微生物所在链霉菌启动子元件和内参基因研究中获进展
链霉菌是重要的抗生素产生菌，对链霉菌进行代谢工程和合成生物学改造需要大量不同强度的启动子元件。然而，前期链霉菌只有一个组成型启动子ermEp* 被广泛应用。中国科学院微生物研究所杨克迁课题组在2013年开发了活性明显高于ermEp* 的强启动子kasOp*（Appl. Environ. Microbiol. 2013；79(14):4484-92）。目前，kasOp* 已经被提供给多个国内、外的链霉菌研究组使用，同时也在该所张立新课题组和娄春波课题组的相关工作中得到应用（Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015；112(39):12181-6）。 为了得到具有不同序列、不同强度特征系列组成型启动子，杨克迁课题组从天蓝色链霉菌不同培养条件下的时序转录组数据出发，经过一系列理性的分析遴选和实验验证，获得了166个不同强度的组成型启动子(图1)。这些启动子将为链霉菌合成生物学研究提供元件支撑。相关工作发表......阅读全文
微生物所在链霉菌启动子元件和内参基因研究中获进展
链霉菌是重要的抗生素产生菌，对链霉菌进行代谢工程和合成生物学改造需要大量不同强度的启动子元件。然而，前期链霉菌只有一个组成型启动子ermEp* 被广泛应用。中国科学院微生物研究所杨克迁课题组在2013年开发了活性明显高于ermEp* 的强启动子kasOp*（Appl. Environ. Micr
启动子元件的功能
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列,可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别,从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
核心启动子元件的定义
中文名称核心启动子元件英文名称core promoter element定 义真核生物基因启动子中介导基因转录起始的最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列,大小约为40个核苷酸。含有TATA框,起始子(Inr),TFⅡB识别元件(
天蓝色链霉菌的基因特征
天蓝色链霉菌（Streptomyces coelicolor）基因组，也是迄今最大的微生物基因组的测序工作，该基因组中蕴藏着令人惊奇而又大有前途的基因组特征。科学家们力图将该细菌转化成更佳的药物开发工具。 天蓝色链霉菌是生产三分之二用于医药的天然抗生素以及共9000余种具生物活性物质的链霉菌大
启动子元件的基本特征
中文名称启动子元件英文名称promoter element定 义启动子中的一些顺式作用序列，可以位于启动子的任何方向和任何位置(上游或下游)。可以被一些转录因子所识别，从而调节启动子的活性。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），基因表达与调控（二级学科）
核心启动子元件的基本定义
中文名称核心启动子元件英文名称core promoter element定 义真核生物基因启动子中介导基因转录起始的最小的一段连续DNA序列。RNA聚合酶Ⅱ识别的启动子通常包含转录起始位点及其上游或下游约35个核苷酸的序列，大小约为40个核苷酸。含有TATA框，起始子(Inr)，TFⅡB识别元件(
微生物所链霉菌次级代谢产物产量的适配策略研究获进展
链霉菌能产生丰富的次级代谢产物，目前临床上应用的抗生素约三分之二由该属微生物产生，因此链霉菌被称为药物合成的天然细胞工厂。然而，自然界分离得到的野生链霉菌抗生素合成水平很低，难以满足产业化的要求；已产业化的工程菌株需要不断提高产量，以降低生产成本。因此，如何获得链霉菌高产菌株成为几十年来对其进行
顺式作用元件的结构启动子的介绍
原核操纵子中启动序列的同义语。真核基因启动子是RNA聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件，每一组件含7~20bp的DNA序列。启动子包括至少一个转录起始点以及一个以上的机能组件。在这些机能组件中最具典型意义的就是TATA盒，它的共有序列是TATAAAA。TATA盒通常位于转录起始点上游-25~-
真核生物上游启动子元件包括哪些
真核生物启动子有三类，分别由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ进行转录。 类别Ⅰ（class Ⅰ）启动子： 只控制rRNA前体基因的转录，转录产物经切割和加工后生成各种成熟rRNA。 类别Ⅰ启动子由两部分保守序列组成： 核心启动子（core promoter）：位于转录起点附近，从-45至+20； 上游控制元件
链霉菌，你了解多少？
放线菌目的一科。基内菌丝不断裂，气生菌丝通常发育良好，形成长（有时短）的孢子丝。孢子不能运动，外鞘上常有疣、刺或毛发等状饰物。简介链霉菌（Streptomycetaceae）是最高等的放线菌。放线菌目的一科。有发育良好的分枝菌丝，菌丝无横隔，分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。孢子丝再形成分生孢子
什么是链霉菌属？
链霉菌属（Streptomyces）共约1000多种，其中包括和很多不同的种别和变种。它们具有发育良好的菌丝体，菌丝体分枝，无隔膜，直径约0.4~1微米，长短不一，多核。菌丝体有营养菌丝、气生菌丝和孢子丝之分，孢子丝再形成分生孢子。孢子丝和孢子的形态因种而异，这是链霉菌属分种的主要识别性状之一。
链霉菌，你了解多少？
简介 链霉菌（Streptomycetaceae）是最高等的放线菌。放线菌目的一科。 有发育良好的分枝菌丝，菌丝无横隔，分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。孢子丝再形成分生孢子。 孢子丝和孢子的形态、颜色因种而异，是分种的主要识别性状之一。已报道的有千余种，主要分布于土壤中。爱医培
链霉菌，你了解多少？
简介 链霉菌（Streptomycetaceae）是最高等的放线菌。放线菌目的一科。 有发育良好的分枝菌丝，菌丝无横隔，分化为营养菌丝、气生菌丝、65孢子丝。孢子丝再形成分生孢子。 孢子丝和孢子的形态、颜色因种而异，是分种的主要识别性状之一。已报道的有千余种，主要分布于土壤中。爱医培
什么是内参基因
这个概念一般是用在定量PCR中。定量PCR是要检测某个基因的表达，降低或者提高，但是当你得出结果以后，你并不知道是它本身的表达降低/提高了，还是你操作过程中造成的误差（比如提RNA时的损失），所以这个时候需要同时检测另外的基因作为参照。这个基因就是内参基因，这类基因是生物体或者细胞中稳定表达的基因，
蓝色链霉菌中筛选出活性基因簇
荷兰格罗宁根大学的研究人员利用基因挖掘法从蓝色链霉菌中发现了一组活性基因簇，通过该基因簇可制造出无耐药性的新型抗生素，该研究有望为链霉菌的药用开发提供一条新思路。相关研究发表在最新一期《微生物学》杂志上。 链霉菌是生活在土壤中的一种常见细菌，其家族包含多种细菌。不同于其他细
目的基因的Ct值小于内参基因，这个内参基因还能用吗
如何通过荧光定量目的基因和GAPDH计算相对表达量内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因，又叫看家基因，比如常用的GAPDH， actin。或者18s rRNA也可以。如果内参表达量一致，说明你PCR的上样量一致，样本的质量也一致。如果出入很大，说明你的样本的浓度或者是质量有问题。测到的目的基
目的基因的Ct值小于内参基因，这个内参基因还能用吗
如何通过荧光定量目的基因和GAPDH计算相对表达量内参就是一个表达量在各个组基本保持不变的基因，又叫看家基因，比如常用的GAPDH， actin。或者18s rRNA也可以。如果内参表达量一致，说明你PCR的上样量一致，样本的质量也一致。如果出入很大，说明你的样本的浓度或者是质量有问题。测到的目的基
链霉菌天然产物沉默基因簇激活方法开发获进展
近日，中国科学院南海海洋研究所研究员张长生团队在国家重点研发计划、国家自然科学基金等项目的资助下，在链霉菌天然产物沉默基因簇的激活方法开发中取得新进展。相关成果发表于《代谢工程》（Metabolic Engineering）。采用kasOp*-KCl协同策略激活海洋链霉菌中沉默天然产物生物合成基因簇
链霉菌属的分类介绍
中科院微生物研究所根据气生菌丝（孢子堆）的颜色、基内菌丝的颜色、可溶性色素、孢子丝的形状、孢子的形状和表面结构等特征，将本属分为14个种组，每个种组又包括许多不同的种，以此做为链霉菌属各种的鉴定和寻找新的抗生素产生菌的依据。主要代表如产生链霉素的灰色链霉菌。
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...（三）
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量以上结果表明同时删除shbR1/shbR3能够完全抑制adpA-H转录，增加井冈霉素产量。5. 同时突变后转录分析为了研究shbR1/shbR3缺失对细胞代谢的影响，本研究采用RNA测序对野生型以及shbR1/shbR3同时突变菌株进行
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...（二）
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量2. afsA及arpA同系物参与井冈霉素生物合成分别删除afsA以及arpA同系物。shbA1失活导致井冈霉素产量下降超过90%；ShbA2和shbA3失活分别导致产量下降77%和61%（Fig 3A）。ΔshbR1和Δshb
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因...（一）
通过串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素产量摘要 γ丁内脂（γ-butyrolactone简称GBL）生物合成基因afsA和GBL受体基因arpA的两对同系物位于吸水链霉菌基因组的不同位置。井冈霉素是一种重要的抗菌抗生素，同时也是抗糖尿病药物合成的关键底物。抑制afsA能够使急剧
研究发现甘蔗杆状病毒启动子及其顺式作用元件
近日，广东省科学院南繁种业研究所联合福建农林大学国家甘蔗工程技术研究中心、法国国际农业研究中心，研究发现受干旱诱导的新型甘蔗杆状病毒启动子及其顺式作用元件。相关成果在线发表于《通讯生物学》（Communications Biology）。全球气候变化导致极端天气频发，其中干旱是影响作物生长和生产力的
关于链霉菌属的分布介绍
链霉菌主要分布于含水量较低、有机质含量丰富的中性或微碱性土壤中，多数为腐生+好气性异养菌。由于能产生大量的孢子，故有较强的抗干燥能力。链霉菌孢子对热的抵抗力比细菌芽胞弱，但强于营养体细胞。对链霉菌的保藏一般利用沙土法，在4℃的冰箱中可存活1~3年。
链霉菌属的重要作用
链霉菌的次级代谢产物种类丰富，最重要的就是产生抗生素。现发现由链霉菌产生的抗生素有1000多种，已经应用于临床的近百种，如链霉素(streptomycin)、卡那霉素(kanamycin)、丝裂霉素(mitomycin)，土霉素(oxytetmcycline)等。有的链霉菌能产生多种抗生素，还有
基于液滴微流控的链霉菌高通量筛选技术平台面世
链霉菌是重要的工业微生物，可以生产蛋白、小分子药物等高附加值产品。工业生产中，常用随机诱变手段产生大量的链霉菌突变库，但缺乏与之相适配的高通量筛选手段用以获得目标突变株。已报道的基于流式细胞分选的方法只能对链霉菌的原生质体或孢子进行筛选，由于抗生素等次级代谢产物多产生于菌丝发酵的平台期，因而原生
关于PCR内参基因选择策略
关于内参基因的选择很多初级的实验人员很少会去思考这个问题，因为摆在面前的只有两种选择，β-actin和GAPDH，甚至在很多人长期的观念中对于内参的认知也仅仅停留在是一个表达量相对较高较稳定的看家基因，对于分子层面相对表达量的一个重要参照而已，至于为什么要选这两种，还有没有其他的内参，人们的回答往往
关于PCR内参基因选择策略
关于内参基因的选择很多初级的实验人员很少会去思考这个问题，因为摆在面前的只有两种选择，β-actin和GAPDH，甚至在很多人长期的观念中对于内参的认知也仅仅停留在是一个表达量相对较高较稳定的看家基因，对于分子层面相对表达量的一个重要参照而已，至于为什么要选这两种，还有没有其他
串联删除吸水链霉菌5008的γ丁内脂受体基因提高井冈霉素
γ丁内脂（γ-butyrolactone简称GBL）生物合成基因afsA和GBL受体基因arpA的两对同系物位于吸水链霉菌基因组的不同位置。井冈霉素是一种重要的抗菌抗生素，同时也是抗糖尿病药物合成的关键底物。抑制afsA能够使急剧降低井冈霉素的生物合成，删除arp同系物能够分别增加井冈霉素的产率
基因内启动子的定义
中文名称基因内启动子英文名称intragenic promoter定 义被RNA聚合酶III识别的基因内的一段DNA序列。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)