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空间转录组测序样本准备指南

现有空间转录组研究平台是基于冰冻样本进行研究,所以在样本冻存前至少10分钟,将异戊烷和液氮浴准备好(之所以用异戊烷而不直接用液氮进行速冻,是因为液氮沸点比较低,直接液氮处理可能在沸腾过程中使组织周围形成空穴,导致不同区域降温不同步而改变内部形态,甚至组织碎裂)。然后用镊子或者刮刀将新鲜组织转移到异戊烷中,使组织完全浸没且浸泡至少1分钟。冷冻后,可用镊子或者刮刀将组织转移到密封的预冷容器或者冻存管中,-80℃储存,或者进行OCT包埋。1.组织样本选择空间转录组研究的特点是基于空间物理位置的转录组学研究,所以组织样本的选择是该研究的前提条件。由于空间转录组捕获芯片的限制(6.5mmX6.5mm),组织样本最后上芯片的切片不能超过该面积范围。因此,在选择实验样本前,需要对进行研究的样本进行预实验。通过前期组织学检测,确认好样本的最佳取材位置,最合理组织大小。如果本身样本使较大的组织,可以在后续OCT包埋、切片过程中被分割(1mm切口的......阅读全文

肿瘤微环境分析指导癌症治疗

  在免疫疗法时代,癌症生物学家依靠新一代工具来了解肿瘤和免疫细胞之间的相互作用是如何影响疾病进程的。  虽然Sean Bendall是一名病理学家,但最近却成了一名图谱制作者,他使用尖端的蛋白质绘图技术来描绘出肿瘤组织的变幻莫测的景观。  这项技术由Bendall在加州斯坦福大学(Stanford

2017年度十大医疗发明:从CAR-T芯片到10倍基因组

  科学家杂志(The Scientist)评选出了2017年度的十大医疗技术发明。他们是:  1. IsoCode芯片:分析CAR-T细胞的芯片    今年二月由Isoplexis公司推出,它包含数千个只能容纳单细胞的微型腔室。在每个微室内,15个分离空间的槽内包含多达三种针对特定分泌蛋白的不同抗