分子克隆技术(质粒DNA和DNA插入片段的制备、连接反应...2

PCR引物决定PCR的特异性,引物的设计就显得尤为重要。下面以已知DNA序列设计引物为例介绍设计引物应考虑的几个方面:1、GC比值:众所周知,碱基对中的GC之间有三条氢键,AT之间有两条氢键,GC和AT在引物序列中的合理比例是设定PCR中退火温度的重要依据。通常在一个引物中GC和AT各半即可。2、长度:通常15-20bp即可。由于目的不同,有时引物长些,但太短会影响引物的特异性。3、方向:设计出的引物永远是5'-3'方向,所以正向引物是与一股模板DNA序列相一致的,而反向引物则与这股模板DNA序列相互补。4、酶切位点:如果想克隆所放大的DNA片段,通常在引物的5'端设计适当的限制性酶切位点,使进一步的克隆工作更容易。一对引物可用一种或两种酶切位点,这取决于设计者,两种不同的酶切位点使克隆具有方向性。5、启始和终止密码:如果想表达所放大的DNA片段,所用的克隆载体又不含启始密码和终止密码,应将其设计在引物的......阅读全文

外源DNA和质粒载体的连接反应原理及实验步骤1

外源DNA片段和线状质粒载体的连接,也就是在双链DNA5'磷酸和相邻的3'羟基之间 形成的新的共价链。如质粒载体的两条链都带5'磷酸,可生成4个新的磷酸二酯链。但如果质粒DNA已去磷酸化,则吸能形成2个新的磷酸二酯链。在这种情况下产生的两个杂交体分子带有2个单链切口,当杂

细菌质粒-DNA-的小量制备实验

细菌质粒的发现是微生物学对现代分子生物学发展的重要贡献之一。特别是自 70 年代末以来,根据质粒分子生物学特性而构建的一系列克隆和表达载体更是现代分子生物学发展、改良生物品种和获得基因工程产品不可缺少的分子载体,发展十分迅速,而质粒的分离和提取则是最常用和最基本的实验技术,其方法很多。仅大肠杆菌质粒

在质粒载体中进行平末端片段的克隆实验

克隆平末端的目的片段时,为最大量地获得“正确”的连接产物,载体和目的 DNA 在连接反应中的比例必须适当。每一重组体中外源 DNA 的连接方向和插入数量都必须用限制酶酶切图谱分析或其他方法加以鉴定。作为一般规律,如果连接反应中质粒和目的 DNA 摩尔数相等,而且 DNA 的总浓度少于 100 μg/

用核酸内切酶构建亚克隆

实验概要所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。主要试剂1.LB液体培养基:胰化蛋白胨(细菌培养用

重组质粒的连接、转化及筛选

第一节 概 述质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆 较小的DNA 片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆 ,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA 和目的DNA 片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得到重组质粒转化细菌,即可

重组质粒的连接、转化及筛选

第一节 概 述质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆 较小的DNA 片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆 ,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA 和目的DNA 片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得到重组质粒转化细菌,即可完成。但在实

将大片段插入-DNA-导入哺乳动物细胞和胚胎实验

                基本方案1 通过质体融合将完整的 YAC 导入哺乳动物细胞 基本方案2 将细菌人工染色体(BAC或PAC)引入到哺乳动物细胞和小鼠胚胎中        

煮沸裂解法制备质粒DNA实验——煮沸裂解法小量制备质粒DNA

这个方法 [ 根据 Holmes 和 Quigley 的方法(1981) 修订而成 ] 是将细菌悬浮于含有 Triton X-100 和能消化细胞壁的溶菌酶的缓冲液中,然后加热到 100℃ 使其裂解。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等实验方法原理经 Triton X-100、溶菌酶和加热处

煮沸裂解法制备质粒DNA实验——煮沸裂解法大量制备质粒DNA

实验方法原理经 Triton X-100、溶菌酶和加热处理可从大量(500 ml ) 细菌培养物中分离质粒 DNA,所获得的质粒通过柱层析或 CsCl-溴化乙锭梯度离心可进一步纯化。试剂、试剂盒抗生素乙醇异丙醇乙酸钠STETTE溶菌酶仪器、耗材LB、YT 或 Terrific 培养液沸水浴实验步骤一

DNA重组技术-连接

实验概要        体外连接获得重组分子,用于转化受体细胞。实验原理    质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA和目的DNA片段,  然后体外使

重组质粒(dna-recombinant-plasmid)的连接

质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA 片段( <10kb) 且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA 和目的DNA 片段,然后体外使两者相连接,再用所得到重组质粒转化细菌,即可完成。但在实际工作中,

目的基因的亚克隆

            实验方法原理 亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。 实验材料

分子生物学常用实验技术(八)

第五章重组质粒的连接、转化及筛选第一节概述  质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆较小的DNA 片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA 和目的DNA 片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得

牙签法小量制备质粒DNA实验

            实验方法原理 用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多,不能作为大多数限制酶的底物。 试剂、试剂盒

牙签法小量制备质粒DNA实验

用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多,不能作为大多数限制酶的底物。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多,不能作为大多数限制酶

牙签法小量制备质粒DNA实验

实验方法原理 用牙签从琼脂培养基上挑取的菌落可直接用于制备质粒 DNA。所得的闭合环状 DNA 往往杂质太多,不能作为大多数限制酶的底物。试剂、试剂盒 抗生素溴酚蓝溶液EDTA溴化乙锭NSS 溶液KCl琼脂糖凝胶仪器、耗材 LB、YT 或 SOB热循环仪木质牙签实验步骤 一、材料1. 缓冲液和溶液(

PCR产物的平末端克隆

            实验方法原理 靶基因经 PCR 扩增,样品进行必要的纯化回收后,接下来用平末端进行连接克隆也是分子生物学实验中常规采用的技术路线,实验一般利用噬菌体 T4 DNA 聚合酶等补平扩增 DNA 片段的末端(Weiner 1993; Chuan

在质粒载体中进行平末端片段的克隆

在质粒载体中进行平末端片段的克隆1.分别设立两个反应,用适当的限制性内切核酸酶消化1~10μg质粒DNA和外源DNA片段,使它们能产生平末端。2.苯酚:氯仿抽提与乙醇沉淀法纯化出已被消化的载体和外源DNA片段。3.分别用TE(pH 8.0)重新溶解纯化出的两种DNA沉淀,使终浓度为100 ng/ml

PCR产物的平末端克隆

常规采用的技术路线,实验一般利用噬菌体 T4 DNA 聚合酶等补平扩增 DNA 片段的末端(Weiner 1993; Chuang et al. 1995)。Liu 与 Schwartz (1992) 发现在连接反应的温育过程中,当反应液中存在过量的限制性内切核酸酶能显著地增加重组质粒的产率

质粒载体和外源DNA中限制酶切位点的性质

如今,质粒载体中限制酶切位点的种类极为繁多,因而通常都有可能找到某种带限制酶切位点恰恰与外源DNA片段本身毫无二致的载体。这就具备一个不可比拟的优点,也应是可以用相应的限制酶消化重组质粒崦回收外源DNA。另一种方案,则是把片段插入到载体中能产生匹配末端的任何位点中。例如,识别不同的六核苷酸的限制酶B

重组质粒(dna-recombinant-plasmid)的连接、转化及筛选1

第一节 概 述质粒具有稳定可靠和操作简便的优点。如果要克隆 较小的DNA 片段(<10kb)且结构简单,质粒要比其它任何载体都要好。在质粒载体上进行克隆 ,从原理上说是很简单的,先用限制性内切酶切割质粒DNA 和目的DNA 片段, 然后体外使两者相连接, 再用所得到重组质粒转化细菌,即可完成

DNA连接试验

当我们已经获得目的基因片段,选择好适当的克隆(或表达,转化)质粒载体, 并确定重组方案后,下面要进行的就是DNA片段之间的体外连接,从而获得重组子。 此重组子可转入相应的宿主菌中用于对目的基因的扩增以及目的基因表达(如现代基因工程药物的生产),还可用于序列分析和转基因等重要生物技术的研究中。 DNA

氯化锂沉淀法去除质粒DNA制备物中的小片段核酸

实验方法原理 氯化锂沉淀法去除质粒制备物中小片段核酸(包括 DNA 和 RNA ) 的原理是基于两种核酸在氯化锂溶液中的溶解度有所不同。氯化锂是强脱水剂,可降低 RNA 的溶解性 ( Hearst and Vinograd 1961a, b),并剥离染色质上的蛋白质(Kondo 1979)。

氯化锂沉淀法去除质粒DNA制备物中的小片段核酸

氯化锂沉淀法去除质粒制备物中小片段核酸(包括 DNA 和 RNA ) 的原理是基于两种核酸在氯化锂溶液中的溶解度有所不同。氯化锂是强脱水剂,可降低 RNA 的溶解性 ( Hearst and Vinograd 1961a, b),并剥离染色质上的蛋白质(Kondo 1979)。因此,质粒粗提物中的高

Sephacryl-S1000-层析法去除质粒-DNA-制备物中的小片段核酸

实验方法原理 Sephacryl S-1000 层析是一个可供选择的将质粒 DNA 与小分子核酸(DNA 和 RNA ) 分离的方法。这一方法由波士顿麻省总医院的 F.DeNoto 和 H.Goodman 首先采用,后来由 Gomez-Marquez 等总结成论文发表于 1987 年。实验材

氯化锂沉淀法去除质粒DNA制备物中的小片段核酸

氯化锂沉淀法去除质粒制备物中小片段核酸(包括 DNA 和 RNA ) 的原理是基于两种核酸在氯化锂溶液中的溶解度有所不同。氯化锂是强脱水剂,可降低 RNA 的溶解性 ( Hearst and Vinograd 1961a, b),并剥离染色质上的蛋白质(Kondo 1979)。因此,质粒粗提物中的高

氯化锂沉淀法去除质粒DNA制备物中的小片段核

            实验方法原理 氯化锂沉淀法去除质粒制备物中小片段核酸(包括 DNA 和 RNA ) 的原理是基于两种核酸在氯化锂溶液中的溶解度有所不同。氯化锂是强脱水剂,可降低 RNA 的溶解性 ( Hearst and Vinograd 1961a

Sephacryl-S1000-层析法去除质粒-DNA-制备物中的小片段核酸

Sephacryl S-1000 层析是一个可供选择的将质粒 DNA 与小分子核酸(DNA 和 RNA ) 分离的方法。这一方法由波士顿麻省总医院的 F.DeNoto 和 H.Goodman 首先采用,后来由 Gomez-Marquez 等总结成论文发表于 1987 年。本实验来源「分子克隆实验指南

在质粒载体(plasmid-vector)中进行平末端片段的克隆

1、分别设立两个反应,用适当的限制性内切核酸酶消化1-10μg质粒DNA和外源DNA片段,使它们能产生平末端。2、苯酚:氯仿抽提与乙醇沉淀法纯化出已被消化的载体和外源DNA片段。3、分别用TE(pH 8.0)重新溶解纯化出的两种DNA沉淀,使终浓度为100 ng/ml。假设1 bp相当于660Da,

目的基因的亚克隆

目的基因的亚克隆所谓亚克隆就是对已经获得的目的DNA片段进行重新克隆,其目的在于对目的DNA进行进一步分析,或者进行重组改造等。    亚克隆的基本过程包括:(1)目的DNA片段和载体的制备;(2)目的DNA片段和载体的连接;(3)连接产物的转化;(4)重组子筛选。 一、试剂准备1.LB液体培养基: