mtSC:单细胞类型自动鉴定的新方法
单细胞测序技术有助于刻画细胞层面的异质性,为进一步探索细胞功能和内在作用机制等奠定了基础。在单细胞转录组测序数据的分析过程中,细胞类型鉴定是必须且重要的一步。常规的细胞类型鉴定依赖于细胞类型标记基因,这种方法费时费力且不稳定,可重复性差,易导致不同实验室的鉴定结果不可比较。随着单细胞测序技术的迅猛发展,众多科学家联名在2017年提出人类细胞图谱计划(The Human Cell Atlas),于2020年提出了人类癌症图谱计划(The Human Tumor Atlas),海量的已标注细胞类型的单细胞转录组测序数据越来越多,利用这些数据作为参考数据集(reference)来鉴定新测序的细胞(single cell assignment against the reference),正成为一种细胞注释的新思路。 2021年5月29日,同济大学生命科学与技术学院生物信息系刘琦教授课题组(段斌,陈绍奇,陈晓涵为文章共同第一作者)......阅读全文
ABO血型鉴定的鉴定方法
生理盐水凝集法 ①玻片法:操作简单,适于大量标本检查,但反应时间长;被检查者如血清抗体效价低,则不易引起红细胞凝集,因此,不适于反向定型。 ②试管法:由于离心作用可加速凝集反应,故反应时间短,而且,借助于离心力可以使红细胞接触紧密,促进凝集作用,适于急诊检查。 红细胞亚型抗原性弱,如抗A抗
裸子植物鉴定实验_松科鉴定
实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤(三)松科 Pinaeeae油松 ( 图 2-2
构建出人类肝脏的完整细胞图谱,鉴定出新的肝细胞亚型
肝脏是人体最大、功能最广泛的器官之一。它将我们食物中的糖、蛋白和脂肪转化为对身体有用的物质,并将它们释放到细胞中。肝脏除了在人体新陈代谢中发挥作用外,还是一种免疫器官,对血液的排毒是必不可少的。最引人注目的是,当仅为原始质量的25%时,肝脏是唯一能够恢复到原来大小的内脏器官。 肝病是世界上最大
JASN:鉴定出可能让HIV感染肾细胞的受体
2016年11月6日/生物谷BIOON/--HIV-1相关肾病是一种能够在未合适地利用抗逆转录病毒疗法加以治疗的非洲裔HIV阳性患者体内产生的肾病。尽管经过多年的广泛研究,人们仍不清楚来自HIV阳性患者的并不表达主要的HIV-1 CD4受体的肾上皮细胞是如何被HIV-1感染的。 如今,在一项新
白细胞介素2的制备及鉴定实验
实验概要本实验制备了白细胞介素2(IL2),并进行了鉴定实验。IL2是Th细胞受有丝分裂原或特异性抗原刺激后,并在白细胞介素1的辅助下,产生的一种可溶性糖蛋白。IL2是体内重要的广谱免疫增强因子,临床上常用于治疗免疫缺陷病及肿瘤等。实验步骤1. 制备粗制IL2无菌采血,肝素抗凝,用RPMI1640按
STR基因分型应用于细胞鉴定的意义
新买到的细胞,实验室传了几代的细胞,又或者储存于超低温冰箱几年不用的细胞,被污染了么? 鉴定正确么?用它做研究会影响实验结果么? 没有经过相应的细胞鉴定,使用了被污染的细胞,经过大量的实验,写出一篇论文,但是结论被推翻,论文被召回,大量的时间、物力和人力被浪费,一切都要从头再来。 背景介绍应用于
研究鉴定出肝脏中Sox9+双向祖细胞
中国科学院生物化学与细胞生物学研究所周斌研究组在国际学术期刊Stem Cell Reports上发表了题为Lineage Tracing Reveals the Bipotency of SOX9+ Hepatocytes during Liver Regeneration 的最新研究成果。该项
细胞分裂素的生物鉴定(萝卜子叶增重法)
一、原理细胞分裂素有促进萝卜子叶增大(鲜重增加)的效应。可先做出细胞分裂素浓度与子叶重量增加的关系曲线,再以待测样品进行对比试验,就可鉴定样品中细胞分裂素的浓度或效价。二、仪器与用具培养皿(直径9cm)5套;圆形滤纸5张;搪瓷盘(带盖)1个;镊子1把;手术剪1把。三、试剂漂白粉适量;5mg/L激动素
ICLAC关于细胞鉴定(Cell-Line-Authentication)的指南与建议
国际细胞系认证委员会 (International Cell Line Authentication Committee, ICLAC)成立于2012年。它的成立是为了帮助学术界发现更多的错误识别/被污染的细胞进而避免在研究实验中使用;同时进一步提高科学家们的细胞鉴定意识以及推动细胞株鉴
关于皮肤干细胞的标志鉴定角蛋白的介绍
角蛋白是表皮细胞的结构蛋白,随着分化程度的不同,表皮细胞表达不同的角蛋白,因而可用于鉴别表皮干细胞、短暂增殖细胞和终末分化细胞。表皮干细胞表达角蛋白19;短暂增殖细胞表达角蛋白5和14;终末分化细胞表达角蛋白1和10。一般认为皮肤基底层、毛囊隆突部干细胞角蛋白19表达阳性,但有毛发皮肤基底层的表
分析细胞鉴定金标准STR(Short-TandemRepeat)短串联重复...
分析细胞鉴定金标准-STR(Short TandemRepeat)短串联重复序列STR(Short TandemRepeat,短串联重复序列)分析已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定。由于目前使用错误细胞情况非常严重,越来越多的杂志要求在投稿时提供细胞STR分析数据。经常有小伙
细胞株STR鉴定(Cell-Line-STR-Authentication)-FAQs-(2)
1.细胞株进行STR鉴定时,进行比对、参考的数据库有哪些?答:国外数据库有ExPASy (Cellosaurus) 、ATCC (American type culture collection) 、DSMZ (Deutsche Sammlung von Mikrorganismen and Zel
裸子植物鉴定实验_苏铁科鉴定
实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤苏铁科cycadaceae苏铁为常绿乔木,茎短不
裸子植物鉴定实验_柏科鉴定
实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤柏科Cupressaeeae侧柏,如图取侧柏新鲜
裸子植物鉴定实验_银杏科鉴定
实验材料苏铁带球果新鲜材料、苏铁大抱了叶新鲜叶片(或腊叶标本)、银杏腊叶标木(或新鲜叶片)银杏种子纵切片油松新鲜材料(或腊叶标本)油松叶横切片、侧柏新鲜材料(或腊叶标本)试剂、试剂盒乙酸洋红仪器、耗材显微镜镊子解剖针载玻片盖玻片滴管培养皿吸水纸实验步骤(二)银杏科 Ginkgoaceae银杏 ( 图
流式细胞术实验关于细胞活性的鉴定等相关内容
一、细胞与抗体的比例:厂家推荐的抗体用量通常是假定靶细胞数量在5X105 ~1x106范围内。有些标本没有足够的细胞,有些则由于细胞量大,正常浓度下的抗体相对过量或不足,导致假阳性或假阴性结果。因此,每个实验室应根据不同于厂家推荐的方法,调整细胞与抗体用量,得到最适的细胞/抗体比例。 二、细胞
人类大脑皮层新鉴定出75种不同细胞类型
据英国《自然》杂志22日发表的一项研究,美国艾伦脑科学研究所科学家利用单核RNA测序技术,鉴定出了人类大脑皮层某区域中的75种不同细胞类型。通过与小鼠的类似脑区比较,研究人员发现了二者在结构和细胞类型方面的相似性,但也存在相当多的差异。这强调了在研究模式生物之外,直接研究人脑的重要性。 人脑的
胚胎小鼠纹状体神经干细胞的分离培养及鉴定
方法:神经干细胞的培养①原代细胞的培养:取孕13.5天昆明种二级孕小鼠,引臼脱颈处死,碘酒、乙醇消毒腹部,逐层剖开腹部皮肤、肌肉、腹膜,取出子宫,放入盛有D1-SGH液的器皿中。仔细剥离胎膜、羊膜,暴露胎鼠,剪开颅骨,取出胎鼠脑组织并转移至另一盛有D1-SGH液的器皿中,体视显微镜下剥离脑膜,分离胎
胚胎小鼠纹状体神经干细胞的分离培养及鉴定
原代、传代培养 实验材料 孕13d的昆明种二级小鼠 试剂、试剂盒 胎牛血清
胚胎小鼠纹状体神经干细胞的分离培养及鉴定
原代、传代培养实验材料孕13d的昆明种二级小鼠 试剂、试剂盒胎牛血清
我国科学家发现并鉴定免疫调控红细胞亚群
人体中,部分非免疫细胞也可以发挥免疫调节作用,促进个体的健康发育。在人类发育过程中,红细胞的免疫调节功能所依据的分子和细胞机制仍有待研究。中国医学科学院血液学研究所研究人员通过单细胞转录组学分析,发现并鉴定了免疫调控红细胞亚群。该研究成果于近日发表在《Nature Immunology》上,题为:S
为什么STR鉴定对于ATCC细胞系来说很重要
ATCC 成立于 1925 年,是大的生物资源中心,由美国 14 家生化、医学类行业协会组成的理事会负责管理,是一家全球性、非盈利生物标准品资源中心。 进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国?ATCC,
视神经少突胶质细胞体外培养纯化及鉴定
1.材料和方法 1.1 DMEM/F12条件培养液(亚硒酸钠40μg·L-1,腐胺16.2 mg·L-1,转铁蛋白100 mg·L-1,胰岛素234U·L-1,甲状腺素0.4μg·L-1,黄体酮0.62 mg·L-1,谷氨酰胺3g·L-1)。DMEM/F12培养基、小牛血清购自Hy
效应细胞功能鉴定和抗体药物研发之ADCC分析(二)
8.不同效靶比(E:T)对ADCC作用的影响 10:1 5:1 2.5:1 1.3:1 0.6:1 0.3:1
小鼠CD4+T细胞外泌体分离及鉴定
目的:探讨CD4+T细胞是否具有分泌外泌体的能力,以及CD4+T细胞外泌体参与炎症及肿瘤免疫过程的可能。 方法:应用断颈处死的方法取出小鼠的脾脏,用磁珠分选的方法从小鼠脾脏细胞中分选出CD4+T细胞,并尝试从培养基上清液中提取CD4+T细胞的外泌体,在透射电镜下观察,后用PCR技术分
关于Dopa染色法鉴定黑色素细胞的介绍
黑色素的合成是以酪氨酸为底物,在酪氨酸酶的作用下,经过羟化变成多巴,进而氧化成多巴醌,进一步变成黑色素。MC中存在特异性的酪氨酸酶,细胞培养时加入外源性左旋多巴,会在酪氨酸酶的作用下合成较多的色素颗粒使细胞在镜下呈现黑色。
UMR106RFP荧光标记细胞株鉴定方法
UMR106-RFP荧光标记细胞株鉴定方法 一、外观直接观察鉴定 外观菌种,菌丝浓白、粗壮、富有弹性,则生命力强;如果菌种菌丝萎缩,干燥无色泽,或菌丝体自溶产生了多量红褐色液体,则生活力已变弱,不宜再用;木块菌种如仍保持硬实,则属于生活力强的菌种,如若木块变得软化松散,则已老化,不
红细胞Rh血型系统怎么样进行血型鉴定?
红细胞Rh表型可用特殊的具有抗D、C、c、E和e抗血清检测来鉴定。虽然Rh血型系统中有许多种抗原,但常规只用抗D血清检查有无D抗原。 1.酶介质法: 木瓜酶或菠萝蛋白酶可以破坏红细胞表面的唾液酸,使红细胞膜失去电荷,缩小红细胞间的距离;同时酶还可以部分地改变红细胞表面结构,使某些隐蔽的抗原得
单细胞鉴定6000+蛋白,多场景实测数据震撼来袭!
过去几年里,单细胞蛋白质组学技术取得了长足发展,单细胞蛋白质组学逐渐走向成熟,后续有望广泛应用于肿瘤异质性分析、免疫学研究、发育生物学、神经科学以及精准医学等领域。然而,从技术发展成熟到实际场景应用分析的过程中,我们仍面临诸多挑战:1.当前单个细胞的蛋白鉴定深度还有待进一步提升以更好回答科学问题;2
小鼠CD4+T细胞外泌体分离及鉴定
目的:探讨CD4+T细胞是否具有分泌外泌体的能力,以及CD4+T细胞外泌体参与炎症及肿瘤免疫过程的可能。方法:应用断颈处死的方法取出小鼠的脾脏,用磁珠分选的方法从小鼠脾脏细胞中分选出CD4+T细胞,并尝试从培养基上清液中提取CD4+T细胞的外泌体,在透射电镜下观察,后用PCR技术分析miR-23a、