PCRRFLPSSCP及测序用于霍乱弧菌ctxAB基因多态性的研究
建立PCR-RFLP-SSCP及测序方法，用于分析霍乱弧菌肠毒素AB(ctx-AB)基因多态性。针对ctx-AB基因设计引物，扩增片段为528bp，包括ctx-B编码基因375bp，引物序列为5′-GGT GTA AAA TTC CTT GAC G-3′和5′-GGT TCG ATG ATG AGA AGC-3′。PCR产物经RsaⅠ酶切为317bp和211bp 2个片段。对酶切产物进行单链构象多态性(SSCP)分析，银染色法显示结果。对不同SSCP类型测序，利用PCR方法直接对PCR产物测序。霍乱弧菌O1群古典型(CVC)标准株569B和16017，埃尔托型(EVC)标准株919，O139群标准株MO45，EVC80株(广东省90年代病人分离株)，O139群10株(广东省90年代病人分离株)，由广东省和广州市卫生防疫站提供。PCR扩增ctx-AB基因，上述菌株均产生1条约528bp的片段，扩增产物经RsaⅠ内切酶消......阅读全文
PCRRFLPSSCP及测序用于霍乱弧菌ctxAB基因多态性的研究
建立PCR-RFLP-SSCP及测序方法，用于分析霍乱弧菌肠毒素AB(ctx-AB)基因多态性。针对ctx-AB基因设计引物，扩增片段为528bp，包括ctx-B编码基因375bp，引物序列为5′-GGT GTA AAA TTC CTT GAC G-3′和5′-GGT TCG ATG ATG A
PCRRFLPSSCP及测序用于霍乱弧菌ctxAB基因多态
建立PCR-RFLP-SSCP及测序方法，用于分析霍乱弧菌肠毒素AB（ctx-AB）基因多态性。针对ctx-AB基因设计引物，扩增片段为528bp，包括ctx-B编码基因375bp，引物序列为5′-GGT GTA AAA TTC CTT GAC G-3′和5′-GGT TCG ATG ATG A
生物芯片用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列，这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列，准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异，
454用于西红柿基因组测序
最近，西红柿基因组学会完成了一个农业种植西红柿品系Solanum lycopersicum的基因组图谱，以及一个野生型西红柿品系S. pimpinellifolium的基因组图谱，并将其与已知的土豆基因组以及其他植物比较，寻找与水果有些特性相关的基因，相关文献在Nature杂志作为封面文章发
生物芯片技术用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列，这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列，准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异，
生物芯片技术用于基因测序
基因芯片利用固定探针与样品进行分子杂交产生的杂交图谱而排列出待测样品的序列，这种测定方法快速而具有十分诱人的前景。研究人员用含135000个寡核苷酸探针的阵列测定了全长为16.6kb的人线粒体基因组序列，准确率达99%。用含有48000个寡核苷酸的高密度微阵列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差异，
英国将测序万人基因组用于疾病研究
近日，在英国伦敦的科学博物馆，维康基金会（Wellcome Trust）宣布了英国10K（UK10K）项目，即英国将在接下来的三年内测定10000个人的基因组序列。英国10K项目的负责人Richard Durbin表示，这项宏伟的计划将得到生物医学慈善会约1000万英镑的支持，10K项目旨在找出
－NIH出资$3.13亿用于疾病基因组测序研究
美国国立卫生研究院（NIH）将资助一些基因组测序分析中心，致力于破解人类常见病和罕见病的基因信息。NIH下属的国家人类基因组研究所（NHGRI）14日宣布成立“常见疾病基因组学中心（CCDG）”，该中心将利用基因组测序技术，从基因水平研究心脏病、糖尿病、中风以及自闭症等常见疾病产生的原因。NHG
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
用于基因组测序及足迹分析的连接介导PCR实验
连接介导的单侧PCR 从单层细胞制备用于DMS足迹分析的基因组DNA 从悬浮细胞中制备用于DMS足迹分析的基因组DNA 实验方法原理
用于基因组测序及足迹分析的连接介导PCR实验
实验方法原理 实验材料 0.4μg μL溶于pH 7.5的TE缓冲液的经打断的基因组DNA试剂、试剂盒 第一链合成混合物 含有寡核苷酸引物I20μmol L单侧接头混合物连接酶稀释液连接酶混合物2000 〜3000 Weiss 单位 mL T4 噬菌体 DNA 连接酶用于沉淀的盐混合物10
用于基因组测序及足迹分析的连接介导PCR实验
PCR可用以指数扩增位于两个特定引物杂交位点之间的DNA片段，而在连接介导 的单侧PCR中，本质上，它只需要一个引物杂交位点的特异性，第二个引物是通过连 接反应加上的单一接头。这个接头和旁侧的基因特异性引物一起可以对任 何DNA片段进行指数级的扩增。由于一个确定的已知长度的序.列被加于每个片段，可以
tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-ZDX
PYRO测序用于SNP基因分型原理
其实是一种段片段焦磷酸测序技术，在测序引物的引导下，完成段片段（含snp）的测序，从而实现基因分型。缺点：不能检测长片段，对于重复序列没有办法。原理简介1.测序引物与单链，PCR扩增的DNA模板相结合。然后将其与DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶，以及底物APS和荧光素一起孵
用于基因组测序及足迹分析的连接介导PCR实验2
从单层细胞制备用于DMS足迹分析的基因组DNA实验材料DNA试剂、试剂盒PBS适用于样品细胞的培养液裂解液在15 cm培养血的单层培养细胞双份样品100%硫酸二甲酯（DMS)缓冲液平衡酚25:24:1 (V V V)酚 氯仿 异戊醇24: 1(V V)氯仿 异戊醇仪器、耗材50 mL和15 mL一次
用于基因组测序及足迹分析的连接介导PCR实验3
从悬浮细胞中制备用于DMS足迹分析的基因组DNA实验材料悬浮培养细胞试剂、试剂盒PBS裂解液100%硫酸二甲酯（DMS)100%乙醇室温仪器、耗材50 mL螺口聚丙烯管（如Coming公司产品）台式离心机实验步骤1) 在50 mL螺口聚丙烯管中分别准备3份49 mL PBS,用前置于冰上预冷至少30
研究揭示多态性重复基因的基因组演化机制
近百年来，进化遗传学工作致力于探索重复基因的起源机制和功能演化过程。经典观点认为，基因重复后产生两个完全等同的拷贝，其中一个冗余拷贝在自然选择作用下获得新功能。也有观点认为，剂量效应和不完整基因重复等因素使重复基因并非是等同的冗余拷贝。剂量敏感基因（满足剂量平衡效应的蛋白复合体成员基因或X染色体
基因多态性的成因
1、等位基因复等位基因（multiple allele）是指位于一对同源染色体上对应位置的一对基因。由于群体中的突变，同一座位的基因系列称为复等位基因。某些复合体基因的每一座位都存在为数众多的复等位基因，这是某些复合体（HLA）高度多态性的最主要原因。2、共显性共显性（condominance）是指
基因多态性的定义
基因多态性（gene polymorphism）是指处于随机婚配的群体中，同一基因位点可存在2种以上的基因型。在人群中，个体间基因的核苷酸序列存在着差异性称为DNA基因多态性(gene polymorphism)。这种多态性可以分为两类，即DNA位点多态性(site polymorphism)和长度
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究
研究背景 胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中，大约有40%胃癌发生于中国，多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究
研究背景 胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中，大约有40%胃癌发生于中国，多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移
基因测序未来研究方向
研究人员对基因测序数据的需求越来越大。Eric Green、Edward Rubin和Maynard Olson三位科学家对未来40年基因测序技术的应用进行了展望。四十年前，也就是1997年前，两篇论文首次报道了确定DNA片段中化学碱基顺序的简易方法。在此之前，分子生物学家们只能检测DNA片段，而不
康成tRF测序应用于Biomarker研究
南京医科大学第一附属医院肿瘤科副主任医师殷咏梅教授长期从事消化道肿瘤和乳腺肿瘤的内科治疗，近来，其实验室利用tRF&tiRNA测序，发现在曲妥单抗敏感和耐受的乳腺癌细胞中，tRNA来源的小非编码RNA分子tRF&tiRNA表达差异显著。其中tRF-30-JZOYJE22RR33和tRF-27-Z
－深圳：无偿献血血液不能用于基因测序
“无偿献血者所献血液只能用于临床输血，除了不得买卖外，也不得用于包括基因测序等科学研究在内的其他用途。”28日，深圳市人大常委会再次审议了《深圳经济特区无偿献血条例（草案）》（以下简称“条例”）。记者注意到，此次修改对献血者予以更多优惠和鼓励，而对所献血液的用途则作出明确限定。 由于深圳是一个
单分子测序：基因测序不再遥不可及
在年初的J.P.Morgan健康医疗大会上，美国基因测序公司Illumina宣布将创建一个新公司——Grail，致力于开发一种不超过1000美元的血液检测，用于多类型癌症的早期筛查。这种肿瘤DNA测序的主要目的是在无症状的个体中诊断各种各样的癌症，从而实现提前预防或治疗。 随着技术的不断进步，
单分子测序：基因测序不再遥不可及
如果说二代测序的使命是使成本降低到1000美元/基因组的话，那么三代测序的使命就是使成本降低到100美元/基因组，进一步促进测序发展为临床的常规检测技术，在临床诊疗上发挥更大的作用。 在年初的J.P.Morgan健康医疗大会上，美国基因测序公司Illumina宣布将创建一个新公司——Grail
单分子测序：基因测序不再遥不可及
如果说二代测序的使命是使成本降低到1000美元/基因组的话，那么三代测序的使命就是使成本降低到100美元/基因组，进一步促进测序发展为临床的常规检测技术，在临床诊疗上发挥更大的作用。在年初的J.P.Morgan健康医疗大会上，美国基因测序公司Illumina宣布将创建一个新公司——Grail，致力于
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究－二
图2. Sanger 测序验证后的非同义体细胞突变，A，B分别代表胃癌原发灶和腹膜转移灶中的非同义体细胞突变。 图3.胃癌原发灶和腹膜转移灶中验证后的SNP分布。参考文献1. Torre LA, Bray F, Siegel RL, Ferlay J, Lortet-Tieulent J an
全外显子测序应用于胃腺癌腹膜转移的驱动基因研究－一
研究背景胃癌是全世界发病率第五、肿瘤死亡率高居第三的常见恶性肿瘤[1]。其中，大约有40%胃癌发生于中国，多数人被诊断为胃癌时已是进展期，更容易转移或者复发[2]。无论是早期胃癌还是晚期胃癌，腹膜转移都是最常见的转移或者复发方式[3-5]。由于目前没有有效的治疗手段，胃癌一旦发生腹膜转移，患者的中位
纳米孔测序技术用于快速的病毒病原体的鉴定及进化研究
2014-2016年，西非暴发埃博拉疫情流行期间，进行了大量ELISA和基于RT-PCR的检测，这些方法的检测虽然简易、便携、快速，但由于病原体不断进化，这些方法很快变得过时，并且还缺乏能在症状出现前检测出病毒的方法。 使用传统的测序技术虽然可以克服病原体不断进化的问题，但这一技术只有在将样品