一种基于CRISPRCas9的新型诱导谱系示踪技术

通常情况下,是癌症的转移而非原发病灶导致了癌症患者的死亡。转移不单是由遗传驱动的,这表明其他水平的失调可能也是癌症转移的推手。目前的方法无法同时捕获每个分析细胞的分子表型,这限制了人们对不同转移性克隆的研究。 前瞻性谱系示踪方法,例如慢病毒条形码,它涉及用独特的 DNA 条形码标记细胞。然而,这种“静态”条形码策略通常仅限于在体外和单个时间点引入多种标签。因此,它们无法在体内捕获关键的过程。 2021年6月10日,来自美国宾夕法尼亚大学的研究团队在 Cancer Cell 期刊发表了题为:Single-cell lineage tracing of metastatic cancer reveals selection of hybrid EMT states 的研究论文。 该研究开发了一种基于 CRISPR-Cas9 的新型诱导谱系示踪技术—macsGESTALT。该技术可高效捕获单细胞转录和系统发育信息。通过将此技......阅读全文

Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(五)

Correlation analysis of HS-AFM images2D correlation coefficients were calculated between the HS-AFM images of the first frame and each of the fram

Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(一)

Real-space and real-time dynamics of CRISPR-Cas9 visualized by high-speed atomic force microscopyAbstractThe  CRISPR-associated endonuclease Cas9 bind

Realspace-and-realtime-dynamics-of-CRISPRCas9-visualized-by-...(三)

Fig. 4Structural rearrangement of the HNH domain. a, b HS-AFM images of the HNH domain in the high-height (a) and low-height (b) states. The mean ce

数字PCR在CRISPRCas9基因编辑结果验证的应用

 CRISPR-Cas9技术的发明,是基因编辑技术的一大突破,但如何验证实验是否成功,仍需要高灵敏度的检测方法,数字PCR技术可以满足这一需求。Broad研究所张锋团队发明了以CRISPR为基础的SHERLOCK技术可以对核酸进行高灵敏度的定性检测,但精确定量评估时仍采取了数字PCR进行确认。

CRISPRCas9为突破工程化细胞活性扫除障碍

  多数癌症可被免疫系统识别并攻击,但是因为肿瘤介导的免疫抑制和免疫逃逸机制而进展不一。输注体外工程化T细胞,即T细胞过继疗法(adoptedT cell therapy),能增加患者的天然抗肿瘤免疫反应。基因疗法重定向免疫特异性与基因编辑相结合具有改善疗效并增加工程化T细胞安全性的潜力。CRISP

应用慢病毒载体检测CRISPRCAS9和TALEN脱靶

  近日,国际生物学期刊nature biotechnology在线刊登了美国科学家的一项最新研究成果,他们应用整合酶缺陷的慢病毒载体(IDLV)检测CRISPR-CAS9和TALEN对基因组造成的脱靶效应,最低可检测1%的脱靶频率。这项研究或对推广CRISPR-CAS9和TALEN技术,保证基因操

遗传界大牛Nature子刊发布CRISPRCas9新工具

  来自哈佛医学院的研究人员开发出了一种预测软件,可以准确找出最有效的方法利用CRISPR-Cas9基因编辑技术来实现基因打靶。这项重要的研究成果发布在《自然方法》(Nature methods)杂志上。  领 导这一研究小组的是哈佛医学院著名遗传学教授、Wyss研究所的核心成员著名遗传学Georg

JBC:新突破!成功利用CRISPRCas9靶向脂肪细胞

  在一项新的研究中,Romanelli、MacDougald和他们的同事们描述了使用CRISPR-Cas9取得的新突破,这种工具已经改变了分子生物学研究,但它在脂肪组织研究中的应用一直难以捉摸。  脂肪对生命至关重要,但是过多的脂肪会导致一系列的健康问题。研究脂肪组织在体内的功能对于理解肥胖和其他

科学家利用CRISPRCas9技术在CART细胞中实现多基因编辑

  CART(Chimeric Antigen Receptor T cell)细胞治疗是非常有前景的肿瘤治疗方法,中文翻译为“嵌合抗原受体T细胞”。嵌合抗原受体(Chimeric Antigen Receptor,CAR)是由人工设计合成的跨膜蛋白,包括细胞外、跨细胞膜以及细胞内三个部分。CAR的

大规模CRISPRCas9打靶,收获全新抑癌途径

  KRAS基因突变驱动的癌症是最致命的一类,约20-30%所有人类癌症都与KRAS基因突变有关,包括肺癌、胰腺癌、直肠癌等最难治的危险癌症。KRAS突变癌细胞总有办法改变其代谢方式,让它们比正常细胞更具生长优势。  几十年来,科学家们已经尝试了各种靶向KRAS突变蛋白的治疗手段,但还没有靶向KRA

媲美CRISPRCas9,-新CRISPR-工具探知90%的基因编辑领域

  2类CRISPR–Cas系统,例如Cas9和Cas12,已被广泛用于靶向真核基因组中的DNA序列。但是,代表自然界中所有CRISPR系统90%的1类CRISPR-Cas系统在基因组工程应用中仍未开发。杜克大学(Duke University)的生物医学工程师利用此前未被探索的CRISPR技术,精

Nat-Commun:新研究发现细菌中的CrisprCas9防御系统

  借助高度先进的显微镜和同步加速器,哥本哈根大学的研究人员对细菌防御其他细菌和病毒的分子机制提出了开创性的见解。 相关结果发表在最近一期的《Nature Communications》杂志上。这一发现可能会成为将来与疾病作斗争的重要基石。  研究人员已经证明,被病毒攻击的细胞如何激活称为COA(环

简单小窍门,将CRISPRCas9基因编辑效率提高5倍

  CRISPR-Cas9是用于人类细胞系中敲除基因以发现基因功能的一项首选技术,但其让基因丧失功能的效率却有着巨大的差异。  加州大学伯克利分校的研究人员现在找到了一种方法,可在大多数类型的人类细胞中将CRISPR-Cas9切割及让基因丧失功能的效率提高5倍,使得构建及研究基因敲除细胞系变得更容易

组建CRISPRCas9库,让标记DNA和靶向切割更精准

  CRISPR-Cas9系统,被称为第三代基因编辑技术。自3年前发明这一技术以来,由于它能够很容易地结合并切割非常特异的DNA序列、失活基因,CRISPR-Cas9如暴风般横扫基因组学领域。这为靶向基因疗法治愈遗传疾病,及发现疾病的病因带来了巨大的希望。  相比于它的两位前辈ZFN系统和TALEN

应用CRISPRCas9实现斑马鱼组织特异性基因敲除

  近日,来自美国哈佛大学的研究人员在国际学术期刊Development cell发表了他们的最新研究进展,他们利用基于CRISPR-Cas9技术开发的载体系统在斑马鱼上实现了组织特异性基因敲除,这对于以斑马鱼为主要研究工具的科学家们无疑是一个好消息。  斑马鱼具有养殖方便、繁殖周期短、产卵量大、胚

Science等两篇论文实现CRISPR多基因编辑与多重基因编辑

  12月,首先是Braod研究院的研究人员在CRISPR–Cpf1的基础上打造了一个多重化基因编辑系统,其后,来自中科院动物所的研究人员也在CART细胞中实现多基因编辑。这两项成果分别公布在Science和Cell Research杂志上。  CRISPRs和CRISPR相关蛋白(Cas)蛋白的新

基因编辑可能会诱导癌症续,通讯作者及第一作者齐发声

  2018年6月12日,同时有2篇Nature Medicine发表文章,宣称CRISPR/Cas9技术,可能会增加癌症的患病风险,这给CRISPR/Cas9技术蒙上了一层阴影,同时在全球范围内引起了血雨腥风,各大媒体争相报道,这CRISPR/Cas9技术到底何去何,使人非常的茫然。iNature

eLife:利用CRISPRCas9突变证实癌基因MELK其实并不致癌

  根据一项新的研究,一种被认为是癌细胞必需的蛋白,即母系胚胎亮氨酸拉链蛋白激酶(maternal embryonic leucine zipper kinase, MELK),可能实际上并不是如此必需的。来自美国冷泉港实验室(CSHL)的研究人员利用CRISPR-Cas9敲除MELK基因,结果发现

CRISPRCas9基因编辑系统在灵长类中不会导致明显脱靶效应

  CRISPR-Cas9基因编辑系统已被广泛应用于生物和医学研究,研究人员正在尝试利用这一系统进行人类疾病的基因治疗。然而,CRISPR-Cas9系统在临床前的安全性却缺少全面的评估。之前有研究表明,CRISPR-Cas9系统在小鼠中会造成大量脱靶突变。此外,对细胞系的研究发现,Cas9编辑细胞的

Nature子刊:用CRISPRCas9编写抗癌药物靶点目录

  想象一下如果有一份击中某种特别致命癌症形式的最佳药物靶点完整目录,或是针对所有主要癌症类型和亚型的最佳药物靶点主目录会怎样。来自冷泉港实验室的科学家们在今天的《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上发布了编写这样的目录的一种方法,他们称利用了称作为CRISPR-Cas9

研究发现CRISPRCas9在非人灵长类中不会导致明显脱靶效应

  CRISPR-Cas9基因编辑系统已被广泛应用于生物和医学研究,研究人员正在尝试利用它进行人类疾病的基因治疗,然而,它在临床前的安全性方面还缺少全面评估。记者从中科院昆明动物研究所了解到,近期该所多个课题组合作,发现这一基因编辑系统在非人灵长类中不会导致明显脱靶效应,因而有较高安全性。研究成果发

600多个新癌症基因靶点-CRISPRCas9助力靶向药开发

  在癌症治疗研究中,科学家和制药公司一直在努力探索新的靶向疗法,选择性地杀死癌细胞,使健康组织不受伤害。目前,新靶向药物研发非常困难。一个靶向药物的研发成本约为1~2亿美元,但大约90%的药物在开发过程中失败。因此,在该过程开始时选择良好的药物靶点被视为药物研发最重要的部分。  为了提高药物研发效

Cell子刊:让CRISPRCas9基因编辑更廉价的简单技术

  来自加州大学伯克利分校的研究人员发现了一种更廉价及简单的方法,让热门的基因编辑工具CRISPR-Cas9靶向切割或是标记DNA。  自3年前发明这一技术以来,由于它能够很容易地结合并切割非常特异的DNA序列、失活基因,CRISPR-Cas9如暴风般横扫基因组学领域。这为靶向基因疗法治愈遗传疾病,

一种基于CRISPRCas9-的新型诱导谱系示踪技术

  通常情况下,是癌症的转移而非原发病灶导致了癌症患者的死亡。转移不单是由遗传驱动的,这表明其他水平的失调可能也是癌症转移的推手。目前的方法无法同时捕获每个分析细胞的分子表型,这限制了人们对不同转移性克隆的研究。  前瞻性谱系示踪方法,例如慢病毒条形码,它涉及用独特的 DNA 条形码标记细胞。然而,

科学家拓展CRISPRCas9系统在癌症治疗中的应用

  近日,英国剑桥大学等科研机构的科研人员在Nature上发表了题为“Prioritization of cancer therapeutic targets using CRISPR–Cas9 screens”的文章,研究人员基于功能基因组学,利用CRISPR-Cas9系统对多种癌症治疗的潜在靶标

Mol-Cell:新型DNA剪切技术比传统CRISPRCAS9更优越

  近年来,一种名为CRISPR-Cas9的工具改变了基因研究,就像一把小剪刀一样,允许科学家在精确的位置剪断和编辑DNA链。  但有时候,完成这项工作需要的不仅仅是剪刀。现在,一个合作的国际团队推出了一种新的基于CRISPR的工具,它更像是一台粉碎机,能够清除人体细胞中的长链DNA。图片来源:Zh

一种基于CRISPRCas9-的新型诱导谱系示踪技术

  通常情况下,是癌症的转移而非原发病灶导致了癌症患者的死亡。转移不单是由遗传驱动的,这表明其他水平的失调可能也是癌症转移的推手。目前的方法无法同时捕获每个分析细胞的分子表型,这限制了人们对不同转移性克隆的研究。  前瞻性谱系示踪方法,例如慢病毒条形码,它涉及用独特的 DNA 条形码标记细胞。然而,

CRISPR先驱获得新突破:开发更安全的CRISPRCas9基因疗法

  人们一直希望用CRISPR-Cas9基因编辑技术治疗甚至治愈复杂的神经疾病。帕金森病、亨廷顿舞蹈病和阿尔茨海默症的现有药物只能缓解症状,无法阻止疾病的发展。“但对于确定了致病基因的疾病来说,基因编辑技术有望永久终止其进程,”加州大学伯克利分校Jennifer Doudna实验室的博士后Brett

CRISPRCas9奋战血红蛋白病:造血干细胞富集

  血红蛋白病是由遗传因素导致的血红蛋白肽链合成障碍或分子结构异常引起的疾病。原位修复患者体内的基因突变,是从根本上治愈血红蛋白病的手段。但是受制于修复效率和安全性,这种方法通常较难实现。与之相比,在患者体内添加正常的珠蛋白基因拷贝或者上调胎儿型血红蛋白的表达,是相对容易实现的策略,能够在不同程度上

CRISPR先驱获得新突破:开发更安全的CRISPRCas9基因疗法

人们一直希望用CRISPR-Cas9基因编辑技术治疗甚至治愈复杂的神经疾病。帕金森病、亨廷顿舞蹈病和阿尔茨海默症的现有药物只能缓解症状,无法阻止疾病的发展。“但对于确定了致病基因的疾病来说,基因编辑技术有望永久终止其进程,”加州大学伯克利分校Jennifer Doudna实验室的博士后Brett S