透过大规模基因组分析推出泛癌症图谱开启癌症治疗

【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。 泛癌症图谱主要是针对癌症基因组图谱(TCGA)项目过去十多年的研究进行补充并延伸;TCGA 是美国国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)共同执行的项目,自 2006 年开始已经持续了 10 多年的时间,NIH 投入的资金超过了 3 亿美元,范围涉及 20 个机构、近 150 名研究人员共同参与。 NHGRI 团队负责人 Carolyn Hutter 强调,TCGA 是第一个在分子层面上针对广泛类型癌症研究的项目,而在近 10 年前 TCGA 项目的草创阶段,这些内容甚至是不可能做到的,更别提是在如此广大的范围进行此类型的特征和类型分析,......阅读全文

64%中国癌症患者有可用药的潜在临床基因突变

论文截图研究人员在分析数据(受访者供图)近日,《自然-通讯》刊发了一项由中山大学孙逸仙纪念医院王铭辉教授团队联合多家医院及至本医疗针对亚洲癌症人群基因组特征的研究成果。该成果从基因层面将中国人群与西方人群突变特征的异同进行了系统分析和全面对比,全面阐述了东西方癌症患者的不同临床基因组特征,是截止目前

癌症eRNA表达图谱并揭示其在癌症临床中的应用

  2019年10月8日,德克萨斯大学休斯敦健康研究中心的韩冷、李文博课题组合作在Nature Communications上在线发表题为“Transcriptionallandscape and clinical utility of enhancer RNAs for eRNA-targeted

科研新突破登Nature子刊,泛生子再掀癌症基因的“面纱”

  泛生子致力于从癌症基因开始寻根溯源,揭示肿瘤产生的根源及其赖以发展的关键机制,通过临床转化为癌症患者带来希望。   近日,由美国杜克大学讲席教授、泛生子联合创始人兼首席科学家阎海教授领衔的泛生子团队,联同杜克大学及约翰霍普金斯大学研究人员完成的最新成果,在线发表于国际权威学术期刊《Nature

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

Nature:癌症基因组分析的新浪潮

  肺癌与乳腺癌不一样,与胰腺癌也不一样,然而根据发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)的两项最新研究表明在分子水平上它们具有许多相同之处。同日,Nature网站对这一研究成果进行了即时新闻报道   这项“泛癌症”研究针对12种不同类型的肿瘤3000多个基因组进行了分析,寻找跨

大型研究为癌症基因组分析奠定基础

  12月9日,国际癌症基因组协会(ICGC)在著名的《Nature Communications》杂志,发表了一篇令人瞠目的文章,它为即将到来的癌症基因组学研究时代,奠定了基础。该项目,是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German

北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

  近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can

北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM

近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance

国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据

  国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。   安大略癌症研究所所

Nature发布大规模癌症蛋白质基因组学研究重要成果

  基于来自癌症基因组图谱(TCGA)计划的数据,一个多机构科学家小组完成了首个大规模的乳腺癌“蛋白质基因组学”( proteogenomic)研究,将一些DNA突变与蛋白质信号联系到一起,并帮助确定了一些驱动癌症的基因。  这项研究旨在通过蛋白质和它们的修饰来更好地认识癌症。发表在5月25日《自然

肿瘤微环境分析指导癌症治疗

  在免疫疗法时代,癌症生物学家依靠新一代工具来了解肿瘤和免疫细胞之间的相互作用是如何影响疾病进程的。  虽然Sean Bendall是一名病理学家,但最近却成了一名图谱制作者,他使用尖端的蛋白质绘图技术来描绘出肿瘤组织的变幻莫测的景观。  这项技术由Bendall在加州斯坦福大学(Stanford

甲基化泛癌检测产品全球上市,见证中国力量

  伴随着中国老龄化的加速,“带瘤生存”和新发癌症比例正逐渐上升。癌症早筛早检在国内进入了黄金时期。  10月11日,基准医疗(AnchorDx)与美国著名基因公司Twist Bioscience(拓维思特,纳斯达克股票代码:TWST)公布了联合开发的用于泛癌种研究的甲基化文库制备和靶向富集的NGS

震惊!全基因组测序还能这样用在癌症治疗上?

   近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。  全基因组测序(Whole-genome seque

Cancer-Research:转录组分析发现可诊断多种癌症的泛标记物

  在癌症的发生过程中,许多基因都会发生突变并出现功能紊乱,而越来越多的研究也发现这些发生突变的基因或可作为癌症的诊断标记或靶向治疗得到进一步开发,帮助癌症的临床诊断和治疗。  近日,来自日本、丹麦和澳大利亚的科学家在国际学术期刊Cancer Research上发表了一项最新研究进展,他们利用转录组

科学家绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱

  体细胞突变是肿瘤发生的标志,可用于癌症的无创诊断。美国约翰·霍普金斯大学医学院绘制细胞游离DNA单分子全基因组突变图谱,用于癌症无创检测。该研究成果于近日发表在《Nature Genetics》杂志上,题为:Single-molecule genome-wide mutation profile

癌症基因组——癌症研究和云计算的里程碑

图片来源:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00308-w  2001年,人类基因组计划完成,整个计划花费约30亿美元,1985年提出,1990年正式启动,历经十余年。肿瘤是最热门的研究领域之一,该领域的研究者们一直希望可以借助测序手段去表征肿瘤的

美国将开展大规模癌症筛查试验

美国国家癌症研究所计划研究血液测试是否可以通过发现早期癌症挽救生命。图片来源:DIGICOMPHOTO/SCIENCE SOURCE  通过分析血样检测人们是否会患上癌症的测试开始进入临床。  作为美国癌症登月计划的一部分,美国国家癌症研究所(NCI)正在制定计划,评估这类检测的前景。上周,NCI批

癌症干细胞与癌症治疗研讨会召开

  由中科院上海交叉学科研究中心主办,中科院上海生命科学研究院、中科院上海高等研究院协办的“癌症干细胞与癌症治疗研讨会”,于7月6日至7日在上海交叉学科研究中心举行。中科院副院长江绵恒、生物局局长张知彬、上海分院副院长朱志远、上海生科院院长陈晓亚、副院长李林、上海高等研究院筹建组组长

Cell重要发现开启癌症疗法新思路

  无论是树苗还是总统,每一个生物体都必须不惜任何代价来保护自身的DNA。但有关细胞区分自身DNA损伤及入侵病毒外源DNA损伤的机制却仍然是个谜。  现在,来自Salk研究所的科学家们发现了细胞反应系统区分这两种永恒威胁的一些关键细节。研究发现有可能帮助开发出一些新的癌症选择性病毒疗法,及解释衰老和

PNAS:“分子影院”开启癌症疗法新时代

  近日,一项刊登在国际杂志Proceedings of the National Academy of Sciences上的研究论文中,来自利物浦大学等处的科学家通过研究开发了一种“结构影院”(structural movie),其可以帮助揭示机体中重要天然化学物的产生过程,这对于研究某些癌症非常

首个家鸡泛三维基因组图谱构建成功

鸡是如何从野生原鸡演化为如今的高产肉鸡或蛋鸡的?其背后的基因“开关”在哪里?近日,华南农业大学动物科学学院家禽遗传育种研究团队联合国内多家单位,成功构建了首个高分辨率家鸡泛三维基因组图谱。相关成果发表于《先进科学》(Advanced Science)。“该研究成果就像是一张高精度的‘立体导航图’,将

癌症治疗进入小众时代

  近日,美国国家癌症研究所(NCI)发布了有史以来规模最大的癌症相关基因变异数据库。NCI在一份声明中称,基于基因组学研究的新数据库将对全球开放获取,预计将有助于研究人员加快新药的开发,同时能够更好地将患者与疗法进行匹配。   NCI对全球公布迄今为止最大的癌症相关基因变异数据库,再次证实了现代

Cell:癌症治疗路在何方

  自1971年美国总统尼克松对癌症宣战以来,科学家们一致在寻找让细胞失控的基因删除、插入和重复。不断扩大的突变库帮助人们开发出了靶向性药物,将相应患者的生命延长了几个月甚至几年。  但这并不是治疗癌症的唯一途径,德克萨斯大学MD Anderson癌症中心的James P. Allison和Padm

大蒜能治疗脑部癌症

大蒜是日常生活中常见的调味品,而且还有杀菌防病的作用。最近,来自美国南加州大学医学院的研究人员发现,大蒜可以杀死导致神经胶质母细胞瘤(glioblastoma)的细胞。母细胞瘤是一种致命的脑肿瘤。这项研究的结果发表在9月出版的美国癌症学会刊物《癌症》(Cancer)上。 南加州大学医学院的神经科学

纳米微粒可治疗癌症

   科学家们惊奇的发现,原本用于在外科手术中标记肿瘤的纳米颗粒,可以通过诱发一种不太寻常的细胞死亡因而杀死细胞。  他们在《自然纳米技术》期刊上报告了他们如何在小鼠细胞上进行了纳米颗粒实验,并发现了这一结果。  纽约伊萨卡康奈尔大学的工程学乌尔里希·威斯纳教授表示:“如果你想设计一种能够杀死肿瘤细

Nature重要成果:绘制癌症的全面分子图谱

  根据一项获得美国国立卫生研究院(NIH)支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源,这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。   研究人员利用癌症基因组图谱(TCGA)生成的部分数据,根据来自825名乳腺癌患者样

美基因图谱研究将癌症重新“归类”

  美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。  5日发表在美国《细胞》杂志上的研究,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约

美基因图谱研究将癌症重新“归类”

  美国国家卫生研究院资助的科学家团队完成大规模癌症基因组图谱绘制,他们根据基因变异和表达的相似性,提出可以按照分子类型给癌症“归类”。研究人员认为,这将为癌症诊断和治疗提供新思路。5日发表在美国《细胞》杂志上的研究,对33种癌症、1万多个肿瘤病例的基因、表观遗传和蛋白质组学变化进行分析,确认约30

Nature重要成果:绘制癌症的全面分子图谱

根据一项获得美国国立卫生研究院(NIH)支持的新研究发现一种乳腺癌亚型与难治性高分级浆液性卵巢癌具有许多共同的遗传特征。研究结果表明两种癌症具有相似的分子起源,这可能推动比较乳腺癌和卵巢癌亚型的治疗学数据。 研究人员利用癌症基因组图谱(TCGA)生成的部分数据,根据来自825名乳腺癌患者样本的综合

研究绘制迄今最大规模个人表观基因组图谱

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前,复旦大学类脑智能科学与技术研究院杨禹丞等DNA元件百科全书计划国际合作团队,首次绘制迄今全球最大规模个人表观基因组图谱。作为人类基因组计划以来最大的基因组学协作计划,“DN