siRNA实验成功的十个要点
1. 对每个基因设计并检测两到四个siRNA 序列为了找到潜在靶位点，扫描靶基因中的AA序列。记录每个AA 3’端19个核苷酸作为潜在siRNA 靶位点。潜在靶位点需通过GENBANK数据库的BLAST分析，去除那些与其它基因明显同源的靶位点。如果可能，siRNA 应根据mRNA 低二级结构的区域设计。美国著名RNA 产品公司Ambion提供网上在线设计工具，帮助您更快地完成这项工作。网址为：www.ambion.com/techlib/misc/siRNA_finder.html2. 选择低GC含量的siRNAAmbion公司研究发现GC含量在40-55%的siRNA 比55%以上的活性高。3. 纯化体外转录siRNA在转染前要确认siRNA 的大小和纯度。为得到高纯度的siRNA ，推荐用玻璃纤维结合，洗脱（Ambion siRNA 体外合成试剂盒中已包括纯化柱保证siRNA 纯度）或通过15-20%丙烯酰胺......阅读全文
dsRNA消化法制备siRNA的方法介绍
dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤，为研究人员节省时间和金钱（注意：通常用RNAse Ⅲ通常比用Dicer要便宜）。不过这种方法的缺点也很明显，就是有可能引发非特异的基因沉默，特别是同源或者是密切相关的基因。多数的研究显示这种情况通常不会造成影响。最适用于：快速
RNAi技术突破：siRNA体内传递机制
小RNAs如何进入哺乳动物细胞？ 一切开始于花：上个世纪90年代挪威的研究人员发现在矮牵牛（petunias）中有一种特殊的基因的额外拷贝可以抑制其活性，而不是如之前假想的增强其活性。几年之后这种基因研究发现其机制基于细胞中mRNA的降解，最终在90年代末期诺贝尔获得者Andrew Fire和C
关于小干扰RNA的siRNA设计介绍
最初，siRNA序列的选择是基于实验经验而获得的（Elbashir et al. 2001，2002）。最近，生物信息学工具被用来设计siRNA（表18-1），目前多个数据库收录了经过实验确证的siRNA和shRNA。值得推荐的是，在设计新的siRNA之前可以通过搜索已有的siRNA数据库和科研
关于siRNA的体外制备的介绍
1、化学合成siRNA 合成siRNA应用广泛，这种方法的得率和纯度都比较高。对合成siRNA还可以进行一系列化学修饰以提高siRNA的稳定性、降低脱靶效应，以及（或者）阻止激活天然免疫反应。多家公司，包括Ambion、Thermo Scientific Dharmacon、QIAGEN和Si
【分享】siRNA转染成功的主要关键
siRNA在RNA沉寂通道中起中心作用，是对特定信使RNA（mRNA）进行降解的指导要素，细胞转染实验中经常会遇到siRNA转染，下面介绍一下siRNA转染成功的主要关键点。图片来源于网络 1.设计合成有效的siRNA RNAi的核心需要siRNA对相应mRNA进行有效的结合和作用。si
siRNA的化学合成方法的介绍
许多国外公司都可以根据用户要求提供高质量的化学合成siRNA。主要的缺点包括价格高，定制周期长，特别是有特殊需求的。由于价格比其他方法高，为一个基因合成3—4对siRNAs 的成本就更高了，比较常见的做法是用其他方法筛选出最有效的序列再进行化学合成。最适用于：已经找到最有效的siRNA的情况下，需要
常规剂型、系统给药siRNA显示动物疗效
《自然生物技术》杂志发表一篇由哈佛大学和麻州大学科学家的一个妊娠毒血症siRNA药物发现工作。作者根据溶解性FLT1（sFLT1，也称sVEGFR1）mRNA与膜上全长FLT1 mRNA的区别找到选择性敲低sFLT1的siRNA序列。在小鼠模型中不需使用特殊纳米制剂的siRNA显着降低血浆和胎盘
JVI：昆虫利用siRNA而非miRNA抵御病毒侵染
棉铃虫（Helicoverpa armigera），是夜蛾科昆虫的一种，寄主植物有20多科200余种，其中大部分为重要栽培作物，是棉花的主要害虫之一。棉铃虫单核衣壳核多角体病毒（HaSNPV）是一种杆状病毒,能专一性地感染棉铃虫，作为生物杀虫剂已得到广泛应用。 近日澳大利亚昆士兰大学的研究
JVI：昆虫利用siRNA而非miRNA抵御病毒侵染
棉铃虫(Helicoverpa armigera)，是夜蛾科昆虫的一种，寄主植物有20多科200余种，其中大部分为重要栽培作物，是棉花的主要害虫之一。棉铃虫单核衣壳核多角体病毒(HaSNPV)是一种杆状病毒,能专一性地感染棉铃虫，作为生物杀虫剂已得到广泛应用。 近日澳大
概述siRNA的抗病毒治疗应用
近年来，RNAi技术在病毒感染性疾病治疗方面的应用已受到极大关注，尤其在AIDS、乙型肝炎和丙型肝炎等治疗中的应用研究最为活跃。，在siRNA抗AIDS的研究中，针对HIV结构蛋白基因及长末端重复序列（longterminal repeat，LTR）的SiRNA可以控制病毒复制；针对宿主细胞HI
miRNA、siRNA、dsRNA与shRNA－表示什么意思？
siRNA，shRNA，dsRNA，miRNA间的区别RNA干扰（RNAi），即用20多个核苷酸组成的短的双链RNA（siRNA）代替传统反义核酸进行转录后基因沉默，已经迅速而广泛地应用到基因功能，基因表达调控机制研究等热门领域，并为基因治疗开辟了新的途径。近两年来，这方面的科学论文及报道爆炸性增长
用siRNA或其生物合成前体RNAi诱导
通过转染外源siRNA进行的基因敲低通常是不令人满意的，因为该效应仅是短暂的，特别是在快速分裂的细胞中。这可以通过产生siRNA的表达载体来克服。修饰siRNA序列以在两条链之间引入短环。得到的转录物是短发夹RNA（shRNA），其可以通过Dicer以其通常的方式加工成功能性siRNA。典型的转
用RNase－III制备siRNA库来诱发RNAi(2)
Figure 1. Silencing Gene Targets by RNase III Derived siRNA Cocktails. A 200 bp dsRNA (15 µg) for each gene of interest was digested with 2.5 U RN
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法RNA干扰(RNA interference，RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA， dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达，用特异性的抗体几乎检测不到靶向
用RNase－III制备siRNA库来诱发RNAi(1)
小分子干扰RNA (Small interfering RNA ，siRNA ) 是一种非常有效的工具，能够在包括哺乳动物细胞在内的多个体系中抑制特定基因的表达，从而研究某个基因的功能或者是相关信息。但是这种强有力的方法的难题之一是需要设计，合成siRNA s 和验证其效果，从而找到最有效的
siRNA的体外转录合成方法的介绍
以DNA Oligo为模版，通过体外转录合成siRNAs，成本相对化学合成法而言比较低，而且能够比化学合成法更快的得到siRNAs。不足之处是实验的规模受到限制，虽然一次体外转录合成能提供足够做数百次转染的siRNAs，但是反应规模和量始终有一定的限制。而且和化学合成相比，还是需要占用研究人员相当的
PNAS：携带siRNA纳米颗粒可抑制肺癌细胞
RNA干扰（RNAi）是一种很有前途的方法，可以用来作为针对人体不同疾病（如癌症）的治疗策略。然而，在体内，如何将小分子siRNA转移到肿瘤或者癌细胞聚集的区域一直是很难的课题。通过一种高效的自组装系统，来自美国哈佛医学院和中国四川大学华西医学院的课题组，发展了一套独特的纳米颗粒平台，通过由固体
人造病毒改进基因疗法有望定向输送siRNA和药物
病毒擅长于从感染的细胞中获取遗传物质进行自复制。这一特征被用于开发基因治疗手段，这些基因被引入到患者的细胞内进行遗传疾病或是遗传缺陷的治疗。韩国的研究者制备了一种人造病毒。该研究发表在化学研究杂志上，研究者可以使用人造病毒向癌症细胞内输送治疗性的基因和药物。 天然的病毒在基因治疗中具有极其高效的将
siRNA疗法运输到肺部－有望治疗人类相关肺部疾病
近日，一篇发表在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上题为“Divalent siRNAs are bioavailable in the lung and efficiently block SARS-CoV-2 infecti
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法（二）
2.3 倍增阶段 siRNA在RNA依赖性RNA聚合酶(RdRP)的作用下，以mRNA为模板，siRNA为引物，扩增产生足够数量的dsRNA作为底物提供给Dicer酶，产生更多的siRNA， 可再次形成RISC，并继续降解mRNA，从而产生级联放大效应。并作用于靶mRNA。如此反复
北大等在siRNA抗病毒研究方面获进展
北京大学生命科学学院李毅课题组与美国加州大学河滨分校丁守伟教授合作，近日在美国科学院院刊（PNAS）上发表了题为Virus infection triggers widespread silencing of host genes by a distinct class of endogenou
《自然—生物技术》：研究发现siRNA体内传递机制
小RNAs如何进入哺乳动物细胞？ 上个世纪90年代挪威的研究人员发现在矮牵牛（petunias）中有一种特殊基因的额外拷贝可以抑制其活性，而不是如之前假想的增强其活性。几年之后这种基因研究发现其机制基于细胞中mRNA的降解，最终在90年代末期诺贝尔获得者Andrew Fire和Craig Mello
如何有效地降低PepMuteTM，GenMuteTM－and－PepMuteTM－Plus－siRNA转...
如何有效地降低PepMuteTM，GenMuteTM and PepMuteTM Plus siRNA转染试剂的毒性PepMuteTM，GenMuteTM 及 PepMuteTM Plus转染试剂，仅被发现在DMEM基础细胞培养基中偶有毒性，使用其他的培养基（含10%FBS及抗生素）培养细胞，将基本
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法（一）
RNA干扰(RNA interference，RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA， dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达，用特异性的抗体几乎检测不到靶向基因所表达的蛋白质。因此，RNAi技术又
携带siRNA纳米颗粒抑制三阴性乳腺癌转移
来自美国的华人科学家Zheng-Rong Lu在国际学术期刊cancer research发表了一篇文章，他们针对β3整合素设计了siRNA并通过纳米颗粒进行体内转运能够显著抑制三阴性乳腺癌的生长，转移和复发，具有重要应用前景。 转移性乳腺癌是癌症导致女性死亡的第二大杀手，而三阴性乳腺癌是乳腺
JCI：siRNA筛选发现促乳腺癌转移关键因子
近日，著名国际期刊JCI在线发表了荷兰莱顿大学研究人员的一项最新研究成果，他们利用小干扰RNA对H1299细胞内与细胞迁移有关的基因进行了筛选，发现了一些与肿瘤细胞迁移速度和持续性有关的基因，并发现了与乳腺癌病人肿瘤转移密切相关的SRPK1基因或可成为乳腺癌药物治疗的潜在靶点，因此具有重要意义。
Cell子刊：siRNA纳米药物用于脑部疾病治疗研究综述
2018年2月5日，国际著名学术杂志《Cell》子刊《Trends in Biotechnology》杂志在线发表了河南大学生命科学学院师冰洋教授课题组的综述论文，论文题为《Nanotechnology-based strategies for siRNA brain delivery for
siRNA降胆固醇药物inclisiran持久、显著降低LDLC！
诺华（Novartis）公布评估首创小干扰RNA（siRNA）降胆固醇药物inclisiran治疗成人高脂血症三项关键III期临床试验汇总数据的预先指定分析结果。这些数据在近日举行的美国心脏病学会年度科学会议/世界心脏病学大会（ACC.20/WCC Virtual）虚拟会议上公布。ORION-9
如何优化GenMuteTM转染试剂，提高siRNA/DNA共转染效率？
GenMuteTM siRNA转染试剂（Cat#SL100568）是市场上最有力的siRNA传递工具之一。siRNA/DNA共转染时，siRNA的最佳浓度范围是0.5ηM到10ηM，过多的siRNA可能导致沉默效果差的“洪水效应”，切勿使用超过20ηM的siRNA。以24孔板为例，如下步骤将对如何优
RNAi－实验介绍
1. RNAi 介绍 RNA 干扰（RNAi:RNA interference）是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello（1）在线虫实验中发现的，2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导