一种基于CRISPRCas9的新型诱导谱系示踪技术

通常情况下,是癌症的转移而非原发病灶导致了癌症患者的死亡。转移不单是由遗传驱动的,这表明其他水平的失调可能也是癌症转移的推手。目前的方法无法同时捕获每个分析细胞的分子表型,这限制了人们对不同转移性克隆的研究。 前瞻性谱系示踪方法,例如慢病毒条形码,它涉及用独特的 DNA 条形码标记细胞。然而,这种“静态”条形码策略通常仅限于在体外和单个时间点引入多种标签。因此,它们无法在体内捕获关键的过程。 2021年6月10日,来自美国宾夕法尼亚大学的研究团队在 Cancer Cell 期刊发表了题为:Single-cell lineage tracing of metastatic cancer reveals selection of hybrid EMT states 的研究论文。 该研究开发了一种基于 CRISPR-Cas9 的新型诱导谱系示踪技术—macsGESTALT。该技术可高效捕获单细胞转录和系统发育信息。通过将此技......阅读全文

肿瘤研究,从认识肿瘤细胞开始

  最近一段时间我们一直围绕着肿瘤动物模型的构建,为大家介绍了肿瘤研究中各种实用动物模型的建立方法,相信大家应该收获颇多。动物水平的研究为我们提供了更接近临床的数据分析,与此同时,肿瘤细胞的实验研究也同样重要,它是肿瘤研究的初级阶段,可以更加快捷地提供在体外水平的研究结果。本期我们就开启肿瘤细胞学新

中大长江学者发表CRISPR成果

  在细胞中,对于不稳定的蛋白质来说,稳定性调控是特别重要的。然而,目前还没有开发出一种方便而无偏差的方法,能够确定蛋白质稳定性的调节因子。近期,来自中山大学肿瘤防治中心的研究人员,在《Cell Discovery》杂志发表的一项研究中,通过将全基因组CRISPR-Cas9文库与双荧光蛋白稳定性报告

T细胞重编程来改善癌症免疫疗法功效获突破

  日前,一项刊登在国际杂志Nature上的研究报告中,来自圣犹大儿童研究医院等机构的科学家们通过研究开发了一种有效增强癌症免疫疗法的新型治疗策略,其或能有效减缓肿瘤的生长并延长患癌小鼠的寿命。本文研究发现或能为开发更有效的过继细胞疗法(adoptive cell therapy)提供一种有希望的策

基因编辑先前Doudna盛赞:CRISPR治疗癌症是安全有效的

  工程化的T细胞疗法通过实现与血液相关的癌症(如白血病和淋巴瘤)的长期缓解,正在彻底改变癌症的治疗方法。这些疗法涉及获得患者的T细胞,对其进行“重编程”以攻击癌细胞,然后将其转移回患者体内。使用CRISPR-Cas9进行靶向基因灭活(敲除)可以增强T细胞活性,并具有扩大细胞治疗应用的潜力。到目前为

靶向基因编辑敲除免疫检查点——肿瘤免疫治疗新策略

  中国科学院动物研究所王皓毅团队在Frontiers of Medicine 发表封面文章《利用CRISPR/Cas9在CAR-T细胞中敲除免疫检查点LAG-3》(标题原文:CRISPR-Cas9 mediated LAG-3 disruption in CAR-T cells),聚焦靶向基因编辑

王皓毅研究员:基于CRISPRCas9系统的模式小鼠构建

  在第一天的会议中,来自中国科学院动物研究所干细胞与生殖生物学国家重点实验室基因工程技术研究组组长、2014年入选“青年千人计划”的王皓毅研究员关于CRISPR-Cas9基因编辑技术在小鼠模型构建、T细胞基因编辑和基因表达调控的应用的报告激起了热烈的反响。  CRISPR-Cas9基因编辑技术近两

PNAS:构建出提高CRISPRCas9基因编辑精确度的新变体

  在一项新的研究中,来自中国香港城市大学的研究人员开发出基因编辑技术CRISPR-Cas9的一种新变体,它有潜力在人类基因治疗期间提高基因编辑的精确度。相比于野生型CRISPR-Cas9,这种新变体降低了DNA中出现的意外变化,这表明它可能在需要高精确度的基因疗法中发挥作用。相关研究结果近期发表在

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基

CRISPRCas9编辑CART细胞疗法可由于治疗难治性癌症

  根据宾夕法尼亚大学艾布拉姆森癌症中心研究人员发布的最新数据,经过Crispr-Cas9基因编辑的CAR-T细胞可以在癌症患者体内持续存在几个月的时间,并且能够稳定增殖并发挥功能。  该研究是美国首个测试人类基因编辑方法的临床试验,在最近发表在《Science》杂志上的文章中,研究者们介绍了他们对

通过增加靶点范围来扩大CRISPRCas9技术的可用性

  近日,来自麻省总医院(Massachusetts General Hospital)的学者们通过研究表示,一种用来改善基因编辑工具CRISPR-Cas9 RNA引导核酸酶可用性和精确性的方法或许可以应用于其它细菌的Cas9酶中,相关研究发表于国际杂志Nature Biotechnology上,文

Cell:利用CRISPRCas9鉴定出新的辅助性T细胞调节基因

  T细胞是免疫系统中的关键细胞。在一项新的研究中,来自英国威康基金会桑格研究所和芬兰图尔库大学的研究人员构建出首个逆转录病毒CRISPR-Cas9基因编辑文库来探究对小鼠T细胞的调节。他们绘制出控制辅助性T细胞(T helper cell, Th)的最为重要的基因的图谱,并鉴定出几个新的调节基因。

科学家利用CRISPRCas9成功实现T细胞重编程

  从20世纪80年代开始,研究人员就提出了一种理念,即对患者自身的免疫细胞进行遗传修饰使其有效抵御机体感染和肿瘤,但截至目前为止,修饰后的T细胞仍然无法像天然T细胞一样有效发挥作用,这无疑限制了其在临床中使用的价值。近日,一项刊登在国际杂志Nature Biomedical Engineering

CRISPRCas9敲除了九种不同的基因,寻找癌症的“突变标签”

  如果一个细胞发展成了肿瘤,就会失控,不受控制的生长,并向附近组织侵袭,最终开始转移,这是由于细胞出现了许多连续的DNA突变。这些遗传物质的突变积累通常源于最初的环境问题,酶活性变化,DNA复制或DNA修复机制出故障等。  每一种最初的诱变条件都会导致产生各自的DNA损伤模式,科学家们将之称为mu

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(上)

  前言:近年来,CRISPR基因编辑技术正在席卷整个生物医学研究领域,上一期我们已先从CRISPR系统开发及机制研究方面梳理了2018年相关大事件。伴随着基础技术不断优化,CRISPR技术的应用也更加广泛,如动物造模、药物筛选、单碱基编辑技术、细胞谱系示踪、基础疾病研究、疾病诊断、体内编辑和遗传病

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍

治疗遗传性失明症-CRISPRCas9基因疗法直接人体试验

  一名遗传失明症患者成为接受CRISPR-Cas9基因疗法直接人体试验的第一人。据英国《自然》网站近日报道,科学家首次开展临床试验,将CRISPR-Cas9基因疗法直接用于人体,治疗遗传性眼病——莱伯氏先天性黑蒙症(LCA10)。他们表示,此试验旨在测试该基因编辑技术移除导致LCA10的基因突变的

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(五)

二、DNA标记与细胞谱系示踪发育生物学的重点包括构成器官或生物体的细胞类型的多样性以及这些细胞的发育谱系历史。这些方面通常作为一个方向被单独研究,但最近的四篇新论文报道了一种将单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术与基于CRISPR的谱系示踪技术相结合来同时解剖转录组细胞表型和谱系历史的方法。近

CRISPRCas9技术创造新型超甜与糯性复合型玉米

  近日,中国农业科学院作物科学研究所玉米分子育种技术和应用创新团队与安徽农业大学合作,利用基因编辑技术创制超甜、糯与超甜糯复合型鲜食玉米育种技术,该研究克服了传统超甜与糯性玉米育种中仅通过回交导入少数已发现的自然突变的局限,并同时解决了同一代谢途径中上游基因对下游基因上位性效应对育种选择的困扰,为

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(二)

5. 优化碱基编辑器实现细胞、类器官和小鼠中的高效编辑2018年7月,Nature biotechnology刊登了一篇新的研究,通过密码子优化和加入额外的核定位序列,重新设计BE3、BE4Gam和xBE3的序列。优化筛选的组成型和诱导型碱基编辑系统极大地提高了C to T的突变效率,重

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(三)

上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。一、大规模基因功能的筛选尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍然是数量遗传学的一个

体积是CRISPRCas9的一半的新型基因编辑工具CasΦ

基因编辑(gene editing),又称基因组编辑(genome editing)或基因组工程(genome engineering),是一种新兴的比较精确的能对生物体基因组特定目标基因进行修饰的一种基因工程技术。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行定点“编辑”,实现对特定DNA片段的修

JCI-insight:CRISPRCAS9-基因编辑技术用于治疗肌营养不良症

  CRISPR的基因编辑技术是治疗遗传性疾病的革命性方法。但是,该工具尚未用于有效治疗长期慢性病。由密苏里大学医学院的Dongsheng Duan博士领导的一个研究小组已经确定并克服了CRISPR基因编辑的障碍,这可能为使用该技术进行持续治疗奠定基础。  CRISPR基因编辑的灵感来自于身体抵御病

体积是CRISPRCas9的一半的新型基因编辑工具CasΦ

  基因编辑(gene editing),又称基因组编辑(genome editing)或基因组工程(genome engineering),是一种新兴的比较精确的能对生物体基因组特定目标基因进行修饰的一种基因工程技术。基因编辑技术指能够让人类对目标基因进行定点“编辑”,实现对特定DNA片段的修饰。

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(四)

 6. 基于CRISPRi的高通量技术快速绘制人类基因的功能图谱2018年7月,Cell刊登了美国加州大学旧金山分校的研究小组的研究成果,开发了一种基于CRISPR的高通量技术快速地绘制人细胞中将近500个基因的功能图谱,其中的许多基因之前从未被详细地研究过。人类目前研究过的基因还不到10%,剩余的

Nature子刊:双功能CRISPRCas9,可同步实现基因编辑和调控

  哈佛医学院著名遗传学家George Church教授是基因编辑技术的鼻祖之一:2年前张锋使用CRISPR技术完成了多重基因组编辑,Church则使用CRISPR技术完成了RNA介导的人类基因组编辑。  自此之后,CRISPR/Cas9技术持续火爆,方便快捷的方式迅速风靡科研界,不论是医学研究,农

基因编辑进展梳理-Part-II-基于CRISPRCas9的技术应用篇(一)

前言:近年来,CRISPR基因编辑技术正在席卷整个生物医学研究领域,上一期我们已先从CRISPR系统开发及机制研究方面梳理了2018年相关大事件。伴随着基础技术不断优化,CRISPR技术的应用也更加广泛,如动物造模、药物筛选、单碱基编辑技术、细胞谱系示踪、基础疾病研究、疾病诊断、体内编辑和遗传病校正

研究成功抑制肿瘤血管、阻止肿瘤生长

  美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)和其他机构的科学家设计了一种新策略,以阻止肿瘤生长所需的新血管。曾经被认为是极有希望的癌症治疗手段--阻断刺激新的血管生长(血管生成)的分子已被证明无效,因为肿瘤细胞的反应会产生更多的刺激分子。新的策略包括使关键的酶

肿瘤标志物高是否就有肿瘤?

   肿瘤标志物是指在肿瘤发生和增殖的过程中,由肿瘤细胞合成、释放或者是机体对肿瘤细胞反应而产生的一类物质。当机体发生肿瘤时,血液、细胞、组织或体液中的某些肿瘤标记物就可能会相应的升高。通过肿瘤标志物的检查可以在肿瘤普查中早期发现肿瘤病人,帮助观察抗肿瘤治疗疗效以及判断预后。       

肾盂肿瘤和输尿管肿瘤的基本介绍

  肾盂肿瘤和输尿管肿瘤,约占所有尿路上皮肿瘤的10%左右。本病多数为移行细胞癌,少数为鳞癌和腺癌,后二者约占肾盂癌的15%左右,它们的恶性程度远较移行细胞癌为高。临床所见移行细胞癌可在任何被覆有移行上皮的尿路部位先后或同时出现,因此,在诊断及处理上应视为一个整体,不能孤立地对待某一局部的移行细胞癌

张锋参与Cell发布CRISPR重要新成果

   一直以来研究人员都无法在哺乳动物细胞中实现高通量的靶向基因编辑,CRISPR-Cas9系统的应用标志着遗传筛查一个重大的突破。  现在,来自哈佛-麻省理工Broad研究所的研究人员将这一筛查技术应用于小鼠骨髓源性树突状细胞,研究了PAMPs触发的免疫反应的调控机制。通过综合分析基因敲除结果及蛋