武汉科研团队破译并公布莲基因组数据库
近日,武汉市园林科学研究院和中科院武汉植物园携手研发出破译荷花遗传密码的莲基因组数据库。日前,该数据库在国际知名学术期刊公布,供各国荷花研究人员免费共享。 据介绍,水生植物莲是地球上最早出现的开花植物之一。研究发现,早在约1.4亿年前蕨类植物和恐龙称霸地球的时代,在北半球许多水域已有莲的分布。 武汉市园林科学研究院具有悠久的荷花研究传统与历史,目前收集、栽培国内300多个荷花品种,2018年以来还引进栽培了美洲莲、澳洲莲,以及印度、泰国、越南等国的莲品种。中科院武汉植物园在莲属植物的科研上全国领先,2013年完成了中国古代莲的基因组测序和分析,绘制了基因组框架图谱。 2019年12月,两家单位的学者联手打造的莲基因组数据库问世。2020年9月,该数据库取得国家版权局授予的计算机软件著作权。2021年1月,该数据库在国际知名学术期刊《Scientific Data》在线发表。中科院武汉植物园李会博士和武汉市园林科学研究院......阅读全文
武汉科研团队破译并公布莲基因组数据库
近日,武汉市园林科学研究院和中科院武汉植物园携手研发出破译荷花遗传密码的莲基因组数据库。日前,该数据库在国际知名学术期刊公布,供各国荷花研究人员免费共享。 据介绍,水生植物莲是地球上最早出现的开花植物之一。研究发现,早在约1.4亿年前蕨类植物和恐龙称霸地球的时代,在北半球许多水域已有莲的分布。
中国莲基因组测序完成
继中国科学家成功完成水稻、玉米基因组测序工作后,近日,中国科学院武汉植物园研究人员与国外多家科研机构合作,顺利完成中国莲的基因组测序,构建了首张中国莲全基因组图谱,相关论文在线发表于《基因组生物学》杂志。 “该项目为将来的莲分子育种提供了坚实的基础,也标志着我国相关研究将对生物进
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
全球药典草药基因组数据库已上线
近期,中国中医科学院中药研究所团队建立了全球药典基因组数据库(GPGD)。该数据库是全球首个针对药典收载草药物种的大型基因组学数据库。相关研究成果发表在《Science China-Life Sciences》杂志,标题为“Global Pharmacopoeia Genome Database
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
北京基因组所构建完成质体基因组结构变异数据库
多相催化是实现高效定向化学转化的关键技术,其中的一个重要基础科学问题是如何通过精确设计和调控催化活性位结构及所在环境,从而强化其定向催化功能并创造新型高效催化剂。近日,中国科学技术大学熊宇杰教授课题组和江俊教授课题组继在电催化体系中提出表面极化概念后,再次通过与黄伟新教授课题组合作,证实界面极化
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas
北京基因组所开发系列特色科学数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas
武汉植物园等完成中国莲基因组框架图谱绘制
中科院武汉植物园与美国、澳大利亚科学家合作完成了对中国古代莲的基因组测序和分析,相关研究成果已于5月10日刊登在《基因组生物学》杂志上。 研究人员利用全基因组鸟枪测序法完成了对中国莲(Nelumbo nucifera)基因组的测序。结果显示,莲基因组大约有2.7万个基因,全长9.3亿个
基因组多样性和祖源信息数据库
11月3日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果,以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human popul
世界最大的自闭症基因组数据库公布
自闭症,或称为自闭症谱系障碍,是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知,自闭症分好多亚型,大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计,每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然,目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试
本报讯 日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea.catas.cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到
橡胶树HeveaDB基因组数据库平台完成测试
日前,中国热带农业科学院“橡胶树等主要热带作物功能基因组学研究”创新团队负责搭建的橡胶树HeveaDB基因组数据库平台(hevea。catas。cn)上线运行,并在国际橡胶研究与发展委员会(IRRDB)各成员国间开展测试工作。经过1个月的测试,数据库平台各项指标保持稳定,运行可靠,达到预期效果。
科学家呼吁关注全球基因组数据库污染
样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
我国发布首个柑桔全基因组变异数据库
近日,《园艺研究》(Horticulture Research)在线发表了中国农业科学院柑桔研究所构建完成的柑桔全基因组变异数据库CitGVD(http://citgvd.cric.cn/home),这是第一个园艺类作物全基因组变异数据库。 柑桔是全世界最重要的商业水果作物之一。当前,柑桔类物
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human can
北京基因组所发布癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心开发的癌症单细胞表达图谱数据库CancerSCEM上线。该研究成果以CancerSCEM: a database of single-cell expression map across various human cance
穿心莲中穿心莲内酯含量的测定
穿心莲,又名一见喜,苦草,四方草等。穿心莲具有清热解毒,凉血消肿等作用,多用于感冒发热,咽喉肿痛,舌生疮,顿咳劳嗽,泄泻痢疾,热淋涩痛,痈肿疮疡等症,是临床常用药。穿心莲有多种制剂,有片剂,注射剂,滴眼剂等。好的药材才能产生好的疗效,因此,中国药典中,对穿心莲的质量进行了严格要求。 文
首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布
近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。 黄瓜是葫芦科的重要经济蔬菜作物。黄瓜基因组中有近3
北京基因组所构建出多物种转录图谱综合数据库
随着高通量测序技术的发展,转录组测序(RNA-seq)已成为系统研究基因转录及转录后水平调控状态的常规方法,并在多个物种中得到广泛应用。海量转录组数据以前所未有的速度产生,以数据驱动为导向的大规模数据整合、挖掘与解析面临挑战。为更充分展现转录组数据蕴含的丰富信息,服务生物医学基础研究领域需求,构
贝瑞和康建成全球最大妇科肿瘤基因组数据库
基因组大数据的重大意义开始凸显,贝瑞和康与阿里云合作开展的“神州基因组数据云”项目取得的阶段性成果,便已经收效显著。 9月23日,在第十九届全国临床肿瘤学大会暨CSCO学术年会上,北京贝瑞和康生物技术股份有限公司(以下简称“贝瑞和康”)公布了在生物信息分析领域和大数据建设方面做出的重要成果。
Nature子刊公布世界最大的自闭症基因组数据库
自闭症,或称为自闭症谱系障碍,是指包括了社会技能、重复行为、语言和非语言交流、以及与众不同的优势或差异等多表征型障碍。我们现在得知,自闭症分好多亚型,大多数由遗传和环境共同作用造成。据估计,每68名儿童中就有一人患有自闭症。虽然,目前自闭症的干预方法很多。但是大多数缺乏循证医学的证据。尚无最优治
首个近完整黄瓜基因组及多组学综合数据库发布
近日,中国农业科学院蔬菜花卉研究所葫芦科蔬菜遗传育种创新团队在黄瓜基因组学方面取得重要进展,首次完成接近完整的黄瓜参考基因组组装和基因注释,搭建了第一个黄瓜多组学综合数据库。相关研究成果发表在《分子植物》(Molecular Plant)上。黄瓜参考基因组“9930”和核心种质资源。中国农科院蔬菜所
独角莲的简介
独角莲(拉丁学名:Typhonium giganteum Engl.)是佛焰苞目天南星科犁头尖属多年生草本植物,另有:滴水参、天南星、野芋、白附子、禹白附、疔毒豆、芋叶半夏等别称。独角莲块茎直径2-4厘米大小不等,颈部须根多。叶与花序同时抽出。叶柄密生紫色斑点,中部以下具膜质叶鞘;佛焰苞紫色,管
珍珠莲的概述
珍珠莲(学名:Ficussarmentosavar.henryi)为桑科榕属下的一个变种。[1]本变种广泛分布于秦岭、淮河以南,自东向西海拔渐高,广西升至900米,陕西升至1200米,贵州升至1800米,云南升至2500米,渐向var.duclouxii(Levl.etVant.)Corner过
半枝莲的介绍
半枝莲(学名:Scutellaria barbataD. Don),唇形科黄芩属多年生草本植物。[1] 半枝莲根茎短粗,生出簇生的须状根。叶具短柄或近无柄,叶片三角状卵圆形或卵圆状披针形,有时卵圆形,花单生于茎或分枝上部叶腋内,花萼开花时长约2毫米。花冠紫蓝色。花柱细长,先端锐尖。花盘盘状,前
珍珠莲的简介
珍珠莲(学名:Ficussarmentosavar.henryi)为桑科榕属下的一个变种。[1]本变种广泛分布于秦岭、淮河以南,自东向西海拔渐高,广西升至900米,陕西升至1200米,贵州升至1800米,云南升至2500米,渐向var.duclouxii(Levl.etVant.)Corner过