用siRNA或其生物合成前体RNAi诱导
通过转染外源siRNA进行的基因敲低通常是不令人满意的,因为该效应仅是短暂的,特别是在快速分裂的细胞中。这可以通过产生siRNA的表达载体来克服。修饰siRNA序列以在两条链之间引入短环。得到的转录物是短发夹RNA(shRNA),其可以通过Dicer以其通常的方式加工成功能性siRNA。典型的转录盒使用RNA聚合酶III启动子(例如,U6或H1)来指导小核RNA(snRNA)的转录(U6参与基因剪接;H1是RNase)人RNase P)的成分。理论上,所得的siRNA转录物然后由Dicer处理。 通过使用细胞挤压也可以提高基因敲低效率。 RNAi中siRNA的活性很大程度上取决于其与RNA诱导的沉默复合物(RISC)的结合能力。双链体siRNA与RISC的结合之后是用内切核酸酶解开和切割有义链。然后剩余的反义链-RISC复合物可以与靶mRNA结合以启动转录沉默。......阅读全文
用siRNA或其生物合成前体RNAi诱导
通过转染外源siRNA进行的基因敲低通常是不令人满意的,因为该效应仅是短暂的,特别是在快速分裂的细胞中。这可以通过产生siRNA的表达载体来克服。修饰siRNA序列以在两条链之间引入短环。得到的转录物是短发夹RNA(shRNA),其可以通过Dicer以其通常的方式加工成功能性siRNA。典型的转
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA, dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达,用特异性的抗体几乎检测不到靶向
用RNase-III制备siRNA库来诱发RNAi(2)
Figure 1. Silencing Gene Targets by RNase III Derived siRNA Cocktails. A 200 bp dsRNA (15 µg) for each gene of interest was digested with 2.5 U RN
用RNase-III制备siRNA库来诱发RNAi(1)
小分子干扰RNA (Small interfering RNA ,siRNA ) 是一种非常有效的工具,能够在包括哺乳动物细胞在内的多个体系中抑制特定基因的表达,从而研究某个基因的功能或者是相关信息。但是这种强有力的方法的难题之一是需要设计,合成siRNA s 和验证其效果,从而找到最有效的
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法(二)
2.3 倍增阶段 siRNA在RNA依赖性RNA聚合酶(RdRP)的作用下,以mRNA为模板,siRNA为引物,扩增产生足够数量的dsRNA作为底物提供给Dicer酶,产生更多的siRNA, 可再次形成RISC,并继续降解mRNA,从而产生级联放大效应。并作用于靶mRNA。如此反复
RNAi的作用机制及siRNA的合成方法(一)
RNA干扰(RNA interference,RNAi)是由双链RNA(double strandedRNA, dsRNA)分子在mRNA水平关闭相应序列基因表达或使其沉默的过程。dsRNA可以抑制不同类型细胞的靶向基因表达,用特异性的抗体几乎检测不到靶向基因所表达的蛋白质。因此,RNAi技术又
RNAi片段siRNA设计原则
RNAi target selection rules:Targeted regions on the cDNA sequence of a targeted gene should be located 50-100 nt downstream of the start codon (ATG).S
专访RNAi前沿科学家刘一
5月14日的《Nature》杂志以封面文章形式发表了德克萨斯大学西南医学中心刘一的一篇RNAi研究前沿文章,刘一教授发现了一类新的RNAi分子,qiRNA。人们对RNAi的了解又深入了一步。 为了让读者更进一步的了解qiRNA,生物通记者采访了文章的通讯作者刘一教授,百忙中的刘一教授爽
吴立刚课题组Nature子刊发布RNAi新工具
来自中科院上海生命科学研究院的研究人员报告称,他们设计出了一种替代性的小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)前体,将之命名为saiRNA (single-stranded, Argonaute 2 (Ago2)-processed interfering RNA)
Rules-of-siRNA-design-for-RNA-interference-(RNAi)
General GuidelinessiRNA targeted sequence is usually 21 nt in length.Avoid regions within 50-100 bp of the start codon and the termination codonAvoid
小环状干扰-RNA-(sciRNA)-作为基因沉默的有效治疗平台
为了实现由RNA干扰(RNAi)途径介导的有效的治疗性基因沉默,小干扰RNA (sirna)必须经过化学修饰。一些具有在代谢上稳定sirna潜力的超rna结构已被评估其诱导基因沉默的能力,但所有这些结构都有局限性或尚未在治疗相关的背景下进行探索。共价闭合环状RNA转录本普遍存在于真核生物中,有潜
RNAi的机理与应用(二)
首先,外源的或体内产生的长双链 RNA(long double stranded RNA, dsRNA) 首先被 Dicer 酶降解为长 21 ~ 23bp (碱基对)长度的小分子双链 RNA (称为小干扰核酸, small interfering RNA, siRNA), 这是一个依赖 A
RNAi的研究进展(二)
三,RNAi的应用前景RNAi 技术中的相关问题主要涉及以下几点:(1) dsRNA 序列的选择dsRNA 主要选自已知的cDNA 的开放阅读框架(ORF) 中的基因区域。为防止mRNA 调控蛋白对RISC 与靶RNA 结合的干扰,应避免选择包括:1) 起始密码子下游或终止密码的50~100 核
RNAi的机理与应用
RNAi 技术的机理与应用 关于 RNAi 技术 RNA 干扰(RNA interference,RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链 RNA( double-stranded RNA,dsRNA) 诱发的、同源 mRNA 高效特异性降解的现象。 RNAi 受到追捧的
RNAi的研究进展(一)
RNA干扰(RNA interference ,RNAi) 现象是一种进化上保守的抵御转基因或外来病毒侵犯的防御机制。将与靶基因的转录产物mRNA 存在同源互补序列的双链RNA(double strand RNA ,dsRNA) 导入细胞后,能特异性地降解该mRNA ,从而产生相应的功能表型缺失
RNAi及siRNA转染相关实验攻略
RNAi 是一种高效的特异性强的基因表达抑制,应用RNAi生物学机制进行基因功能研究已经成为一种创新性的新方法,人们第一次可以如此快速和方便地抑制细胞中特定基因的表达水平,从而用于分析特定基因在细胞中的功能。RNAi 技术还为新药开发、疾病治疗提供了创新性的方法和途径,有着极其广阔的应用前景。转染是
产生RNA干扰RANi-的方法
4 产生RANi 的方法产生RANi 的方法主要有体外合成和体内合成siRNA 法。将siRNA 导入细胞的方法又分为微量注射法、电穿孔法、浸泡法、工程菌喂养法、转基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]设计体外合成21nt siRNA 的方法是:在基因库中寻找靶向基因的mRNA 序列,
miRNA和siRNA的基本介绍及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是
miRNA和siRNA简介及区别
1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室
RNAi干扰技术及应用进展研究(一)
RNAi是Napoli CD等在试图向紫色矮牵牛花转导色素合成基因,用以增加其花色时发现的。结果出乎预料,转基因的植株不仅没有新基因的表达,反而自身的色素合成也减弱了,一些转基因的花出现了全白色或部分白色。他们把这种导入的基因未表达和植物本身合成色素基因的失活现象命名为共抑制(cosuppressi
基因敲除技术概述(三)
2.1.2.2 诱导性基因敲除法诱导性基因敲除也是以Cre/loxp 系统为基础,但却是利用控制Cre 表达的启动子的活性或所表达的Cre 酶活性具有可诱导的特点,通过对诱导剂给予时间的控制或利用Cre 基因定位表达系统中载体的宿主细胞特异性和将该表达系统转移到动物体内的过程在时间上的可控性
RNA干扰的作用机制
病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞内R
RNA干扰技术的作用机制
病毒基因、人工转入基因、转座子等外源性基因随机整合到宿主细胞基因组内,并利用宿主细胞进行转录时,常产生一些dsRNA。宿主细胞对这些dsRNA迅即产生反应,其胞质中的核酸内切酶Dicer将dsRNA切割成多个具有特定长度和结构的小片段RNA(大约21~23 bp),即siRNA。siRNA在细胞内R
RNAi-实验介绍
1. RNAi 介绍 RNA 干扰(RNAi:RNA interference)是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello(1)在线虫实验中发现的,2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导
RNAi-实验介绍
1. RNAi 介绍RNA 干扰(RNAi:RNA interference)是由诺贝尔生理学/医学奖得主 Andrew Z. Fire 和 Craig C. Mello(1)在线虫实验中发现的,2001 年 Elbashir 等人发现哺乳类的 siRNA 可以进行 RNAi 诱导。这个方法与常规方
RNAi技术突破:siRNA体内传递机制
小RNAs如何进入哺乳动物细胞? 一切开始于花:上个世纪90年代挪威的研究人员发现在矮牵牛(petunias)中有一种特殊的基因的额外拷贝可以抑制其活性,而不是如之前假想的增强其活性。几年之后这种基因研究发现其机制基于细胞中mRNA的降解,最终在90年代末期诺贝尔获得者Andrew Fire和C
RNAi表达载体构建(一)
近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分
基因技术专题2
RNAi技术RNA干扰(RNA interference, RNAi)是近年来发现的研究生物体基因表达、调控与功能的一项崭新技术,它利用了由小干扰RNA(small interfering RNA, siRNA)引起的生物细胞内同源基因的特异性沉默(silencing)现象,其本质是siRNA与对应
RNAi表达载体构建
近年来的研究表明,一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达,诱使细胞表现出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference,RNAi)。siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子,能够
RNA干扰(转录后基因沉默)实验
RNA干扰(RNA interference, RNAi)是指在进化过程中高度保守的、由双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)诱发的、同源mRNA高效特异性降解的现象。目前主要用于(1)特异性剔除或关闭特定基因的表达 (2)探索基因功能和传染性疾病及恶性肿瘤的治疗 (3)使