LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法

在真核细胞中,RNA可以“形单影只”,也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白,它拥有着强大的基因调节能力。 RNA究竟与那些蛋白结合?将怎样作用于人类的发育、疾病?这都是悬而未解的难题。 6月10日,中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA结合蛋白作用靶点的新技术LACE-seq,首次实现了在单碱基分辨率和单细胞层面精准鉴定RNA结合蛋白的结合位点,为研究RNA结合蛋白在胚胎发育和生殖疾病中的功能机制打开了大门。相关研究成果发表在《自然-细胞生物》。 寻觅工具 人类基因组共编码了约1500个RNA结合蛋白,它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。 研究表明,RNA结合蛋白在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。同时,RNA结合蛋白的突变会导致多种遗传性疾......阅读全文

LACEseq——一种RNA结合蛋白靶标研究的新方法

  在真核细胞中,RNA可以“形单影只”,也可以与蛋白质“珠联璧合”。后者被称为RNA结合蛋白,它拥有着强大的基因调节能力。  RNA究竟与那些蛋白结合?将怎样作用于人类的发育、疾病?这都是悬而未解的难题。  6月10日,中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超团队与合作者开发了可在微量细胞中鉴定RNA

LACEseq方法在微量细胞中准确鉴定PTBP1的结合靶标

  6月10日凌晨,中国科学院生物物理研究所研究员薛愿超课题组及其合作者在Nature Cell Biology上,在线发表了题为Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq的论文。  人类基因组编码了约1500个R

可在微量细胞中鉴定RBP作用靶点的新技术LACEseq被开发

  人类基因组编码了约1500个RNA结合蛋白(RNA-binding protein, RBP),它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。RBP在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了关键的调控作用。R

浙大:RNA编辑阻止RISC识别靶标mRNA

  MicroRNAs(miRNAs)结合Ago形成RNA诱导沉默复合体,通过沉默靶mRNA调控基因表达。miRNA的RNA编辑可能影响miRNA的加工,Ago复合物的组装,以及靶mRNA的结合。然而,组装进Ago复合物的被编辑的miRNA的功能,还没有被深入研究过。  浙江大学生命科学学院章晓波教

植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标

  近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。  RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6

植物RNA修饰将成为新一代作物改良靶标

近日,上海交通大学生命科学技术学院副教授姜博晨课题组在《生物技术通报(英文)》(aBIOTECH)发表了综述论文。文章系统梳理了植物m6A调控的最新研究进展以及利用m6A修饰进行作物改良的潜在应用策略。RNA表观修饰是指发生在RNA分子上的化学修饰,广泛存在于动物、植物、真菌等真核生物。N6-甲基腺

“看”得更清!RNA结构解析新技术孕育新发现

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516890.shtm“结构决定功能”是物质科学界的基本共识。目前,非编码RNA的结构解析难题是开展其调控功能和作用机制研究的一大瓶颈。与编码蛋白质的信使RNA(mRNA)不同,非编码RNA往往需要先形成二

靶标预测

靶标预测A:有什么简单的方法可以通过化合物的结构式预测该化合物可能的药理毒理作用么,比如抗肿瘤,抗炎,抗神经等等。B:反向找靶。A:那就复杂咯,想简单点,然后去做细胞实验验证。想着是不是可以通过计算机来预测哈子。C:反向对接。D:直接做激酶谱不就行了。E:多糖类药物可以做这个激酶谱吗?F:激酶谱 一

什么是分子靶标

分子靶标是以研究疾病发生、发展过程中细胞分子生物学上的差异(包括基因、酶、信号转导等不同特性)为基础,筛选和鉴定与疾病密切相关的蛋白质、核酸、酶、受体等生物分子作为药物作用的靶点,通过研究药物设计和构效关系得到靶向特异性生物分子的先导化合物,通过靶向给药控释系统实现有效靶向给药及个体化治疗。分子靶标

细胞瘤新靶标

科学研究人员发现可能用于治疗神经母细胞瘤的新靶点。神经母细胞瘤是zui致命的儿童癌症之一,占所有儿童癌症死亡人数的15%。多数患者无法得到完全治愈,往往在确诊时癌症已经扩散至全身。在过去的20年中,儿童接受的治疗通常伴有非常大的副作用,不仅杀死肿瘤细胞,也杀伤正常细胞。相较于其他大部分癌症,神经母细

Cell子刊:RNA剪接或成治疗阿尔兹海默症的潜在分子靶标

  众所周知,RNA剪接失调与某些神经退行性疾病的发展有关,例如脊髓性肌萎缩和肌萎缩性侧索硬化症。而阿尔兹海默症作为世界上最常见的神经退行性疾病,在这一领域仍未得到详细的研究。  于是,在2013年,美国Emory大学的Seyfried教授课题组在这一领域开启了最前沿的研究。该研究首次发现RNA剪接

单靶标or多靶标:新冠检测试剂该如何选择?

目前,国家药品监督管理局(NMPA)批准的新型冠状病毒检测试剂中,大部分采用的方法为实时荧光RT-PCR。它具有简便快速、特异性强、灵敏度高等特点。那么,其高灵敏度和高特异性的基础究竟是什么呢?让我们来一探究竟。01试剂的检测性能如何体现?检测性能评价中最主要的就是灵敏度与特异性。PCR扩增产物以指

什么是靶标发现技术

靶标发现技术靶标的发现对发展创新药物、生物诊断和生物治疗技术具有重要意义。重点研究生理和病理过程中关键基因功能及其调控网络的规模化识别,突破疾病相关基因的功能识别、表达调控及靶标筛查和确证技术,“从基因到药物”的新药创制技术。简单来说就是一种准确定位致病基因并通过对该基因的修复达到治疗疾病的目的的技

不是lnc--piRNAs可调控飞蝗后代数量的变化

  自然界中,很多动物会根据环境的变化来调节繁殖对策,产生不同数量的后代。动物种群的内在因素在调节繁殖对策方面也发挥重要作用,如种群密度、性比、亲缘关系和个体竞争强弱等均影响所繁殖的后代数量。而后代的多少与种群的维持及动态密切相关,也是动物适应性的重要标志。人们对这种自然现象有所了解,但对动物如何自

首次!黄超兰:单碱基分辨率和单细胞层面的精准鉴定

  2021年6月10日,北京大学医学部精准医疗多组学研究中心黄超兰团队,与中国科学院生物物理研究所薛愿超团队、广东省第二人民医院孙青原团队,合作在Nature Cell Biology上发表了题为“Global profiling of RNA-binding protein targetsite

piRNAs调控新机制决定飞蝗后代数量的变化

自然界很多动物都会根据环境的变化来调节繁殖对策,产生不同数量的后代。动物种群的内在因素在调节繁殖对策方面也发挥着重要作用,比如种群密度、性比、亲缘关系和个体竞争强弱等都会影响所繁殖的后代数量。而后代的多少与种群的维持及动态密切相关,同时也是动物适应性的重要标志。人们对这种自然现象有所了解

piRNAs调控新机制决定飞蝗后代数量的变化

自然界很多动物都会根据环境的变化来调节繁殖对策,产生不同数量的后代。动物种群的内在因素在调节繁殖对策方面也发挥着重要作用,比如种群密度、性比、亲缘关系和个体竞争强弱等都会影响所繁殖的后代数量。而后代的多少与种群的维持及动态密切相关,同时也是动物适应性的重要标志。人们对这种自然现象有所了解

研究发现抗衰老靶标基因

  2月27日,《自然》期刊在线发表了题为《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室蔡时青研究组与中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌研究组合作完成。  衰老是生物体随时间推移各

在化学上,什么叫做靶标

一般是做药学或者医学的会用到靶标这个概念我们现在做的课题是材料化学方向的,应用在医学上面,就牵涉到靶标靶标是指药物作用于体内并实现疗效的特定分子看到你的补充了底物这个概念是和酶配套存在的正所谓酶的反应有特异性就是说酶的活性位点能够结合的是一个特定的结构而能够和酶进行结合反应的,拥有这样特定结构的东西

Bioinformatics:新型肺癌肿瘤靶标

3月25日从中科院昆明动物研究所获悉,在国家自然科学基金委和科技部项目的支持下,该所李功华博士在黄京飞研究员的指导下,建立了新的系统生物学模型,并发现可能是新型的针对肺癌的肿瘤靶标。该研究成果已发表在《生物信息学》上        3月25日从中科院昆明动物研究所获悉,在国家自然科学基金委和科技部项

Cell-Reports:CRISPR挖出大量抗癌靶标

  白血病是一种造血系统的恶性肿瘤,俗称“血癌”。急性髓性白血病AML是比较常见的一种白血病,现有治疗药物在临床上的效果并不理想。Wellcome Trust Sanger研究所改良了CRISPR基因编辑技术,并用该技术找到了大量治疗AML的新靶标。这项研究发表在十月十八日的Cell Reports

肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA

  肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领

EMT可作为肾病的治疗靶标

  成年人受惊吓或恐惧的时候会蜷缩成胎儿姿势。同样,受伤(包括引起癌症的遗传损伤)的成年细胞,会启动一个过程,该过程存在于胚胎发育过程中。  当面临糖尿病、癌症或感染之类的情况时,大多数器官会回复到导致它们出现的方式。然而,这种适应性可能是保护性的,也是有代价的,会导致进一步的长期器官损害。  德克

首次成功靶定“通用”肿瘤靶标

  端粒酶是一种几乎“通用”的肿瘤靶标,因为它在绝大多数的肿瘤中是被激活的。尽管端粒酶在癌症中的重要作用,但是目前在临床上,还没有靶定这种酶的治疗方法。特别是,由于缺乏可用的结构信息,端粒酶小分子抑制剂的研究和开发,已经远远落后于任何其他方法。基于结构的药物设计,是一个强大的工具,可开发高度有效的特

肿瘤早期诊断新靶标之ctDNA

  肿瘤液态活检是目前最具发展潜力的肿瘤无创诊断和实时疗效监测手段,区别于传统的临床诊断手段,该方法具有简便、安全、无创、实时等特点。广义而言,肿瘤液态活检主要是指以外周血液为主的体液标本中细胞及核酸的检测。通常包括了循环肿瘤细胞(CTC)和游离的DNA(ctDNA)两大类,是目前精准医疗的最前沿领

NEJM:癌症药物研发的新型靶标

  SALL4基因负责调节胚胎干细胞的自我更新,是许多癌症中的关键基因,例如肝癌。现在,哈佛干细胞研究所HSCI的研究人员,在肝癌模型中对SALL4基因进行研究,找到了阻断其活性的新型药物。这项研究发表在新英格兰医学杂志(New England Journal of Medicine)上。  

Immunity:败血症研究靶标确定

  败血症是一种很少有病人听说过,但大多数医生都害怕的疾病。人体对细菌攻击的反应可能引发一连串的细胞自我毁灭,无意间导致血块、多器官衰竭和死亡。  免疫系统的功能类似于细胞吃豆人,利用白细胞来追捕"坏人",发起攻击和反击。然而,在极端的情况下,白细胞会进行某种切腹自杀,触发自己的死亡,试图消灭感染。

研究揭示调节炎症的新靶标

  炎症是人体自愈过程不可分割的组成部分,但是,当它变成慢性炎症时就会导致癌症、阿尔兹海默症和心血管疾病等。炎性体(inflammasomes)是遇到各种细胞应激信号时触发炎症反应的蛋白质分子机器。  都柏林圣三一学院的科学家们发现了一个调节炎症的潜在新靶点,炎症会引发一系列疾病,包括糖尿病、癌症和

“973”分子靶标绿色农药项目验收

  “973”计划项目分子靶标导向的绿色化学农药创新研究课题结题总结会日前在华东理工大学召开。会议由项目首席科学家钱旭红院士主持。该项目发表论文总计801篇,申请ZL280项,授权119项,其中国外授权ZL11项。  会上,课题负责人汇报了5年来课题的完成情况和代表性成果,钱旭红院士作了项目总结。该

靶标效应是什么意思?

  药物靶标,选择药物作用靶标要考虑两个方面:  1. 靶标的有效性,即靶标与疾病确实相关,并且通过调节靶标的生理活性能有效地改善疾病症状。  2. 靶标的副作用,如果对靶标的生理活性的调节不可避免地产生严重的副作用,那么将其选作药物作用靶标是不合适的。  靶标发现与确证的一般流程:  1. 寻找疾