Science：控制出生前后小鼠小脑细胞类型发育的遗传程序
长期以来，哺乳动物的小脑几乎只与运动控制有关，然而近期的研究已表明，它也有助于许多更高级的大脑功能。在一项新的研究中，德国海德堡大学分子生物学中心（ZMBH）的Henrik Kaessmann教授、海德堡霍普儿童癌症中心（KiTZ）的Stefan Pfister教授及其团队如今破解了控制出生前后小脑细胞类型发育的遗传程序。他们将小鼠小脑的数据与负鼠的相应数据进行了比较，揭示了基本的基因调控网络，这些网络在1.6亿多年前的哺乳动物进化的早期阶段已经形成。相关研究结果于2021年7月29日在线发表在Science期刊上，论文标题为“Developmental and evolutionary dynamics of cis-regulatory elements in mouse cerebellar cells”。 哺乳动物器官的发育是由许多不同的基因--也称为基因表达网络--的微调激活和复杂互动控制的。论文共同第一作者、K......阅读全文
时空分辨单细胞测序技术有哪些优缺点？
时空分辨单细胞测序技术具有以下优点：优点：更全面的细胞动态信息能够同时获取细胞的基因表达信息以及它们在组织中的位置和时间维度上的变化，提供更全面和准确的细胞动态变化图像。精准定位细胞功能有助于确定特定细胞类型在特定时间和空间位置上的功能，从而更深入地理解细胞间的相互作用和组织器官的发育、功能维持及疾
单细胞测序技术在细胞呼吸研究进展
单细胞测序技术在细胞呼吸研究中面临以下一些挑战：数据复杂性和分析难度：单细胞测序会产生大量复杂的数据，需要复杂的生物信息学分析方法和专业知识来解读，从海量数据中准确识别与细胞呼吸相关的有意义信息并非易事。技术误差和噪声：包括样本制备、细胞捕获、核酸扩增等过程中可能引入技术偏差和噪声，影响数据的准确性
玉米单细胞转录组测序，11种细胞类型
近日，广东省科学院南繁种业研究所生物育种研究室在玉米单细胞转录组测序研究方面取得新进展。相关研究在线发表于《作物学报》（The Crop Journal）。广东省科学院南繁种业研究所李旭辉博士为该论文第一作者，齐永文研究员为通讯作者。玉米是全球重要的粮食和能源作物，而其产量形成的基础依赖其特殊的根系
单细胞测序技术“遍地开花”，精准医疗“如虎添翼”！
作者：Carrie 单细胞测序技术 基因测序在体外诊断市场中的重要性日益突出。其中，单细胞测序技术自2009年问世，2013年被Nature Methods评为年度技术以来，越来越多地被应用在科研领域。2015年以来，10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-
著名学者Nature综述：单细胞测序之现状
每个细胞都是独一无二的，但我们的研究对象往往是细胞群体，忽略了这些细胞之间的异质性。正因如此，单细胞基因组学研究受到了越来越多的关注。 单细胞基因组学领域近年来发展得非常迅速，为人们揭示了复杂生物学体系的许多重要线索，包括微生物群落的生态多样性和人类癌症的基因组。一月二十五日Nature Re
单细胞测序技术在癌症治疗中的应用
单细胞测序技术在癌症治疗中的应用具有重要意义，以下是详细的介绍：肿瘤异质性分析癌症通常由具有不同基因表达模式和突变特征的细胞群体组成。单细胞测序能够揭示肿瘤内细胞的异质性，包括不同的亚型、分化状态和恶性程度。这有助于更全面地理解肿瘤的发展和演进，为制定个性化治疗方案提供依据。发现新的治疗靶点通过对大
单细胞测序技术的主要流程是怎样的？
单细胞测序技术的主要流程通常包括以下几个步骤：单细胞分离从组织或细胞悬液中分离出单个细胞。常用的方法包括流式细胞术分选、微流控技术、激光捕获显微切割等。细胞裂解和核酸提取裂解细胞以释放其中的核酸（DNA 或 RNA）。提取和纯化核酸，确保其质量和纯度适合后续的测序反应。逆转录和文库构建（对于 RNA
对疟原虫的单细胞基因组测序
美国圣安东尼奥，2014年5月8日——美国德克萨斯生物医学研究所的科研人员和他们的同事开发出了一种分离单个疟原虫细胞然后对其基因组测序的新方法。这一进展将让科学家能够改进他们识别病人感染的多种类型的疟原虫的能力，而且还可带来最佳的经设计的药物何疫苗以应对这种主要的全球性杀手。疟疾仍然是全世界最致
更便宜、更全面的单细胞RNA测序技术
康奈尔大学生物医学工程学院助理教授Iwijn De Vlaminck课题组开发了一款更健全的、低成本的方法解决了这个问题，不仅推动了单细胞基因组学发展，而且为感染和免疫生物学研究提供了一条新途径。这篇题为“Simultaneous Multiplexed Amplicon Sequencing
浅谈单细胞RNA测序的技术与分析难点
如今，单细胞生物学是一个热门话题。而在这一领域中，最前沿的则是单细胞RNA测序（scRNA-seq）。传统“批量的”RNA测序方法（RNA-seq）可以一次处理成千上万个细胞，并得到变异的平均水平。但是没有两个细胞是完全相同的，而scRNA-seq则可以揭示出每个细胞独特的微妙变化，甚至可以揭示全新
－著名学者Nature综述：单细胞测序之现状
每个细胞都是独一无二的，但我们的研究对象往往是细胞群体，忽略了这些细胞之间的异质性。正因如此，单细胞基因组学研究受到了越来越多的关注。 单细胞基因组学领域近年来发展得非常迅速，为人们揭示了复杂生物学体系的许多重要线索，包括微生物群落的生态多样性和人类癌症的基因组。一月二十五日Nature Re
【盘点】单细胞测序研究进展一览
细胞是生物学的基本单位，近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术，该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组，更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降，破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始
单细胞测序技术在肿瘤研究中的应用
单细胞测序技术在肿瘤研究中有以下多方面的应用：肿瘤细胞异质性研究鉴定肿瘤内不同的细胞亚群，包括具有不同基因突变、转录组特征和表型的细胞。揭示肿瘤细胞之间的差异对肿瘤进展、转移和治疗反应的影响。肿瘤微环境分析解析肿瘤微环境中免疫细胞、基质细胞等的组成和功能状态。研究肿瘤细胞与微环境中其他细胞的相互作用
单细胞测序技术应用和发展现状研究
一背景概况单细胞测序技术是指能够在单个细胞的水平上，对基因组或转录组进行高通量测序分析的一项新技术。与传统高通量测序相比，单细胞测序不仅能够分析相同表型细胞的异质性，还能获取难以培养微生物的遗传信息以及珍贵的临床样本的信息，具有广阔的应用前景。细胞是生命的单位，目前大部分的基因检测均是从组织中抽提D
单细胞测序前期常见问题解答
目前，单细胞测序这项技术被应用的越来越多，领域包括了神经科学、肿瘤免疫、胚胎发育等等，您是否也计划着开展相关的研究呢？心中关于单细胞的疑惑就让古朵生物带您从常见问题出发，逐步拨开迷雾吧 1、为什么要做单细胞测序？ 细胞与细胞之间的异质性，微环境里的细微差别，这些我们关注的信息都会被常规Bulk
测序技术再现新进展，已开发基于单分子测序平台的单细胞多组学测序技术
单细胞多组学测序技术是指对一个单细胞同时检测多个组学层面（例如基因组、表观基因组和转录组）的测序技术。这类技术可以更系统、全面地探索细胞异质性以及同一个细胞内的不同组学层面之间的互动关系，有利于更深入地解析复杂的生理、病理过程中细胞类型特异性的分子调控机制1, 2。2019年，Nature Me
单细胞测序发现帕金森病的关键调节因子
帕金森病（PD）是一种常见的神经系统变性疾病，其临床症状主要表现为僵化和震颤。目前，全球大约有600万人患有帕金森病。尽管大多数患者为散发病例，但少数患者是由于GBA基因中的变异，特别是N370S突变。 近日，牛津大学的研究人员利用患者和对照的诱导多能干细胞（iPSC）生成了多巴胺神经元，其丢
如何解读时空分辨单细胞测序技术的数据？
解读时空分辨单细胞测序技术的数据是一个复杂但关键的过程，通常可以遵循以下步骤：数据预处理质量控制：检查测序数据的质量，去除低质量的细胞和测序读段。数据标准化：校正不同细胞之间由于测序深度等因素导致的偏差。细胞聚类根据基因表达模式将细胞分组，识别不同的细胞类型或状态。空间定位分析将细胞的基因表达数据与
时空分辨单细胞测序技术的未来发展趋势
时空分辨单细胞测序技术的未来发展趋势可能包括以下几个方面：更高的时空分辨率技术将不断改进，能够在更小的空间尺度和更短的时间间隔内解析细胞的动态变化，实现对细胞活动更精细的监测。多组学整合不仅能同时检测基因表达，还将整合染色质结构、蛋白质组、代谢组等多组学信息，提供更全面的细胞状态描述。临床应用的拓展
谢晓亮院士研发出单细胞测序新技术
人类、草莓、蜜蜂、鸡和大鼠等许多生物体都已经进行过DNA测序。如果说测序个别物种具有挑战性，那么测序单个细胞的DNA无疑更难。 谢晓亮院士研发出单细胞测序新技术 为了获得足够的DNA进行测序，通常需要数以千计或甚至数以百万计的细胞。而找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的，
有哪些常用的基准单细胞测序数据集？
以下是一些常用的基准单细胞测序数据集：Human Cell Atlas（HCA）：这是一个大规模的项目，旨在绘制人体所有细胞类型的图谱，包含了来自多个组织和器官的单细胞测序数据。10x Genomics 提供的一些公开数据集，例如 PBMC（外周血单核细胞）数据集。Mouse Cell Atlas：
影响时空分辨单细胞测序技术发展的因素
时空分辨单细胞测序技术的发展可能会受到以下因素的影响：技术创新和突破包括更灵敏的检测方法、更高精度的空间定位技术、更有效的单细胞分离和捕获技术，以及更强大的数据处理和分析算法等。如果在这些方面缺乏关键的创新，技术发展可能会受到限制。成本降低高昂的设备、试剂和实验成本可能限制其广泛应用和大规模研究。降
单细胞测序是一种高效的检测技术
单细胞测序技术又称“下一代“测序技术或深度测序技术，可以一次性对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定，现已广泛应用在基因组测序、基因表达分析、非编码小分子RNA鉴定、转录因子靶基因筛选及DNA甲基化等相关的研究领域。 测序技术的突出优点是可以从细胞图谱的角度，探测细胞特异性以及细胞间的差异，探
Cell：单细胞测序绘制骨髓基质细胞全景图谱
最新发布在Cell上的一项研究表明，单细胞测序可以绘制骨髓基质细胞的完整类群，并为白血病研究提供新的视角。这一新研究由美国哈佛大学的David T. Scadden教授和马萨诸塞州综合医院Broad研究所的Aviv Regev团队合作而成。他们创新地使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术
－NIH鼓励科学家在单细胞测序领域创新
8月19日，美国国立卫生研究院（NIH）的Common Fund 基金会向单细胞测序领域发出挑战，Common Fund 称，愿意提供2项50万美元的奖金奖励那些在单细胞测序领域中有所突破的科学家或科研团队。 通过该技术，NIH称，希望能够了解细胞在发育过程中的各个阶段的变化以及行为，NIH要
单细胞转录组测序研究热点和发文锦囊
从Top50期刊2000余篇文献统计： 在刚刚发布的“十四五”规划中，“基因与生物技术”作为前沿科技攻关领域之一。而在这个领域，近年来最具里程碑的技术突破必然不能忽略“单细胞转录组测序”。本文通过对PubMed数据库中Top50期刊的共计2357篇单细胞转录组测序的引文进行数据分析，帮助读者了
单细胞测序的重要性及应用方向（一）
单细胞测序研究一直是当今的热门话题，想知道单细胞技术有哪些重要的应用？想深入了解当今主流的单细胞测序技术吗？华大智造《单细胞测序技术讲堂》开讲啦！跟着小造一起寻找这些问题的答案。单细胞测序的重要性随着第二代测序(next generation sequencing，NGS) 技术和第三代测序(
Nature：如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型？
近日，来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展，他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型，这对于深入了解器官的细胞组成，探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义。 理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清
Cell：单细胞测序深度解析三阴乳腺癌
美国MD安德森癌症中心联合瑞典卡罗林斯卡学院的研究人员利用单细胞测序对三阴乳腺癌展开分析，表明耐药性是来源于现有的带有基因突变的克隆。这些结果于周四发表在《Cell》杂志上，将对这种癌症的诊断、预后和治疗具有临床意义。 三阴乳腺癌是指雌激素受体、孕激素受体和原癌基因Her-2均为阴性的乳腺癌。
小个头大内涵的单细胞测序研究盘点
近几年来，基于单细胞测序技术的科学研究取得了突飞猛进的发展，其成果有望为一些重要的生物学问题提供新的解决方案。测序君盘点了2015年的单细胞测序研究成果，供大家查阅。《Science》：瑞典卡罗林斯卡学院的科学家们的单细胞测序研究。该研究生成了有关皮质细胞类型以及细胞内活化基因的详细图谱。研究小组利