马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发现了调控重要农艺性状的大量串联复制的基因簇。相关研究成果于近日发表在《分子植物》（Molecular Plant）上。 马铃薯是仅次于小麦和水稻的世界第三大粮食作物，其同源四倍体遗传和高度杂合性限制了马铃薯遗传育种研究。高质量的参考基因组是马铃薯遗传育种研究的重要基础。双单倍体DM1-3 516 R44 (DM)基因组在马铃薯基因组学、遗传和育种研究中作为参考基因组一直发挥着重要作用。但其基因组版本仍然存在161个gap，端粒和着丝粒结构不完整，在这些GAP区域以及端粒和着丝粒结构隐藏着什么遗传信息不得而知。 随着三代测序技术的发......阅读全文
马铃薯单倍型DM基因组全序列完成图组装成功
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发现了
马铃薯基因组完成图揭示复杂区域存在重要农艺性状相关
中国农业科学院蔬菜花卉研究所马铃薯遗传育种与栽培创新团队和蔬菜分子设计育种创新团队，对马铃薯单倍型DM的基因组进行了全序列组装，获得了包含24个端粒和12个着丝粒完整序列的马铃薯单倍型DM的端粒到端粒（T2T）的基因组完成图（DM8.1），并在之前马铃薯基因组未能完整组装的高度重复序列区域中，发
解析四倍体攸茶（Camellia－meiocarpa－Hu）单倍型基因组
在植物的奇妙世界里，油茶作为重要的木本食用油料植物，有着超 2300 年的栽培历史，其用途广泛，在全球粮食危机的大背景下愈发受到关注。攸茶（Camellia meiocarpa Hu）是其中一员，它叶茂花大果丰，极具农业利用潜力。然而，四倍体攸茶的染色体水平基因组数据匮乏，且多倍体油茶物种高质量基因
中国科学家绘就谷子基因组单倍型图谱
由中国农科院作物科学研究所、中科院上海生科院国家基因研究中心、中科院遗传与发育生物学研究所等8家单位组成的科研团队，在国际上率先完成了谷子单倍体型图谱的构建和47个主要农艺性状的全基因组关联分析。相关成果6月23日在线发表于《自然—遗传学》杂志。 据介绍，谷子为二倍体，基因组小、自花
研究人员完成枣和酸枣单倍型基因组组装
近日，西北农林科技大学林学院红枣团队黄建研究员课题组以我国制干枣主栽品种‘骏枣’和著名“秦药”代表清涧酸枣为研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多种先进测序技术以及多种组装策略完成了枣和酸枣T2T gap-free和T2T gap-free单倍型基因组的组
单倍型与基因型的区别
更进一步的讲，单倍型也是指一个染色单体里面具有统计学关联性的一类单核苷酸多态性（SNPs）。一个单倍型内的这类统计学关联性和等位基因的确认被认为是可以明确的识别所有其他多态区域。这些信息对于探查普通疾病的基因学非常有用，也被用于人类单倍体型图计划（HapMap）中。基因在一条染色体上的组合称单元
新方法破解高杂合物种单倍型基因组组装难题
近日，南京农业大学梨工程技术研究中心教授张绍铃团队在《基因组研究》在线发表最新研究成果。该研究将单花粉原生质体分离的新方法与单细胞DNA扩增技术相结合，并采用“条形码”生物信息学策略整合了12个花粉细胞的单倍体特征序列数据，从而开发出一种高杂合物种单倍型基因组组装的新方法。 论文通讯作者张绍铃
首个半野生型单倍型甜瓜T2T基因组装成功
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/511997.shtm甜瓜（ Cucumis melo L.）是一种重要的园艺作物，位居十大水果之列。甜瓜分为薄皮甜瓜和厚皮甜瓜两个亚种，多样性丰富。长期的人工选择导致严重的驯化瓶颈，栽培品种的遗传多样
农科院研究揭示水稻全基因组功能单倍型自然变异特征
近日，中国农业科学院作物科学研究所（以下简称作科所）水稻分子设计技术与应用创新团队构建了一个全基因组基因功能单倍型（gcHap）数据集，全面揭示了亚洲栽培稻基因功能单倍型自然变异特征，提出亚洲栽培稻多起源（驯化）假说，并开发了适用于功能单倍型数据全基因组关联分析和全基因组预测的软件包“HAPS”
杂交猪单倍型分辨率三维基因组特征成功解析
我国是世界第一养猪大国，2023年出栏生猪7.27亿头，占全球总量54.89%。生猪在国计民生、粮食安全和社会稳定中具有重要地位和作用。筛选并鉴定影响猪重要经济性状的关键基因组变异，挖掘育种靶点，创新性运用到实际育种中，能有效加速优质高产猪新品种（系）的培育进程。因此，系统鉴定猪基因组中的调控元件并
基于SNPs－研究的单倍型图谱计划
寻找标记SNPs 的国际遗传变异图谱计划，即国际单倍型图谱计划(Haplotype Map Project)已于2002年10月正式启动，2003 年中国承担了“国际单倍型图谱计划”10% 的任务，这表明我国基因科学研究能力的提高和在国际生命科学领域学术地位的提升。该计划的启动将为人类致病基
“理想型”翻开马铃薯杂交育种新篇章
“马铃薯是典型的无性繁殖作物，基因组高度杂合，存在大量有害变异，只有系统揭示马铃薯的基因组特征，才能有效实现无性繁殖作物的有性化育种。”中国科学院院士、中国农业科学院深圳农业基因组研究所（以下简称基因组所）研究员黄三文告诉《中国科学报》，有性繁殖的作物能够通过杂交改良性状，大大提高育种效率。
八倍体草莓单倍型定相与着丝粒演化动态研究获进展
多倍化是植物演化的关键驱动力之一。同时，多倍化是植物进化和育种应用的重要机制，对物种遗传组成和习性具有重要影响。现今，广泛栽培的凤梨草莓为异源八倍体，其基因组具有高杂合性和高倍性的特点。随着测序技术与分型算法发展，高质量的单倍型基因组解析成为可能，但未有研究评估分型策略对多倍体基因组解析的影响。植物
马铃薯基因组序列框架图全球发布
中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成 9月23日，由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。
“北京方案”,使造血干细胞单倍型移植成可行
白血病是危害人类健康的重大疾病之一，造血干细胞移植是治愈白血病最有效的手段。造血干细胞是血液系统中的成体干细胞，是一个异质性的群体，具有长期自我更新的能力和分化成各类成熟血细胞的潜能。它是研究历史最长且最为深入的一类成体干细胞，对研究各类干细胞具有重要的指导意义。我国的医学家们在不断探索的道路上
基因组研究揭示欧洲马铃薯进化史
近日，来自德国、秘鲁、英国和西班牙的一个国际研究团队，对大量的马铃薯品种进行了测序，以了解更多关于现代欧洲马铃薯的历史。在他们6月24日发表在Nature Ecology and Evolution上的论文中，该团队描述了他们对马铃薯历史的研究以及新发现。 过去的研究表明，马铃薯是在17世纪被
我国学者绘制全球首张精细普通菜豆单倍型图谱
近日，中国农业科学院作物科学研究所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队联合国内外6家科研单位对来自19个国家的683份普通菜豆资源的全基因组进行重测序，并在纬度跨度、光照时间长短差异明显的四地（黑龙江哈尔滨、河南南阳、贵州毕节和海南三亚）开展了三年的主要农艺性状的表型鉴定，明确了普通菜豆
我科学家主导完成马铃薯基因组测序
7月15日，中国农业科学院公布，经过6年努力，由14个国家97名研究人员组成的“马铃薯基因组测序国际协作组”日前完成了马铃薯基因组测序。由中方团队主导的这项研究，奠定了中国在这一研究领域的领先地位。 7月14日，国际权威学术期刊《自然》以封面文章的形式发表了马铃薯全基因组序列
马铃薯琼脂
成分 马铃薯(去皮切块) 200g 琼脂 20g 蒸馏水 1000mL制法 同马铃薯葡萄糖琼脂。 用途 鉴定霉菌用。
世界重大害虫马铃薯块茎蛾高质量基因组破译
马铃薯块茎蛾形态特征和危害症状。中国农科院植保所供图 近日，中国农业科学院植物保护研究所经济作物虫害监测与防控创新团队联合国内外多家单位，组装了茄科作物的世界重大害虫马铃薯块茎蛾的染色体水平高质量基因组，相关研究结果发表在Nature旗下刊物《科学数据》（Scientific Data）。 马铃薯
单型培养的定义
中文名称单型培养英文名称monotypic culture定 义仅有一种类型细胞的体外生长与增殖的培养技术。应用学科细胞生物学（一级学科），细胞培养与细胞工程（二级学科）
DM5E－Basic/DM5E/DM5EDL－超声波测厚仪－常用探头有哪些
DM5E Basic/DM5E/DM5EDL 超声波测厚仪 常用探头有哪些DM5E 系列超声波测厚仪是GE传感与检测科技推出的一代便携式腐蚀监测测厚仪。 DM5E 系列超声波测厚仪大大改进了先前腐蚀测厚仪的性能，在正常温度以及高温时拥有更佳的厚度测量稳定性和可重复性。 DM5E 系列超声波测厚仪可在
酮症酸中毒起病的DM患者的分型及治疗方案
病例资料患者男，51岁，因“多饮多尿10余天，门诊测指尖血糖Hi”入院。母亲有糖尿病，有高血压病史，吸烟30余年，每日10余支。入院查：血压120/80mmHg，体重74kg，BMI 22.3kg/m2，腰围 78cm，心率88次/min，空腹血糖24.3mmol/L，餐后2h血糖23.4mmo
泛基因组：赋能未来作物育种的基石
绘图：黄怡可 泛基因组（Pan-genome）是一个物种内所有基因组信息的总和，它比单一参考基因组涵盖了更多的遗传多样性。 近年来，科学家已经获得了多个作物的泛基因组。如何利用这些更为全面的基因组信息培育下一代良
泛基因组：赋能未来作物育种的基石
绘图：黄怡可 泛基因组（Pan-genome）是一个物种内所有基因组信息的总和，它比单一参考基因组涵盖了更多的遗传多样性。 近年来，科学家已经获得了多个作物的泛基因组。如何利用这些更为全面的基因组信息培育下一代良
新型量子点发射单光子速率提升3倍
由巴西坎皮纳斯州立大学科学家领衔的国际团队，研制出一种新型低密度半导体量子点，其发射单光子的速率较传统方法提升3倍，有望助推量子通信和光子量子计算等技术进一步发展。相关研究成果发表于新一期《纳米快报》。量子点是一种纳米级半导体结构，因能捕获电子和空穴，被称为“人造原子”。在外加电场或光照下，它会发出
京东一款马铃薯淀粉大肠菌群超标5.1倍－平台已下架
国家食品药品监督管理总局于2017年12月22日发布《关于12批次食品不合格情况的通告（2017年第221号）》（以下简称《通告》），指出一款京东商城出售的马铃薯淀粉大肠菌群超标5.1倍。日前北京市食品药品监督管理局已责令京东平台对其采取下架措施控制风险。 《通告》显示，这款不合格产品为银京调
多个有害突变导致马铃薯自交衰退
自交衰退在异花授粉植物中是一种普遍存在的现象：在进行连续多代自交后，会出现生理机能的衰退，表现为生长势减弱、产量降低。 当地时间1月14日，《自然—遗传学》杂志在线发表了云南师范大学马铃薯科学研究院与中国农业科学院农业基因组研究所（以下简称基因组所）共同完成的马铃薯自交衰退遗传机制解析成果。这
单头昆虫基因组DNA的提取
实验概要一种简单快速提取单头小型昆虫基因组DNA的方法。主要试剂1. 蛋白酶K[美国Merck公司]2. 三羟甲基氨基甲烷(Tris)[美国Amresco公司]3. Taq DNA聚合酶及dNTP[NEB公司]4. 琼脂糖及溴化乙锭(EB)[美国Amresco公司]5. 乙二胺四乙酸钠(Na2EDT
云南师范大学Nature－Genetics发文：自交衰退的遗传基础
研究人员发表了题为“The genetic basis of inbreeding depression in potato”的文章，公布了“优薯计划”的最新成果：用二倍体替代四倍体，并用杂交种子替代薯块，对马铃薯的育种和繁殖方式进行颠覆性创新。 马铃薯是世界上最重要的块茎类粮食作物。与其它谷