QPCR常见问题及其分析
一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为100-400mM;模板如果是总RNA一般是10ng-500,如果cDNA,通常情况下是1ul或者1ul的10倍稀释液,要根据目的基因的表达丰度进行调整。当然这些都是经验值,在操作过程中,还需要根据所用MasterMix,模板和引物的不同进行优化,达到一个最佳反应体系。在反应体系配置过程中,有下面几点需要注意: 1. MasterMix不要反复冻融,如果经常使用,最好溶解后放在4度。 2. 更多的配制Mix进行,减少加样误差。最好能在冰上操作。 3. 每管或每孔都要换新枪头!不要连续用同一个枪头加样! 4.......阅读全文
QPCR常见问题及其分析
一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为100-400
QPCR常见问题及其分析
一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为100-400
QPCR常见问题及其分析
一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓
QPCR常见问题及其分析
一般来讲,进行real-time qPCR MasterMix都是2×的浓缩液,只需要加入模板和引物就可以。由于real-time qPCR灵敏度高,所以每个样品至少要做3个平行孔,以防在后面的数据分析中,由于Ct相差较多或者SD太大,无法进行统计分析。通常来讲,反应体系的引物终浓度为10
qPCR常见问题及其分析解决方法
常见问题 1. 无Ct值出现 检测荧光信号的步骤有误: 一般SG法采用72℃延伸时采集,Taqman法则一般在退火结束时或延伸结束采集信号。 引物或探针降解: 可通过PAGE电泳检测其完整性。 模板量不足: 对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起。 模板降解: 避免样品制备中杂
同科生物qPCR常见问题及分析
通常来讲,real-time qPCR的反应程序不需要像常规的PCR那样,要变性、退火、延伸3步。由于其产物长度在80~150 bp之间,所以只需要变性和退火就可以了。SYBR@Green等染料法,zui好在PCR扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲线,判断PCR产物的特异性扩增。而溶解程序
同科生物qPCR常见问题及分析
通常来讲,real-time qPCR的反应程序不需要像常规的PCR那样,要变性、退火、延伸3步。由于其产物长度在80~150 bp之间,所以只需要变性和退火就可以了。 SYBR@Green等染料法,zui好在PCR扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲线,判断PCR产物
测序常见问题及其分析
1、PCR 产物测序时出现重叠峰 问题图1(模板中有碱基缺失,往往是单一位点(1-1)或两个位点(1-2)碱基缺失导致测序 结果移码) 解决方法:将PCR 产物克隆到质粒(如T 载体)中挑单克隆测序,或将PCR 产物进行PAGE 纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进
测序常见问题及其分析
1、PCR 产物测序时出现重叠峰 问题图1(模板中有碱基缺失,往往是单一位点(1-1)或两个位点(1-2)碱基缺失导致测序 结果移码) 解决方法:将PCR 产物克隆到质粒(如T 载体)中挑单克隆测序,或将PCR 产物进行PAGE 纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进
测序常见问题及其分析
1、PCR 产物测序时出现重叠峰问题图1(模板中有碱基缺失,往往是单一位点(1-1)或两个位点(1-2)碱基缺失导致测序结果移码)解决方法:将PCR 产物克隆到质粒(如T 载体)中挑单克隆测序,或将PCR 产物进行PAGE纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进行测序。问题图2(PCR 产物不纯,
测序常见问题及其分析(图)
1、PCR 产物测序时出现重叠峰问题图1【模板中有碱基缺失,往往是单一位点(1-1)或两个位点(1-2)碱基缺失导致测序结果移码】图1-1解决方法:将PCR产物克隆到质粒(如T载体)中挑单克隆测序,或将PCR产物进行PAGE纯化(至少琼脂糖充分电泳后切胶纯化)后再进行测序。问题图2(PCR产物不纯,
qPCR-常见问题解答
通常来讲,real-time qPCR 的反应程序不需要像常规的 PCR 那样,要变性、退火、延伸 3 步。由于其产物长度在 80~150 bp 之间,所以只需要变性和退火就可以了。 SYBR@Green 等染料法,最好在 PCR 扩增程序结束后,加一个溶解程序,来形成溶解曲线,判断 PC
原理易懂然而难做,qPCR结果分析的常见问题
qPCR的英文全名是Real-time Quantitative PCR Detecting System。即实时荧光定量核酸扩增检测系统,也叫实时定量基因扩增荧光检测系。qPCR主要是利用插入性染料或荧光探针(比如TaqMan),人们可以通过监控PCR过程中的荧光强度比较多个样品的DNA水平。
核酸提取常见问题、原因分析及其对策
一、DNA提取方法简介二、DNA提取常见问题、原因分析及其对策三、RNA提取方法简介四、RNA提取常见问题、原因分析及其对策核酸提取原理及常见问题.pptx
TA克隆常见问题分析及其解决方案
TA克隆常见问题分析及其解决方案 问 题 可能的原因 建 议 转化后无 克隆菌产生 转化过程有问题或感受态细胞失活 可通过转化pUC18/19等未切割的可用于抗性筛选的质粒,检测感受态细胞的转化效率和转化操作是否正确 插入对照DNA片段的阳性率低 10×快速连接缓冲 液稀释不当 提供的T4 连接酶缓
PCR实验常见问题、原因分析及其解决方案
PCR产物的电泳检测时间,一般为48h以内,有些最好于当日进行检查,大于48h后带型不规则甚至消失。但有时仍会与到这样那样的问题,影响检测结果的判断,具体归类为以下常见的4点,描述如下:问题一:无扩增产物现象:正对照有条带,而样品则无。原因:1、模板:含有抑制物,含量低。2、Buffer对样品不合适
质粒小量提取常见问题分析及其解决方案
质粒小量提取常见问题分析及其解决方案
RTPCR常见问题分析及其解决方案
常见问题可能原因建议解决方案少量或没有RT-PCR产物RNA被降解分离无污染,高质量的RNA;提取RNA的材料要尽量新鲜,防止RNA降解;RT反应前,在变性胶上分析RNA的完整性;RNA提取后,应储存在100%甲酰胺中, 如果使用RNase抑制剂,加热时小于45℃;pH小于8.0,否则抑制剂会释放所
qPCR结果分析经验分享
Real-time qPCR就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。由于常规的PCR的缺点,real-time qPCR由于其操作简便,灵敏度高,重复性好等优点发展非常迅速。设在
RealTime-PCR-(qPCR)常见问题及解决方案
Real Time PCR(qPCR),即实时荧光定量核酸扩增检测系统,是一种利用荧光染剂检测每次PCR循环后产物总量的方法技术,是常规PCR的衍生反应。主要是通过荧光信号的变化实时监测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过ct值和标准曲线的关系对起始模板进行定量分析。因其具有灵敏、特异、
PH计电极及其常见问题
PH电极,PH计电极种类,PH电极结构,PH电极类型,PH电极使用,PH电极常见问题及其解决方法有哪些?1、什么是pH指示电极?对溶液中氢离子活度有响应,电极电位随之而变化的电极称为pH指示电极或pH测量电极。pH指示电极有氢电极、锑电极和玻璃电极等几种,但zui常用的是玻璃电极。玻璃电极是有玻璃支
离子色谱常见问题及其对策
离子色谱常见问题类型主要有压力异常(偏高、波动)、漏液、保留时间漂移、基线问题(漂移、噪声)、 峰形异常等,本文主要针对这几个现象逐条分析,让你不再为使用离子色谱而烦恼。 一、压力异常 无压力,流动相不流动的可能原因: 1、保险丝断或电源问题;2、柱塞杆折断;3、泵头内有
胶回收、DNA片段纯化常见问题分析及其解决方案
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通过qPCR开展基因表达谱分析
一提起基因表达谱分析,大家马上会想到芯片。然而,并不是每个实验室都具备这个条件。现在,利用每个实验室都有的定量PCR仪,也能开展可靠的基因表达谱分析啦。 QIAGEN推出的RT2 Profiler PCR Array是一种高度可靠且灵敏的基因表达谱分析技术,它利用实时定量PC
如何用spss对qpcr结果分析
主要做方差分析或t检验
qPCR常见异常曲线实战分析-(二)
图九:试剂蒸发引起扩增曲线抬升4确定实验过程中的操作细节如果以上都正常,还要确定下实验过程中的操作细节。比如在做标准曲线的时候是否是梯度稀释的标准品,如果不是梯度稀释标准品,可能会引起标准曲线扩增效率或者R2值异常;从冰箱冷冻中取出的试剂是否有混匀,如果试剂融化后没有混匀,这时候取出的试剂不是均一的
qPCR常见异常曲线实战分析-(一)
1确认软件设置是否正确对照试剂盒说明书,检查时间、温度、循环数、荧光采集等是否设置正确。有一个比较容易忽略的设置问题是,需要看下所选用的试剂中是否含有ROX来作为参比荧光染料。2确定耗材及配件是否使用正确 耗材对于荧光定量PCR来说比较重要,很多
qpcr数据分析及作图方法
荧光定量PCR(qPCR)就是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。由于常规的PCR的缺点,荧光定量PCR( qPCR)由于其操作简便,灵敏度高,重复性好等优点发展非常迅速。设在已经涉
史上最全的QPCR数据分析
用参照基因 ( 如GAPDH 或 ß-actin)能准确量化初始材料的载量,尤其当初始材料量常常受限时,进行相对基因表达分析实验十分方便。缺点是这个方法要求得到一个或多个在所有测试样本中恒定表达的已知参照基因,而且表达水平不受研究条件下处理方式的影响。确定这样的参照基因十分重要,最近有报道提出在