余学清/张镇海/曹广文等联合揭示人抗体组库的关键特征
广东省人民医院余学清团队、南方医科大学张镇海团队以及中国人民解放军海军军医大学曹广文团队联合在线发表了群体水平下人抗体组库特征谱的研究,揭示了包括基因使用率、基因重组偏好、公共克隆以及体细胞超突变在内的多个抗体组库的关键特征。 国际学术期刊《细胞报告》在线发表了这一研究成果,博士生杨修佳为第一作者。 抗体组库(Antibody repertoire)是指某一特定个体或组织所包含的全部抗体的集合,它是人类适应性免疫系统的重要组成部分。抗体的多样性源于多个机制,包括生殖系基因片段的重组、连接位点的修饰、体细胞超突变以及重轻链配对等。据估计,这些机制可以产生至少1012种不同的抗体,因此,多样化的抗体能够特异性地识别几乎是无限的潜在免疫原。 早期的技术(即Sanger测序和谱型分析)由于通量小或分辨率低,极大地限制了对抗体组库的研究。然而,高通量测序的出现使人们能够以单个核苷酸的高分辨率同时对数以百万计的抗体进行深入仔细的研......阅读全文
噬菌体抗体库的富集筛选
实验概要用于噬菌体抗体库富集筛选的抗原至关重要,一般来说,纯化后的可溶性蛋白纯度高,含量大,可直接包被ELISA板,是筛选特异性抗体的最佳选择。在某种情况下,需要获得针对某一特殊蛋白的单克隆抗体,也可以用抗这种蛋白的单克隆抗体捕捉抗原的方法来进行筛选。实验步骤1. 将用于筛选特异性抗体的抗原用0.1
余学清/张镇海/曹广文等联合揭示人抗体组库的关键特征
广东省人民医院余学清团队、南方医科大学张镇海团队以及中国人民解放军海军军医大学曹广文团队联合在线发表了群体水平下人抗体组库特征谱的研究,揭示了包括基因使用率、基因重组偏好、公共克隆以及体细胞超突变在内的多个抗体组库的关键特征。 国际学术期刊《细胞报告》在线发表了这一研究成果,博士生杨修佳为第一
噬菌体抗体库技术的特点介绍
1.模拟天然全套抗体库 抗体文库可以达到或超过1011库容,所以能包含B细胞全部克隆。建库的外源基因来自人体外周血,骨髓或脾脏的淋巴细胞提取的mmDNA,mmDNA反转录形成cDNA,这些mRNA是人体多克隆细胞的总mRNA。使用的通用引物采自多个人体,具有人的种属普遍性。抗体的VH和VL基因的
噬菌体抗体库的菌落筛选法
实验概要本实验介绍了噬菌体抗体库的菌落筛选操作流程。实验步骤1. 将每轮筛选洗脱的噬菌体用来感染新鲜的XLIBlu菌,以10μl、20μl等不同量菌液涂于LB氨苄青霉素平皿,37℃ 4~5h。2. 事先将硝酸纤维素膜在5mmol/L的IPTG溶液中浸泡10min,在超净台中晾干后,铺在上述涂有细菌的
人肠道菌株资源库建立
肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关。微生物所供图 近日,中科院微生物所研究员刘双江团队构建了包含400个不同物种的健康人群肠道微生物菌株资源库(hGMB),相关成果发表于《微生物组》期刊。 越来越多的证据表明,肠道微生物与宿主健康和生长发育密切相关。目前,仅有不足半数的肠道微生物物种,
噬菌体抗体库技术知识点
将体外克隆的抗体基因片段插入噬菌体载体,转染工程细菌进行表达,然后用抗原筛选即可获得特异的单克隆噬菌体抗体。利用这一技术可以得到完全人源性的抗体,在HIV等病毒感染和肿瘤的诊断与治疗方面有其独特的优越性。(一)基本原理和程序构建噬菌体抗体库通常包括以下几个过程:1.构建噬菌体载体;2.表达载体转化细
基因组所发布全转录组关联研究知识库
近日,中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的全转录组关联研究知识库正式上线。该研究成果以“TWAS Atlas: a curated knowledgebase of transcriptome-wide association studies”为题在
人源化抗体嵌合抗体的基本介绍
嵌合抗体是利用DNA重组技术,将异源单抗的轻、重链可变区基因插入含有人抗体恒定区的表达载体中,转化哺乳动物细胞表达出嵌合抗体,这样表达的抗体分子中轻重链的V区是异源的,而C区是人源的,这样整个抗体分子的近2/3部分都是人源的。这样产生的抗体,减少了异源性抗体的免疫原性,同时保留了亲本抗体特异性结
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物(一般50-1500 Da)进行高通量定性和定量分析,代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据,方便后续的代谢组学数据分析,揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
北京基因组所开发表观组关联分析数据库
近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
关于人源化抗体的改型抗体的介绍
改型抗体也称CDR植入抗体(CDRgraftingantibody),抗体可变区的CDR是抗体识别和结合抗原的区域,直接决定抗体的特异性。将鼠源单抗的CDR移植至人源抗体可变区,替代人源抗体CDR,使人源抗体获得鼠源单抗的抗原结合特异性,同时减少其异源性。然而,抗原虽然主要和抗体的CDR接触,但
单克隆抗体技术人源性抗体简介
从最初的鼠源单抗技术到人源化技术,单克隆抗体在几十年的岁月中取得了突飞猛进的发展。人源化的问世使单克隆抗体基本解决了人抗鼠源性问题。但有用人源化的抗体基因均来自杂交瘤细胞。杂交瘤的这个操作过程很复杂且耗时加之利用杂交瘤技术难以制备自身抗原抗体和全人源抗体,这两大缺点成为基因工程抗体应用的绊脚石。
人鼠嵌合抗体的特点
人鼠嵌合抗体有以下特点:①不仅保留了亲本鼠抗体的高特异性和亲和力,而且使鼠源性成分减少 70%左右;②其人源Fc 段能有效介导生物学效应功能,如抗体依赖性细胞介导的细胞毒作用(Antibody dependent cell-mediated cytotoxicity,ADCC)、补体依赖性细胞毒作用
人源化抗体的目的
主要目的是减少抗体的异源性,以利于临床应用。(一)嵌合抗体 从杂交瘤细胞中分离出功能性可变区基因,与人Ig恒定区的基因连接,构建鼠-人嵌合质粒载体,转染宿主细胞,表达鼠-人嵌合抗体。(二)改形抗体 将人抗体可变区中互补决定簇(CDR)序列改换成鼠源单抗CDR序列。重构成既具有鼠源性单抗的特异性又保持
人用抗体偶联药物制品
随着生物制药行业的不断发展及抗体类药物的持续创新,国内已经批准上市的ADC药物越来越多,新版药典更新人用抗体偶联药总论。ADC药物在主要利用公用靶点、偶联方式、偶连比、偶连的药物分子及Payload上都有更新。靶点,抗体,毒性分子,连接子的选择与表征成为药物是否成功的关键,检测与表征技术的不断完
噬茵体展示技术和噬菌体抗体库
噬菌体展示技术是一种强有力的基因表达筛选技术,1985年首次由美国科学家SmithMl在(Science)杂志进行了阐述。噬菌体展示技术的基本原理是将外源蛋白的基因克隆到噬菌体的基因组DNA中,从而在噬菌体的表面表达特定的外源蛋白。Ellis SEp等指出利用噬菌体展示多肽库可以筛选和确定线虫疫苗的
噬茵体展示技术和噬菌体抗体库
噬菌体展示技术是一种强有力的基因表达筛选技术,1985年首次由美国科学家SmithMl在(Science))杂志进行了阐述。噬菌体展示技术的基本原理是将外源蛋白的基因克隆到噬菌体的基因组DNA中,从而在噬菌体的表面表达特定的外源蛋白。Ellis SEp等指出利用噬菌体展示多肽库可以筛选和确定线虫
中国BIGD跻身国际生物组学数据库
测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及
《自然》获得首创性全基因组RNAi库
来自奥地利科学院维也纳分子生物学研究院(Institute of Molecular Biotechnology of the Austrian Academy of Sciences)的研究人员以果蝇为研究对象,利用一套完整的基因组序列数据,从达到了88%覆盖率的蛋白编码基因中获得了全基因组范围内
基因组所完成开发RiceWiki数据库
近日,中国科学院北京基因组研究所章张研究员课题组与北京理工大学、中国林业科学研究院及华中农业大学合作开发完成RiceWiki数据库。该数据库是基于维基百科的水稻基因信息平台,是可编辑且内容公开的公众注释系统。研究成果在Nucleic Acids Research杂志发表。 水稻是人类重
cDNA文库组标准流程八:pBlueScript-cDNA库扩增
1.试剂及配方:2 x LB (1升): 20g 氯化钠 20g 蛋白提取物 10g 酵母提取物 加入蒸馏水至1升,用NaOH调pH值至7.0,高压灭菌2 x LB-甘油(12.5%)(200ml)175ml 2 x LB液体2
研究开发表观组关联分析数据库
近日,由中国科学院北京基因组研究所国家基因组科学数据中心开发的人类表观组关联分析数据库EWAS Data Hub正式上线。该项研究成果以EWAS Data Hub: a resource of DNA methylation array data and metadata 为题在国际学术期刊《核
研究发布大豆多维组学数据库SoyOmics
大豆(Glycine max (L.) Merr.)是重要的粮油作物之一,其产量提升、品质改进关乎全球人口的需求和利益。高通量测序技术的发展促使大豆组学研究不断深入。实现大豆多维组学数据的整合分析,将会为大豆遗传育种提供有力支持。 近日,中国科学院遗传与发育生物学研究所田志喜团队联合北京基因组
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank-3.0
中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese
概述噬茵体展示技术和噬菌体抗体库
噬菌体展示技术是一种强有力的基因表达筛选技术,1985年首次由美国科学家SmithMl在(Science)杂志进行了阐述。噬菌体展示技术的基本原理是将外源蛋白的基因克隆到噬菌体的基因组DNA中,从而在噬菌体的表面表达特定的外源蛋白。 Ellis SEp等指出利用噬菌体展示多肽库可以筛选和确定线
噬菌体抗体库技术基本原理是什么?
构建噬菌体抗体库通常包括以下几个过程: 1.从外周血或脾、淋巴结等组织中分离B淋巴细胞,提取mRNA并反转录为cDNA; 2.应用抗体轻链和重链引物,根据建库的需要通过PCR技术扩增不同的Ig基因片段; 3.构建噬菌体载体; 4.表达载体转化细菌,构建全套抗体库。
人用重组DNA蛋白制品细胞库系统概念
通常包括主细胞库和工作细胞库。主细胞库是由含目的基因表达载体转化的细胞种子经传代扩增制成的均一悬液,分装于单独容器中用于贮存。工作细胞库是从主细胞库经有限传代扩增制成的均一悬液,并分装于单独容器中用于贮存。所有的贮藏容器应在相同条件下妥善保管,一旦取出使用,不得再返回库内保存。应详细记录细胞库类型、
38人,拟入选科技专家库
厦门市科学技术局关于2024年第二批拟入选科技专家库专家公示 根据相关要求,经本人申请、所在工作单位推荐,我局初审38人符合专家库入库条件,按程序,现对符合入库要求的38位专家予以公示。
人鼠嵌合抗体的功能特点
人鼠嵌合抗体有以下特点:①不仅保留了亲本鼠抗体的高特异性和亲和力,而且使鼠源性成分减少 70%左右;②其人源Fc 段能有效介导生物学效应功能,如抗体依赖性细胞介导的细胞毒作用(Antibody dependent cell-mediated cytotoxicity,ADCC)、补体依赖性细胞毒作用