透过大规模基因组分析推出泛癌症图谱开启癌症治疗

【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。 泛癌症图谱主要是针对癌症基因组图谱(TCGA)项目过去十多年的研究进行补充并延伸;TCGA 是美国国家癌症研究所(NCI)和国家人类基因组研究所(NHGRI)共同执行的项目,自 2006 年开始已经持续了 10 多年的时间,NIH 投入的资金超过了 3 亿美元,范围涉及 20 个机构、近 150 名研究人员共同参与。 NHGRI 团队负责人 Carolyn Hutter 强调,TCGA 是第一个在分子层面上针对广泛类型癌症研究的项目,而在近 10 年前 TCGA 项目的草创阶段,这些内容甚至是不可能做到的,更别提是在如此广大的范围进行此类型的特征和类型分析,......阅读全文

透过大规模基因组分析推出-泛癌症图谱-开启癌症治疗

  【Technews科技新报】美国国立卫生研究院(NIH)资助的研究团队已经完成了一份详细的基因组分析,这个被称为泛癌症图谱(PanCancer Atlas)的研究结果收录了 27 篇论文,并包含了 33 种癌症、1 万多个种不同肿瘤分子和临床讯息的数据资料。   泛癌症图谱主要是针对癌症基因组

泛癌症T细胞单细胞图谱-相关成果发表

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-

《Cell》:如何根据癌症基因组图谱分析肿瘤

  时至今日,这一计划已经取得了许多成果,最新Cell杂志公布了泛癌症图谱(Pan-Cancer Atlas),这也是癌症基因组图谱(TCGA)的收官项目,同期Cell杂志介绍了根据癌症基因组图谱分类的肿瘤类型列表,以及相关的一些主要发现(每种肿瘤类型的标记论文)。  生物通报道:2005年美国国立

Nature对儿童癌症基因组分析,有望实现儿童癌症精准治疗

  在一项新的研究中,来自美国圣犹大儿童研究医院等研究机构的研究人员证实患有癌症的儿童和成年人通常具有不同的发生突变的基因来促进疾病产生,这提示着这些患者可能受益于不同的疗法。这一发现强调了对儿童癌症进行精准医疗的必要性。相关研究结果于2018年2月28日在线发表在Nature期刊上,论文标题为“P

中国科学家发表泛癌症T细胞单细胞图谱

T细胞单细胞图谱的研究框架和主要发现。(张泽民供图)  12月17日,北京大学生物医学前沿创新中心教授张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在《科学》上发表了泛癌症T细胞图谱。结合基因表达谱和T细胞受体序列,研究者系统刻画了肿瘤浸润性T细胞的异质性和动态变化,并系

《科学》:北大团队发表泛癌症T细胞单细胞图谱

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)张泽民课题组联合北京大学肿瘤医院季加孚、步召德课题组以及北京大学第三医院,在国际期刊Science上发表了题为“Pan-Cancer Single Cell Landscape of Tumor-

大规模癌症基因组研究发表《Nature》文章

  髓母细胞瘤是儿童最常见的恶性脑瘤。大多数患者年龄在16岁以下。主要有4个亚组:Wnt、Sonic Hedgehog (SHH)、3组和4组。这些亚群由不同基因变化驱动,起始于不同细胞,常常表现出不同临床状况。Wnt组中,约95%患者可以成为长期存活者,3组患者只有50%。目前,尚无针对3组和4组

泛癌症分析工具新版本推出-为药物开发提供差异性方案

  近日,生物技术公司Strata Oncology宣布,推出针对实体肿瘤的泛癌症分析工具StrataNGS 3.0版,为医药公司的药物开发提供差异化解决方案。  Strata Oncology是由哈佛医学院和密歇根大学癌症基因组学、分子病理学和临床肿瘤学领域的领军人物创立,总部位于美国密歇根州。该

最全癌症基因图谱公布-有望提前数十年识别出肿瘤突变

  癌症是一种基因病,由体细胞癌基因突变引起。早在2001年对首个人类基因组进行测序后,肿瘤的全面基因组表征就成为癌症研究人员的一个主要目标。从那时起,测序技术和分析工具取得的进展使得这个研究领域蓬勃发展。  2月5日,Nature杂志及其子刊同期发表了20余篇关于癌症研究的文章,由来自37个国家、

全球癌症基因组图谱计划又一研究突破

  最近,发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中,来自从事癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)研究计划的科学家通过进行研究,对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析,并且对这种常见类型的肾癌进行了

Nature-Genetics公布又一大规模癌症基因组分析结果

  超过20个研究机构的63位研究人员公布了一项包括30,000多人血液样本的大规模研究成果,通过这项分析,研究人员确定了13种胶质瘤新遗传危险因素,这揭示了增加胶质瘤易感性的个体DNA的特殊差异,同时也首次为临床医师提供了一种能区分成胶质细胞瘤和非胶质母细胞瘤等胶质瘤类型的新方法。  这一研究成果

《科学》:基因组大规模筛选新技术助力癌症研究

3000种基因经初次筛选后,大约24个符合要求  多年来生物学家一直在搜寻癌细胞的弱点,以期找到对付癌症的线索。美国科学家近日研究出了一种基因组大规模筛选技术,有望提供一种强大的经济有效的方法以挑选出对付癌症的新药靶。相关论文发表在2月1日的《科学》(Science)上。 2005年,美国国立卫

Nature发布大规模癌症表观基因组研究成果

  科学家们鉴别出了有可能生成第4亚型髓母细胞瘤的细胞。新研究发现为这种最常见的脑肿瘤亚型开发出更有效的靶向疗法清除了一个障碍。他们的研究结果发布在1月27日的《自然》(Nature)杂志上。  圣犹大儿童研究医院发育神经生物学系的Paul Northcott,德国癌症研究中心(DKFZ)的Stef

利用DNA图谱诊断癌症

  作为无创产前诊断等相关领域技术的首创者,来自香港中文大学的卢煜明(DennisLo)教授最早就曾发现孕妇外周血中存在“漂流”的胎儿DNA,也就是说,假设每毫升母亲样品相当于1000个基因组,则总共含有1900条母亲的21号染色体,100条整倍体胎儿的21号染色体或150条21三体胎儿的21号染色

美大规模评估癌症病人临床和基因组数据

  英国《自然·遗传学》杂志1月15日在线发表的一项大型研究称,美国癌症中心展开了大规模癌症晚期患者临床数据和基因组数据评估,结果显示癌细胞的突变水平与患者接受检查点抑制剂治疗后的存活率相关。该研究意味着这一现象普遍存在于众多类型的癌症中,或有助于预测哪些患者将对这种免疫疗法应答良好。  人们一直致

抗癌树突状细胞实现大规模培养-推动癌症治疗

美法两国研究人员组成的团队14日在《细胞报告》杂志上发表论文称,他们开发出一种大规模培养多种类型树突状细胞的方法,或将推动多种类型癌症治疗的研究。 树突状细胞是一种专职抗原递呈细胞,能高效摄取、处理和传递抗原信息,将感知到的危险信号传递给淋巴细胞,诱发免疫反应。因树突状细胞处于人体免疫应答

癌症治疗新曙光:癌症建模

  现在科学家们将患者的肿瘤细胞接种到小鼠体内,进而建立肿瘤模型,以用于分析和开展药物测试。目前研究人员已鉴定了一系列小儿实体肿瘤模型,同时相关数据的允许免费获取。  罕见癌症的研究面临着两方面的挑战:可用的肿瘤样本少;缺乏相应的小鼠模型。最近科学家们非常成功地开发了将人类肿瘤细胞高效移植到免疫缺陷

溶瘤病毒疗法或将开启癌症治疗新视野

  溶瘤病毒是一类具有复制能力的肿瘤杀伤型病毒,近年来科学家们对溶瘤病毒疗法在癌症治疗领域的研究上产生了极大的兴趣,当然,他们也取得了很多研究成果,那么溶瘤病毒疗法到底是如何帮助有效抵御肿瘤进展呢?科学家们又是如何利用这种新型疗法或者同其它疗法联合来治疗癌症患者呢?如今溶瘤病毒疗法的研究现状又是如何

Cell推出四篇癌症免疫治疗精选综述

  尽管利用免疫系统来对抗癌症这一想法已存在了几十年,直到近年来才找到一些成功的治疗策略。通过操控免疫检查点和T细胞激活来发挥抗瘤活性,免疫疗法由最初在几种癌症类型中显示出治疗潜力,到现在已被应用至更广泛的恶性肿瘤中。近 日Cell杂志以“Harnessing Immunotherapy again

NIH-340万美元资助癌症基因组图谱研究计划

美国国立卫生研究院于当地时间7月2日宣布,决定对八个单位(或个人)进行为期两年、总值340万美元的资助,以支持癌症基因组图谱研究计划(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌症基因组图谱计划是美国国立癌症研究所和美国国家人类基因组研究的合作项目,于2005年晚期,

全球首份癌症病例图谱发布

  日前,《科学》杂志刊登了瑞典科学家的重磅成果——全球首份癌症病例图谱“Atlas”,将数千种特定癌症相关基因与患者生存情况联系起来,发掘出32种不以癌症类型分类、但与80%人类癌症相关的“公共”基因,可作为潜在新药研发的精准靶点。新图谱被认为是肿瘤临床实践革命性改进的重要推手。  据《麻省理工技

首个棉花泛基因组图谱助力分子育种

  近日,华中农业大学棉花遗传改良团队发表了题为“Cotton pan-genome retrieves the lost sequences and genes during domestication and selection”的研究论文,公布了目前为止变异类型最丰富的棉花遗传变异数据集。文章

最大规模泛癌种脉管系统全息细胞图谱构建

重庆大学附属三峡医院印明柱教授团队首次构建了最大规模的泛癌种脉管系统全息细胞图谱,为充分理解肿瘤血管生成的复杂过程提供了全景视角,同时为临床肿瘤精准治疗提供了科学依据。相关成果在线发表于国际学术期刊《自然》上。  “肿瘤的发生与进展和血管的生成息息相关。”印明柱解释道,血管像人体内的交通系统。肿瘤作

1300多名学者合作-迄今最全面癌症基因组分析完成

  英国韦尔科姆基金会桑格研究所5日宣布,一个国际团队完成了迄今覆盖面最广泛的癌症全基因组分析,这有助于加深研究人员对癌症的认识,为开发出更高效的治疗方案铺平道路。这个被称为“泛癌症计划”的项目由来自37个国家的1300多名科学家合作开展,旨在研究可导致癌症的变异基因,绘制出这些基因的全图谱,桑格研

液体活检开启癌症早期诊断大门

   肺部活检是一个侵入性的痛苦过程,对一位80岁的老太太来说尤其如此。但是通过穿刺性检查,肿瘤学家Geoffrey Oxnard给患者开出了一种相对应的靶向药物。经过治疗,患者的肿瘤似乎消失了。  然而,一段时间后,这位80岁的老人又带着病痛再次来到Oxnard的诊所。医疗诊断表明,癌症又回来了,

液体活检开启癌症早期诊断大门

  肺部活检是一个侵入性的痛苦过程,对一位80岁的老太太来说尤其如此。但是通过穿刺性检查,肿瘤学家Geoffrey Oxnard给患者开出了一种相对应的靶向药物。经过治疗,患者的肿瘤似乎消失了。  然而,一段时间后,这位80岁的老人又带着病痛再次来到Oxnard的诊所。医疗诊断表明,癌症又回来了,而

Nature子刊:非编码RNA癌症药物基因组图谱新突破

  近日,匹兹堡大学药物遗传研究中心的杨达和张敏课题组借力于一种名为弹性网络回归(Elastic Net regression)的机器学习模型,从1,001个肿瘤细胞系的高通量长非编码RNA表达谱(long noncoding RNAs, lncRNAs)与265种抗癌药物敏感性数据中,挖掘出了27

Science推出专刊:癌症免疫疗法

  最新一期(4月3日)Science杂志推出了癌症免疫疗法专刊,介绍了近期癌症免疫疗法方面的各种进展,尤其指出一种改变游戏规则的癌症免疫疗法也许能用于治疗某些患有特定癌症类型的患者。  在这一专刊中, 有5篇文章提出了目前这一研究领域保持进展所需的要素,Ton Schumacher等人探讨了在同期

CollabRx公司:-推出分析工具角逐癌症基因测序市场

  位于旧金山的生物技术公司 CollabRx宣布将要竞逐癌症基因测序市场,公司目前推出了一套Genetic Variant Annotation (GVA)的服务软件,能帮助研究人员分离定位并鉴定癌症基因。利用生物信息学确定癌症基因已经成为癌症研究人员研究的重要途径之一,因此也使得这个领域成为

首张癌症驱动突变图谱绘成

新突变图谱揭示关键癌症基因的微小变化如何显著改变肿瘤生长模式。图片来源:美国《每日科学》网站癌症驱动突变是指某些基因突变能直接推动正常细胞向癌细胞转化。一个国际科研团队绘制出全球首张完整的癌症驱动突变图谱,揭示了癌症关键基因中数百种突变如何影响肿瘤生长。当与真实患者数据比对时,这张图谱能准确预测癌症