动物细胞基因组DNASNP的生物芯片检测2
DNA (500 ng) is digested with Nsp I and Sty I restriction enzymes and ligated to adaptors that recognize the cohesive 4 bp overhangs. All fragments resulting from restriction enzyme digestion, regardless of size, are substrates for adaptor ligation. A generic primer that recognizes the adaptor sequence is used to amplify adaptor-ligated DNA fragments. PCR conditions have been optimized to preferentially amp......阅读全文
动物细胞基因组DNA－SNP的生物芯片检测2
DNA (500 ng) is digested with Nsp I and Sty I restriction enzymes and ligated to adaptors that recognize the cohesive 4 bp overhangs. All fragment
动物细胞基因组DNA－SNP的生物芯片检测1
实验原理：1、SNP的概念及意义单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP），主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在群体中的发生频率不小于1%。SNP在
动物细胞基因组DNA－SNP的生物芯片检测3
3.3、寡核苷酸DNA微阵列芯片检测SNP技术：寡核苷酸芯片检测基因突变技术是基因芯片技术的一种。该技术用于检测基因突变的基本原理是在玻璃、硅等载体上，根据检测需要，设计、固定多个特异的寡核苷酸探针。而后将大量经扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子的待测DNA样品与之杂交，若两者存在至少一个碱基的差
动物细胞基因组DNA的制备
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA的制备原理及操作流程。本方法一般可从5×107培养的非整倍体细胞（如HeLa细胞）中获得大约200μg DNA。DNA的长度可达到100~150kb。20ml正常血的DNA产量约为250μg。实验原理真核生物的一切有核细胞（包括培养细胞）都能用来制备基因组
动物细胞基因组DNA提取实验
实验原理真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从
知识分享：动物细胞基因组DNA提取
实验原理 真核生物的DNA是以染色体的形式存在于细胞核内，制备DNA将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离，同时保持DNA分子的完整。提取DNA的过程是指将分散好的组织细胞在含SDS（十二烷基硫酸钠）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉
基因芯片与SNP分析
基因芯片技术作为一种新兴的生物技术，近年来得到迅速发展，其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性（SNP）作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90
Southern－blot对动物细胞基因组DNA中小卫星多态性的检测
实验概要本实验介绍了动物细胞基因组DNA中小卫星多态性Southern blot检测的原理和操作步骤。掌握核酸杂交检测技术（Southern blotting技术）、核酸探针的标记技术、小卫星DNA多态性检测分析技术（DNA 指纹图谱技术）和化学发光检测技术。实验原理Southern印迹杂交技术包括
系统化生物芯片技术在功能基因组研究中的应用简介
三、生物芯片技术研究应用点滴 人类基因组计划推动了各种生物基因组测序工作的进展，越来越多的生物全基因组序列被测定并公布，可是这才是解读“天书”的开始。掌握了基因组序列，却不知道基因序列背后所隐藏的秘密——即基因组的功能，就不能真正理解“天书”更谈不上服务于人类。如何从海量的基因序列数
SNP－的检测方法
SNP 的分型技术可分为两个时代，一为凝胶时代，二为高通量时代。凝胶时代的主要技术和方法包括限制性酶切片段长度多态性分析（RFLP）、寡核苷酸连接分析（OLA）、等位基因特异聚合酶链反应分析（AS2PCR）、单链构象多态性分析（SSCP）、变性梯度凝胶电泳分析（DGGE），虽然这些技术与高通量时代的
基因检测的原理
1) 基因检测的基础及适用人群： 人类基因组由23对染色体组成，其中包括22对常染色体和1对性染色体（包括1条X染色体和1条Y染色体）。染色体由 DNA 和核糖体蛋白组成，人类基因组含有31.6亿个DNA碱基对。相同碱基对位置上的单核苷酸产生变异（这种情况称之为单核苷酸多态性，简称 SNP ）
SNP的检测知识
SNP的检测知识：人类基因组中存在着广泛的多态性，最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代，即单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）。SNP通常是一种二等位基因的（biallelic），即二态的遗传变异，SNP的数量大、分布广，在组成人
SNP检测技术（测序、taqman探针和snp芯片）
snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点，如hla区域，但成本较高，工作量大，不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠，国外文章也大量应用，不过对于国内成本偏高，同类还有snpshot技术，abi和贝克曼
生物芯片在功能基因组学研究中的应用进展
生物芯片技术是伴随人类基因组研究发展起来的，它是指通过微电子、微加工技术，在固体基质（如硅芯片、玻片、瓷片等）表面构建的微型生物化学系统，以实现对细胞、蛋白质、核酸及其它生物组分进行快速、敏感、高效地处理。一般来说，应用芯片进行实验主要包括3个步骤：样品制备、生物化学反应、检测和数据分析处
SNP检测技术对比
1. SNP检测方法分类1.1. 根据检测原理分类根据检测原理进行分类，目前来说，基于杂交原理的检测方法应用更为广泛。1.2. 根据检测通量分类根据检测通量进行分类，可以分为高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量总的基因芯片法（包括beadschip）应用更为广泛。除此之外，基于Ta
基本方案2－基因组－DNA－的扩增
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒4dNTP 混合物10 X PCR 扩增缓冲液寡聚核苷酸引物Taq DNA 聚合酶矿物油筛（子）琼脂糖DNA 分子大小标准参照物仪器、耗材聚丙稀微量离心管循环变温加热器实验步骤
SNP检测——HRM技术应用
HRM技术服务之SNP检测（snp检测的最佳方案） 单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），指单个核苷酸碱基的改变，包括置换、颠换、缺失和插入，导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一
SNP检测——HRM技术应用
单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNPs），指单个核苷酸碱基的改变，包括置换、颠换、缺失和插入，导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象，这就是SNP。SNP在人类
基因组DNA文库构建必备实验技巧2
技术支持资料：材料缓冲液和溶液- 碱裂解液I , 4°C50 mM 葡萄糖25 mM Tris-Cl (pH 8.0)10 mM EDTA (pH 8.0)配制碱裂解液I 约100ml，灭菌，保存在四度。- 碱裂解液II，新鲜配置，室温保存0.2 N NaOH （从10N的NaOH新鲜制备）1% (
应用SNP芯片测基因组知起源地
欧洲的历史上充满着战争、入侵和移民，这些因素似乎可以彻底地将不同人种混合在一起。然而，美国和荷兰科学家独立进行的两项最新研究表明，一个欧洲人的基因组信息足以表明他的地理起源，欧洲人的基因地图和地理地图间存在着一种映射关系。相关论文分别发表在《自然》和《当代生物学》杂志上。 领导其中一项
应用SNP芯片测基因组知起源地
欧洲的历史上充满着战争、入侵和移民，这些因素似乎可以彻底地将不同人种混合在一起。然而，美国和荷兰科学家独立进行的两项最新研究表明，一个欧洲人的基因组信息足以表明他的地理起源，欧洲人的基因地图和地理地图间存在着一种映射关系。相关论文分别发表在《自然》和《当代生物学》杂志上。 领导其中一项研究的是美国加
分子诊断常用技术（二）
( 五) 生物芯片1991 年Affymetrix 公司的Fordor利用其所研发的光蚀刻技术制备了首个以玻片为载体的微阵列，标志着生物芯片正式成为可实际应用的分子生物学技术。时至今日，芯片技术已经得到了长足的发展，如果按结构对其进行分类，基本可分为基于微阵列( microarray) 的杂交芯片与
基因芯片实验操作流程图
芯片实验操作流程包括样本DNA或RNA制备、标记、杂交及洗涤等步骤基因芯片实验操作流程图 1．样本DNA或RNA制备 芯片实验中核酸的抽提没有特殊之处，参照常规的分子生物学实验手册就可以。但对于RNA样本，由于RNA的稳定性很差，在活体内的半衰期也很短，因此取材一定要新鲜，取材后
怎样对基因组DNA质量检测
怎样对基因组DNA质量检测用凝胶电泳看,有没有质白质和RNA等物质的污染,还可以测OD,用OD260/280来判断,当OD260/OD280< 1.8,表示蛋白质含量较高当OD260/OD280> 2.0,表示RNA含量较高当OD260/OD280=1.2.0,表示DNA较纯
基因芯片技术的应用和发展趋势
随着基因芯片技术的日渐成熟, 在功能基因组、疾病基因组、系统生物学等领域中得到了广泛的应 用, 已经发表了上万篇研究论文, 每年发表的论文呈现增长的趋势. 芯片制备技术极大地推进了生物芯片的发展, 从实验室手工或机械点制芯片到工业化原位合成制备, 从几百个点的芯片到几百万点的高密度芯片, 生物芯片从
SNP检测方法、前景和问题
SNP 是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性，在群体中的发生频率不小于1 %。包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等。所谓转换是指同型碱基之间的转换，如嘌呤与嘌呤( G2A) 、嘧啶与嘧啶( T2C) 间的替换；所谓颠换是指发生在嘌呤与嘧啶(A2T、A2C、C2G、G
小豆F2群体的简化基因组测序构建高密度SNP遗传图谱
小豆营养丰富、医食两用，在促进健康、改善膳食结构等方面具有重要作用。然而，小豆遗传研究相对缓慢，导致新基因发掘及资源利用效率低下，难以满足生产和市场的需求。 近期，中国农业科学院作物科学研究所食用豆种质资源研究程须珍课题完成的题为“Construction of a high-density
将大片段插入－DNA－导入哺乳动物细胞和胚胎实验2
基本方案2 将细菌人工染色体（BAC或PAC)引入到哺乳动物细胞和小鼠胚胎中实验材料纯化的 BAC DNA试剂、试剂盒RNase A原核的注射缓冲液透析缓冲液I乙醇小鼠胚胎哺乳动物细胞灭菌素仪器、耗材含有合适的抗生素的LB培养基Qiagen Midi-prep 试剂盒培养箱高速离心机高速离心管玻璃离
植物基因组DNA及总RNA提取技术2
（二）植物总RNA提取 （1）65°C水浴中预热15 mL CTAB提取液。 （2）液氮中研磨2～3 g新鲜或-70°C冷冻的材料。 （3）转移样品至有CTAB提取液的离心管中，立即激烈涡旋30s，短时放回 65°C水浴中（4～5 min）。 （4）加入等体积的氯仿/异戊醇并涡旋混合，10000 r
生物芯片及其在基因体研究上的应用
生物芯片概论 DNA分子在大多数生物体中是以双股的型态存在(少数病毒、噬菌体除外)。在某些特殊生理状态下，例如：细胞分裂、基因表现等，双股DNA会解开变成单股，然后再回复成双股。而生物学家很早就把这单股DNA利用氢键结合成双股DNA分子的特性应用在生物相关的研究，称之为杂合反应(Hybridizat