多臂老虎机助力无序蛋白药物虚拟筛选
最近，北京大学化学与分子工程学院的刘志荣教授课题组将多臂老虎机算法应用于天然无序蛋白质的药物设计问题，大大加速了基于构象系综的配体虚拟筛选过程,相关研究成果发表在Phys. Chem. Chem. Phys. (2021, 23, 6800-6806)上。 一个人在成长过程中会遇到各种各样的选择问题，如一些人生规划的抉择：上哪所大学，学什么专业，去哪家公司，等等。再如我们进入一家电玩城，那里摆着一排老虎机，虽然外表一模一样，但是每个老虎机吐钱的概率却不一样，作为一名资深玩家应该选择摇动哪台老虎机呢（图1）？这些选择问题有没有什么科学的办法来解决呢？答案是：有！而且是非常科学的办法，那就是强化学习中的多臂老虎机算法。该算法可以科学地推荐收益最大的方案，而且能够应用于许多领域，如：一种新疾病（如新冠），如何尝试各种治疗方法，来尽快治愈病人？一个新产品，如何调整定价，来获得最大收入？一个新闻稿，如何尝试推荐，来获得最多总点击次数......阅读全文
多臂老虎机助力无序蛋白药物虚拟筛选
最近，北京大学化学与分子工程学院的刘志荣教授课题组将多臂老虎机算法应用于天然无序蛋白质的药物设计问题，大大加速了基于构象系综的配体虚拟筛选过程,相关研究成果发表在Phys. Chem. Chem. Phys. (2021, 23, 6800-6806)上。 一个人在成长过程中会遇到各种各样的选
Science：蛋白无序？但有功能
Rohit Pappu和他的两位同事在9月20日《科学》(Science)杂志上的一篇perspective文章中，揭示了一大类没有遵循结构-功能范例的蛋白质。这些所谓的内在无序蛋白质无论整体或部分均不能折叠，但它们是具有功能的。 近期我们坐下类与圣路易斯华盛顿大学生物系统工程学中心的
Nature解析多功能的无序蛋白
精密折叠的结构，给蛋白赋予了多重功能。不过，细胞中也存在不少未折叠的松散蛋白，这些无序蛋白IDP(intrinsically disordered protein)也能执行多种功能。本周的Nature杂志上，Scripps研究所(TSRI)的科学家们，阐述了一个重要IDP实现多重功能的策略，
化合物虚拟筛选平台技术交流问答
虚拟筛选相关A:问一下，贵公司有没有关于虚拟筛选的在线培训课程?小殷 :没有呢。不过今年平台会上线虚拟筛选功能，届时会针对此功能进行免费培训。A :哦哦，之前看过公众号的教程，哈哈哈，但是想系统学一下如何选择和使用分子库。殷赋科技 : 分子库大多使用商业库，主要看你们经费条件。尽量选择结构多样性良好
利用“数据+知识+AI”实现新靶标药物虚拟筛选
6月6日，中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《自然-机器智能》（Nature Machine Intelligence）上发表了题为Generic protein–ligand interaction scoring by integrating physical prior knowled
通过拉曼光谱逐个探究无序蛋白分子
天然无序蛋白具有独特的结构特点，参与许多重要的生理与病理过程，还与一些神经退行性疾病的发生和发展有着密切联系。其中，α-突触核蛋白（α-Syn）的单体在自然状态中不形成稳定的蛋白质二级结构，而是自发地从某一种二级结构转变为另一种二级结构。有些情况下，α-突触核蛋白从一些不太稳定的低聚体转化成不可
定制+预测，科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台
5月16日，中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术，搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能（AI）平台KinomeMETA，为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。 蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关，激酶靶向抑制剂是
定制+预测，科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台
5月16日，中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术，搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能（AI）平台KinomeMETA，为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。 蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关，激酶靶向抑
定制+预测，科学家开发新型激酶谱虚拟筛选平台
中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组利用结合图神经网络的元学习技术，搭建了支持用户定制的激酶多靶点活性筛选人工智能（AI）平台KinomeMETA，为药物新型激酶靶点发现和药物筛选提供有力工具。相关研究发表于《核酸研究》。 蛋白激酶的异常激活或过表达与多种疾病相关，激酶靶向抑制剂是一类极具价值
数据+知识+AI，科学家解锁新靶标药物虚拟筛选
6月6日，中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组构建了一种通用蛋白质-配体相互作用评分方法EquiScore，在药物虚拟筛选场景和先导化合物优化场景中，EquiScore对训练未见的新靶标表现出了良好的泛化性能，其可解释性分析为基于结构的药物设计提供了有价值的线索。相关研究发表于《自然—机器智能
心理健康虚拟疗法不再“虚拟”
在1日举行的“MQ（心理健康慈善机构）心理健康2018年会”上,英国卫生部政务次官夏含夷宣布,英国国家卫生研究院（NIHR）将推出一项总额为400万英镑的计划,旨在为国家医疗服务体系（NHS）提供先进的心理健康虚拟疗法。 这项突破性计划将由英国国家医疗服务基金会、牛津大学等机构组成的团队实施,
抗体的亲和力
抗体的亲和力 是指抗体和抗原结合的牢固程度。亲和力的高低是由抗原分子的大小、抗体分子的结合位点与抗原决定簇之间立体构型的合适度决定的。有助于维持抗原抗体复合物稳定的分子间力有氢键、疏水键、侧链相反电荷基因的库仑力、范德华力和空间斥力。亲和力常以亲和常数K表示，K的单位是L/mol，通常K的范围在 1
Science子刊：增加胶原蛋白亲和力可改善癌症免疫疗法
基于免疫检查点抑制剂（CPI）和白细胞介素-2（IL-2）的癌症免疫疗法正变得越来越普遍，这是因为它们具有令人印象深刻的激活患者自身免疫系统以对抗肿瘤的能力。然而，全身性的免疫系统激活方法不是没有风险的，免疫疗法通常伴随着严重不良事件。 为了解决这个问题，在一项新的研究中，来自美国芝加哥大学、
Cell：科学家阐释天然无序蛋白质的研究进展
截至目前为止研究人员并不清楚细胞中的蛋白“交通”如何运转地这么迅速，而且可以足够精确地抑制不必要分子的通过，近日，一项刊登在国际杂志Cell上的研究报道中，来自德国、法国和英国的研究人员解开了这个谜题。 在细胞中蛋白质可以识别其它的蛋白质，每一种蛋白质都会在一类特殊的蛋白质中从事特殊的工作，就
融合蛋白的免疫筛选实验
实验材料 大肠杆菌试剂、试剂盒 LB顶层琼脂糖叠氮钠第一抗体仪器、耗材 硝酸纤维素滤膜实验步骤 1. 在150 ml LB 平板上滴定λgt11 cDNA文库的滴度，宿主菌为大肠杆菌LE392菌株，每个平板使用7 ml 1%LB顶层琼脂。2. 选择适当的滴度铺平板，于37℃温育8 h。 3.
Northwestern筛选蛋白表达文库实验
实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库（融合蛋白的 N 端由载体序列编码，C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码），进而诱导融合蛋白表达，并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上，以标记的 RNA 探针进行筛选，最终获取能与靶
Northwestern筛选蛋白表达文库实验
Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库（融合蛋白的 N 端由载体序列编码，C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码），进而诱导融合蛋白表达，并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤膜上，以标记的 RNA 探针进行筛选，最终获取能与靶 RNA 分子特异性结合
Northwestern筛选蛋白表达文库实验
实验方法原理 Northwestern 筛选蛋白表达文库的方法是通过构建 IPTG 可诱导的融合蛋白表达文库（融合蛋白的 N 端由载体序列编码，C 端由克隆到载体的 cDNA 文库编码），进而诱导融合蛋白表达，并将蛋白质固定于硝酸纤维素滤
融合蛋白的免疫筛选实验
基本方案 IPTG法 实验材料 大肠杆菌 试剂、试剂盒
GST融合蛋白纯化——筛选表达株
Purification of GST fusion proteins in E.coli GSTSugden lab,McArdle Laboratory for Cancer Research ,University of Wisconsin-Madison Medical SchoolScre
如何测定抗体亲和力
在《抗体工程》上有亲和力常数的测定方法，如平衡透析、竞争结合、荧光增强法、硫氰酸盐洗脱法、ELISA和固相放射免疫测定法（SPRIA）等。其中ELISA和SPRIA是最敏感的检测方法。通常采用竞争结合以及Scatchard作图法。如果有条件用SPR方法，这是目前国际上流行的方法，该方法灵敏，客观。另
如何测定抗体亲和力
在《抗体工程》上有亲和力常数的测定方法，如平衡透析、竞争结合、荧光增强法、硫氰酸盐洗脱法、ELISA和固相放射免疫测定法（SPRIA）等。其中ELISA和SPRIA是最敏感的检测方法。通常采用竞争结合以及Scatchard作图法。如果有条件用SPR方法，这是目前国际上流行的方法，该方法灵敏，客观。另
全面剖析人工智能寻找新冠病毒治疗靶点及药物筛选
SARS-CoV-2来势汹汹，目前没有特效药特异性的靶向SARS-CoV-2并将其“杀死”，治疗通常通过维持患者机体的稳态平衡，然后靠患者自身的免疫系统来杀灭新型冠状病毒。基于蛋白质结构的计算机虚拟筛选能够在极短时间内从化合物数据库中发现与抗病毒靶点之间可能存在相互作用的小分子化合物，能够为新药
蛋白质的吸附性质和亲和力有什么区别
材料表面蛋白质吸附的影响因素：蛋白质(浓度、速度、分子大小、亲和性、结构重组） ； 材料表面(理化性质、疏水性、荷电特性、形貌、机械性质、电学性质) 特点： （1）蛋白质在表面的浓度比它以前所在的溶液中的浓度大得多。 （2）蛋白质在表面和 溶液中是完全不同的两种状态，在表面状态称为被吸附态。 （3）
蛋白质的吸附性质和亲和力有什么区别
材料表面蛋白质吸附的影响因素：蛋白质(浓度、速度、分子大小、亲和性、结构重组） ； 材料表面(理化性质、疏水性、荷电特性、形貌、机械性质、电学性质) 特点： （1）蛋白质在表面的浓度比它以前所在的溶液中的浓度大得多。 （2）蛋白质在表面和 溶液中是完全不同的两种状态，在表面状态称为被吸附态。 （3）
财政贴息贷款改造医疗设备－|－NanoTemper助力仪器申报
近日卫健委发布《国家卫健委开展财政贴息贷款更新改造医疗设备的通知》，对医疗机构设备购置和更新改造新增贷款实施阶段性鼓励政策，中央财政贴息2.5个百分点，期限2年，申请贴息截止到2022年12月31日，合计涉及1.7万亿贷款总额。涉及的关键领域包括高校、职业院校、医院、中小微企业等九大领域的设备购置和
关于圆素胶原蛋白的筛选介绍
1、原料粉 原料来源：骨胶原蛋白基本采用药用明胶为原料。骨胶原蛋白中富含弹力蛋白，对于改善皮肤松弛，延缓衰老的效果会更明显。因此无论从工艺还是效果上，纯骨胶原蛋白更适合为人体吸收。 2、萃取工艺 酸碱水解与酶解的差别：酶法工艺为目前最为理想和安全的技术，不会破坏分子结构，但相应的萃取成本也
mRNA－显示蛋白的筛选与扩增实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 纯化的 mRNA 显示蛋白
mRNA－显示蛋白的筛选与扩增实验
实验材料纯化的 mRNA 显示蛋白试剂、试剂盒NaOHHClNaClMgCl2乙醇1-丁醇苯酚 氯仿 异戊醇EDTAPCR 缓冲液ATP 琼脂糖ATP-适配体筛选结合缓冲液ATP-适配体筛选洗脱缓冲液鲑精 DNABSA3'引物5'引物Taq DNA 聚合酶仪器、耗材凝胶过滤柱实验步骤
mRNA－显示蛋白的筛选与扩增实验
实验方法原理 实验材料 纯化的 mRNA 显示蛋白试剂、试剂盒 NaOHHClNaClMgCl2 乙醇1-丁醇苯酚 氯仿 异戊醇EDTAPCR 缓冲液ATP 琼脂糖ATP-适配体筛选结合缓冲液ATP-适配体筛选洗脱缓冲液鲑精 DNABSA3'引物5'引物Taq DNA 聚合酶仪器、耗