高通量自动化筛选加速对蛋白质定向进化的影响

进化在自然界中每天都在发生,从未停止,由自然选择压力进行筛选,往往需要漫长的时间。近代生物学的发展使人们认识到蛋白质进化大多是由于某些点突变或修饰的积累而形成的。2018年诺贝尔化学奖获得者弗朗西斯.阿诺德,其首次提出了酶的定向进化理论而获此殊荣。 蛋白质定向进化技术,被广泛的应用于酶分子改造,以改变酶分子的活性和催化效率,改善底物的选择性、pH和温度的耐受性等方面,也可以应用于改善代谢途径、优化代谢网络等,在蛋白质工程、代谢工程和合成生物学领域都发挥了重要的作用。 蛋白质定向进化策略 根据原理的不同,可以主要分为三种策略,随机进化、理性进化,和介于两者之间的半理性进化。这三种方式各有优缺点,其中随机进化的多样性最高,但样本量巨大,筛选困难,常使用易错PCR、DNA Shuffling等技术;理性进化,借助于软件建模,进行分子对接等模拟实验,减少了筛选的工作量,但往往得到的蛋白质活性不高;......阅读全文

什么是高通量筛选技术?什么是高内涵药物筛选?

【导读】高通量筛选是指以分子或和细胞水平的实验方法为基础,采用不同密度的微孔平板作为实验载体和自动化工具操作实验步骤,通过快速灵敏的检测装置在同一时间内对海量样品进行生物活性测定、采集实验数据和数字化分析处理,并以相应的信息管理软件支持整个系统正常运转的技术体系。高内涵筛选是指在保持细胞结构和功能完

高通量筛选技术的实验方法介绍

  高通量筛选的实验方法分子水平和细胞水平的实验方法(或称筛选模型)是实现药物高通量筛选的技术基础。由于药物高通量筛选要求同时处理大量样品,实验体系必须微量化,而这些微量化的实验方法应根据新的科研成果来建立。第四军医大学周四元研究认为,药物高通量筛选模型的实验方法,根据其生物学特点,可分为以下几类:

关于高通量筛选的实验方法介绍

  高通量筛选的实验方法分子水平和细胞水平的实验方法(或称筛选模型)是实现药物高通量筛选的技术基础。由于药物高通量筛选要求同时处理大量样品,实验体系必须微量化,而这些微量化的实验方法应根据新的科研成果来建立。第四军医大学周四元研究认为,药物高通量筛选模型的实验方法,根据其生物学特点,可分为以下几类:

关于高通量筛选的基本信息介绍

  高通量筛选(High throughput screening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机分析处理实验数据,在同一时间检测数以千万的样品,并以得到的相应数据库支持运

药物高通量筛选技术的研究进展

  药物高通量筛选技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。   ■发展中的高通量筛选技术   高通量筛选的组合模式。近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、

药物高通量筛选技术的研究进展

药物高通量筛选技术,是发现创新药物的重要技术手段之一,已受到药学同行的极大关注。现将近年来药物高通量筛选技术的研究进展做一综述。■发展中的高通量筛选技术高通量筛选的组合模式。近年来,由于自动化技术特别是机器人的应用,在新药研究中出现了高通量筛选技术,该技术将化学、基因组研究、生物信息,以及自动化仪器

高通量筛选的FLIPR荧光检测法介绍

  近年来,光学测定技术在美、英两国研究人员在高通量筛选检测中,努力进行了光学测定方法的研究,建立了大量的非同位素标记测定法,如用分光光度检测法筛选蛋白酪氨酸激酶抑制剂、组织纤溶酶原激活剂等,均获得成功。  放射性检测技术美国学者GanieSM在高通量药物筛选研究中,应用放射性测定法,特别是亲和闪烁

TILLING高通量点突变筛选方法

TILLING-高通量点突变筛选方法     反向遗传学方法是功能基因组研究的重要方法。为了克服传统的基因敲除方法的局限性,TILLING(Targeting Induced Local Lesions In Genomes)技术通过化学诱变的方法产生的大量点突变个体,可以对部分功能缺失的基因及基因

-高通量miRNA药物精准筛选的新方法

  高通量的药物筛选是具有挑战性的。信息化处理的基因网络过程能够对应这个挑战。它能将多个药物候选的潜在目标整合,处理成信息化的可读数据,同时报告特异性和非特异性的效果。在2月16日的Nature Communication中报告了基于细胞检验miRNA药物靶点的这样的基因网络。  该研究采取细胞内遗

关于高通量筛选的AlphaScreen检测法分析介绍

  高通量筛选的AlphaScreen assay应用广泛且拥有众多优点,更优化药物筛检试验的效果。其操作硬体之限制,导致这实验方法虽然已研发数年,大多数研究人员并未知晓或广泛应用它。  化学生物学研究项目的研究重点是在我们的平台上执行的筛选与蛋白质相互作用的高通量检测。为了这个目的,我们采用Alp

加工对蛋白质营养价值的影响

  (1)热变性虽然会导致蛋白质生物活性的丧失,但经热变性后的蛋白质更易于消化吸收;  (2)热烫或蒸煮可以使对食品保藏不利的酶失活,如脂酶、脂肪氧化酶、多酚氧化酶,从而可以防止食品在贮藏过程中发生变色、风味变差、维生素损失等现象;  (3)热变性可使一些具有毒性的蛋白质和抗营养因子失活,如肉毒杆菌

高通量RNA干扰技术筛选DNA损伤实验

目前,将RNAi库和基于细胞水平的高通量分析技术相结合对于我们鉴定药物敏感性和抵抗性的新机制有非常广阔的前景。举例来说,已有研究者对全基因组进行RNAi筛选找出了导致非小细胞肺癌对紫杉醇敏感的基因。这项研究也证实了RNAi技术在发现影响癌症细胞细胞有丝分裂的靶点上具有很大潜力。 Molecular

蛋白质工程的筛选和选择技术

一旦蛋白质经历了定向进化,定量设计或半定量设计,就必须筛选突变体蛋白的文库,以确定哪些突变体显示出增强的特性。噬菌体展示方法是筛选蛋白质的一种选择。该方法涉及将编码变体多肽的基因与噬菌体外壳蛋白基因融合。通过在体外与固定的靶标结合来选择在噬菌体表面表达的蛋白质变体。然后在细菌中扩增具有选定蛋白质变体

什么是蛋白质工程?

蛋白质工程是开发有用或有价值的蛋白质的过程。它是一门年轻的学科,正在对蛋白质折叠的理解和蛋白质设计原理的识别方面进行大量研究。它也是一个产品和服务市场,到2017年估计价值为1,680亿美元。蛋白质工程有两种通用策略:合理的蛋白质设计和定向进化。这些方法不是互斥的。研究人员经常会同时使用这两种方法。

实验室自动化与筛选协会2013亚洲会展对杨颖女士的专访

  Ying Yang: Translator of Possibilities   What does a German-language undergrad with an M.B.A. have in common with a drug discovery scientist? Ven

刘小乐教授:CRISPR高通量筛选的新算法

  高通量的CRISPR筛选,已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日,华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz

关于高通量筛选系统的技术指标介绍

  高通量筛选系统是一种用于生物学领域的分析仪器,于2010年9月21日启用。  一、高通量筛选系统的技术指标:  1、配备高端品牌的5X(或4X)、10X和20X等至少4组镜头;  2、多组自动滤光片套件:10位激发光滤光片,10组二色相滤镜及发射光滤光片等自动滤光片套件,可进行6个荧光通道的同时

刘小乐教授:CRISPR高通量筛选的新算法

  高通量的CRISPR筛选,已在功能基因组学研究中显示出巨大的潜力。12月16日,华人女学者、哈佛大学公共卫生学院Dana-Farber癌症研究所的刘小乐教授,在国际著名学术期刊《Genome Biology》发表题为“Quality control, modeling, and visualiz

新型整合酶抑制剂高通量筛选方法

随着HIV-1病毒耐药性的不断升级,抗艾滋病药物的研发远远滞后,抗HIV-1药物新靶点的发现和创新药物的研发已成为燃眉之急。HIV-1整合酶催化病毒cDNA与宿主细胞基因组的整合,是HIV病毒复制周期中必需的关键酶。人体内无整合酶功能类似物。因此,整合酶是抗艾滋病药物研发的理想靶点。近年来,北京工业

Junior进行自动化的高通量小体积粘度测量

  高浓度单克隆抗体(mAb)制剂通常是高度粘性的,使得这些制剂的生产和输送潜在地存在问题。测定生物制剂在其最终浓度下的粘度有助于更全面地表征生物制剂的可开发性。  常规的测定粘度的方法往往需要大量的手工操作和较大的样品量,这限制了在早期制剂开发中进行测试的制剂数量。配备粘度站的Big Kahuna

邹鹏团队报道基于荧光成像的蛋白质定向进化方法

  近日,北京大学化学与分子工程学院、合成与功能生物分子中心、IDG麦戈文脑科学研究所、北大-清华生命科学联合中心邹鹏课题组(博士生林畅为第一作者)在 Cell 子刊 Cell Reports Methods 上发表了题为:Functional imaging-guided cell selecti

医用直线加速器主要部件对X射线能谱的影响

研究了医用直线加速器的主要部件对X射线能谱的影响。利用蒙特卡罗软件包EGSnrc/BEAMnrc针对Varian600C医用直线加速器,模拟完整及分别去除初级准直器、均整器和次级准直器条件下的相空间文件,通过相空间文件分析程序Beamdp对相空间文件进行分析,分别得到相应条件下的X射线能谱。均整器对

Cell子刊:细胞重编程加速药物筛选

  最近,美国约翰霍普金斯大学的研究人员报道称,一种实验室培养的人类神经细胞可与心肌细胞搭档,来刺激收缩。因为加速心跳的神经细胞来自于由人类皮肤细胞制成的诱导多能干细胞(iPS),因此研究人员认为,这些细胞——称为交感神经细胞,将有助于我们研究影响神经系统的疾病,也就是说,科学家将能够在实验室里培养

高通量筛选在基因工程菌培养的应用

高通量筛选基因工程菌(如E.coli)时,如果先从固体培养基中挑取单菌落、在含有抗生素的液体培养基中放大培养,多少也要等上4-6个小时才能够获得适合检测的菌体量。现在,IKA 帮您大大缩短工作时间——使用恒温摇床KS 4000 ic的通用夹具,您即可固定8块深孔板,而无需单独购买其它夹具。 KS 4

高通量筛选平台(HTS)在抗体药物开发中的应用

细胞株开发和培养基优化是生物药物的开发的第一步,工业界一直致力于寻找一个高效快速的解决方案,我们将分两期给大家介绍一下默克提供的解决方案。这一期将分享HTS技术。HTS全称为高通量筛选(High Throughput Screen ),这里要划一下重点:1)高通量,是指通过大量不同的培养基筛选,

高通量筛选技术揭示AAV衣壳蛋白是如何演化的?

  在最近一项研究中,研究人员使用腺相关病毒(AAV)载体衣壳库的高通量筛选来最大程度地获得具有所需特性的AAV变异体的可能性。这些实验的结果使他们获得了一些意想不到的知识,相关结果发表在最近一期的《Human Gene Therapy》杂志上。(图片来源:www.pixabay.com)  文章作

亲和质谱技术:药物靶标配体的高通量筛选

  疾病相关的药物靶标蛋白与小分子化合物的亲和作用研究是当今开发新药分子的热点领域。亲和质谱技术(Affinity Selection Mass Spectrometry)作为一种间接筛选小分子配体的方法,已经成功应用于许多受体、酶等靶蛋白的配体的筛选,并且得到了广泛的应用。  亲和质谱分析的基本原

电动筛选器参与分析磷化氢对稻谷脂肪酸值的影响

磷化氢是一种广泛应用于储粮害虫防治的熏蒸药剂,具有使用简便、效果良好、残留少、毒 性低等特点,是储粮害虫治理中不可或缺的重要药剂之一。在磷化氢熏蒸作用下,可降低粮堆中微生物的繁殖力和活力,即减小其对稻谷品质的影响,从而减缓稻谷 脂肪酸值的上升。脂肪酸值是评价稻谷储藏品质变化最敏感的指标之一,研究在不

研究揭示DNA编码环肽库中不同环化方法对筛选结果的影响

环肽因独特的空间结构和生物活性,在口服药物、多肽偶联药物、诊断试剂等领域展现出应用潜力。然而,如何高效筛选并发现具有优异性质的新型环肽分子一直是药物研发领域的重要挑战。DNA编码化合物库技术(DELT)通过将特定的核酸标签与多肽分子连接,实现大规模化合物库的快速构建和筛选。因此,DELT在引入各类非

安徽师范大学启动“合成生物智能研发平台”建设

6月28日,安徽师范大学与中国科学技术大学、芜湖市弋江区共建的“合成生物智能研发平台(AI4S)”建设启动仪式在芜湖市弋江区举行。该研发平台旨在整合三方优质资源,实现人工智能与合成生物学的深度交叉融合,打造集科学创新、技术研发、人才培养、成果转化于一体的国内一流研发基地,助力地方打造绿色、生态、可持