的天然突变。他们希
CRRSPR/Cas9基因敲除系统之sgRNA设计
sgRNA设计网站介绍sgRNA的在线设计网站有：1、http://crispr.mit.edu/ ；2、http://www.e-crisp.org/E-CRISP/；等网站。这些网站虽然一定程度上满足了部分研究 者的需要，但仍然存在很多不足和缺陷。例如：1、数据分析周期长；2、无具体的脱靶数据；
一步生成条件性基因敲除小鼠ESC
最近发展的基因组编辑工具，包括转录激活因子样效应物核酸酶（TALENs）和CRISPR/Cas9，使我们能够通过诱导双链断裂（DSBs）的非同源末端连接（NHEJ）修复，快速而有效的敲除靶向基因。然而，这种方法不能进行必需基因的功能研究，这类研究通常采用的策略是基于Cre-LoxP系统的条件性基
基因编辑成进化发育生物学领域“杀手级”技术
提塔利克鱼模型与化石，该过渡期化石有助于解释鱼类如何开始长出四肢。图片来源：Field Museum Library/Getty Images从1893年至今，几乎在每年的夏季，年轻的发育和进化生物学者都会涌向美国马萨诸塞州伍兹霍尔，钻研业内的技术。在该校全球有名的海洋生物学实验室中，参与其年度胚胎
最新基因组测序成果盘点
近来，各大杂志上陆续发表了不少重要的基因组测序成果。the scientist杂志对此进行了盘点，以飨读者。 种属：野鸭，绿头鸭(Anas platyrhynchos) 基因组：约13 billion bp 鸭子是几乎所有甲型流感病毒的天然宿主(包括H5N1)。日前，研究人员测
Cancer－Cell揭示肝癌的强力推手
罹患晚期肝细胞癌(肝癌)的病人有很高的死亡率，现有的药物证实只有很小的显著生存优势。通过结合斑马鱼肝癌模型和来自人类肿瘤的数据，西奈山Icahn医学院的研究人员希望能够鉴别出一些能够被肝癌新疗法靶向的潜在目的基因。 利用转基因斑马鱼作为一种新兴的、强有力的、全新动物模型来发现癌症基因，结合