《科学》:DNA绕个圈转录转向

在玩具赛车轨道游戏里,出老千的玩家会扳动开关,让他们对手的车辆进入一个循环轨道,从而赢取比赛。细胞也会这一招――改变“轨道”布局,影响细胞功能,来自欧洲分子生物学实验室(EMBL)和牛津大学的科学家们发现通过形成或撤销基因环结构(gene loops),细胞能调控转录机器,控制它是沿着遗传物质的一个方向还是两个方向前进。 “我们发现基因环可以将双向启动子变成单向系统,”领导这项研究的Lars Steinmetz说。 三年前,Steinmetz实验室发现当转录机器定位在大部分基因启动子(标记转录开始位置的序列)上的时候,它不仅会沿着基因的方向移动,而且也会朝着相反的方向,DNA的另外一条“路”移动。而当时令他们感到有点惊讶的是,这种现象并不是无处不在的,一些基因似乎其启动子只能朝着一个方向。 同一期间,英国牛津大学的Nicholas Proudfoot研究组则发现基因能弯曲成一个环,从而当转录机器到达......阅读全文

微生物所在链霉菌启动子元件和内参基因研究中获进展

  链霉菌是重要的抗生素产生菌,对链霉菌进行代谢工程和合成生物学改造需要大量不同强度的启动子元件。然而,前期链霉菌只有一个组成型启动子ermEp* 被广泛应用。中国科学院微生物研究所杨克迁课题组在2013年开发了活性明显高于ermEp* 的强启动子kasOp*(Appl. Environ. Micr

原核表达载体的重要调控元件(启动子、SD序列与终止子)

1.启动子 启动子是DNA链上一段能与RNA聚合酶结合并起始RNA合成的序列,它是基因表达不可缺少的重要调控序列。没有启动子,基因就不能转录。由于细菌RNA聚合酶不能识别真核基因的启动子,因此原核表达载体所用的启动子必须是原核启动子。 原核启动子是由两段彼此分开且又高度保守的核苷酸序列组成,

病毒和宿主细胞启动子新认识有望开发出新的HIV治愈策略

  启动子是基因的一个重要的组成部分,控制着基因表达(转录)的起始时间和表达的程度。在一项新的研究中,来自美国伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的研究人员首次证实病毒和宿主在它们的启动子上都具有高度类似的调节序列。相关研究结果于2017年5月2日在线发表在Nature Communications期刊上,

研究可视化观察增强子和启动子的动态运动控制基因活性

  尽管密集地排列在细胞核中,但储存我们遗传信息的染色体总是处于运动状态。这使得染色体的特定区域能够被接触到,从而激活一些基因。在一项新的研究中,来自奥地利科技学院、美国普林斯顿大学和法国巴斯德研究所的研究人员可视化观察这一动态过程,并对DNA的物理特性提出了新的见解。相关研究结果发表在2023年6

用碱性磷酸酶启动子和信号序列分泌表达外源蛋白实验

            实验材料 大肠杆菌菌株 pTA1529 或 pBAce 阳性对照质粒 试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色

用碱性磷酸酶启动子和信号序列分泌表达外源蛋白实验

实验材料 大肠杆菌菌株pTA1529 或 pBAce阳性对照质粒试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液微量营养MOPS 盐中性磷酸盐缓冲液SDS 凝胶加样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶靶基因或 cDNA 片段诱导培养基 LB 琼脂平板LB 培养基仪器、耗材 Sorvall GSA 转头或相当的转头

用-IPTG-诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因实验

实验材料 带有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的适于转化的大肠杆菌菌株IPTG 诱导的表达载体试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液IPTGSDS 凝胶加样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶靶基因或 cDNA 片段LB 琼脂平板LB 培养基仪器、耗材 SorvallGSA 转头或相当的转头沸水

用-IPTG-诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因实验

本方案将在疑难解析和诱导启动子表达蛋白的优化部分讨论影响质粒表达效率的因素。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料带有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的适于转化的大肠杆菌菌株IPTG 诱导的表达载体试剂、试剂盒考马斯亮蓝染色溶液或

用-IPTG-诱导启动子在大肠杆菌中表达克隆化基因实验

            实验材料 带有 lacIq 或 lacIq1 等位基因的适于转化的大肠杆菌菌株 IPTG 诱导的表达载体 试剂、试剂盒

用碱性磷酸酶启动子和信号序列分泌表达外源蛋白实验

本实验介绍关于用碱性磷酸酶启动子(phoA) 和信号序列在大肠杆菌中分泌表达外源蛋白的过程。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实验材料大肠杆菌菌株pTA1529 或 pBAce阳性对照质粒试剂、试剂盒考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液微量营养MOP

中科院获关于水稻组蛋白脱乙酰化酶基因启动子发明ZL

  7月15日,由中科院华南植物园段俊等科研人员完成的“一种水稻组蛋白脱乙酰化酶基因HDT701启动子及其应用”获得国家发明ZL授权(ZL号:ZL201110327877.8)。   启动子是指DNA分子上能与RNA聚合酶结合并形成转录起始复合体的区域,通常位于编码基因的上游。在启动子片段中存在大

用-T7-噬菌体启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

实验材料 大肠杆菌菌株 HMS174(DE3) 或 BL21(DE3)pET 载体或同类载体阳性对照质粒试剂、试剂盒 考马斯亮蓝染色溶液或银染溶液IPTGSDS 凝胶加样缓冲液SDS-聚丙烯酰胺凝胶靶基因或 cDNA 片段NZCYM 琼脂平板NZCYM 培养基仪器、耗材 SorvallGSA 转头或

用-T7-噬菌体启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

Tabor 和 Richardson 在 1985 年及 Studier 和 Moffatt 在 1986 年提出了一个新的利用 T7 噬菌体启动子的表达系统,使用的是从 T7 噬菌体基因组获得的转录信号。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。实

用-T7-噬菌体启动子在大肠杆菌中表达克隆基因实验

            实验材料 大肠杆菌菌株 HMS174(DE3) 或 BL21(DE3) pET 载体或同类载体 阳性对照质粒 试剂、试剂盒

华人学者首次直接证明基因启动子非正常甲基化会引发癌症

  根据最近在Journal of Clinical Investigation发布的一篇研究论文,基因甲基化水平改变是肿瘤发生的一个独立因素。  美国贝勒医学院的研究者把一段可以诱导甲基化发生的人源基因序列通过转基因技术重组到小鼠基因组中的一个抑癌基因p16基因上游,结果有27%的转基因小鼠出现了

徐彦辉组揭示转录起始复合物识别启动子及动态组装机制

   4月1日,《科学》在线发表了复旦大学生物医学研究院研究员徐彦辉课题组的一篇研究长文,首次报道了包含TFIID的完整转录前起始复合物(PIC)结构,揭示了PIC如何识别不同类型启动子并完成多步组装的完整动态过程。  “徐彦辉团队在《科学》发表的论文中,解析了25种复合物冷冻电镜结构,涵盖了不同P

揭秘胚胎发育奥秘!为何发育中胚胎细胞彼此并不相同?

  近日,一项刊登在国际杂志Molecular Cell上的研究报告中,来自纽约大学的科学家们通过研究阐明了在胚胎发育(embryogenesis)过程中细胞变得彼此不同的分子机制,相关研究结果或能帮助阐明胚胎发育的遗传规律,同时也能帮助理解疾病发生和出生缺陷的原因。图片来源:commons.wik

如何做原核表达(prokaryotic-expression)(二)

几个常用的启动子和诱导调控表达系统最早应用于的表达系统是Lac乳糖操纵子,由 启动子Plac + 操纵基因lacO +结构基因组成。其转录受CAP正调控和lacI负调控。lacUV5突变能够在没有CAP的存在下更有效地起始转录,该启动子在转录水平上只受lacI 的调控,因而随后得到了更广泛采用。la

Nature子刊发布最全面的基因组“通讯录”

  启动子是控制基因开或关的关键DNA片段,它们的功能异常与多种疾病有关。科学家们在人类基因组中全面分析了启动子和增强子的远距离互作,绘制了迄今为止最全面的启动子互作图谱,有助于进一步理解疾病的遗传学基础。  这份图谱记录了上百万的启动子互作。“这就像是一本通讯录,现在我们知道通讯录中谁和谁在通话,

双荧光素酶报告基因检测实验技术服务

1、  实验简介Luciferase报告基因系统是以 荧光素(luciferin) 为底物来检测 萤火虫荧光素酶 (fireflyluciferase)活性的实验。荧光素底物会在荧光素酶作用下会发光(波长540-600nm),且光强能反应荧光素酶的表达量。荧光素酶的蛋白表达量与启动子活性、mRNA的

双荧光素酶报告基因检测实验技术服务

1、  实验简介Luciferase报告基因系统是以 荧光素(luciferin) 为底物来检测 萤火虫荧光素酶 (fireflyluciferase)活性的实验。荧光素底物会在荧光素酶作用下会发光(波长540-600nm),且光强能反应荧光素酶的表达量。荧光素酶的蛋白表达量与启动子活性、mRNA的

真核基因转录水平的调控1

一、真核生物的RNA聚合酶有三种RNA聚合酶:RNA聚合酶Ⅰ;RNA聚合酶Ⅱ;RNA聚合酶Ⅲ。二、真核基因顺式作用元件(一)、顺式作用元件概念指DNA上对基因表达在调节活性的某些特定的调控序列,其活性仅影响其自身处于同一DNA分子上的基因。(二)、种类启动子、增强子、静止子1、启动子的结构和功能启动

关于增强元件因子的基本信息介绍

  增强元件因子是存在于高等真核生物和各种病毒的基因组中的一种DNA序列。通常位于基因转录起始位点的上游,在与专一的转录因子结合后能提高该基因的转录水平。与启动子不同,单独的增强元件因子不足以使基因表达。它们在两个方向和与启动子的任何距离处都能发挥作用。  与增强元件因子不同的是,启动子是基因(ge

在大肠杆菌中高效表达外源蛋白的策略

  本世纪60至70年代对大肠杆菌的研究使之成为自然界中最普遍为人们所认识的生物体。    大肠杆菌具有两个显著特征:操作简单和能在廉价的培养基中高密度培养,它的这些特征加上十多年外源基因表达的经验使其在大多数科研应用中成为高效表达异源蛋白最常用的原核表达系统。尽管大肠杆菌有众多的优点,但并非每一种

生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制

  7月12日,中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》(Nature)上,在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。  转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中,增

关于顺式作用元件的简介

  顺式作用元件是指与结构基因串联的特定DNA序列,是转录因子的结合位点,它们通过与转录因子结合而调控基因转录的精确起始和转录效率。  在分子遗传学领域,相对同一染色体或DNA分子而言为“顺式”(cis);对不同染色体或DNA分子而言为“反式”(trans)。  顺式作用元件是转录调节因子的结合位点

简述前起始复合体形成的步骤

  1、TATA结合蛋白 (TBP,TFIID的一个亚基) 与启动子结合;   2、TFIIA与启动子结合;   3、TFIIB与启动子结合;   3、RNA聚合酶II和TFIIF与启动子结合;   4、TFIIE加入复合体,并吸引TFIIH,有ATP酶及解链酶活性;   5、亚基中有AT

RNAi在基因治疗领域中的应用

RNAi作为一种高效的序列特异性基因剔除技术在传染性疾病和恶性肿瘤基因治疗领域发展极为迅速。在利用RNAi技术对HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等进行基因治疗研究中发现,选择病毒基因组中与人类基因组无同源性的序列作为抑制序列可在抑制病毒复制的同时避免对正常组织的毒副作用。同时将抑制序列选择在特定的位点,

概述RNAi在基因治疗领域中的应用

  RNAi作为一种高效的序列特异性基因剔除技术在传染性疾病和恶性肿瘤基因治疗领域发展极为迅速。在利用RNAi技术对HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等进行基因治疗研究中发现,选择病毒基因组中与人类基因组无同源性的序列作为抑制序列可在抑制病毒复制的同时避免对正常组织的毒副作用。同时将抑制序列选择在特定的位

RNAi在基因治疗领域中的应用

RNAi作为一种高效的序列特异性基因剔除技术在传染性疾病和恶性肿瘤基因治疗领域发展极为迅速。在利用RNAi技术对HⅣ-1、乙型肝炎、丙型肝炎等进行基因治疗研究中发现,选择病毒基因组中与人类基因组无同源性的序列作为抑制序列可在抑制病毒复制的同时避免对正常组织的毒副作用。同时将抑制序列选择在特定的位点,