表观遗传研究指南（二）
今年九月，对于基因组研究者们来说是一个具有纪念意义的月份，因为美国人类基因组研究院(NHGRI)资助的ENCODE项目在Nature，Genome Biology，Genome Research等杂志上公布了三十多份论文，还有在Science，Cell，以及the Journal of Biological Chemist上的一些功能性介绍论文。这一项目的研究人员对147细胞系进行了将近1,650次实验，分子转录，转录因子结合，染色体拓扑结构，组蛋白修饰，DNA甲基化等多方面内容。 包含这些种种功能元件的就是表观遗传学，近年来科学家们越来越意识到这些元件特征在发育和疾病中的重要性，因此早在2008年，也就是NHGRI启动ENCODE计划的五年后，NIH又开始了第二项大规模图谱绘制工程：表观基因组学路线图项目(Roadmap Epigenomics Program)，这一项目整理了61个“完整”的表观基因组，......阅读全文
华裔科学家徐金荣率国际研究组测序禾谷镰孢菌染色体基因
对一种真菌的基因组测序研究或许能够回答一种病原物的成因。这种真菌能导致最严重的谷物疾病，并且还能产生可能对人和家畜有生命威胁的毒素。 这种真菌（禾谷镰孢菌，Fusarium graminearum）对小麦和大麦的破坏尤为严重，过去10年在美国造成大约100亿美元的损失。测序了这种真菌基因的研究人员表
Cell发布突破性染色质检测技术
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术，可以提供真核生物基因组的详细三维（3-D）图像，这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》（Cell）杂志上的研究论文中，这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠，填补了以往一些
弥补ChIPseq缺陷的新工具
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术，可以提供真核生物基因组的详细三维（3-D）图像，这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》（Cell）杂志上的研究论文中，这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠，填补了以往一些
Cell发布突破性基因组研究技术
来自美国麻省大学医学院的研究人员开发出了一项新技术，可以提供真核生物基因组的详细三维（3-D）图像，这有可能帮助科学家们解答一些有关染色质结构的关键问题。在发表于《细胞》（Cell）杂志上的研究论文中，这一称作为Micro-C的新技术使得研究人员能够以核小体分辨率来分析染色体折叠，填补了以往一些
研究揭示核纤层蛋白塑造三维基因组空间秩序机制
核纤层是紧贴内核膜内侧的蛋白网状结构，主要由核纤层蛋白（lamins）及其结合蛋白构成。人类的lamins在发育、衰老及疾病过程中扮演关键角色，分为由LMNA基因编码的A型和分别由LMNB1和LMNB2编码的B型。目前，在LMNA基因中已鉴定出超600种致病突变，这些突变可导致儿童早衰症、扩张型心肌
染色体制备
实验方法原理 固定阻滞于分裂中期的细胞，在低渗液中膨胀，将细胞滴在载玻片上，染色，观察 [ Rothfels and Siminovitch，1958；Rooney and Czepulkowski，1986 ] 。实验材料 D-PBS0.25%胰蛋白酶对数期的培养细胞秋水仙酰胺试剂、试剂盒 低渗溶
染色体制备
实验方法原理 固定阻滞于分裂中期的细胞，在低渗液中膨胀，将细胞滴在载玻片上，染色，观察 [ Rothfels and Siminovitch，1958；Rooney and Czepulkowski，1986 ] 。
等臂染色体
有的具有一个着丝粒，有的具有两个着丝粒。在减数分裂中会发生两臂间的联会，为此，由于形成交叉而使形态发生变化，所以无论是一个着丝粒的或两个着丝粒的等臂染色体都是不稳定的。在体细胞分裂中，具有一个着丝粒的，多数是稳定的，而具有两个着丝粒的则是不稳定的。一般认为，具一个着丝粒的等臂染色体的形成经过三个阶段
染色体制片
实验概要掌握染色体制片的基本程序。实验步骤1. 取对数生长期细胞一个。2. 将培养基换成10mL DMEM(H) 10%FBS 0.1μg/mL秋水仙素的培养基，处理1~2小时。3. 将细胞培养液倒掉，马上加入3~4mL 0.1%胰蛋白酶，并立即摇晃0.5~1min。当在显微镜下看到分裂相细胞脱壁后
染色体臂内倒位
中文名称臂内倒位英文名称paracentric inversion定 义发生在染色体一条臂上不包含着丝粒的倒位。应用学科遗传学（一级学科），细胞遗传学（二级学科）
染色体制备
实验方法原理固定阻滞于分裂中期的细胞，在低渗液中膨胀，将细胞滴在载玻片上，染色，观察 [ Rothfels and Siminovitch，1958；Rooney and Czepulkowski，1986 ] 。实验材料D-PBS0.25%胰蛋白酶对数期的培养细胞秋水仙酰胺试剂、试剂盒低渗溶液醋酸
平衡染色体
中文名称平衡染色体英文名称balance chromosome定 义平衡易位中两个非同源染色体各发生断裂后，互相交换其片段。产生的染色体大多保留了原有基因总数，对基因表达和个体发育一般无严重影响，故称平衡染色体。是由姐妹染色单体交换形成的。应用学科遗传学（一级学科），细胞遗传学（二级学科）
染色体联合
中文名称染色体联合英文名称chromosome association定 义减数分裂时同源染色体间的相互吸引及配对的现象。应用学科遗传学（一级学科），细胞遗传学（二级学科）
染色体制备
一、 人外周血染色体制备 1. 实验原理 人的外周血淋巴细胞培养方法是1960年由Moorhead 提出来的。正常情况下，人外周血小淋巴细胞都处在G1期（或G0期），但在体外给予一定的条件，进行培养，经72 h就可获得大量的有丝分裂细胞。这种取材简易、用血量少的培养方法已被广泛采用。
染色体制备
实验方法原理固定阻滞于分裂中期的细胞，在低渗液中膨胀，将细胞滴在载玻片上，染色，观察 [ Rothfels and Siminovitch，1958；Rooney and Czepulkowski，1986 ] 。实验材料D-PBS
染色体臂间倒位
所谓臂间倒位（pericentric inversion）,是指染色体的长臂和短臂各发生一次断裂，断片倒转180度后重接，从遗传物质的得失角度看，这种结构变化没有遗传物质的丢失，因此具有臂间倒位染色体的个体一般不具有表型效应，被称为臂间倒位的携带者。很多染色体都可以发生臂间倒位，以9号染色体最为常见
Science：中美科学家联手从结构上揭示RSC复合物作用机制
控制染色体结构的细胞机器，比如RSC复合物，在大约五分之一的人类癌症中发生突变。如今，在一项新的研究中，来自中国清华大学、北京大学和美国犹他大学医学院的研究人员首次构建出RSC复合物的高分辨率视觉图，阐明了这种多蛋白机器的工作原理及其在健康细胞和癌细胞中的作用。论文通讯作者为清华大学生命科学学院
绘制基因组的“谷歌地图”
染色体的功能远不止保持DNA整齐有序。这种基因组DNA和蛋白质组成的复合物有许多不同的结构和构象。这些结构和构象可能会影响周围基因的表达。在某些构象中，线性DNA中相距较远的两个序列可能实际上非常靠近，并影响彼此的活性；而在其他形式中，这两个序列又可能相距甚远。 美国麻省理工学院研究生Erez
关于非同源染色体的染色体的介绍
染色体是细胞核中最重要的组成部分，在细胞分裂的间期，由于染色体分散于细胞核中，故而一般只看到染色较深的染色质，而看不到具一定形态特征的染色体。几乎在所有生物的细胞中，包括噬菌体（病毒）在内，在光学显微镜或电子显微镜下都可以看到染色体的存在。各个物种的染色体都各有特定的形态特征。在细胞分裂过程中，
人类染色体的染色体带的命名
根据人类细胞遗传学命名的国际体制(ISCN)的规定，每条染色体都以显著的形态特征(着丝粒、染色体两臂的末端和某些带)作界标而区分为若干个区，每个区都含一定数量、一定排列顺序、一定大小和染色深浅不同的带，这就构成了每条染色体的带型。 区和带的命名是从着丝粒开始，向臂的远端序贯编号。"1"是最靠近
复活猛犸象不是梦！科学家重建猛犸象三维染色体
一个国际研究小组成功地重构了一只生活在5.2万年前的猛犸象的基因组和三维染色体结构，这是首次利用古代DNA样本开展此类研究。研究揭示了猛犸象基因组在细胞内的组织方式，以及特定基因在其皮肤组织中的表达情况。相关研究7月11日发表于《细胞》。了解基因组的三维结构可以提供除序列之外的许多额外信息，但大多数
关于染色质免疫共沉淀的内容简介
真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。因此，研究蛋白质与DNA在染色质环境下的相互作用是阐明真核生物基因表达机制的基本途径。染色质免疫沉淀技术（chromatin immunoprecipitation assay, ChIP）是目前研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细
两篇Nature技术文章介绍基因组组织
【摘要】近期两项最新的研究报道了染色体构象捕获领域的技术进展，第一篇文章描述了一种高分辨率4C-seq 新型工作流程和计算通道，第二篇则报告一种新策略，能同时消除Hi-C数据中多个背景来源。 染色体构象捕获（3C）技术正在改变我们对于基因组空间组织构架的理解。然而目前推测染色质相互作用，却
我国科学家揭示哺乳动物胚胎染色体3D结构重编程规律
记者从中国科学院获悉，我国科学家近日在染色体3D结构以及在早期胚胎发育过程中染色体结构的重编程变化方面取得重大科学突破，相关成果于2017年7月13日发表在国际著名期刊《CELL》上。 记者了解到，人类DNA如果拉成一条直线，长度大约是2米，但一般的细胞核的直径却仅有5～10微米左右。因此基因
中科院、上科大：受精卵如何发育成多功能个体
来自中科院北京基因组研究所，上海科技大学的研究人员发表了题为“3D Chromatin Structures of Mature Gametes and Structural Reprogramming during Mammalian Embryogenesis”的文章，揭示了哺乳动物成熟精子
这个“酿酒”细菌有望成为下一个“细胞工厂”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/5/522843.shtm 炎热的天气里，一杯香甜的果汁很快就会变质，有时还会产生酒精味。这很可能是一种“擅长”将葡萄糖和果糖转化为乙醇的细菌在“作祟”。不过这种天然能产生乙醇的“罪魁祸首”却是科学家眼中的潜力
美国NIH将启动3D核小体重大研究计划
在过去的10年中，科学家已经认识到基因组并非随机存储于细胞核中。但一个核心问题是，基因组和表观基因组的变化是如何影响细胞核的3D结构，以及如何进一步影响到高度受控的转录平衡体系。 为解决这个问题，美国国立卫生研究院（NIH）宣布，将人类染色体的三维结构研究方向视为进一步认知生物学和
这个“酿酒”细菌有望成为下一个“细胞工厂”
炎热的天气里，一杯香甜的果汁很快就会变质，有时还会产生酒精味。这很可能是一种“擅长”将葡萄糖和果糖转化为乙醇的细菌在“作祟”。 不过这种天然能产生乙醇的“罪魁祸首”却是科学家眼中的潜力股——有资质成为像酵母、大肠杆菌那样的底盘细胞，为人类制造大宗化学品。 这就是早在1928年被人们发现的运
三维基因组（HiC）技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
马科动物基因组与物种形成理论
一项研究发现，包括马、驴和斑马在内的马科动物的进化史与物种形成的某些理论相矛盾。尽管细节丰富的马科动物化石记录常常作为进化的例子，导致现代马科动物多样性的一系列事件仍然不清楚。为了填补这些动物的进化历史——目前代表这一历史的只有马和家驴的遗传史——Ludovic Orlando及其同事对每一个现