10月4日《自然》杂志内容精选
牡蛎基因组所显示的防卫机制 牡蛎是河口生态系统中的重要物种，也是世界范围内最重要的水产养殖物种之一。本期Nature报告了太平洋牡蛎基因组的测序结果和组成情况。与其他基因组所作的对比显示，它们的防卫基因有所增加，这是对作为潮间带中一种“固着物种”的生活方式的一种适应，是甲壳的形成及与幼虫发育相关基因的骤变的一个通道，这个通道的复杂程度令人吃惊，突显了它们在适应性方面对于海洋无脊椎动物的重要性。 糖尿病与肠道元基因组 Ⅱ型糖尿病的发病率已知与遗传因素和环境因素都有关系，曾有人提出，小肠微生物群发生的变化也可能牵涉其中。Jun Wang及其同事建立了一种新颖的研究方法，被称为“元基因组范围的关联研究”，用来比较健康人和糖尿病患者粪便微生物群的综合基因内容。他们识别出与其中任何一个人群相关的多种微生物和代谢通道，并且发现其中一些还可能用作生物标记。 乳腺癌中的基因变异 来自“癌症基因组图谱”联合体的这......阅读全文
化妆品易致乳腺癌？盘点乳腺癌7大诱因
统计数据显示，多达1/8的女性在一生中的某个时间会患上乳腺癌。但是，乳腺癌风险存在很大的个体差异，美国“福克斯新闻网”11月3日载文，刊出“乳腺癌的风险因素”，并提醒所有女性每年查一次乳房X光片，以提早发现乳腺癌征兆。 1.体重超标。体重超标或肥胖会导致乳腺癌风险增加30%~60%。其原因是，
Nature－Genetics：更年期的早晚由什么来决定
女性更年期出现的早晚，对乳腺癌等疾病风险有着明显的影响，但其内在机制却不为人知。英国剑桥大学等机构的研究人员通过近七万名妇女的分析，发现基因组中有40多个区域与妇女的更年期年龄存在关联。这项成果于周一发表在《Nature Genetics》上。 “我们已经知道，女性何时经历更年期，在一定程度上
准确预测身高？这种机器学习算法能做到
美国密歇根州立大学的研究人员近日开发出一种先进的算法，能够根据个人基因组来预测他们的身高、骨密度，甚至是教育水平。这项成果于近日发表在《Genetics》杂志十月刊上。 这项研究的负责人、密歇根州立大学的Stephen Hsu博士表示这仅仅是开始。“尽管我们现在验证了这一工具的这三个结果，但我
Diabetes－Care：二甲双胍并不能提高癌症患者生存率
尽管此前的科学研究表明糖尿病药物二甲双胍具有防癌抗癌的特性，但一项新的研究发现该药可能实际上并不能提高某些乳腺癌患者生存率。 这项研究发表在Diabetes Care杂志，该研究未能证实中老年糖尿病患者服用药物二甲双胍能改进乳腺癌患者的生存率。 然而，作者提醒进一步的研究是必要的
乳腺癌精准治疗策略再升级！
4月9日，复旦大学附属肿瘤医院教授邵志敏、江一舟、胡欣领衔的研究团队，系统性地构建了迄今最为全面的乳腺癌基因组变异互作网络，并功能性解析基因组变异互作对乳腺癌治疗结局的影响，有望给乳腺癌精准治疗带来新的突破。相关研究成果发表于《癌细胞》。随着测序技术在临床上的广泛应用和对肿瘤基因组认知的深化，乳腺癌
－世界糖尿病日：健康饮食与糖尿病
世界糖尿病日（World Diabetes Day' WDD），是由世界卫生组织（WHO）和国际糖尿病联盟（IDF）于1991年共同发起的，并自1992年起在每年的11月14日举行庆祝活动，其宗旨是引起全球对糖尿病的警觉和醒悟。 之所以将每年的11月14日定为“世界糖尿病日”，是为了纪念班廷（
乳腺癌的治疗预防
治疗 随着对乳腺癌生物学行为认识的不断深入，以及治疗理念的转变与更新，乳腺癌的治疗进入了综合治疗时代，形成了乳腺癌局部治疗与全身治疗并重的治疗模式。医生会根据肿瘤的分期和患者的身体状况，酌情采用手术、放疗、化疗、内分泌治疗、生物靶向治疗及中医药辅助治疗等多种手段。外科手术在乳腺癌的
如何区分早期乳腺癌
对于乳腺癌的早期治疗总是存在着一个悖论：一些属于低风险“原位”病变乳腺癌病例花费了很多不必要的手术和化疗费用，同时，又有一些选择保守治疗的病例根本无法控制侵略性强的乳腺癌，使其扩散到其他器官。因此，如何通过早期乳腺癌来区分它的致命性与否就变得十分重要。 怀特黑德研究所研究人员发现了SMARCE
乳腺癌疫苗的简介
乳腺癌虽然不是导致女性死亡人数最多的癌症，但它是女性发病率最高的癌症之一。根据美国癌症协会的数据，在美国，乳腺癌发病率约为111/10万。中国是乳腺癌的传统低发区，根据全国肿瘤防治研究办公室的杨玲等人的研究，2005年，中国女性乳腺癌发病率为24.8/10万，居各类癌症之首，并导致48164人死
乳腺癌疫苗的原理
乳腺癌在女性所患癌症中风险最高 抗癌疫苗能够激活免疫细胞，使后者把肿瘤细胞识别为外来物，从而攻击肿瘤。医生们认为疫苗产生的免疫反应可以作为其它癌症疗法的补充，或者作为高危险人群的预防措施。 80%的乳腺癌患者乳腺癌细胞上会表现出一种由“六个单醣”组合的“多醣体”。锁定此“病原特征”后，他合成
乳腺癌外科治疗体会
摘要目的：探讨乳腺癌不同方法外科治疗的得失总结不同外科治疗方法优缺点。方法：回顾性分析乳腺癌患者不同的临床特点、生存情况及疗效分析，探讨术前新辅助化疗对预后的影响。结果：术前新辅助化疗无助于提高Ⅰ、Ⅱ期乳腺癌患者术后生存率，但能延长Ⅲ期患者术后生存时间及改变原有手术方式；正确的选择保乳手术术式在正规
乳腺癌的检查诊断
检查 在乳腺门诊，医生了解了病史后首先会进行体检，检查双侧乳腺；还会结合影像学检查，包括乳腺X线摄影（乳腺钼靶照相）、彩超，必要时也可进行乳腺磁共振检查（MRI）。乳腺X线摄影是近年来国际上推荐的乳腺癌筛查中的主要方法，可以发现临床查体摸不到肿块的乳腺癌，通常用于40岁以上的妇女，
单细胞基因组测序如何实现：从实验到分析，步步解析
随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。 【应用概览
单细胞基因组测序：从实验到分析，步步解析
随着生命科学研究的微观化，基于细胞群体的研究方法已不适用于某些研究领域（如肿瘤异质性、早期胚胎发育等）。单细胞基因组测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。【应用概览】从20
Nature：短链脂肪酸在早发1型糖尿病中具有保护作用
短链脂肪酸(short-chain fatty acids，SCFA)，也称挥发性脂肪酸(Volatile fatty acids，VFA)，根据碳链中碳原子的多少，把碳原子数为1-6的有机脂肪酸成为短链脂肪酸，主要包括乙酸、丙酸、异丁酸、丁酸、异戊酸、戊酸。它们被后肠迅速吸收后，既储存了能量又
宏基因组及宏转录组测序揭示极端环境微生物的生态学作用
中山大学与千年基因合作应用宏基因组及宏转录组测序对极端环境酸性矿山废水（Acid mine drainage, AMD）中的微生物群落进行研究，相关成果于11月7日发表于The ISME Journal杂志。 本研究是继2012年11月发表于The ISME Journal杂志的微生物群落多样
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日，国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日，华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章，在动物和住院患者中发现多粘
微生物所在酵母中开发CRISPRCas9介导多重基因组编辑技术
汉逊酵母（Ogataea polymorpha）是一种重要的工业微生物，常被用于研究甲醇利用、自噬、过氧化物酶体生物合成和硝酸盐同化等。除此之外，它有一个重要的特性，就是能够通过NHEJ将多达100个拷贝的靶基因整合到基因组上，这一特性可用于过表达外源基因合成多种产物。虽然CRISPR/Cas9
微生物所多粘菌素耐药基因mcr1的比较基因组研究获进展
12月17日，国际学术期刊《柳叶刀感染性疾病》杂志在线发表了中国科学院微生物研究所病原室研究员朱宝利课题组对多粘菌素耐药基因mcr-1的比较基因组分析通讯文章。 11月18日，华南农业大学教授刘健华和中国农业大学教授沈建忠领导的团队在《柳叶刀感染性疾病》杂志发表文章，在动物和住院患者中发现多粘
今日视点：美国为何启动“国家微生物组计划”
美国白宫13日宣布启动“国家微生物组计划”，这是奥巴马政府继脑计划、精确医学、抗癌“登月”之后推出的又一个重大国家科研计划。小小的微生物，为何能成为美国的国家级大型科研计划？美国政府将如何实施这个计划？最终的目标又是什么？ 启动资金超5亿美元 微生物存在于人体、植物、土壤、海洋等各种环境中
科学家如何有效预测多种人类疾病的发生？
【1】Genet in Med：科学家开发出一种能预测女性乳腺癌风险的新型工具 doi：10.1038/s41436-018-0406-9 近日，一项刊登在国际杂志Genetics in Medicine上的研究报告中，来自英国癌症研究中心(Cancer Research UK)的科学家们通
《细胞》2012年度最佳论文
Cell杂志创刊于1976年，现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一，并陆续发行了十几种姊妹刊，在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。在最新一期(12月21日)Cell杂志内容公布的同时，也盘点了本年度最佳论文，其中清华大学的戚益军研究组关于DNA双链断裂修复中起重要作用的新型小分子RN
一生中患病的几率或可预测，十种慢性病遗传风险估算更接近临床
通过分析基因组中数百万个微小的遗传差异，就可预测一个人一生中患某种疾病的几率。在过去的10年中，研究人员为数十种疾病制定了风险评分，希望有一天患者能利用这些信息来降低患病风险。在《自然·医学》杂志最新发表的一项研究中，美国麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所团队概述了他们如何选择、优化和验证10种
分析头部脂溢性皮炎的发病原因
多认为头部脂溢性皮炎与遗传、皮脂代谢改变、微生物寄生、神经功能障碍以及饮食习惯等因素有关。曾推测本病的发生是由于皮脂分泌增多和化学成分的改变，使原存在于皮肤上的正常菌群大量生长繁殖侵犯皮肤所致。 头部脂溢性皮炎为多因素所致。与年龄、性别有关，大多数病例有遗传倾向，雄激素水平增高，导致皮脂分泌增
美科学家历时六年破解肠道微生物对2型糖尿病的影响
【吃纤维有助于肠道细菌对抗糖尿病】一项新的研究发现，饮食的改变，包括更多的纤维，可以鼓励特定类型的肠道细菌减少糖尿病的症状。 2型糖尿病通常被称为一种生活方式疾病，在许多情况下，它可以通过改变饮食和活动水平等习惯来预防。然而，现代社会似乎无力停止疾病前进的步伐。目前，美国每10人患糖尿病的人数
深圳先进院首次揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病的相关性
近日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所（筹）研究团队，在人体微生物组研究领域取得进展，相关研究成果以A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes为题，发表在Microbiome（《
75个乳腺癌遗传风险相关新位点揭示
英国《自然》和《自然·遗传学》杂志近日同时发表两篇重磅论文，揭秘乳腺癌基因组真相，报告了75个与乳腺癌风险上升相关的新位点。科学家们希望，收集成千上万的个体数据进行分析的全基因组关联研究，能够改进该疾病的筛选、早期检测和治疗。 乳腺癌风险受遗传影响，虽然医学界之前已知105个遗传区域与乳腺癌相
乳腺癌发病的“土壤学说”
牛钢（右一）与团队人员讨论。（受访者供图）“人表皮生长因子受体2（HER2）阳性乳腺癌更多是由于环境毒素或不良生活方式所致，患者需要更多地关注生活方式，选择并坚持健康的生活方式以防范肿瘤的侵袭；而HER2阴性乳腺癌往往是由胚系基因组决定，根据我们的临床试验统计，若胚系病因评分大于1，则表明该受试者携
NIH公布重要资助项目获得者名单
来自9月4日纽约的消息，美国国立卫生研究院（NIH）宣布了其基因，环境和卫生方面的首批获资助的名单。2007年NIH财政预算大约为7700万美元，其中2800万已拨出，4000万用于新的资助项目，剩余的900万用于NIH两个研究院。 今年NIH计划资助8个全基因组相关性研究，两个基因分型中心，一个
国际人类微生物组联盟启动
经过近3年的酝酿和筹备，以解析人类共生微生物与健康关系为目标的国际人类微生物组联盟(IHMC)近日在德国海德堡宣布成立。来自美国国立卫生研究院(NIH)、欧盟委员会，以及中国、日本等9个国家的科学家出席成立大会并交流了各自的计划和进展。 基因与环境相互作用决定人体健康，目前大量的研究都集中在分析人