HBVRNA检测技术盘点——RTqPCRVSRNA捕获探针法
慢性乙型肝炎影响着世界上超过2.4亿人口[1],难以治愈已成为公认的事实。大多研究认为难以治愈与肝细胞核内HBV共价闭合环状DNA(cccDNA)半衰期过长且难以清除有关。[2]因此,肝内检测cccDNA对评估抗病毒治疗疗效和治疗终点具有重要意义。但直接检测cccDNA十分困难,通常需要进行肝组织活检,具有创伤性,难以在临床上推广应用。如何真实地评估肝细胞内cccDNA的水平和转录活性,成为临床亟待解决的问题。随着研究的增多,HBV RNA逐渐进入人们的视野。2019年《慢性乙型肝炎临床治愈(功能性治愈)专家共识》指出血清HBV RNA是反映肝内cccDNA转录活性的良好生物学标志物,可早期预测抗病毒治疗期间HBeAg血清学转换以及停药后病毒学复发和HBsAg逆转。[3]血清HBV RNA更是作为cccDNA的替代血清学指标被列入中国和欧洲乙肝防治指南[4,5],在评估抗病毒药物的疗效、NAs停药后复发风险、早期预测干扰......阅读全文
HBV-RNA检测技术盘点——RTqPCR-VS-RNA捕获探针法
慢性乙型肝炎影响着世界上超过2.4亿人口[1],难以治愈已成为公认的事实。大多研究认为难以治愈与肝细胞核内HBV共价闭合环状DNA(cccDNA)半衰期过长且难以清除有关。[2]因此,肝内检测cccDNA对评估抗病毒治疗疗效和治疗终点具有重要意义。但直接检测cccDNA十分困难,通常需要进行肝组织活
RNA干扰技术(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃尔大学的Su Guo博士在试图阻断秀丽新小杆线虫(C. elegans)中的par-1基因时,发现了一个意想不到的现象。她们本是利用反义RNA技术特异性地阻断上述基因的表达,而同时在对照实验中给线虫注射正义RNA(sense RNA)以期观察到基因表达的增强。但得到的结果
反义技术——RNA干扰(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干扰(RNA interference,RNAi)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNAi领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA干扰是由长的双链 RNA
捕获早期RNA转录动力学的关键
生命的活动是通过蛋白质的制造而发生的,蛋白质赋予我们的细胞结构和功能。细胞蛋白质从DNA编码的基因指令中获得行进顺序,他们的序列首先被复制并在一个叫做转录的多步骤过程中被制造成RNA。 科罗拉多州立大学的一个研究合作项目专门研究高分辨率荧光显微镜和计算模型,以实时、精细地可视化和描述这类生命过
RNA干扰实验技术
实验概要本文介绍了RNA干扰的原理及基本实验方法,包括了siRNA的设计、siRNA的制备和siRNA的转染等方法,及RNA干扰实验中的注意事项。实验原理近年来的研究表明,将与mRNA对应的正义RNA和反义RNA组成的双链RNA(dsRNA)导入细胞,可以使mRNA发生特异性的降解,导致其相应的基因
反义RNA技术改良
用反义RNA分子来调节基因表达时,经常会遇到的困难是反应模板的稳定性差。因此,人们正在探索如何改进反义基因的新方法,目前主要有:(1)优化反义RNA的结合。反义RNA链的长度对抑制基因的效果是重要的。双螺旋形成过程中将释放能量,RNA链越长,释放的自由能越多。从这一意义来讲,可以说长RNA作为反义R
RNA探针技术简介
许多载体如pBluescript, pGEM等均带有来自噬菌体SP6或E.coli噬菌体T7或T3的启动子,它们能特异性地被各自噬菌体编码的依赖于DNA的RNA聚合酶所识别,合成特异性的RNA。在反应体系中若加入经标记的NTP,则可合成RNA探针。RNA探针一般都是单链,它具有单链DNA探针的优点,
概述反义RNA技术
随着分子生物学和遗传工程的发展,基因治疗应运而生,反义技术是其中一种,它的基础是根据核酸杂交原理设计针对特定靶序列的反义核酸,从而抑制特定基因的表达,包括反义RNA、反义DNA及核酶(Ribozyme),它们通过人工合成和生物合成获得。 反义DNA是指一段能与特定的DNA或RNA以碱基互补配对
双RNA测序技术
在发表于《自然》(Nature)杂志上的一篇研究论文中, 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现,采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术,可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制,以及在研究中获得的重要发现
反义RNA技术介绍
随着分子生物学和遗传工程的发展,基因治疗应运而生,反义技术是其中一种,它的基础是根据核酸杂交原理设计针对特定靶序列的反义核酸,从而抑制特定基因的表达,包括反义RNA、反义DNA及核酶(Ribozyme),它们通过人工合成和生物合成获得。反义DNA是指一段能与特定的DNA或RNA以碱基互补配对的方式结
RNA提取技术概述
RT-PCR是将RNA的反转录(Reverse Transcription,RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术,近年来得到快速发展和广泛应用。首先,经反转录酶的作用,以RNA为模板,合成互补的DNA链(cDNA),再以cDNA为模板,通过PCR扩增合成目的片段。RT-PC
反义RNA技术要素
[1]长的反义RNA并不一定比短的反义RNA更为有效;[2]在原核生物中针对SD序列及其附近区域的反义RNA可能更有效;[3]在真核生物中,对应于5'端非编码区的反义RNA可能比针对编码区的反义RNA更有效;[4]尽量避免在反义RNA分子中出现自我互补的二级结构;[5]设计的反义RNA分子中
细胞RNA含量检测
细胞RNA含量检测 实验步骤
细胞RNA含量检测
实验步骤 展开
细胞RNA含量检测
实验步骤展开
【盘点】长链非编码RNA的研究进展
非编码RNA在生命调控过程中扮演着重要角色,近年来的研究成果常入选CNS年度十大科学突破。人类基因组转录区高达76%,但转录产物中只有不到2%是编码蛋白质的mRNA,其他均为非编码RNA,其中microRNA (miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)、环状RNA(circRNA)等调控
RNA干扰技术的特点
1.高效性:Elbashir等在研究中发现分别为25 nmol/L与100 nmol/L的起始双链RNA产生的结果是一样的,只是高浓度起始的更有效些。将双链RNA浓度降低到1.5 nmol/L时产生的基因沉默效果变化不大,只有当浓度降低到0.05 nmol/L时,沉默的效果才消失。Holen等也证实
RNA干扰实验技术介绍
通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。证据表明;一个称为Dicer
RNA转录的技术特点
转录时,细胞通过碱基互补的原则来生成一条带有互补碱基的mRNA,通过它携带密码子到核糖体中可以实现蛋白质的合成。与DNA的复制相比,转录有很多相同或相似之处,亦有其自己的特点。转录中,一个基因会被读取并复制为mRNA。就是说,以特定的DNA片段作为模板,以DNA依赖的RNA聚合酶作为催化剂,合成前体
培养细胞中RNA检测
实验概要掌握培养细胞中RNA的检测方法。实验步骤1.制胶(1%): 琼脂糖 2.5g 10×Mops缓冲液 25.0ml H2O 192.0ml2.在微波炉中加热煮沸使胶完全溶于水并灭菌。3.取出胶冷却到60℃,于通风柜中加45ml甲醛,混匀。4.加20μl溴化乙锭,混匀。5.令胶液再
RNA质量检测与鉴定
方法一、检测RNA溶液的吸光度280、320、230、260nm下的吸光度分别代表了核酸、背景(溶液浑浊度)、盐浓度和蛋白等有机物的值。一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)。1.82.0时,我们认为RNA中蛋白或者时其他有机物的污染是可以容忍的,不过要注意,当你用Tris作为缓冲
新型冠状病毒病原学检测假阴性的产生原因及高效检测...
新型冠状病毒病原学检测假阴性的产生原因及高效检测方法分析自2020年开始,新型冠状病毒肺炎的疫情就一直牵动着亿万人的心。截至2月11日8:29,全国已确诊病例累计42708例,疑似21675例,疫情防控形势依然严峻。 新型冠状病毒传播方式多样,除了经呼吸道飞沫和接触传播的主要途径外,目前已有报道病毒
盘点-|-2018年十大RNA生物制药公司
将2018年称之为RNA疗法之年一点也不为过。今年8月,来自Alnylam公司的RNAi药物Onpattro获得美国FDA批准,成为RNAi现象被发现整整20年以来获准上市的首款RNAi药物,具有里程碑式的意义。而在本月7日,Moderna Therapeutics公司IPO募集6.043亿美元
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(2)
早期的 RNAi 技术可用在研究与胚胎发育相关基因的功能上,但是由于细胞分裂造成 dsRNA 的稀释,使得这种方法在研究成体的基因功能时有一定的局限性。为弥补早期 RNAi 技术的不足,Tavernarakis 等将 RNAi 技术做了一些改进及更动,将目的基因之标的序列以反向重复的方式,由
RNA干涉(RNA-Interference,RNAi)(1)
基因沉默(gene silencing)是生物体内特定基因由于种种原因不表达的遗传现象。一方面,基因沉默是生物遗传操作创造新的遗传修饰生物(genetically modified organisms)的障碍,另一方面,它又是植物抵抗外来核酸入侵(如病毒)的一种反应,为植物抗病毒的遗传育
RNA提取时RNA降解原因
1 ) 新鲜细胞: 裂解液的量不足,使得裂解不充分。 2 ) 新鲜组织: 某些含有内源性核酸酶的样品,很难避免RNA酶的降解,建议采用的方法为在液氮条件下将组织研碎,并且,匀浆时采用更多的裂解液。 3 ) 冷冻样品: 样品取材后应该迅速置于液氮中冷冻存放,然后转移到-70℃冰箱存
RNA探针技术的应用介绍
这类RNA探针主要用于研究目的,而不是用于检测。例如,在筛选逆转录病毒人类免疫缺陷病毒(HIV)的基因组DNA克隆时,因无DNA探针可利用,就利用HIV的全套标记mRNA作为探针,成功地筛选到多株HIV基因组DNA克隆。又如进行中的转录分析(nuclear run on transcrip-tion
RNA研究热点技术介绍总汇
头条消息:2019年8月16日,2019年国家自然科学基金评审结果发布,今年国自然重点资助项目743项,总金额达22.184亿,北京大学、浙江大学位居前两位,分别获得37项和34项,总计超过1亿元,而上海交通大学(30项)、复旦大学、清华大学、南京大学、中山大学、天津大学、华中科技大学、同济大学
反义RNA技术的注意要点
[1]长的反义RNA并不一定比短的反义RNA更为有效;[2]在原核生物中针对SD序列及其附近区域的反义RNA可能更有效;[3]在真核生物中,对应于5'端非编码区的反义RNA可能比针对编码区的反义RNA更有效;[4]尽量避免在反义RNA分子中出现自我互补的二级结构;[5]设计的反义RNA分子中
RNA干扰实验技术介绍(二)
dsRNA消化法的主要优点在于可以跳过检测和筛选有效siRNA序列的步骤,为研究人员节省时间和金钱(注意:通常用RNAse III通常比用Dicer要便宜)。不过这种方法的缺点也很明显,就是有可能引发非特异的基因沉默,特别是同源或者是密切相关的基因。现在多数的研究显示 这种情况通常不会造成影