国内外专家点评第一代基因组设计的杂交马铃薯
北京时间2021年6月24日晚23时，《细胞》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下称“基因组所”）黄三文团队完成的论文——“杂交马铃薯的基因组设计”，这是“优薯计划”实施以来取得的里程碑式突破。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物，全球有13亿人口以马铃薯为主食。与谷物类粮食作物不同，栽培马铃薯是依靠薯块进行无性繁殖的同源四倍体物种。 由于四倍体遗传的复杂性，马铃薯的遗传改良进程缓慢，一些上百年历史的马铃薯品种仍然在广泛种植。 马铃薯产业面临的另外一个挑战是薯块的繁殖系数低、储运成本高、易携带病虫害。 为了彻底解决马铃薯产业面临的问题，黄三文团队联合云南师范大学等国内外优势单位发起了“优薯计划”，即运用“基因组设计”的理论和方法体系培育杂交马铃薯，用二倍体育种替代四倍体育种，并用杂交种子繁殖替代薯块繁殖。这是马铃薯育种和繁殖的新底层技术，是对马铃薯产业的颠覆性创新。 黄三文告诉《中国科学报》，要实现......阅读全文
国内外专家点评第一代基因组设计的杂交马铃薯
北京时间2021年6月24日晚23时，《细胞》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下称“基因组所”）黄三文团队完成的论文——“杂交马铃薯的基因组设计”，这是“优薯计划”实施以来取得的里程碑式突破。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物，全球有13亿人口以马铃薯为主食。与谷物类粮食作
国内外专家点评第一代基因组设计的杂交马铃薯
北京时间2021年6月24日晚23时，《细胞》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下称“基因组所”）黄三文团队完成的论文——“杂交马铃薯的基因组设计”，这是“优薯计划”实施以来取得的里程碑式突破。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物，全球有13亿人口以马铃薯为主食。与谷物类粮食
马铃薯杂交育种获重要突破
马铃薯是人们餐桌上的常客，但对育种家来说，培育优质马铃薯品种是个难题。北京时间2023年5月4日，国际学术期刊《细胞》在线发表了中国农业科学院深圳农业基因组研究所黄三文团队的最新成果，通过追踪最长8000万年、累计12亿年的马铃薯基因组进化痕迹，绘制了首个马铃薯有害突变的基因二维图谱。
“理想型”翻开马铃薯杂交育种新篇章
“马铃薯是典型的无性繁殖作物，基因组高度杂合，存在大量有害变异，只有系统揭示马铃薯的基因组特征，才能有效实现无性繁殖作物的有性化育种。”中国科学院院士、中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称基因组所）研究员黄三文告诉《中国科学报》，有性繁殖的作物能够通过杂交改良性状，大大提高育种效率。
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日，由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
基因组研究揭示欧洲马铃薯进化史
近日，来自德国、秘鲁、英国和西班牙的一个国际研究团队，对大量的马铃薯品种进行了测序，以了解更多关于现代欧洲马铃薯的历史。在他们6月24日发表在Nature Ecology and Evolution上的论文中，该团队描述了他们对马铃薯历史的研究以及新发现。 过去的研究表明，马铃薯是在17世纪被
我科学家主导完成马铃薯基因组测序
7月15日，中国农业科学院公布，经过6年努力，由14个国家97名研究人员组成的“马铃薯基因组测序国际协作组”日前完成了马铃薯基因组测序。由中方团队主导的这项研究，奠定了中国在这一研究领域的领先地位。 7月14日，国际权威学术期刊《自然》以封面文章的形式发表了马铃薯全基因组序列
比较基因组杂交方法介绍
比较基因组杂交是将消减杂交、荧光原位杂交相结合，用于检测DNA序列的拷贝数变异并将其定位在染色体上的方法。CGH 只能检测不平衡的染色体改变。结构染色体变异，例如：平衡的相互易位或倒位不能被检测出来，因为拷贝数没有变化。CGH最初设计是用来检测单一副本缺失的，所以它的的区带长度至少5～10Mbarr
比较基因组杂交芯片介绍
比较基因组杂交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比较基因组杂交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者阵列比较基因组杂交技术（array comparative g
比较基因组杂交芯片介绍
比较基因组杂交芯片（Comparative Genomic Hybridization Array）、基于芯片的比较基因组杂交（Microarray-based comparative genomic hybridization）或者阵列比较基因组杂交技术（array comparative gen
多个有害突变导致马铃薯自交衰退
自交衰退在异花授粉植物中是一种普遍存在的现象：在进行连续多代自交后，会出现生理机能的衰退，表现为生长势减弱、产量降低。 当地时间1月14日，《自然—遗传学》杂志在线发表了云南师范大学马铃薯科学研究院与中国农业科学院农业基因组研究所（以下简称基因组所）共同完成的马铃薯自交衰退遗传机制解析成果。这
全基因组的比较基因组杂交技术介绍
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
黄三文：用大数据精准培育“你的菜”
在中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员黄三文办公室的一面白色玻璃隔断上，用马克笔写着一组杂交育种模式图。这是多年前，他写下的关于“优薯计划”的创想。 杂交育种是将父母本杂交，形成不同的遗传多样性，再通过对杂交后代的筛选，获得具有父母本优良性状、且不带有父母本中不良性状的新品种的育种方法。马
马铃薯育种的“火眼金睛”
马铃薯是最重要的块茎类粮食作物，也是我国第四大主粮作物，全球有13亿人以马铃薯为主食。但你可能不知道的是，我们在快餐店吃的薯条，其实全都来自120年前育成的一个马铃薯品种，背后的重要原因之一马铃薯的育种进程十分缓慢。 5月4日，国际权威期刊《细胞（Cell）》在线发表了中国农业科学院深圳农业基
中国农科院发布2021年度10项重大科学发现
1月12日，中国农业科学院举办2022年工作会议，会上发布了该院2021年度的10项重大科学发现，包括首获证实植物到动物的功能基因转移、首次发现烷基型产甲烷古菌、第一代基因组设计的杂交马铃薯问世等。具体如下：1.首获证实植物到动物的功能基因转移 4月1日《细胞》以封面文章出版蔬菜花卉所张友军团队
LexA酵母双杂交系统的设计原理
LexA酵母双杂交系统的设计原理 报告质粒p8op-LacZ的GAL4 UAS编码序列被完全去除，因此在缺乏LexA融合激活剂的情况下，报告基因LacZ的转录活性为零，该基因的筛选标志为URA3，可以作为有自主复制能力的质粒存在于酵母EGY48菌株中，也可以被整合到EGY48基因组DNA上。质粒p
基因组DNA－Southern杂交操作步骤
1）基因组DNA Southern印迹的制备 预备 1．用适当的限制性内切酶消化基因组DNA样品（10μg）。 2．进行琼脂糖凝胶电泳。一般用0.7～1.0％的琼脂糖凝胶分离基因组DNA，它在1～15kb的范围内有较好的分辨率，可选用TBE或TAE缓冲液。琼脂糖凝胶电泳需在1V/cm的电
基因组原位杂交的概念
中文名称基因组原位杂交英文名称genomic in situ hybridization;GISH定 义用核酸探针进行原位杂交，确定与探针互补的DNA序列在基因组上的位置。应用学科遗传学（一级学科），基因组学（二级学科）
《2022中国农业科学重大进展》报告发布
12月16日，2022中国农业农村科技发展高峰论坛暨中国现代农业发展论坛在北京召开。论坛上发布了《2022中国农业科学重大进展》报告，该报告由中国农业科学院科技管理局和农业信息研究所科技情报分析与评估创新团队研制，遴选了10项能够充分代表2021年我国农业科技前沿研究水平、取得重大突破性进展的基础科
云南师范大学Nature－Genetics发文：自交衰退的遗传基础
研究人员发表了题为“The genetic basis of inbreeding depression in potato”的文章，公布了“优薯计划”的最新成果：用二倍体替代四倍体，并用杂交种子替代薯块，对马铃薯的育种和繁殖方式进行颠覆性创新。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物。与其它谷
马铃薯琼脂
成分 马铃薯(去皮切块) 200g 琼脂 20g 蒸馏水 1000mL制法 同马铃薯葡萄糖琼脂。 用途 鉴定霉菌用。
世界重大害虫马铃薯块茎蛾高质量基因组破译
马铃薯块茎蛾形态特征和危害症状。中国农科院植保所供图 近日，中国农业科学院植物保护研究所经济作物虫害监测与防控创新团队联合国内外多家单位，组装了茄科作物的世界重大害虫马铃薯块茎蛾的染色体水平高质量基因组，相关研究结果发表在Nature旗下刊物《科学数据》（Scientific Data）。 马铃薯
马铃薯基因组完成图揭示复杂区域存在重要农艺性状相关
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发
马铃薯单倍体诱导系创制成功
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员黄三文团队在《生物技术通报（英文）》（aBIOTECH）杂志上发表了研究成果。报道了利用双单倍体技术构建高纯度二倍体马铃薯自交系的方法体系，为二倍体马铃薯杂交育种提供了强有力的技术保障。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物，全球约有13亿人以马铃薯
马铃薯单倍体诱导系创制成功
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员黄三文团队在《生物技术通报（英文）》（aBIOTECH）杂志上发表了研究成果。报道了利用双单倍体技术构建高纯度二倍体马铃薯自交系的方法体系，为二倍体马铃薯杂交育种提供了强有力的技术保障。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物，全球约有13亿人以马铃
泛基因组：赋能未来作物育种的基石
绘图：黄怡可 泛基因组（Pan-genome）是一个物种内所有基因组信息的总和，它比单一参考基因组涵盖了更多的遗传多样性。 近年来，科学家已经获得了多个作物的泛基因组。如何利用这些更为全面的基因组信息培育下一代良
泛基因组：赋能未来作物育种的基石
绘图：黄怡可 泛基因组（Pan-genome）是一个物种内所有基因组信息的总和，它比单一参考基因组涵盖了更多的遗传多样性。 近年来，科学家已经获得了多个作物的泛基因组。如何利用这些更为全面的基因组信息培育下一代良
马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发现了
如何设计特异性荧光原位杂交探针
1.探针分为好多种，你要先决定你用何种，是RNA探针还是DNA探针，杂交时，RNA－RNA结合的稳定性要比DNA－RNA好，所以RNA探针具有结合牢固、背景低等优点；DNA探针背景稍微深一些，不过也可以，标记方法比前者简单一些，另外还有寡核苷酸探针，此类探针分子量小，通透性好，但就是标记的敏感性
Southern印迹及基因组DNA杂交技术实验
Southern 印迹 放射性标记的探针与固定化核酸进行杂交 实验方法原理 硝酸纤维膜或尼龙滤膜对单链DNA的吸附能力很强，当电泳后凝胶经过DNA变