迄今为止规模最大的灵长类基因组调控元素研究

虽然每个生物体都有一个独特的基因组,一个单一的基因序列,但每个个体都有许多表观基因组。表观基因组由化合物和蛋白质组成,它们可以与DNA结合并调节基因活动,可以激活或失活这些化合物和蛋白质,也可以产生器官或组织特异性蛋白质。由于它是一种高度动态的材料,它可以提供大量的信息来阐明组成身体的各种组织和器官的进化。 现在,来自西班牙国家研究委员会(CSIC)和庞培法布拉大学(Pompeu Fabra University)联合中心进化生物学研究所(IBE)的一个团队,对灵长类动物基因组的调控元素进行了迄今为止规模最大的研究。详尽分析托马斯Marques-Bonet领导的研究小组进行的比较基因组学研究小组的首席研究员IBE,分析了广泛的信号调节基因在类人猿和人类,包括弱活动信号,在先前的研究被忽视。这项由IBE研究员大卫·胡安(David Juan)共同领导的研究表明,在人类中,通常不被研究的最弱的调控信号在与大脑相关的基因调控中发......阅读全文

表观基因组关联研究开放平台EWAS-Open-Platform

  近日,由中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心(NGDC)开发的表观基因组关联研究资源开放平台EWAS Open Platform上线。相关研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit

表观基因组对糖尿病发展作用揭示

  英国《自然·通讯》期刊近日发表的一篇表观遗传学论文,揭示了表观基因组对疾病发展的作用,探索了环境对Ⅰ型糖尿病发展产生影响的线索。科学家在Ⅰ型糖尿病病人中发现了免疫基因的表观遗传变化,而这些机制对人类来说仍是未解的谜题。   过去十年来,Ⅰ型糖尿病的发病率出现了显著上升,这被认为是环境因素(比如感

曹雪涛发Nature综述:抗感染固有免疫反应的表观遗传调控

  曹雪涛院士全面阐述了近年来关于表观遗传调控因子在感染诱导的天然免疫和炎症反应中的调控作用的代表性研究成果。  表观遗传学立足于染色质层面,涉及DNA、非编码RNA和组蛋白等染色质相关分子的调控,为近年来世界生命科学前沿的热点领域。其研究生命体分化发育过程中,在基因组不变的情况下,产生表型和功能各

60年谜团:DNA复制时序维持细胞表观遗传状态

  近日发表在《科学》杂志上的一项研究称,美国佛罗里达州立大学大卫·吉尔伯特博士带领的研究团队回答了一个60年未解的科学谜题:DNA的复制时序维持着人类细胞中全局的表观遗传状态。  在过去60年里,科学家已经能够观察到遗传信息的复制方式和时间,并确定了“复制时序程序”的存在,该程序控制着DNA片段的

世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱

  记者25日从北京大学第三医院获悉,该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作,绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》,影响因子达38.597。  据介绍,哺乳动物的胚胎发育起始于单个受精卵细胞,父母的表观遗传记

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

  *本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供   染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神

我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控

  近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。   CpG岛是指基

我国学者揭示发育过程中表观遗传修饰的协同调控

  近期,哈尔滨工业大学和哈尔滨医科大学的研究人员利用生物信息学方法,整合高通量的表观基因组数据,发现了在小鼠发育过程中CpG岛上各种表观遗传修饰的协同变化,并揭示了其对发育基因的共调控。相关成果公布在Nature出版集团旗下期刊Scientific Reports杂志上。   CpG岛是指基

下一代转基因工具:表观遗传调控

  2015年,加州大学圣地亚哥分校的生物学家Ethan Bier和Valentino Gantz提出了一项突破性技术,这种名为“活跃遗传(active genetics)”的新技术打破了父母向后代传递遗传性状的几率(超越孟德尔式遗传)。  今年2月,他们和Shannon Xu在《eLife》发表文

新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控

  几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白

解读重要表观调控因子:保护端粒的非编码RNAs

  在2008年,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的Maria A. Blasco博士领导的端粒和端粒酶研究组是世上首个发现TERRAs的团队。这是一段非编码端粒RNAs,属于染色质端粒的一部分。从那时起,该团队就致力于研究这些序列有什么作用。  最近他们在《Nature Communicatio

研究揭示水稻DELLA蛋白的表观调控新机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/508456.shtm

研究发现植物光形态建成的表观遗传调控机制

  光是植物光合作用的能量来源。作为重要的环境信号,光广泛参与调控植物生长发育的各个阶段。当植物幼苗出土见光后,光信号迅速激活光形态建成,表现为下胚轴生长抑制、子叶张开变绿以启动光合作用。这是植物早期生长的关键性阶段之一。植物在进化过程中形成复杂而精密的光信号转导系统,通过精细调控光形态建成,实现对

研究揭示水稻DELLA蛋白的表观调控新机制

  9月11日,华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室水稻团队教授周道绣和赵毓课题组在国际期刊EMBO Journal在线发表了研究论文,揭示了水稻DELLA蛋白抑制基因表达的表观调控新机制。  20世纪60年代以来,矮杆作物以其抗倒伏和收获指数高等优势,极大地增加了粮食产量。生长抑

Nature子刊:表观遗传学调控与小脑发育

  渥太华大学的研究团队在Nature Communications杂志上发表文章指出,Snf2h基因能够通过控制染色质的组成形式,对小脑发育产生特殊的影响。小脑是大脑的重要控制中心,与平衡能力、精细运动和复杂的肢体运动有关。  运动员和艺术家们的非凡成就取决于他们的小脑,同样小脑对我们的日常生活也

eLife:白血病干细胞干性维持表观调控机制

  利用抑癌基因PTEN敲除的T-ALL小鼠模型,北京大学吴虹课题组前期工作发现PTEN缺失或PI3K信号通路激活所导致的β-catenin活化及Tcra/d-Myc易位在T-ALL的发生和发展过程中起至关重要的作用,并鉴定出LSC富集的Lin-CD3+KITmid亚群。  急性T淋巴细胞白血病(T

长链非编码RNAs介导的表观遗传调控基础

  近日,中国科学院昆明动物研究所李家立、胡新天和郑永唐课题组与中国科学技术大学生命科学学院汪香婷课题组、武汉生命之美生物科技公司合作,揭示了长链非编码RNAs在灵长类大脑发育和老化过程中表达动态变化和作用。该研究成果以Annotation and cluster analysis of spati

两篇Nature论文挑战流行表观遗传学观点

  Friedrich Miescher生物医学研究所(FMI)的Dirk Schübeler和他的研究团队,确定了沿着基因组设置表观遗传学标记的决定因素。这项发表在《自然》(Nature)杂志上的新研究表明,基因活性和DNA序列在对表观遗传标记的调控中发挥了比以往认为更大的作用。这对流行的观点:外

植物DNA去甲基化的机理和功能

  10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为The mechanism and function of active DNA demethylation i

Cell:两项研究解析胚胎干细胞的表观遗传机制

  在干细胞研究领域中,表观遗传调控,尤其是细胞核内染色体高级组织形式一直是当前的前沿和热点领域。近日,两个研究小组在《细胞》(Cell)杂志上发表文章,分别报道了人类胚胎干细胞的转录和表观遗传动态机制 以及 多向分化胚胎干细胞的表观遗传作用机制。   在第一项研究中,来自哈佛麻省Broad研

Science解读甲基化组新观点

  在真核生物中,DNA甲基化通常发生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不会改变DNA序列,它被视为一种表观遗传学标志。DNA甲基化可以在细胞分裂过程中延续到子代细胞,这一机制现在已经相当明确。而这种继承性使DNA甲基化成为储存表观遗传学记忆的潜在途径,这种记忆包括环境或发育过程中的基因调控。不过要证实

华东师范大学Nature子刊发布表观遗传重要成果

  来自华东师范大学、中科院生物物理研究所等机构的研究人员,提供了令人信服的证据证实H3K9甲基化促进了哺乳动物中的DNA维持性甲基化,但并非是其必要条件。研究结果发布在8月24日的《自然通讯》(Nature Communications)杂志上。  华东师范大学的翁杰敏(Jiemin Wong)教

生活环境和生活方式会影响你的表观基因组

  法国巴斯德研究所和CNRS领导的一项基因组研究,首次证实生活环境和生活方式能够影响我们的表观基因组。表观基因组控制着我们基因的表达,但不影响基因的序列。  研究人员发现,从森林迁移到城市对人类免疫应答的表观遗传学模式有深远的影响。而生活方式(定居耕种或游牧狩猎)主要影响较为持久的机能,比如发育相

孙方霖:表观遗传学-后基因组时代的领舞者

DNA双螺旋的解码者、诺贝尔奖获得者Watson说:“你可以继承DNA序列之外的一些东西。这正是现在遗传学中让我们激动的地方。” 不久前,美国国立卫生研究院利用由“路标计划”管理的新基金,启动了表观基因组学研究计划,一批表观遗传学项目和研究人员将获得数百万到上千万美元的经费支持。几乎在同时,国家自然

科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式

  DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达,从而影响一系列的生物学过程,如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上,DNA甲基化失调与人类疾病密切相关,如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和

稳定性与可塑性:细胞命运的“天平”

表观遗传指的是在不改变DNA序列的情况下,基因表达和生物性状的可继承变化。细胞命运决定包括细胞身份的维持和转换,这就涉及到表观遗传信息的继承性和可塑性,是生命科学领域的重点前沿方向。生命的"天平"  人体内有约十万亿个细胞,上千种功能各异的细胞类型,但它们拥有同样的基因组。那么,为什么同样的基因组会

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神疾病的患病风险息息相关,但这一研究领域仍存在许多未解之谜。来自西

清华团队Nature、Cell子刊连发多项表观遗传学成果

  表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下调控基因的活性,对于人类发育和人类疾病有深远的意义。组蛋白修饰是一种重要的表观遗传学修饰,包括甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化、ADP-核糖基化等等。  组蛋白修饰可以调控许多关键的细胞过程。不过,人们一直不清楚组蛋白的这些标签是否能从哺乳动物生殖细胞传

解读“生命之书”--新发现填补人类基因组图谱空白

  美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的研究人员制作了一份人类基因组的单细胞染色质图谱,确定了240种多基因特征和与疾病特征相关的细胞类型,并注释了非编码DNA变异的风险,有利于更好地理解遗传学与疾病之间的联系。这一发现发表在12日的《细胞》杂志在线版上。  此前,科学家在公布最新的被称为“生命之

研究揭示男性长寿老人特有的健康老化表观调控基础

如何延长男性的健康寿命是亟需解决的科学问题。有研究认为,男性长寿老人表现出更佳的健康状态。因此,男性长寿老人可作为理想的自然模型,用于识别与男性健康长寿相关的保护因子或生物标志物。DNA甲基化是重要的表观遗传修饰,与衰老和老年病发生关系密切。近年来,中国科学院昆明动物研究所研究员孔庆鹏团队在女性长寿