生物物理所CellRes揭示疾病蛋白在DNA损伤修复中的作用机理

2013年9月3日,《Cell Research》杂志在线发表了题为“Structure analysis of FAAP24 reveals single-stranded DNA-binding activity and domain functions in DNA damage response”的论文,报道了FAAP24(Fanconi anemia associated protein 24KD)的三维结构,通过结构分析对其在DNA损伤修复中ssDNA结合活性以及结构域功能进行了体内体外的实验验证。 这项研究由中科院生物物理所龚为民课题组、合肥强磁场中心田长麟课题组以及美国MD安德森癌症中心Lei Li课题组合作完成。 范可尼贫血(Fanconi anemia ,FA)是由基因变异引发的常染色体隐形遗传病,FA 基因突变会导致骨髓障碍,癌症,早衰等一系列疾病。目前已经找到了与范科尼贫血......阅读全文

泛素结合酶的结构组成

E2s家族成员都含有一个由150-200个氨基酸组成的高度保守的泛素结合结构域(UBC)。该结构域的分子量大约为14-16kDa,并且其中有35%的序列在不同的E2s成员中是保守的,它可以为泛素活化酶E1s,泛素连接酶E3s和活化的Ub或UBL提供结合位点。UBL是一种类泛素蛋白,如SUMO,ISG

泛素结合酶的结构组成

E2s家族成员都含有一个由150-200个氨基酸组成的高度保守的泛素结合结构域(UBC)。该结构域的分子量大约为14-16kDa,并且其中有35%的序列在不同的E2s成员中是保守的,它可以为泛素活化酶E1s,泛素连接酶E3s和活化的Ub或UBL提供结合位点。UBL是一种类泛素蛋白,如SUMO,ISG

配体结合口袋是什么结构?

中文名称配体结合口袋英文名称ligand-binding pocket定  义受体的配体结合域中的疏水氨基酸残基通过疏水相互作用所形成的一种口袋形结构。其形状与配体的互补性越大,则受体与配体的亲和力也就越大。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

结合珠蛋白的结构和功能

结合珠蛋白 (haptoglobin,HP)又称触珠蛋白,是一种分子量为85000的酸性糖蛋白,广泛存在于人类和多种哺乳动物 的血清及其他体液 中。在CAM电泳及琼脂糖凝胶电泳中,结合珠蛋白位于α2区带,分子中有两对肽链(α链与β链)共同形成α2β2的四聚体。结合珠蛋白主要在肝脏合成,其降解也在肝脏

DNA结合模体的结构特点

中文名称DNA结合模体英文名称DNA-binding motif定  义DNA结合蛋白中与DNA发生相互作用的区域所具有的特定的结构模式。如锌指结构、亮氨酸拉链、螺旋-转角-螺旋、螺旋-环-螺旋等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

青霉素结合蛋白的结构介绍

  以前是通过细菌提取的羧肽酶的青霉素-肽衍生物的氨基酸序列分析弄清了数种PBPs的活性中心,结果显示细菌PBP活性中心常是丝氨酸,β-内酰胺类抗生素正是通过其β-内酰胺环中的羧基和细菌相应的PBPs的丝氨酸的羟基共价结合成丝氨酸酯起作用。另外也有研究表明可能存在半胱氨酸-巯基为活性中心的羧肽酶。后

核心结合因子的结构和作用

核心结合因子(cbf)是一种与许多增强子和启动子的核心元素结合的异二聚体转录因子。该基因编码的蛋白质代表CBF的α亚单位,被认为与正常造血的发育有关。涉及这一基因的染色体易位有很好的文献记载,并与几种类型的白血病有关。三种编码不同亚型的转录变体已经被发现。

性激素结合球蛋白的结构功能特点

性激素结合球蛋白(sex hormone-binding globulin, SHBG),又称睾酮-雌二醇结合球蛋白,是一运输性激素的载体,它在性激素人作用过程中以及在各种生理病理情况下都有变化和意义。

双链DNA结合域的结构和作用

双链DNA结合域,DNA结合蛋白中与双链DNA结合的结构域。 双杂交系统的基础是在一些转录因子上发现的模域(modular domains):一个DNA结合域,它可以结合一段特异的DNA序列,和一个转录激活域,这个转录激活域与基础转录机制相作用。

解密:全长-CaSR-及其与配体结合的分子结构

  钙敏感受体 (CaSR) 是一种 C 类 G 蛋白偶联受体 (GPCR),在钙稳态和甲状旁腺激素分泌中起重要作用。迄今为止,已确定处于活性和非活性状态的 N 端人类 CaSR 的晶体结构。然而,缺乏完整的 CaSR 结构信息限制了对受体功能、偏向信号转导和针对多种疾病的临床药物开发的理解。  2

暗场显微结合微球-实现微结构超分辨显微成像

  在光学成像领域中,由于受到衍射极限的限制,常规成像分辨率难以突破200nm。生物医学、集成电路等领域对提高成像分辨率有迫切要求,如何实现更高成像分辨率成为近年来的热门研究方向之一。  受自然界微滴可提高成像分辨率的启发,2011年科学家提出将直径在微米级的介质微球直接放置于待测样品表面,在普通白

Nature:一个Tbox-tRNA结合域的结构

  细菌T-box核开关见于编码“氨酰基-tRNA合成酶”(为tRNAs加载氨基酸的酶)的基因的5′ UTR中。它们与其他核开关的不同之处在于,它们结合tRNAs而非一个小分子或代谢物来调控表达。现在,Jinwei Zhang 和 Adrian Ferré-D’Amaré解决了与tRNA 结

核糖体结合位点的超微结构的介绍

  非膜相结构,大小15-20nm,可单个或成群分布于细胞质中,也可附着在核外膜,内质网上,或存在于线粒体,叶绿体中,用负染色高分辨电镜观察,核糖体不是圆形颗粒,而是由大、小二个亚基组成的不规则颗粒。  大亚基侧面观是低面向上的倒圆锥形,底面不是平的,边缘有三个突起,中央为一凹陷,似沙发的靠背和扶手

Science:从结构上揭示INSTI药物结合HIV整合体机制

  在一项新的研究中,来自美国国家糖尿病与消化疾病研究所、美国国家癌症研究所、沙克生物研究所和斯克里普斯研究所的研究人员发现了一类强大的HIV药物如何结合HIV整合体(intasome)的一个关键部分。通过首次解析出这种整合体与不同药物结合在一起时的三维结构,他们发现了是什么让这类药物如此有效。这项

Science揭示CXCR4与趋化因子结合的晶体结构

  趋化因子是一种免疫信号蛋白,它与受体的互作与癌症、炎症和HIV感染有关,现在科学家们首次捕捉到了这一互作的3D结构。  加州大学和南加州大学的科学家们克服重重困难,获得了细胞受体CXCR4与趋化因子结合时的晶体结构,这一突破性成果发表在一月二十二日的Science杂志上。CXCR4与趋化因子的互

上海生科院发现裂殖酵母端粒结合蛋白Taz1结构

  国际学术期刊Cell Research 于6月19日在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)雷鸣研究组的最新研究成果“Fission yeast telomere-binding protein Taz1 is a functional but

日探明麻疹病毒感染细胞结合部立体结构

  日本研究人员在10日的《自然·结构和分子生物学》网络版上发表论文说,他们从原子层面探明麻疹病毒入侵细胞时起重要作用的蛋白质及其受体结合部位的立体结构,这项成果有望帮助人们开发抗麻疹病毒新药。   麻疹病毒表面的“H-蛋白质”在病毒感染细胞时发挥着重要作用,这种蛋白质和人体细胞表

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成

实验材料寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材琼脂糖凝胶实验步骤3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片段的三维朝向对于 PCA 报告蛋白是否能正确折叠至关重要,它取决于形成复合体的目的蛋白 N 端或 C 端的朝向(图 15.1

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及

Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆             实验材料 寡核苷酸引物

崔屹组:冷冻电镜结合EELS实现硅负极纳米结构检测

  今年诺贝尔化学奖所表彰的“锂离子电池”,可以说是目前最贴地气的诺奖技术了,您拿着的智能手机里,应该都藏着一块默默工作的锂离子电池。不过,拿到诺奖并不意味着锂离子电池已经完美无缺了,别的不说,当前智能手机每天至少要充一次电,否则就黑屏变砖,是不是很让人无奈?科学家们也一直在改进锂离子电池,希望能进

分布式阵列射流冲击结合微结构表面强化沸腾传热技术

  随着电子芯片朝着高性能化和微小型化的方向快速发展,其热流密度不断增加,部分高性能芯片的热流密度已超过500W/cm2,传统的风冷、液冷以及被动式冷却技术已不能满足要求,热失效成为电子设备失效的主要形式。发展先进高效散热技术是解决芯片热失效的有效对策。射流冲击结合微结构表面强化沸腾传热技术作为一种

TATA结合蛋白

TBP用β-折叠结合到DNA双螺旋的小沟上,能使TATAbox弯曲80°。主要结合在A、T碱基上,因为这样有利于扭曲使小沟开放。

TBP结合因子

中文名称TBP结合因子英文名称TBP-associated factor;TAF定  义通用转录因子TFⅡD的亚单位。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及利...(二)

3.3 文库的克隆和回收( 1 ) 插入片段和载体的理想比例是(2 : 1 ) ~(3 : 1 )。我们将用于连接的 DNA 浓度限制在 10 ng/μl,使用 1 mmol/L 的 ATP,16°C 连接过夜(见注 8 )。( 2 ) 连接反应体系于 65°C 处理,使酶失活,用氯仿抽提,然后用乙

Raf-蛋白-Ras-结合结构域的简并进化库合成以及利...(一)

Raf 蛋白 Ras 结合结构域的简并进化库合成以及利用片段互补法快速筛选二氢叶酸还原酶的快速折叠且稳定的克隆实验实验材料 寡核苷酸引物Tag 聚合酶BL21 电转感受态细胞试剂、试剂盒 氨苄青霉素卡那霉素仪器、耗材 琼脂糖凝胶实验步骤 3.1 概论3.1.1 PCA 对空间排列的要求PCA 片

血清结合胆红素与非结合胆红素测定的介绍

  原理:血清中不加溶解剂,当血清与重氮盐试剂混合后快速发生颜色改变,在1分钟时测得胆红素即为结合胆红素(CB)。总胆红素减去结合胆红素即为非结合胆红素(UCB)。  临床意义:根据CB与STB比值,可协助鉴别黄疸类型,如CB/STB50%为胆汁淤积性黄疸。某些肝胆疾病的早期,肝炎的黄疸前期之黄疸型

直接、间接、结合、未结合胆红素四者之间的区别

血清中的胆红素有三种存在形式:为结合胆红素、结合胆红素和共价结核药白蛋白的胆红素即胆红素这三种形式,在血清中总量不超过17.2为么儿/L其中4/5是为结合胆红素。胆红素在水溶液中具有不同的溶解度,因而对重担实际的反应能力也有差别。为结合胆红素在水中的的溶解度极低而另外两种胆红素的溶解度接好。由于这几

结合DNA的酶

核酸酶和连接酶:核酸酶是能够切割DNA链的酶,因为它们催化磷酸二酯键的水解。从位于DNA链末端的核苷酸开始水解DNA的核酸酶称为核酸外切酶。另一方面,直接切入DNA链的那些是内切核酸酶。分子生物学中使用最广泛的核酸酶,称为限制性内切酶,以切割特定序列的DNA。在自然界中,这种酶通过在进入细菌细胞时消

结合磁珠实验

这一步仅为基因表达的系列分析 cDNA 合成中实验方案 A 的一部分,在实验方案 B 中,cDNA 已经结合到链霉抗生物素包被的 PCR 试管上,因此不必用磁珠结合。实验材料磁珠试剂、试剂盒Dynabead M-280链霉抗生物素仪器、耗材磁设备实验步骤实验方案 A振荡 lmin 以使 Dynabe

多精入卵的结合过程

多精入卵时,一般也只有一个精核和卵核相结合,其他的以后就退化消失。多精入卵的有鸟类、爬行类及昆虫等少数生物。多精入卵在哺乳动物是不能发育的,鸟类可以发生多精入卵,但只有一个精子能和卵结合,最后还是一精一卵的结果,其余的精子最终都消失了。