斑马鱼基因敲除是怎么做的
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息，包括名称ID号等，一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑，设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR，分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP，少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物，确认实际基因组序列与理论匹配情况，如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入，需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件，以备后用，如不能正常扩增需要重新设计，并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录，完成后需测定浓度（不得低于400 ng/μl） 和OD......阅读全文
RNAi的应用(研究基因功能、信号传导通路和基因治疗)
研究基因功能的新工具已有研究表明RNAi能够在哺乳动物中灭活或降低特异性基因的表达，制作多种表型，而且抑制基因表达的时间可以随意控制在发育的任何阶段，产生类似基因敲除的效应。线虫和果蝇的全部基因组序列已测试完毕，发现大量未知功能的新基因，RNAi将大大促进对这些新基因功能的研究。与传统的基因敲除技术
我国科学家发现遗传性眼病“夜盲症”新致病基因
浙江温州医科大学科研团队通过对248例散发或隐性遗传视网膜色素变性患者的DNA样本进行基因测序，首次发现了引起常染色体隐性视网膜色素变性的高发致病基因——SLC7A14。 视网膜色素变性俗称“夜盲症”、“鸡盲眼”，是眼科中最常见的遗传性眼病，是导致成年人中途失明的主要原因。在我国预计有多达
Science：震撼视频！哈佛科学家揭示“胚胎发育”最详细过程
一个受精卵究竟是如何产生构成完整身体的多种细胞类型、组织和器官的？这是生物学领域最大的谜题之一。如今，结合单细胞测序技术和新型计算工具，来自哈佛大学、Broad研究所等机构的科学家们提供了关于这一过程最详细的图片。4月26日，Science杂志用3篇论文报道了这一突破性成果。为了追踪数千个细胞及其后
胚胎发育之谜？刘江揭开面纱
DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰。以高等动物为例，个体从受精卵发育成成体的过程中，DNA甲基化图谱都是动态变化的，会调控不同的细胞往不同的方向分化。因此，建立DNA甲基化图谱对理解生殖细胞形成和胚胎发育至关重要。刘江（中）团队合影 在基金委“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划中，
LSFIS助力苏州医工所在斑马鱼高通量三维成像研究获进展
斑马鱼胚胎具有通体透明特点，适于光学显微镜下的活体观测。光片显微技术（Light-sheet microscopy）是一种新型的三维成像方式，具有光毒性小、扫描速度快等特点。针对斑马鱼、线虫等毫米级模式生物，光片成像需复杂的样品准备流程，且由于视场限制，获得全胚胎的三维数据往往需要多区域成像与拼接，
基因组所最新成果揭示精子对遗传使命的新贡献
20世纪生命科学的快速发展证实了遗传的物质载体是DNA，DNA序列可以稳定地从父母遗传到子代中去，从而使物种得以延续。但如果仅仅只是DNA序列的遗传，难以解释为什么一个受精卵细胞可以发育成一个包含多种不同细胞、组织和器官的复杂生命个体。 最近20年的研究发现，表观遗传信息通过有序地开启和关
动物所揭示贵德沙蜥体色变异的进化驱动力与分子基础
动物体色的本地适应在物种形成和适应性进化过程中至关重要，但缺乏关于其本地适应的近因（生理生化）和远因（进化）的研究。中国科学院动物研究所杜卫国团队和刘峰团队联合攻关，以青藏高原分布的贵德沙蜥物种为研究系统，整合室内外生态实验、基因组测序和遗传验证等手段，揭示了贵德沙蜥体色本地适应的驱动力以及生理
动物所揭示贵德沙蜥体色变异的进化驱动力与分子基础
动物体色的本地适应在物种形成和适应性进化过程中至关重要，但缺乏关于其本地适应的近因（生理生化）和远因（进化）的研究。中国科学院动物研究所杜卫国团队和刘峰团队联合攻关，以青藏高原分布的贵德沙蜥物种为研究系统，整合室内外生态实验、基因组测序和遗传验证等手段，揭示了贵德沙蜥体色本地适应的驱动力以及生理
新的动物模型－改善癌症和其他潜在疾病的个性化治疗
麻省总医院（MGH）的研究人员开发了一种新的动物模型，该模型有望降低成本，更易于使用，并改善癌症和其他潜在疾病的个性化治疗。他们发表在Cell杂志的论文中，描述了在单细胞分辨率水平使用他们的免疫缺陷斑马鱼模型，在活动物体内观察药物反应。他们还发现了一种治疗横纹肌肉瘤的新方法，横纹肌肉瘤是一种主要
GDNF的生物学效应GDNF的基因敲除动物模型
gdnf-、gfmα1-或vet-knockout小鼠表现出相同的表型，即肾脏发育不全和胃肠道神经支配缺失，出生后不久全部死亡。gdnf-knockout大鼠中脑DA能神经元无明显改变，可能有其他NT代偿GDNF的作用。腰部脊髓运动神经元仅减少21%，颈上交感神经节中减少23%的神经元，睫状节神经元
“基因突变”让“老药新用”，降胆固醇药可预防传染病
影响胆固醇水平的基因变异会增加病人患伤寒的风险 杜克大学的科学家发现，影响胆固醇水平的基因变异可能会增加病人患伤寒的风险。同时，他们还发现了一种常用的降胆固醇药物Zetia可以保护斑马鱼（乃至人类）免受沙门氏菌（Salmonella typhi）伤寒，这是令人讨厌的感染背后的罪魁祸首。 8月
Nature：新研究定量确定发育中的胚胎内的细胞基因活性变化的细节
在一项新的研究中，来自美国华盛顿大学的研究人员开发出一种技术，可以定量确定斑马鱼胚胎中发生的基因活性变化，这些变化是对关键基因的特定编辑做出的反应。这种方法可以定量确定数千个胚胎中数百万个细胞在发育过程中的基因活性和遗传变异的影响。相关研究结果于2023年11月15日在线发表在Nature期刊上
色素细胞的人工应用介绍
色素细胞被用来进行许多基础研究，以对这些细胞有更深入的了解。例如斑马鱼的幼体，能够用来研究成体斑马鱼精确的产生横向条纹时，色素细胞之间的安排和连结，所以斑马鱼是适合用来了解演化发育生物学领域中，动物花纹生成的动物模型。色素细胞也能够当作研究人类疾病与症状的模型，如黑色素细胞瘤与白化症。此外最近的研究
光谱仪是怎么做金属元素检测的
光谱仪又称分光仪，广泛为人知的为直读光谱仪。以光电倍增管等光探测器测量谱线不同波长位置强度的装置。它由一个入射狭缝，一个色散系统，一个成像系统和一个或多个出射狭缝组成。以色散元件将辐射源的电磁辐射分离出所需要的波长或波长区域，并在选定的波长上（或扫描某一波段）进行强度测定。分为单色仪和多色仪两种。利
光谱仪是怎么做金属元素检测的
直读光谱仪金属元素分析是现代检测材料质量的一种更加科学的手段。在大家日常的锻造中，其中常用的金属元素有80余种，组合而成的合金高达上千种，而金属成品制造企业采购合金生产多是根据市场需求制定的，如此不同的合金内部的元素也不同，对应的光谱仪检测范围也需要更广泛才能贴合检测需求。那在采购金属检测光谱仪时该
谁是血红素“物流”中的搬运工？
科研团队合影。（浙大供图） 血液因为红细胞中存在血红素而显示为红色。可别以为血红素只是个“染色剂”，它实则是一种必要的生命因子。 10月19日，浙江大学生命科学学院教授陈才勇团队在《自然》发表研究论文，揭示细胞内血红素转运的重要机制。该研究发现一个血红素分子伴侣家族，其成员HRG-9、
水生所在污染物通研究中取得进展
肠道微生物在维持宿主健康方面发挥重要作用，紧密调控着宿主生物一系列生理代谢活动，如能量代谢、免疫功能、神经行为等。然而，环境持久性有机污染物会显著干扰肠道微生物群落，进而影响宿主生理健康。然而，目前污染物如何影响肠道微生物和宿主健康缺乏机理研究。 近日，中国科学院水生生物研究所研究员陈联国团队
手指由鱼鳍进化而来？科学家发现它们有共同基因
8月17日消息，当我们的祖先从海洋爬到向陆地上的时候，他们无疑完成了地球历史上最伟大的壮举之一。现在，这一伟大进化的详细过程正变得越来越清晰。最新研究发现，上亿年前的鱼类身上长有的鱼鳍中，存在一块小小的骨头，而这块小骨头与我们当今人类以及四足动物的手指和脚趾的生长方式有着密切的联系。 科学家们
日本研究发现柠檬可预防脂肪肝
日本研究人员日前宣布，柠檬内含有的成分能够预防脂肪肝。由于脂肪肝会导致肝硬化和肝癌，持续摄取柠檬将有助于预防上述疾病。 意大利和希腊等地中海沿岸的居民，代谢综合征和心血管疾病发病率较低，其饮食中的橄榄油、红酒等被认为发挥了重要作用。不过日本三重大学等机构的研究人员注意到，地中海地区的柠檬消
新技术能同时“敲除”动物体内不同基因
据《自然》杂志20日报道，瑞士苏黎世联邦理工学院领导的研究团队开发出一种方法，可极大简化和加快对基因功能的研究：使用CRISPR-Cas技术，可同时在单个动物的不同细胞内敲除不同的基因，每个细胞被改变的基因不超过一个，从而能平行观察不同基因变化导致的细胞走向。 追踪疾病遗传原因的一种行之有效的
湖北农科院用CRISPR制备基因敲除克隆猪
来自湖北省农科院畜牧兽医研究所、河南科技大学和中科院水生生物研究所的研究人员，用CRISPR/Cas9系统和Cre/LoxP，敲除了猪初生细胞中肌生成抑制蛋白（MSTN）的一个等位基因，制备了无选择标记的MSTN基因敲除克隆猪。相关研究结果发表在8月17日的《Scientific Reports
中国科学家实现灵长类动物基因定向敲除
这是两只运用CRISPRA/Cas9技术成功实现基因靶向修饰的食蟹猴(1月10日摄)。 记者从云南省科技厅获悉，经过近一年的努力，中国科学家在云南昆明成功培育了多只被去除特定基因的猴子，实现了基因靶向修饰技术在灵长类动物身上的应用，并于近期在国际权威学术刊物发表了相关成果，将为人类遗传疾病
Nature方法：大型单基因敲除人类单倍体细胞库
由奥地利科学院和维也纳Haplogen的研究人员领导的一个研究小组，利用一种称之为“基因捕获”( gene trap)的技术构建出了一个人类单倍体细胞库，该细胞库中包括有3000多种细胞系，每个细胞系都具有一种不同的突变基因。这项研究工作发布在8月25日的《自然方法》(Nature Me
华人科学家首次培育出基因敲除大鼠
可能在不久的未来，大鼠将会代替小鼠，重新成为实验室里的头号“动物明星”。最近，国际顶级学术期刊《自然》发表了华人科学家的最新成果——首次培育出了基因敲除的大鼠。这一突破解开了20多年来“无法用基因敲除的方法来构建大鼠疾病动物模型”的难题，使得这种“与人类更接近”的动物能更好地为人类疾病
新一批敲除小鼠序列数据存入基因银行
美国得克萨斯州基因组医学研究所将其敲除小鼠库的超过275000个核苷酸序列信息存入了美国国立卫生研究院的基因银行。 以休斯敦为根据地的得克萨斯州基因组医学研究所于今年5月加入国际敲除小鼠协会。在美国国立卫生研究院号召在国际科学界广泛分享小鼠研究信息后，该研究所表示愿意向美国健康研究院提供基因序列
旅美华裔学者直接参与“基因敲除小鼠”试验
70岁的意大利裔美国人卡佩基等美英三位学者本月8号获得今年的诺贝尔生理学或医学奖。旅美华裔学者邓初夏当年曾是卡佩基科研团队的成员。日前他在接受本台驻美国记者采访时，谈到了自己参与“基因敲除小鼠”试验的感受。 1986年，邓初夏考入犹他大学研究生院，师从卡佩基，成为从事“基因敲除”试验的第一个研究
设计cas9条件性基因敲除小鼠
其关键是构建带有两个Loxp位点的小鼠，即flox(flanked by loxP)小鼠。今天我们就来详细介绍一下如何设计。共分三步：第一步，选择外显子。第二步，设计sgRNA。第三步，设计SSODN。听起来蛮简单的哈？下面我们详细讲讲。第一步，选择外显子。1. 尽量选择敲除所有转录本共用的外显子。
人类心肌细胞制成“人造鱼”－可自主游泳超百天
美国哈佛大学与埃默里大学研究人员合作，利用人类干细胞来源的心肌细胞制造出一种完全自主的“人造鱼”。这种生物混合装置同时包含生物和人工部分，能通过心肌收缩，在水中游泳超过100天。这一成果有助于开发由活肌肉细胞制成的人造心脏，并为研究心律失常等心脏病提供平台。相关论文10日发表在《科学》杂志上。
脊椎动物恐怖反应选择机理揭开
日本理化学研究所10月11日宣布，他们的一个联合研究小组利用斑马鱼研究发现，脊椎动物共有的称为“缰核”的大脑部位，能够基于过去的恐怖经验对行动选择作出指令。该研究成果发表在10月10日的美国科学杂志《自然·神经科学》网络版。 当捕食者或危险突然降临的时候，立刻逃跑或是站立不
“超级再生”动物激发人类医疗灵感
在受伤后，一些涡虫几乎可以再生体内的所有细胞，墨西哥钝口螈可以重建整个四肢和部分大脑，斑马鱼可以修复断裂的脊髓，绿安乐蜥则能重新长出尾巴。鱼类、两栖动物、爬行动物和蠕虫展现的再生能力令研究人员着迷已久，而大多数哺乳动物却不具备这种能力。如今，由于基因组学、蛋白质组学和单细胞成像技术的进步，科学家能够