DNA双链断裂检测——变压场凝胶电泳(GFGE)
DNA双链断裂与细胞死亡的关系更为密切。变压场凝胶电泳是采用将细胞包埋在低熔点琼脂糖凝胶中,通过蛋白酶、去污剂等渗入凝胶中融解细胞、去蛋白,纯化细胞DNA,再通过梯增电压进行琼脂糖凝胶电泳,结合DNA解旋荧光测定(FADU)法和检测DNA双链断裂。 1、主要试剂及配制方法: (1)蛋白酶K,SDS,低熔点琼脂糖。 (2)配制方法: 细胞缓冲液(A液)。0.25mol/L NaCl + 10mmol Na2HPO4 + 1mmol/L MgCl2,pH7.2. 细胞裂解液(B液)。9mol/L脲 + 10mmol/L NaOH + 2.5mmol/L环烷二胺四乙酸 + 0.1%SDS。 碱性变性液I(C液)。B液 + 0.2mol/NaOH,体积比为45:55. 碱性变性液I(D液)。B液 + 0.2mol/NaOH,体积比为40:60. 抗变性液(F液)。1ug/L溴化乙锭 + 13.3mmol/......阅读全文
解旋酶打开DNA双链过程破解
美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。 温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提
电离辐射引起的DNA损伤介绍
电离辐射损伤DNA有直接和间接的效应,直接效应是DNA直接吸收射线能量而遭损伤,间接效应是指DNA周围其他分子(主要是水分子)吸收射线能量产生具有很高反应活性的自由基进而损伤DNA。电离辐射可导致DNA分子的多种变化:①碱基变化 主要是由OH-自由基引起,包括DNA链上的碱基氧化修饰、过氧化物的形成
关于电离辐射引起的DNA损伤的介绍
电离辐射损伤DNA有直接和间接的效应,直接效应是DNA直接吸收射线能量而遭损伤,间接效应是指DNA周围其他分子(主要是水分子)吸收射线能量产生具有很高反应活性的自由基进而损伤DNA。电离辐射可导致DNA分子的多种变化: ①碱基变化 主要是由OH-自由基引起,包括DNA链上的碱基氧化修饰、过氧化
DNA损伤的三种分子生物检测方法
DNA是携带生物体遗传信息的重要分子,它的完整性对细胞存活至关重要。然而,在生命活动中,DNA时刻遭受着内源性(氧化自由基、复制叉崩塌等)或外源性(电离辐射、烷化剂等)刺激,DNA损伤不可避免。检测DNA损伤的方法有很多,根据其原理大致可以分为3类: 基于损伤DNA理化性质的改变检测DNA损伤、基于
物理因素引起的DNA损伤有哪些?
紫外线引起的DNA损伤DNA分子损伤最早就是从研究紫外线的效应开始的。当DNA受到最易被其吸收波长(~260nm)的紫外线照射时,主要是使同一条DNA链上相邻的嘧啶以共价键连成二聚体,相邻的两个T、或两个C、或C与T间都可以环丁基环(cyclobutane ring)连成二聚体,其中最容易形成的是T
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义
阳性或增高: 可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病: 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程
检查方法:测定抗双链dSDNA的方法有多种,如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程
检查方法:测定抗双链dSDNA的方法有多种,如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值
Farr法结合活性小于或等于20%。 间接免疫荧光法阴性。 斑点免疫结合试验小于1:40(阴性)。 (注具体参考值请根据各实验室而定。)
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义
阳性或增高: 可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病: 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的检查过程
检查方法:测定抗双链dSDNA的方法有多种,如免疫扩散、对流免疫电泳、凝集试验、科体结合试验、间接免疫荧光法、放射免疫分析、酶联免疫吸附法等。目前最常用的是放射免疫分析、间接免疫荧光和酶联免疫吸附法。
抗双链DNA抗体(aniDNA)的注意事项
检查时要求:一般认为抗双链DNA的效价与病情相平行,即病情活动时,抗DNA抗体效价升高,病情缓解时,效价降低。由于各地测定的方法不同,所以正常值也不同,一般来说,结合率要大于20%以上才有临床意义。 检测技术的特异性都不是100%的。例如,绿蝇短膜虫动基体中虽不含ssDNA,但可能含少量组蛋白
如何判断提取的DNA是高纯度的双链DNA
首先:可以通过分光光度计A 260 / A 280的比值,用于评估样品的纯度,因为蛋白的吸收峰是 280 nm.纯净的样品,比值大于 1.8(DNA)或者2.0(RNA).如果比值低于 1.8 或者2.0,表示存在蛋白质或者酚类物质的影响.A 230表示样品中存在一些污染物,如碳水化合物,多肽,苯酚
抗双链DNA抗体(aniDNA)的正常值
Farr法结合活性小于或等于20%。 间接免疫荧光法阴性。 斑点免疫结合试验小于1:40(阴性)。 (注具体参考值请根据各实验室而定。)
抗双链DNA抗体(aniDNA)的临床意义
阳性或增高: 可能为系统性红斑狼疮,还可见于其他结缔组织病、慢性活动性肝炎等。 结果阳性可能疾病: 系统性红斑狼疮 、 系统性红斑狼疮性关节炎 、 系统性红斑狼疮所致脊髓病。
于洋博士等发现基因组长片段DNA插入的新机制
我们身体中每个细胞的基因组DNA每天都会面临成千上万次的损伤。所幸的是,细胞中有一套能够修复各种类型损伤的机器来保证基因组的完整性(genome integrity)。修复DNA损伤的机器在从酵母到人所有的真核生物中都是非常保守的,因此酵母作为模式生物被广泛应用于DNA修复(DNA repair
简述注射用盐酸伊立替康的药理作用
伊立替康是喜树碱的半合成衍生物。喜树碱可特异性地与拓扑异构酶I结合,后者诱导可逆性单链断裂,从而使DNA双链结构解旋;伊立替康及其活性代谢物SN-38可与拓扑异构酶I-DNA复合物结合,从而阻止断裂单链的再连接。现有研究提示,伊立替康的细胞毒作用归因于DNA合成过程中,复制酶与拓扑异构酶I-DN
伊立替康的药理毒理
伊立替康是喜树碱的半合成衍生物。喜树碱可特异性地与拓扑异构酶I结合,后者诱导可逆性单链断裂,从而使DNA双链结构解旋;伊立替康及其活性代谢物SN-38可与拓扑异构酶I-DNA复合物结合,从而阻止断裂单链的再连接。现有研究提示,伊立替康的细胞毒作用归因于DNA合成过程中,复制酶与拓扑异构酶I-DN
Nature子刊揭示DNA剪刀的秘密
科学家们通过低温冰冻定格了差不多两百个生物学结构,首次为人们展示了DNA双链断裂的整个过程。 西班牙国家癌症研究所(CNIO)的研究团队开发了一种特别的生物学晶体制造技术,首次观察到了DNA双链断裂的全过程。他们通过计算机模拟,将这个微秒级的过程展现在人们眼前。这一成果发表在十二月八日的Nat
化学发光双脱氧DNA测序实验
实验材料 DNA试剂、试剂盒 生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPdTTP仪器、耗材 热循环仪尼龙膜滤纸离心机实验步骤 1. 在微量离心管中混匀下列试剂,配制DNA摸板混合物(1)1 μg 单链DNA模板或1~3 μg 变性双链DNA模板(2)0.5 pmol 生物素
化学发光双脱氧DNA测序实验
利用生物素标记引物 实验材料 DNA 试剂、试剂盒
细胞化学词汇双链DNA结合域
中文名称:双链DNA结合域外文名称:dsDNA-binding domain定 义:双链DNA结合域,DNA结合蛋白中与双链DNA结合的结构域。作 用:双杂交系统的基础是在一些转录因子上发现的模域(modular domains):一个DNA结合域,它可以结合一段特异的DNA
分子遗传学词汇双链DNA
中文名称:双链DNA英文名称:double-stranded DNA;dsDNA定 义:由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
抗双链DNA抗体参考值
健康人血清1:10稀释为阴性(绿蝇短膜虫法)。 健康人结合率≤20%(放射免疫分析法Farr试验)。 一般以待测血清A值/阴性对照A值(P/N)≥2.1为阳性,正常人P/N值<2.1(ELISA法)。 正常人为阴性(NC膜上不出现着色点)(滴金免疫渗滤试验)。
双链DNA探针随机引物合成法
随机引物合成双链探针是使寡核苷酸引物与DNA模板结合,在Klenow酶的作用下,合成DNA探针。合成产物的大小、产量、比活性依赖于反应中模板、引物、dNTP和酶的量。通常,产物平均长度为400-600个核苷酸。利用随机引物进行反应的优点是:(1)Klenow片段没有5'→3'外切
化学发光双脱氧DNA测序实验
标准的双脱氧DNA测序可以很容易和很有效地使用非同位索标记的化学发光法进行检测。在测序反应中,使用生物素标记的引物。用非同位素标记如生物素衍生化的引物,可用于为5’-末端标记引物而设的入测序反应的工作方案。实验材料DNA试剂、试剂盒生物素Tris·ClMgCl2DNA聚合酶dATPdCTPdGTPd
DNA双链体的结构和功能
中文名称DNA双链体英文名称DNA duplex定 义两条以3′,5′-磷酸二酯键相连而成的反向多核苷酸链通过沿着其轴向的互补碱基对的氢键交联在一起形成的双链DNA,通常形成双螺旋的结构。可以共价闭合成环状分子,形成超螺旋DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
限制酶切割双链DNA的方式
限制酶切割双链DNA的方式有两种,产生的末端也有两种:第一种是交错切割,即两条链的切点不在同一水平而是相隔数个碱基,故断口产生两小段自身互补的单链,这种末端容易互补连接,称为粘性末端(cohesive terminus);第二种为平整切割。
抗双链DNA抗体的检测方法
检测抗DNA抗体的方法有多种,如ELISA、IIF、金标法、免疫印记法、放免法等。其中最特异敏感的是应用锥虫或血鞭毛虫(如绿蝇短膜虫)作基质测定抗dsDNA抗体。因为这些血寄生虫的动基体内含大量的纯dsNDA,无其他抗原干扰;在阳性结果时,可见鞭毛一端的动基体显示清晰的荧光。因此该试验用于测定抗
DNA测序——双脱氧链末端终止法
实验方法原理DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3'-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3'-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3'-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。 本实验根据此原理,将待测DNA片段插入单链噬菌体M13载体,