miRNA和siRNA简介及区别
1998年，Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术：通过dsRNA诱导特异基因的沉默，即所谓RNAi。2000年，Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs，mall temporal RNAs)。RNA干涉（RNAi）在实验室中是一种强大的实验工具，利用具有同源性的双链RNA（dsRNA）诱导序列特异的目标基因的沉寂，迅速阻断基因活性。SiRNA 在RNA沉寂通道中起中心作用，是对特定信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素。siRNA是RNAi途径中的中间产物，是RNAi发挥效应所必需的因子。SiRNA的形成主要由Dicer和Rde-1调控完成。由于RNA 病毒入侵、转座子转录、基因组中反向重复序列转录等原因,细胞中出现了dsRNA，Rde-1(RNAi缺陷基因-1)编码的蛋白质识别外源dsRNA，当dsRNA达到一定量的时候，Rde-1引导......阅读全文
siRNA的转染方法
将制备好的siRNA，siRNA表达载体或表达框架转导至真核细胞中的方法主要有以下几种：1.磷酸钙共沉淀将氯化钙，RNA(或DNA)和磷酸缓冲液混合，沉淀形成包含DNA且极小的不溶的磷酸钙颗粒。磷酸钙-DNA复合物粘附到细胞膜并通过胞饮进入目的细胞的细胞质。沉淀物的大小和质量对于磷酸钙转染的成功至关
siRNA个人经验小结
在活体RNAi关键点：类似药物属性的引入，如稳定性、细胞内的传送、组织的生物可溶性进入合成的siRNA。授予siRNA类似药物的属性化学稳定性的胆固醇共聚的siRNA 显著的改善了其在体内和体外的药物属性。化学稳定性增强的方法：对正义和反义链进行部分的phosporothioate backbone
siRNA的制备方法
化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了，比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于：已经找到最有效的siRNA的情况
siRNA的设计方法
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响，至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置，但这个过程十分耗时且昂贵，不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3-4对siRNAs，实验选择较有效的siRNA。方法一、根据T
简述siRNA表达载体
多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶Ⅲ启动子（pol Ⅲ）中的一种，操纵一段小的发夹RNA（short hairpin RNA，shRNA）在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol Ⅲ启动子是由于它可以在哺乳动物细胞
siRNA－Oligo设计原则
1． 希望软件可以在 web 上使用。 即用户可以访问我们的网站， 输入基因代码， 即可自行在网上设计 siRNA Oligo 。2． 可参照的软件形式： 见如下网站：www.dharmacon.comwww.ambion.comwww.qiagen.com3． 希望能就每一个所指定的基因找到至少四
siRNA实验成功要点
1. 对每个基因设计并检测两到四个siRNA序列 为了找到潜在靶位点，扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析，去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能，siRNA应根据mRNA低二级结构的区域设
siRNA用户手册
The siRNA user guide (revised May 6, 2004) Selection of siRNA duplexes from the target mRNA sequenceUsing Drosophila melanogaster lysates (Tuschl et
siRNA的转染方法
将制备好的siRNA，siRNA表达载体或表达框架转导至真核细胞 中的方法主要有以下几种：1.磷酸钙共沉淀将氯化钙，RNA(或DNA )和磷酸缓冲液混合，沉淀形成包含DNA 且极小的不溶的磷酸钙颗粒。磷酸钙-DNA 复合物粘附到细胞 膜并通过胞饮进入目的细胞 的细胞 质。沉淀物的大小和质量对
siRNA的设计方法
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响，至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置，但这个过程十分耗时且昂贵，不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3-4对siRNAs，实验选择较有效的 siRNA。方法一、
siRNA－的设计方法
关于设计siRNA以及siRNA设计对siRNA功能的影响，至今还没有可靠的规律。虽然我们可以通过对mRNA实验分析准确的找到一段基因的全部siRNA最佳作用位置，但这个过程十分耗时且昂贵，不推荐常规实验使用。一种做法是每个目标序列设计3－4对siRNAs，实验选择较有效的siRNA。 目前
TCT、LCT及LPT的区别和原理
薄层细胞学检测系统(Thinprep Cytologic Test，TCT)：1996年获美国FDA批准用于临床。TCT检查是采用液基薄层细胞检测系统检测宫颈细胞并进行TBS细胞学分类诊断，它是目前国际上最先进的一种宫颈癌细胞学检查技术，与传统的宫颈刮片巴氏涂片检查相比明显提高了标本的满
生物制药技术大跃进：RNABase时代悄悄到来
以RNA为基础（RNA-Base）的生物制药是一类相对较新的技术，包括以RNA为基础开发新疗法和疫苗，该技术主要针对一些慢性疾病和罕见疾病的治疗和预防，如癌症、糖尿病、肺结核以及某些心血管疾病等。据市场研究分析，DNA与RNA疗法预计以12%的年复合增长率增长，预计到2020年市场规模达12亿美
从小鼠和人中克隆miRNA实验方法
Supplementary information to miRNAs cloned from mouse and humanAn online clearinghouse for miRNA gene name assignments (http://www.sanger.ac.uk/Softwa
人造病毒改进基因疗法有望定向输送siRNA和药物
病毒擅长于从感染的细胞中获取遗传物质进行自复制。这一特征被用于开发基因治疗手段，这些基因被引入到患者的细胞内进行遗传疾病或是遗传缺陷的治疗。韩国的研究者制备了一种人造病毒。该研究发表在化学研究杂志上，研究者可以使用人造病毒向癌症细胞内输送治疗性的基因和药物。 天然的病毒在基因治疗中具有极其高效的将
科研中的“新星”技术——MicroRNA荧光定量PCR
Micro RNA简介微小RNA(microRNA，简称miRNA)是生物体内源长度约为20－23个核苷酸的非编码单链小分子RNA，通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控，导致mRNA的降解或翻译抑制。是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶
张辰宇教授权威期刊连发miRNA及RNAi研究新成果
南京大学的张辰宇（Chen-Yu Zhang）主要从事microRNA、线粒体功能和人体及细胞能量代谢研究。近年来因发布了多项有关miRNA的惊人研究成果而广受关注。迄今已在包括Cell, Nature, Science及其子刊（~22篇）在内的国际学术期刊上发表论文约150余篇。 本月，张辰
油菜油份积累及胚胎发育相关小分子RNA研究方面有进展
越来越多的证据表明，miRNA与siRNA这些小分子RNA在植物的生长发育和种子形成等过程中起着重要的调控作用。但目前在油料作物油菜中关于小分子RNA的研究还很少，尤其关于miRNA与siRNA在油菜胚胎发育过程和种子油份积累中表达与功能的研究更少。 中国科学院遗传与发育生物学研
基因干扰技术的作用机制介绍
病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内，并利用宿主细胞进行转录时，常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应，其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA（大约21～23 bp），即siRNA。siRNA在细胞内R
RNA干扰的作用机制
病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内，并利用宿主细胞进行转录时，常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应，其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA（大约21～23 bp），即siRNA。siRNA在细胞内R
关于RNA干扰的作用机制介绍
病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内，并利用宿主细胞进行转录时，常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应，其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA（大约21～23 bp），即siRNA。siRNA在细胞
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法（二）
2.3 倍增阶段 siRNA在RNA依赖性RNA聚合酶(RdRP)的作用下，以mRNA为模板，siRNA为引物，扩增产生足够数量的dsRNA作为底物提供给Dicer酶，产生更多的siRNA， 可再次形成RISC，并继续降解mRNA，从而产生级联放大效应。并作用于靶mRNA。如此反复
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法（一）
RNA干扰(RNA interference，RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA， dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达，用特异性的抗体几乎检测不到靶向基因所表达的蛋白质。因此，RNAi技术又
开发肽siRNA偶联物，向肝外组织定向递送siRNA疗法!
此次合作，将超越肝脏范畴，为多种肝外疾病开启siRNA治疗机会。 行业领先的RNAi治疗公司Alnylam与行业领先的肽基药物发现公司PeptiDream近日宣布了一项许可及合作协议，发现和开发肽-siRNA偶联药物，创造多种机会，为肝外组织递送RNAi疗法。通过这一合作，2家公司将合作选择和
小RNA如何帮助我们理解生命和治疗疾病？
·几名专家表示“有些吃惊”，但也表示该结果在情理之中。这不仅因为安布罗斯与鲁弗肯是该领域中无可置疑的先驱，也因为小RNA在基础研究和临床诊疗上的重要性值得第二块奖牌。·miRNA是一类长度仅约20~22个核苷酸的小RNA（small RNA）分子，它并不直接参与蛋白质的合成，而是通过调控mRNA影响
siRNA的制备方法介绍
体外制备1.化学合成许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了，比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于：已经找到最有效的si
siRNA表达载体的构建
实验方法原理 多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RNA, shRNA)在哺乳动物细胞中的表达。这三类启动子包括大家熟悉的人源和鼠源的U6启动子和人H1启动子。之所以采用RNA pol
siRNA表达载体的构建
siRNA表达载体构建可应用于：（1）作为后基因组时代基因功能分析的有力工具；（2）基因组学、细胞信号传导通路分析；（3）药物靶点筛选、疾病治疗。实验方法原理多数的siRNA表达载体依赖三种RNA聚合酶III 启动子(pol III)中的一种，操纵一段小的发夹RNA(short hairpin RN
Transfection－of－siRNA－oligos－to－peritoneal－macrophages
Use DeliverX Transfection from PanomicsModified protocol belowStep 1: Make complexesNote: Do not scale up more than 3xThaw siRNA and DeliverX reagen
RNAi片段siRNA设计原则
RNAi target selection rules:Targeted regions on the cDNA sequence of a targeted gene should be located 50-100 nt downstream of the start codon (ATG).S