普通pcr引物设计和荧光定量pcr引物设计的区别
一、方法不同1、普通pcr引物设计:引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。2、荧光定量pcr引物设计:通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,标记跟踪PCR产物进行实时监测反应,利用与之相适应的软件对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度二、原理不同1、普通pcr引物设计:为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。2、荧光定量pcr引物设计:在PCR反应体系中加入荧光基团,通过荧光信号不断累积而实现实时监测PCR全程,然后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。在实时荧光定量PCR中,对全程PCR扩增过程进行实时检测,根据反应时间和荧光信号的变化可以绘制成一条曲线。三、注意事项不同1、普通pcr引物设计:引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。产物不能形成二级结构。引物长度在15~30碱基之间。2、荧光定量pcr引物设计:实时荧光定量 PCR 仪应安放在湿度较低、灰尘较少、远离水池的平稳台面上,不能......阅读全文
PCR技术(二):PCR反应模板的制备
PCR反应的关键因素主要有引物的选择与设计,酶的质量.模板的制备,在前二者都稳定可行的情况下,PCR模板的制备尤为重要.模板处理方法的选择及操作人员的基 本技能,决定分离模板核酸(DNA或RNA)的质和量及PCR的成败.而提高模板核酸质量的 关键是除去杂质(蛋白质、酶、脂肪等).除去抑制Taq DN
定量RTPCR-(Quantitative-RTPCR)
Application: Quantitative RT-PCR is used to quantify mRNA in both relative and absolute terms. It can be applied for the quantification of mRNA expres
荧光PCR/实时定量PCR技术应用简介
一.荧光PCR原理1.荧光共振能量传递 (FRET)某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光,当另一屏蔽基团与其距离合适时,原发射光将会被屏蔽基团所吸收,并转化为其他波长的发射光或热能,称之为FRET。2.荧光化学:荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加
免疫PCR(ImmunoPCR)概念和基础
(一) 免疫PCR技术的概念免疫PCR是一种抗原检测系统,将一段已知序列的DNA片段标记到抗原抗体复合物上,再用PCR方法将这段DNA扩增,然后用常规方法检测PCR产物。免疫PCR集PCR的高灵敏度与抗体和抗原反应的特异性于一体。其突出的特点是指数级的扩增效率带来了极高的敏感度,能检出浓度低至2ng
免疫PCR(IMPCR)注意事项
免疫PCR(IM-PCR)注意事项 (1)固相载体的选择:主要取决于抗原在固相载体上的吸附程度。如果抗原吸附良好,可以进行IM-PCR。如果抗原吸附不良,则需选用双抗体夹心IM―PCR。另外选用的固相载体要和PCR仪器相匹配。一般用0.5ml的塑料反应管,也可以用微量滴定板。 (2)
Single-Cell-PCR-单细胞PCR实验技术
Single Cell PCR(Protocol provided by Carolyn Troeger)Cell picking c Axiovert 100/Zeiss, extended glass capillary/Drummond, Broomall and a micromanipul
直接原位PCR(In-situ-PCR)操作方法
原位PCR是原位杂交细胞定位和PCR的高灵敏度相结合的技术,使得靶基因检测有了极大的改进。此技术是在细胞(爬片、甩片或涂片)或组织(石蜡、冰冻切片)上直接对靶基因片段进行扩增,通过掺入标记基团直接显色或结合原位杂交进行检测的方法。1.组织切片和细胞样品的制备【试剂与配置】10%福尔马林二甲苯PBS【
实时荧光定量pcr仪的PCR优势
样品到达域值水平所经历的循环数称为Ct值(限制点的循环数)。域值应设定在使指数期的扩增效率为最大,这样可以获得最准确,可重复性的数据。如果同时扩增的还有标有相应浓度的标准品,线性回归分析将产生一条标准曲线,可以用来计算未知样品的浓度。
降落PCR(Touchdown-PCR)技术的的优点
综合比较普通PCR技术和最大耐受量聚合酶链反应,认为前者程序简单,省时,一般的PCR扩增仪都可完成,但缺点是退火温度不适当时容易出现假阳性;而最大耐受量聚合酶链反应虽然程序复杂,需要扩增仪有较大的内存,但能非常有效地降低或避免假阳性,且不在理想的工作条件(比如最佳镁离子浓度)下也可扩增出产物。 这就
直接PCR技术,让PCR更简单(二)
直接PCR(Direct PCR)是一种不经核酸提取而直接使用动物或植物组织等直接进行扩增的反应。在许多方面,直接PCR的工作方式类似于常规PCR。主要区别是直接PCR中使用的定制缓冲液,样本可不经过核酸抽提,直接进行PCR反应,但对于参与直接PCR反应的酶的耐受性和buffer的兼容性有相对应的要
间接原位PCR(原位杂交PCR)实验
实验材料 组织或细胞样品试剂、试剂盒 SSC硫酸葡聚糖甲酰胺脱脂奶粉Denhardt’s 液SDS变性的鲑鱼精DNARnaseDTT乙醇仪器、耗材 玻片石蜡膜橡皮泥湿盒实验步骤 一、预杂交 1. 试剂与配制 2×SSC 50%去离子甲酰胺:用4×SSC配制(v/v) 预杂交液:2×SSC,5%硫
PCR实验技术指南之PCR反应参数
1. 变性:在*轮循环前,在94℃下变性5-10min 非常重要,它可使模板DNA 完全解链,然后加入Taq DNA聚合酶(hot start),这样可减少聚合酶在低温下仍有活性从而延伸非特异性配对的引物与模板复合物所造成的错误。变性不完全,往往使PCR 失败,因为未变性完全的DNA 双链会很快复性
关于温度梯度PCR和降落PCR
关于温度梯度PCR和降落PCR的区别: 温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到zui优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),zui后看看哪个温度的效果z
PCR技术(十三):PCR用于进化分析
进化遗传学具有两个并列的研究方向:系统发育的重建和种群分析。自1962年, Zuckerkandl和Pauling提出蛋白质序列和基因序列的比较可以象分子种一样用于标志 现存物种分化的时间以来,各种生化方法被用于系统发育的研究。在最初二十年内, 同功酶的电泳分析、免疫学比较和蛋白质序列分析被广泛地应
关于温度梯度PCR和降落PCR
关于温度梯度PCR和降落PCR的区别: 温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到最优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),最后看看哪个温度的效果最好。总
什么是反向-PCR?反向-PCR的特点
常规 PCR 是扩增两引物之间的 DNA 片段,反向 PCR(reverse PCR)是用引物来扩增两引物以外的 DNA 片段。一般先用限制性内切酶酶解 DNA(目的基因中不存在该酶的酶切位点,且片段应短于2~3kb),然后用连接酶使带有黏性末端的靶片段自身环化,最后用一对反向引物进行 PCR,得到
反向PCR(reverse-PCR)原理、程序和局限
反向PCR(reverse PCR)是用反向的互补引物来扩增两引物以外的未知序列的片段,而常规PCR扩增的是已知序列的两引物之间DNA片段.实验时选择已知序列内部没有切点的限制性内切酶对该段DNA进行酶切,然后用连接酶使带有粘性末端的靶序列环化连接,再用一对反向的引物进行PCR,其扩增产物将含有
PCR实验技术指南之PCR反应参数
1. 变性:在*轮循环前,在94℃下变性5-10min 非常重要,它可使模板DNA 完全解链,然后加入Taq DNA聚合酶(hot start),这样可减少聚合酶在低温下仍有活性从而延伸非特异性配对的引物与模板复合物所造成的错误。变性不完全,往往使PCR 失败,因为未变性完全的DNA 双链会很快复性
TAILPCR(thermal-asymmetric-interlaced-PCR)简介
在分子生物学研究中,基因克隆和分子杂交的探针制备等操作常需分离与已知DNA序列邻近的未知序列,TAIL-PCR又叫热不对称交错PCR,能够较好地解决上述难题。该技术通过3个嵌套的特异性引物分别和简并引物组合进行连续的PCR循环,利用不同的退火温度选择性地扩增目标片段,所获得的片段可以直接用做探针标记
PCR技术服务PCR的实用技巧
增加PCR的特异性:1. primers design这是zui重要的一步。理想的,只同目的序列两侧的单一序列而非其它序列退火的primer要符合下面的 一些条件1) 足够长,18-24bp,以保证特异性.当然不是说越长越好,太长的primer同样会降低特异性,并且降低产量2) GC% 40%~60
新型PCR分析方法毛细管PCR技术
新型PCR分析方法毛细管PCR技术 常规PCR反应采用导热性较差的塑料管作为反应容器,对于100~1样品,样品温度要比槽板温度滞后2030s,加上槽板升降温度较慢(1C/s),因此30个循环反应通常需要2~6h,循环时间多浪费在常规PCR反应采用导热性较差的塑料管作为反应容器,对于100~1样品,样
RainDrop数字PCR系统实现10重PCR分析
【摘要】美国RainDance Technologies公司拥有ZL的RainStorm即皮升级微流体液滴制备技术,基于此核心技术RainDance推出了新型RainDrop 数字PCR系统,这一新型系统除具有超高检测灵敏度和精确绝对定量能力外,更拥有无与伦比的多重分析能力,可实现10重PCR分
谈关于温度梯度PCR和降落PCR
关于温度梯度PCR和降落PCR的区别: 温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到优退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR,每一管放在仪器内不同列(有的是不同行)上,分别进行PCR(如50℃~60℃可以分6管,分别为50,52,54,56,58,60度),最后看看哪个温度的效果好。总
新型PCR分析方法毛细管PCR技术
常规PCR反应采用导热性较差的塑料管作为反应容器,对于100~1样品,样品温度要比槽板温度滞后20—30s,加上槽板升降温度较慢(1’C/s),因此30个循环反应通常需要2~6h,循环时间多浪费在加热和冷却样品过程中,不能满足临床快速诊断的需要。毛细管PCR由于采用导热性远强于塑料管的毛细管作为反应
快速PCR技术与快速PCR仪的区别
在PCR仪上完成一个PCR反应所需要的时间决定于以下几个因素:1、模块升温和降温时间2、模块与PCR管内温度平衡时间3、延伸时间4、循环次数下面就以上几点做一点分析,以便大家了解快速PCR技术与快速PCR仪的区别。1、模块升温和降温度时间PCR仪一般会标明升温速度和降温速度,但标的大多是zui大变
实时荧光定量PCR与普通PCR的区别
二者结果相同。都能说明生物体外的特殊DNA复制的整个过程的扩增效率和溶解温度情况。区别:1、二者系统组成不同荧光定量PCR仪比普通的PCR仪多了荧光信号采集系统和计算机分析处理系统。2、二者原理不同荧光定量PCR实时监测与DNA结合的荧光染料激发的荧光,普通OCR通过检测插入DNA中核算染料的量来测
PCR仪RACE的PCR结果有杂带
RACE PCR杂带或非特异性PCR条带可能是由于以下原因: *GSP与其他cDNA的非特异性结合会导致在扩增目的产物时得到无关产物。 *GeneRacer引物和cDNA的非特异性结合会导致产生一端带有GeneRacer引物序列的PCR产物。 *RNA降解。 *PCR管或试剂污染。 注
反向pcr和反式pcr一样么
反式PCR,或者称反转录PCR(Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)、逆转录PCR,是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形.在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增.P
PCR(RTPCR)反转录-定性检测方法
1、试剂 (1)10倍 RT 缓冲液:500mmol/L Tris·Cl(pH8.0),0.60 mmol/L MgCl2,400mmol/L KCl,10mmol/L DTT。 (2)10倍 PCR 缓冲液:100mmol/L Tris·Cl(pH8.3),500mmol/L kCl,15
实时荧光定量PCR与普通PCR的区别
二者结果相同。都能说明生物体外的特殊DNA复制的整个过程的扩增效率和溶解温度情况。区别:1、二者系统组成不同荧光定量PCR仪比普通的PCR仪多了荧光信号采集系统和计算机分析处理系统。2、二者原理不同荧光定量PCR实时监测与DNA结合的荧光染料激发的荧光,普通OCR通过检测插入DNA中核算染料的量来测