CancerCell首次揭示lncRNA在20种癌症中的DNA甲基化改变图谱
近日，匹兹堡大学杨达课题组在Cancer Cell杂志上发表了最新研究论文，系统地揭示了20种癌症中长非编码RNA（lncRNA）的DNA甲基化改变图谱。 image.png 论文题为“lncRNA Epigenetic landscape analysis identifies EPIC1 as an oncogenic lncRNA that interacts with MYC and promotes cell-cycle progression in cancer”。 研究者们进一步克隆出了一个在癌症中通过启动子去甲基化激活的促癌长非编码RNA，并将其命名为EPIC1 (Epigenetically induced lncRNA 1)。研究发现，EPIC1的作用机制主要是通过与MYC蛋白相互作用调控MYC靶基因转录，从而促进肿瘤细胞的周期进程与癌症的发生。该论文的第一作者为王泽华博士和杨波博士。 ......阅读全文
LncRNA:从分子调控到临床应用的最新成果
2009年，随着非编码RNA（ncRNA）研究进展的深入，一类新的ncRNA分子—lncRNA掀起科学界的热点话题，并逐渐成为分子生物学及临床医学研究的重要方向。康成生物与美国Arraystar公司合作，利用Arraystar LncRNA系列芯片平台，率先开展lncRNA表达筛查服务。Arra
生物物理所Cell－Res揭示疾病蛋白在DNA损伤修复中的作用机理
2013年9月3日，《Cell Research》杂志在线发表了题为“Structure analysis of FAAP24 reveals single-stranded DNA-binding activity and domain functions in DNA damage
研究揭示植物中DNA半甲基化稳态维持的机制
DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰，其在基因表达调控中起着重要作用。在哺乳动物中，DNA甲基化主要发生在“胞嘧啶-鸟嘌呤”（CG）位点的胞嘧啶上。CG双链上两个胞嘧啶的甲基化状态通常一致，完全甲基化或非甲基化。这种对称的甲基化状态会在DNA复制过程中转化为不对称的“半甲基化”状态，再由DNA甲基转
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分
文章导读 2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台，也是客户发表
Nature：10000人最大研究！“超重”改变DNA甲基化
12月21日，发表在Nature杂志上题为“Epigenome-wide association study of body mass index, and the adverse outcomes of adiposity”的研究证实，节假日养出的“肉”（biao）除了会让你看起来更bigge
中科院Cell子刊揭示癌症模块化特征
来自中科院上海生命科学研究院计算生物学研究所的研究人员，开发出了一种无偏倚适应成簇(adaptive clustering)方法，综合分析了卵巢癌的基因组、表观基因组和转录组的全景图，由此揭示出了卵巢癌不良预后的潜在模块化特征。这一研究成果发表在8月8日的《Cell Reports》杂志
5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据
文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一：非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表
一文了解甲基化研究领域新进展！
本文中，小编整理了多篇重要研究成果，共同解读科学家们在甲基化研究领域取得的新进展，分享给大家！图片来源：Vossman/ Wikipedia 【1】Nature：母体维生素C调节DNA甲基化重编程和生殖细胞产生 doi：10.1038/s41586-019-1536-1 发育通常被认为是在
曹雪涛院士团队重要研究成果汇总
【1】Science：南开大学曹雪涛团队揭示hnRNPA2B1识别病毒DNA并促进IFN-α/β产生 doi：10.1126/science.aav0758 通过模式识别受体（pattern recognition receptor， PRR）识别病毒核酸可触发宿主对病毒的先天免疫应答。这导
Cell揭示癌症之王的保护伞
根据纽约大学Langone医学中心和Perlmutter癌症中心的一项研究，细胞类型之间的内部冲突可以解释免疫系统难以识别和攻击胰腺癌的原因。遏制这种混战有潜力使得治疗更有效。 这项发表在8月25日《细胞》（Cell）杂志上的研究，描述了一个称作为“γδT细胞”的强大免疫细胞亚群阻止其他抗癌T
Cell子刊揭示癌症双面蛋白
在《Molecular Cell》杂志上的一项新研究中，来自Salk研究所的研究人员报告称，一种被视作是在早期癌症形成过程中充当肿瘤抑制因子的蛋白——转化生长因子-β(TGF-β)，在细胞一旦进入到癌前状态后实际上可对癌症起促进作用。 这一研究发现让调查者们感到惊喜，它增大了一种诱人的
Cell：揭示癌症特有的致命弱点
尽管近几十年来，生物技术已经发生了革命性的进步，但人们仍然未能找到理想的抗癌疗法，这样的疗法应当能够立刻杀死癌细胞，无损于健康细胞，并且可以防止癌症复发。 不过，“合成致死”概念（synthetic lethality）为研究者们带来了新的希望。合成致死是指两个非致死基因同时失活导致细胞死亡的
Cell揭示癌症转移新机制
来自斯坦福大学医学院的研究人员揭示出，Nfib通过广泛提高染色质的可接近性促进了癌症转移。这一研究发现发布在6月30日的《细胞》（Cell）杂志上。 斯坦福大学医学院遗传系助理教授William J. Greenleaf，及遗传学系与病理学系助理教授Monte M. Winslow博士是这项研
研究发现植物DNA主动去甲基化新机制
近期《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i
当肿瘤遇上外泌体，会碰撞出怎样的火花？
迄今为止，化疗仍是癌症治疗中的不可或缺的重要一环。但有研究认为，一些化疗药物，在杀死癌细胞的时候，还会促进癌细胞的转移，在这个过程中，外泌体发挥着非常关键的作用。洛桑联邦理工学院的Ioanna Keklikoglou和Michele De Palma等在国际知名杂志《Nature Cell
揭示lncRNA在EMT过程中发挥的作用
西班牙塞利维亚大学教授José A Pintor-Toro长期从事生物化学与细胞生物学研究， 近期，其实验室利用Arraystar LncRNA芯片研究发现了在TGF-β诱导的上皮-间质细胞转化（EMT）过程早期起直接调控作用的lncRNA分子—lnc-Spry1，TGF-β诱导直接引起lnc-Sp
Cell子刊：重编程过程中的lncRNA动态
利用体细胞重编程生成诱导多能干细胞的技术称为iPS，该技术生成的诱导多能干细胞（iPSC）理论上可以生成任何类型的细胞。现在这一技术已经渗透到了生命科学的各个领域，帮助研究者们寻找致病基因、进行药物研发和开发细胞疗法。 全面挖掘iPS技术的临床潜力，需要详细了解重编程各个阶段发生的细胞事件。为
Nat－Commun：DNA修饰会促进乳腺癌对激素疗法产生耐受性
对激素疗法产生耐受性的乳腺癌细胞中的DNA常常会发生表观遗传学的改变，激素疗法是一种治疗ER+乳腺癌的有效疗法，而ER+乳腺癌在所有诊断的乳腺癌患者中占到了70%的比例；逆转这些表观遗传学改变或许有望帮助降低乳腺癌患者的复发率。图片来源：CC0 Public Domain 近日，一项刊登在国际
DNA修饰图谱揭示人脑发育过程
由美国加州大学洛杉矶分校牵头的一项研究，揭示了人类大脑发育过程中基因调控的演变方式，并展示了染色质的3D结构在其中发挥的关键作用。研究人员绘制了海马体和前额叶皮质中DNA修饰的首张图谱，这两个大脑区域对学习、记忆和情绪调节至关重要，也常与自闭症和精神分裂症等疾病相关。这项研究为早期大脑发育如何影响身
著名华裔学者Cancer－Cell解析癌症表观遗传调控的特殊机制
来自美国斯坦福大学，中国科学技术大学等处的研究人员发表了题为“Chromatin accessibility landscape of cutaneous T cell lymphoma and dynamic response to HDAC inhibitors”的文章，利用ATAC-seq
Cancer－Cell：肿瘤干细胞为根治癌症带来了新的曙光
Cancer Cell：肿瘤干细胞为根治癌症带来了新的曙光。 癌症是以细胞异常增殖及转移为特点的一大类疾病。2000年全球新发癌症病例约1000万人，死亡620万人；预计2020年癌症新发病例将达到1500万人，死亡1000万人。《中国癌症预防与控制规划纲要2004-2010》指出：癌症正在成为2
科学研究揭示DNA甲基化的秘密
甲基化指 DNA 的化学修饰，这种修饰发生在 DNA 序列的数百万个位置上。直到现在，科学家们相信这种表观遗传学的现象减少了一些基因的表达。 近日，来自UNIGE大学的研究团队们，发现 DNA 甲基化在基因调节中扮演着积极和消极的角色。 DNA 序列的变异性与基因表达之间的关系也
揭示DNA甲基化与基因沉默的关系
DNA 甲基化与真核基因和转座子的转录抑制有关，但基因沉默的下游机制在很大程度上是未知的。 2021年6月3日，加州大学洛杉矶分校Steven E. Jacobsen团队在Science 在线发表题为“MBD5 and MBD6 couple DNA methylation to gene s
余棣华教授Cancer－cell揭开癌症双面蛋白变身之谜
《化身博士》（Dr. Jekyll and Mr. Hyde）是英国作家Robert Louis Stevenson在19世纪撰写的一部著名的小说。故事描述了在维多利亚时代，Jekyll博士为了探索人性的善恶，研究发明了一种特殊的新药，吃下去便会变成另一个自我，即Hyde先生。博士把自己所有的恶
天津医科大学Cancer－cell发表癌症新文章
来自天津医科大学、德克萨斯大学西南医学中心的研究人员证实， Aiolos通过沉默p66Shc转录促进了癌细胞非贴壁依赖性（Anchorage Independence）生长和转移。这一研究发现发表在5月12日的《癌细胞》（Cancer cell）杂志上。 天津医科大学的刘喆（Zhe Liu）教
研究揭示合子DNA去甲基化机制
中国科学院生物物理研究所朱冰研究组揭示小鼠母源蛋白Pramel15促进合子DNA去甲基化机制。相关论文8月25日发表于《自然-通讯》。哺乳动物卵细胞受精后形成的受精卵会经历DNA甲基化的重编程，将继承自亲本的基因组甲基化状态重置，为后续的组织分化、胚胎发育做准备。其中，DNA甲基化维持的重要DNA甲
Nature首次揭示：年龄如何影响癌症？
当随着时间的推移我们的细胞累积损伤并发生慢性炎症时，癌症的风险会随人的年龄而增长。现在由Wistar研究小组领导的一个国际研究小组证实，黑色素瘤中老化的肿瘤细胞与年轻肿瘤细胞表现不同。他们的研究结果发布在4月4日的《自然》（Nature）杂志上。 微环境的改变使得这些老化肿瘤细胞更具转移性，对
DNA甲基化与癌症之NGS检测篇
摘要 DNA甲基化是哺乳动物中研究最为深入的表观遗传修饰之一。正常细胞中，DNA 甲基化有效的调控基因表达水平。某些抑癌基因的失活是由于启动子区域的高甲基化，大量实验研究表明，在多种类型癌症中，DNA甲基化导致了大范围的基因沉默。除了启动子区域和DNA重复序列中的甲基化水平改变外，甲基化还与非
lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析
Nature子刊|联合南京医科大发表重要研究成果：揭示lncRNA促进胃癌进展的新机制 近日，南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果，以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinoge
Genome－Biology：上海交大解析阿司匹林的抗结直肠癌机制
癌症化学预防指利用天然或合成的化学物质来阻止、逆转、减缓癌症的发生发展过程。虽然阿司匹林的化学预防效果已经被广泛研究，但人们还不完全清楚细胞组分在其中起到的作用，比如长非编码RNA（lncRNA）。lncRNA是长达两百个核苷酸以上的转录本，绝大多数位于细胞核内。 上海交大医学院的研究团队发现