美国加州大学洛杉矶分校物理学院院长访问上海生科院
9月20日，美国加州大学洛杉矶分校物理学院院长Joseph Rudnick教授及该学院黄焕中教授访问中科院上海生命科学研究院。 上海生科院院长助理廖侃研究员介绍了上海生科院的建设发展、研究领域、科研成果、人才队伍、国际合作等情况。计算生物学所杨力研究员向来宾介绍了研究所概况。Rudnick院长也介绍了加州大学洛杉矶分校物理学院相关情况。双方就生命科学与物理学的交叉、结合等共同感兴趣的话题展开了交流。 来宾此行还参观了计算生物学所量化生物学平台，并访问了生化与细胞所丛尧研究员实验室。 参观计算生物学所技术平台 访问丛尧研究员实验室......阅读全文
“计算生物学与生物信息学术研讨会”在基因组所召开
随着生命科学研究及基因测序等相关技术的飞速发展，计算生物学的重要性和复杂性在当前生物学数据量的不断增长中日益显现，并逐渐成为现代生物学研究的核心方法之一。为了推动国内相关研究单位间计算生物学和生物数据库等领域的交流与合作，10月27日至28日，中科院北京基因组研究所召集国内外众多
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能
安捷伦科技生物信息学套装新增整合生物学分析功能 GeneSpring 现可实现通路水平的多组学及新一代测序数据分析 2012 年 3 月 27 日，加利福尼亚州圣克拉拉市——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)今日发布了其广受欢迎的生物信息学软件的重要扩展版本
安捷伦科技将生物信息学系统扩展为综合生物学套装
2010年 11 月 15 日，北京 — 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日发布了，这是广泛使用的生物信息学软件的扩展版，能够对多种类型的生物学数据进行可视化和分析。目前 GeneSpring GX 11.5 是首款可同时对外显子芯片、蛋白组学和代谢组学实验进行解读的软件，该工具
第五届全国生物信息学大会召开
第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会日前在哈尔滨召开，来自海内外的600余位生物信息学专家、学者出席会议。与会专家以“高通量时代的生物信息学与系统生物学”为主题，分别就利用基因组信息学分类细菌的新方法、细菌基因组组织形式、系统生物学在医学发展中的应用和研究策略以及基因组非编码
北京生命科学论坛第八次会议召开
探寻数学与生物学的交叉学科生长点 北京生命科学论坛——数学与生物学交叉应用研究学术研讨会近日在京召开。此次会议由中国科学院北京生命科学研究院与中国科学院数学与系统科学研究院共同主办。会议以数学与生物学交叉应用为主题，中科院院士陈润生、马志明担任本次大会主席。 据了解，以倡导学科交叉融合为宗旨，以
计算生物学所量化生物学平台正式投入运行
近日，中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所量化生物学平台（Omics Core）正式投入运行。平台配备有Illumina HiSeq 2000测序系统和相关仪器设备，该测序系统将文库DNA/cDNA片段附着到特殊处理的光学透明玻璃表面（即Flow cell），并采用可逆终止法边
陈润生院士等获颁中国生物信息学终身成就奖
9月27日，第九届全国生物信息学与系统生物学学术大会在上海开幕。在为期2天半的会议期间，来自全国各地的700余名专家学者代表，将围绕“新冠病毒研究与转化医学信息学”“单细胞组学分析方法与应用”“人工智能与生物信息学”和“脑科学与生物信息学”等生物信息学诸多传统与新兴领域进行研讨与交流。 中国科
生物信息学教程
Sequence - Evolution - FunctionComputational Approaches in Comparative GenomicsbyEugene V. KooninNational Center for Biotechnology Information, Bethes
中科院七研究所联手迎接新的测序时代
9月10日，中国科学院北京生命科学研究院(筹)第一届生物信息学研讨会在京举行。记者从会上获悉，正在筹备的中科院北京生命科学研究院将把中科院京区7个相关研究所整合起来“迎接新的测序时代”。会上，筹备工作组研究员康乐介绍了中国科学院北京生命科学研究院 (筹)的情况。 据康乐介绍，中国科学院北京生命科学
许锦波当选国际计算生物学学会Fellow
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503301.shtm近日，国际计算生物学学会（ISCB）发布消息，计算生物学家、清华大学智能产业研究院卓越访问教授许锦波当选ISCB Fellow，当选理由为“通过开创全新计算方式及软件程序，为蛋白质结构
生物信息学新进展
计算机技术和人类基因组计划的发展，应运而生了一门新兴的学科——生物信息学，该学科包含了两个交叉领域的工作：用于建立现代生物学所需信息系统框架（支持生物学的信息管理系统、分析工具和通讯网络）的研究开发工作，即传统意义上的生物信息学（bioinformatics）；旨在理解基本生物学问题的基于计算的研究
生物信息学技术的原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展，已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析，而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
学科“交叉”比交叉学科更重要
■王义遒 ◎ 形成交叉学科要有相对固定、共同且比较复杂的科学或技术研究对象。 ◎ 不同学科的领头人必须对母学科有相当深入的理解，能掌握其精神实质和处理问题方法的精髓，并具有一定的融合能力。 ◎ 交叉学科成员应与母学科保持经常性联系，不断从母学科中获得新知识、新技术的滋养，并在交叉学科中发挥
奇拉实验室在计算生物学所成立
王学才和Kirstin Augsburg共同为实验室揭牌 9月16日上午，奇拉实验室在上海生命科学研究院计算生物学所内正式挂牌成立。计算生物学所执行所长金力、党总支书记兼副所长王学才、德国驻沪总领事馆文化事务与新闻领事Kirstin Augsburg、领事Fredric Jor
NSF斥巨资－计算机助力植物生物学研究
就像谷歌地球能够让你从空中放大自己的家一样，有朝一日，或许只需要点击几下鼠标，研究人员便能够在植物的整个生态系统与分子结构之间任意切换。1月30日，美国国家科学基金会（NSF）向5家研究机构提供了5000万美元的资金，这些钱将用于研制那些联系和分析多领域数据的软件和硬件，旨在实现解答有关植物复杂问题
生物学,崛起的下一代计算平台
Synhego公司距离Facebook总部仅五分钟车程，从外观来看，它和硅谷的其他创业公司并无差异，但是在它米色的办公园区里，一模一样的黑色服务器机架整齐地排列着，灯光闪烁，发出呼呼的排气声，然而这些金属架子里并没有零件在驱动网络的运行。这些机器正在利用分子改写生代码。 Crispr是一种
生物医学遭遇大数据－复合型人才缺乏待解决
目前获取海量数据变得越来越方便，但一家机构与另一家产生的资料有很多差别，把这些信息集中分析时就需要一个共同的标准。 标准化虽然艰难，但与会的业内人士普遍认为，当务之急是解决生物医学和信息科学兼通的复合型人才缺乏困境。 大数据时代正在深刻影响生物医学研究：海量数据需要在不同系统
生物信息学技术的技术原理
生物信息学在生命科学研究中起着越来越重要的作用。利用生物信息学对蛋白质组的各种数据进行处理和分析，也是蛋白质组研究的重要内容。生物信息学是蛋白质组学研究中不可缺少的一部分。生物信息学的发展，已不仅是单纯的对基因组、蛋白质组数据的分析，而且可以对已知的或新的基因产物进行全面分析。在蛋白质组数据库中储存
生物信息学—促动BT与IT双赢
无论是与结构基因组学对应的“基因时代”，还是与功能基因组学、蛋白质组学相应的“后基因时代”；无论你称呼21世纪是“信息时代”、“后信息时代”，还是“生物时代”，所有这一切，都将BT(生物技术)与IT(信息技术)紧密结合起来。而这其中，无疑“生物信息学”占据了天时地利、出尽了风头，虽然它自身及其相
计算生物学研究所“蛋白建模”学习班举办
Juergen Schlitter教授讲课中 6月7日至11日，中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中科院计算生物学重点实验室举办了为期一周的“Protein Modeling” 学习班。学习班面向生科院各所研究生开放，来自全院的多名研究生参加了学习培训。 学习班由
高校如何发力交叉学科研究
促进交叉学科研究是世界高水平研究型大学的共同发展趋势与重要发展策略。近年来，随着我国高校“双一流”建设深化推进，国家政策层面对高校开展交叉学科研究的重视程度不断提升。《统筹推进世界一流大学和一流学科建设实施办法》《关于高等学校加快“双一流”建设的指导意见》《关于深入推进世界一流大学和一流学科建设
聚焦交叉学科：尴尬源自分化思维
在国际上，交叉学科的地位越来越重要，但在我国，交叉学科研究和管理方面均存在诸多问题：科研前景广阔但难以申请项目，研究成果丰硕但评价标准难以统一，学科地位显要却缺乏人才培养体系。 为此，本报将刊发系列报道，从交叉学科的科研环境、科研人员生存现状和完善学科管理体系三方面问题入手，探讨和反思交叉
摆脱简单叠加－交叉学科如何真正融合
国家纳米中心主任赵宇亮院士长期从事纳米材料的安全性研究。他在国际上率先提出纳米材料安全性问题，创建了我国首个纳米生物效应与安全性实验室，是国际公认的纳米毒理学和纳米药物领域的开拓者。 这位曾经的核物理学家深切地感受到科学交叉融合的重要性——在过去的十多年间，他一直
摆脱简单叠加－交叉学科如何真正融合
国家纳米中心主任赵宇亮院士长期从事纳米材料的安全性研究。他在国际上率先提出纳米材料安全性问题，创建了我国首个纳米生物效应与安全性实验室，是国际公认的纳米毒理学和纳米药物领域的开拓者。 这位曾经的核物理学家深切地感受到科学交叉融合的重要性——在过去的十多年间，他一直从事纳米药物运输技术的研究
交叉学科发展仍需营造良好生态
近年来，随着我国科技研发与人才培养形式的变化，以及创新型国家建设的发展需求，交叉学科的重要性日益凸显。“厚实学科基础，培育新兴交叉学科生长点”也成为我国在国家层面对于学科发展提出的要求。 应该说，我国交叉学科的发展历史虽然不及某些西方国家悠久，但早在上世纪80年代，我国已经看到交叉学科的重要性
“面向蛋白质科学的高性能计算研究”项目通过验收
验收会现场 4月17日至18日，中国科学院计划财务局会同信息化工作领导小组办公室和高技术研究与发展局组织专家，在北京对中科院知识创新工程重大项目——“面向蛋白质科学的高性能计算研究”及该项目下设的9个课题进行了现场验收。 通过四年的努力，项目在高性能计算机系统新技术、领域应用加速新方
Science：生物信息学，神秘的新职业
今天的生物信息学家迎来了好时候。由于各个部门生成了几乎无穷无尽的生物数据，因此形成了对于生物、统计学和计算机科学交叉领域中有经验的专业人才的高度需求。科学家如果能够分析大量信息并将其清晰地展示给决策制定者，就会发现自己的工作和职业生涯前途无量，尤其是在大型制药和生物技术部门。 “在大数据时代，
生物芯片用于生物信息学研究
人类基因组计划是人类为了认识自己而进行的一项伟大而影响深远的研究计划。目前的问题是面对大量的基因或基因片断序列如何研究其功能，只有知道其功能才能真正体现HGP计划的价值--破译人类基因这部天书。后基因组计划、蛋白组计划、疾病基因组计划等概念就是为实现这一目标而提出的。生物信息学将在其中扮演至关重要的
Cystatin基因家族的生物信息学分析
实验概要半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)基因广泛存在于植物物种中。该类基因能够起到抑制某些病原微生物和昆虫体内半耽氨酸蛋白酶的作用，在植物的防卫体系中起到重要作用。我们利用已经分离出植物cystatin基因的cystatin结构域为检索序列在基因组水平上对拟南芥和水稻中的cystatin基因
生物信息学中的HSP的含义
热休克蛋白（英文：heat shock protein ）又称应激蛋白，是机体细胞在一些理化因素刺激后高效表达的一组蛋白质，因最先发现于果蝇唾液腺的热应激反应中而得名，此后的研究表明，热休克蛋白广泛存在于人、动物、微生物和植物的细胞中，是一类在遗传上高度保守的分子，能保护细胞并促进细胞对各种刺激所造