首个核内DNA感受器hnRNPA2B1
一、基因敲除的设计方案 1.1 基因的基本信息 确认斑马鱼基因的基本信息,包括名称ID号等,一般会在NCBI等查询。 1.2 分析基因结构、氨基酸序列等做生物学信息的分析 1.3分析蛋白质的保守结构功能域 通过综合考虑,设计最佳的KO靶点。 1.4 分析并设计CRISPR,分析其效率及脱靶的情况 一般使用CCTOP,少数物种如没有可找其它专业网站。 二、CRISPR活性验证 2.1 分析并确认基因组序列 设计Genotyping引物,确认实际基因组序列与理论匹配情况,如CRISPR靶点验证与理论序列存在出入,需回到1.4重做。 该步骤还需要确认引物扩增条件,以备后用,如不能正常扩增需要重新设计,并且不能进行下一步操作。 2.2 合成sgRNA 使用Thermo转录试剂盒转录,完成后需测定浓度(不得低于400 ng/μl) 和OD......阅读全文
DNA结合染料对细胞核的多色标记技术的多种应用
DNA结合染料对细胞核的多色标记技术 细胞核是动物细胞器中最大的。在哺乳动物细胞中,核的平均直径约为6μm,约占总细胞体积的10%。核包含细胞的大部分遗传物质,组织成多个长线性DNA分子,与多种蛋白质(例如组蛋白)复合形成染色体。这些染色体内的基因是细胞的核基因组。核的功能是维持这些基因的完整性,并
DNA信息存储编解码新方案解决脑部核磁海量数据存储难题
记者9月29日从天津大学获悉,该校合成生物学研究团队与天津市环湖医院合作提出了一种创新的DNA信息存储编解码方案——“DNA Palette”。通过体外存储实验,该方案成功将患者疾病全周期的脑部核磁共振影像数据编码至DNA,并无损解码,实现影像数据的三维重建和病理诊断,为医疗数据存储技术提供了新解决
Science:结构上揭示核小体依赖性的cGAS抑制机制
在一项新的研究中,来自美国北卡罗来纳大学教堂山分校的研究人员首次确定了先天免疫系统中一种名为cGAS的关键DNA感应蛋白与核小体结合在一起时的高分辨率结构,其中核小体是细胞核内最重要的DNA包装单位。相关研究结果于2020年9月10日在线发表在Science期刊上,论文标题为“Structura
我国首个自主研发CART疗法有望在三年内获批
2017年是CAR-T细胞疗法元年。Kymriah和Yescarta两个细胞治疗药物的相继获批,令CAR-T这一原本仅能在实验室和论文里实现的疗法一下子进入到产业化的阶段,给全球成千上万癌症病人带来了希望。图片来源于网络 随着基础研究技术的逐渐成熟,全球细胞治疗产业已进入了一个快速蓬勃发展的新
北大游富平等揭示识别病毒RNA模式识别受体的新机制
病原体模式识别受体(PRR)是识别外来危险信号的感受器,并且传递信号给细胞内的效应分子,从而调动细胞进行免疫应答。所有已知的病毒RNA PRR都具有核外定位。然而,对于许多病毒,在感染过程中通过复制在细胞核中产生双链RNA(dsRNA)。dsRNA是一种重要的PAMP,病毒感染宿主细胞产生的ds
研究揭示了肠内伤害感受器介导宿主防御机制
近日,美国哈佛医学院等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Gut-Innervating Nociceptor Neurons Regulate Peyer’s Patch Microfold Cells and SFB Levels to Mediate Salmonella Host
中国学者用人工光感受器助失明小鼠复明
中国研究人员6日在英国《自然·通讯》杂志上发表报告说,他们通过在失明小鼠眼底植入一种新研发的人工光感受器,让它们的视觉得以恢复。如果这种技术发展成熟,未来或许能帮助因黄斑变性等疾病而视力下降或失明的患者重见光明。图片来源于网络 在健康人眼部,视网膜中的感光细胞,即光感受器可把光转变成大脑可识别
Nat-Methods多巴胺感受器揭示神经元释放的化学信号
近日,加州大学戴维斯分校健康分校的团队开发了一种名为“dLight1”的基于荧光蛋白的生物传感器。这一种高特异性传感器可检测多巴胺,即神经元释放的一种可向其他神经细胞发送信号的化学分子。与先进的显微镜结合使用时,dLight1可提供高分辨率,实时成像的活体动物多巴胺时空释放特征。 在9月7日发
一例化学感受器瘤颈椎转移病例分析
化学感受器瘤是指颈动脉化学感受器及其同类组织细胞发生的肿瘤。1950年由Mulhgan首次命名报道,又称为颈动脉体瘤或副神经节瘤。这是一种罕见的肿瘤,仅占全部嗜铬细胞瘤10%~15%。化学感受器瘤大多为非功能性,以良性居多,仅有5%~10%为恶性,可经淋巴或血行转移至中纵隔及后纵隔的脊柱旁沟,后者相
美研究揭示肠内伤害感受器介导宿主防御机制
近日,美国哈佛医学院等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Gut-Innervating Nociceptor Neurons Regulate Peyer’s Patch Microfold Cells and SFB Levels to Mediate Salmonella Host
疱疹病毒基因组装稳定释放“压力感应和调控”分子机制
人巨细胞病毒(human cytomegalovirus, HCMV)属于疱疹病毒科β亚家族,是一种在人类中广泛传播的双链DNA包膜病毒。HCMV感染会给免疫能力低下的人群(如器官移植患者或艾滋病人)带来致命危害,此外,还会引发胎儿死亡和新生儿出身缺陷等后果。HCMV具有典型的疱疹病毒三层架构:
农科院植保所郭立华团队发现首个真菌多组分DNA病毒
真菌病毒是一类以真菌为宿主的病毒。4月3日,《科学—进展》在线发表了首个三组分环状单链DNA病毒FgGMTV1,这种病毒的寄主是小麦赤霉病的主要病原真菌禾谷镰刀菌。发现者中国农业科学院植物保护研究所(以下简称植保所)研究员郭立华团队,利用克隆载体成功构建了该病毒的侵染性克隆。FgGMTV1的分子
新生儿缺陷DNA比对能预防-山西将建我首个数据库
我国首个出生缺陷基因芯片检测数据库年底将在山西建成。届时,在婚前、孕前或孕早期,人们可以通过采样(血或羊水)提取DNA进行比对,防止新生儿缺陷。 据悉,一次取样可实现对300多种出生缺陷遗传疾病的检测,基本覆盖山西和我国所有的出生缺陷种类。 今后,数据库会逐步纳入其他省份出生缺陷人口
Nature:北大绘就首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
近日,北京大学交叉研究取得重要研究成果:绘就出世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。此项研究工作为人们提供了一个全面的人类早期胚胎DNA甲基化调控网络的研究框架,对于人类认识自身早期胚胎发育过程中表观遗传调控机制、辅助生殖技术的安全性评估与改善,以及临床上疑难病例的诊治均具有非常重要的意义
目的基因在真核系统的表达及细胞内的定位实验—荧光法
实验方法原理绿色荧光蛋白(Green fluorecent protein,GFP)最早是在海洋生物水母(Aequorea victoria)中发现的。GFP 蛋白的多肽链中含有特殊的生色团结构,可在紫外光源下发出稳定的绿色荧光,而且这种荧光发射无需外加辅助因子或进行任何特殊处理。GFP 标记分子最
简洁快照式单光路内窥系统可检测胃肠道癌症细胞核
西安交通大学第二附属医院消化内科秦斌医生团队与西安交通大学物理学院空间光学研究所穆廷魁教授团队开发出一种快照式偏振散射光谱术(PLSS),这种非侵入式的光学诊断工具能够获取常规白光内窥镜无法提供的上皮细胞核的尺寸形态信息。近日该研究成果发表在Laser & Photonics Reviews上。在前
简洁快照式单光路内窥系统可检测胃肠道癌症细胞核
西安交通大学第二附属医院消化内科秦斌医生团队与西安交通大学物理学院空间光学研究所穆廷魁教授团队开发出一种快照式偏振散射光谱术(PLSS),这种非侵入式的光学诊断工具能够获取常规白光内窥镜无法提供的上皮细胞核的尺寸形态信息。近日该研究成果发表在Laser & Photonics Reviews上。在前
核工展上聚焦“核”热点“核雾染”可信吗?
“核雾染”的说法是否可信?在内陆建核电厂会不会影响环境与公众健康?福岛核事故对核电发展有什么启示……正在此间举行的第十三届中国国际核工业展览会上,与“核”有关的热点话题引起了人们的关注。 “核雾染”可信吗? 近期,有文章称华北雾霾与内蒙古伴有铀类放射性元素的煤炭利用有关,认为雾霾是因
Nature子刊:胞外体如何分拣miRNA
在细胞间的通讯过程中,装载小分子的胞外体非常重要。日前,科学家们首次描述了胞外体分选和装载miRNA的机制,文章于十二月二十日发表在Nature Communications杂志上。这一机制的阐明,将有助于人们运送miRNA药物,对相关疾病进行治疗。 绝大多数细胞都会释放胞外体到细胞外
PCR扩增在扩增DNA产物末端引入限制性核酸内切酶酶切位点
实验方法原理 实验材料 噬菌体 T4 DNA 连接酶 限制性内切核酸酶 靶 DNA
机能学实验限制性核酸内切酶消化DNA中离心的作用
这里的离心作用主要是将管壁上的液体离下来,在吸取时也能尽量完全吸取,也可以不离心进行后续实验。孵育30min是酶切的条件,在此条件下才能将环状质粒切开为线性质粒
细胞内共价闭合环状DNA(cccDNA)的抽提与纯化的介绍
最常用的抽提细胞内共价闭合环状DNA(cccDNA)的方法是蛋白质-去污剂沉淀法,其原理是基于rcDNA和共价闭合环状DNA(cccDNA)与蛋白质结合能力的差异。rcDNA能与蛋白质共价结合,与绝大多数细胞染色体DNA一起形成沉淀,而共价闭合环状DNA(cccDNA)不能与蛋白质结合故游离于上
质粒DNA的限制性内切酶(restriction-endonuclease,-RE)酶切及..
实验原理: 限制性内切酶(restriction endonuclease, RE)能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。限制性内切酶可分为三类:I、Ⅱ和III类。I类和III类酶在同一蛋白质分子中兼有修饰(甲基
PCR扩增在扩增DNA产物末端引入限制性核酸内切酶酶切位点
实验方法原理实验材料噬菌体 T4 DNA 连接酶限制性内切核酸酶靶 DNA试剂、试剂盒氯仿EDTA乙醇酚氯仿乙酸钠TE仪器、耗材琼脂糖凝胶水浴箱实验步骤一、材料1. 缓冲液与溶液氯仿EDTA ( 0.5 mol/L, pH 8.0)乙醇酚:氯仿(1:1,V/V)乙酸钠(3 mol/L, pH 5.2
用于基因组文库中的真核DNA的部分酶切(预反应)实验
不管高分子质量 DNA 的碱基组成与序列如何,通过水压机械剪切(hydrodynamic shearing) 均可将其以半随机形式片段化。但是,用这种方法制备的 DNA 需进行一系列酶反应操作(末端修复、甲基化、接头连接、接头消化)以保护内部限制位点,以及产生一些黏性末端。本实验来源「分子克隆实验指
用于基因组文库中的真核DNA的部分酶切(预反应)实验
实验方法原理 不管高分子质量 DNA 的碱基组成与序列如何,通过水压机械剪切(hydrodynamic shearing) 均可将其以半随机形式片段化。但是,用这种方法制备的 DNA 需进行一系列酶反应操作(末端修复、甲基化、接头连接、接头消化)以保护内部限制位点,以及产生一些黏性末端。
用于基因组文库中的真核DNA的部分酶切(预反应)实验
实验方法原理 不管高分子质量 DNA 的碱基组成与序列如何,通过水压机械剪切(hydrodynamic shearing) 均可将其以半随机形式片段化。但是,用这种方法制备的 DNA 需进行一系列酶反应操作(末端修复、甲基化、接头连接
DNA模板原位光还原Ag/Au核壳纳米粒子的光谱学研究
随着纳米材料的发展,具有较好等离子体共振的金银复合金属材料,逐渐成为人们研究的重点。贵金属复合材料在表面增强拉曼光谱的测量领域,具有较强的"热点效应",成为一种较好的SERS基底材料。金和银本身就是很好的等离子体共振效果,适合作为表面增强拉曼光谱增强的基底材料,但是金银核壳式结构具有更好的增强效
昨日明星LncRNA搭上m6A后逆袭为今天新星
m6A RNA甲基化是当前在LncRNA,环状RNA等非编码RNA之后最为火热的科研明星,到底有多火?摆出数据告诉你! 2019年才过去一半还不到,已发表文章数就已占去年的7成。RNA甲基化领域,不仅文章数量多,高分文章也有许多。据统计,仅2019年上半年就发表了多篇Nature,Cell
全DNA纳米机器人可探索细胞过程
用DNA建造一个微型机器人,并用它来研究肉眼看不见的细胞过程——这不是科幻小说,而是法国国家健康与医学研究院(Inserm)、国家科学研究中心和蒙彼利埃大学的科学家们认真研究的主题。这种高度创新的“纳米机器人”能够更密切地研究在微观水平上施加的机械力,这对许多生物和病理过程至关重要,代表了一项