基因组学大牛Science发布癌症重大成果

Whitehead研究所的科学家们发现,称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。 领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Young博士,Young是人类胚胎干细胞调节通路的先驱,也是世界知名的基因组研究专家,他为利用组学工具研究干细胞做出了重要的贡献。 2013年,Young连续在Cell杂志上发表了三篇关于超级增强子的论文,证实超级增强子能够对大量的人类细胞类型起作用,并富集在与广泛疾病密切相关的基因组突变区域,表明它们有可能在疾病诊断和治疗中起重要作用。2015年3月,其在一项研究中揭示出了超级增强子作为功能部件将多个信号通路集中于一些关键基因处及调节转录活性的机制。研究论文发表在Molecular Cell杂志上。同月,他在PNAS杂志上描述了一种......阅读全文

科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能

  早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年,来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出,它们是以染色体外DNA(extrachromosomal DNA,ecDNA)的形式存在的,但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。  201

癌基因的关键——染色体外环状DNA(eccDNA)

实验方法:环状DNA-seq, RNA-seq(云序生物提供以上服务)1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构,作者通过环状DNA-seq(云序生物提供以上服务)方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外,并且

基因组学大牛Science发布癌症重大成果

  Whitehead研究所的科学家们发现,称作为“隔绝邻域”的环状染色质结构遭到破坏可以激活能够推动侵袭性肿瘤生长的癌基因。这一研究发现对于癌症诊断及治疗均具有重大的意义。相关论文发布在《科学》(science)杂志上。  领导这一研究的是Whitehead生物医学研究所的Richard A Yo

JBC:染色质重塑与癌症

  染色质的结构变化又称为染色质重塑(Chromatin remodeling),染色质重塑调节着基因转录、DNA修复、程序性细胞死亡等多种细胞基础过程。Stowers医学研究所的科学家们在前期研究的基础上深入解析了染色质重构的调控机制。   Stowers 研究所的研究人员进行了一系列生化实

Nature:揭示蛋白BORIS是耐药性癌症产生的罪魁祸首

  在一项新的研究中,美国研究人员发现一种称为BORIS的蛋白是某些儿童癌症的罪魁祸首。这种蛋白能够破解神经母细胞瘤基因组,导致在某些类型的治疗后处于休眠状态的癌细胞苏醒过来,从而引起癌症复发。他们还发现这种蛋白与其他几种癌症中的耐药性相关。相关研究结果近期发表在Nature期刊上,论文标题为“BO

环状RNA成癌症诊疗研究新热点

科技日报北京8月7日电 (记者张梦然)医学界正致力于揭示环状RNA在生物学中的复杂性,这一研究有望带领人们迎接癌症诊疗领域的革命性突破。澳大利亚弗林德斯大学发表在世界顶级癌症期刊之一《自然评论·癌症》上的一项新研究预测,在未来5—10年内,环状RNA在改善癌症治疗和患者预后方面具有巨大潜力。文章表示

环状RNA成癌症诊疗研究新热点

医学界正致力于揭示环状RNA在生物学中的复杂性,这一研究有望带领人们迎接癌症诊疗领域的革命性突破。澳大利亚弗林德斯大学发表在世界顶级癌症期刊之一《自然评论·癌症》上的一项新研究预测,在未来5—10年内,环状RNA在改善癌症治疗和患者预后方面具有巨大潜力。文章表示,对环状RNA的探索现已成为重要的研究

《Nature》:癌基因“地震扩增”,驱动多种癌症!

  染色体外DNA(ecDNA)是一类特殊的从正常基因组上脱落下来的游离于染色体外的环状DNA。早在1964年,人们就在神经母细胞瘤细胞中观察到了ecDNA的存在 ,但由于技术受限,人们对于ecDNA在肿瘤发生发展中发挥的具体作用未能有更进一步认识。  2017年Paul Mischel团队在《自然

科学家发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增

  近日,美国克利夫兰凯斯综合癌症中心等科研机构的科研人员在Cell上发表了题为“Functional Enhancers Shape Extrachromosomal Oncogene Amplifications”的文章,发现功能增强子导致染色体外致癌基因扩增  跨越致癌基因边界的非编码区扩增一

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学界,一时之间,将人们的目光都吸引到这个科研界的新宠

染色质基因分析可识别癌症起源

近日,美国杰克逊实验室(JAX)的研究人员开发出一种新方法,通过对开放染色质进行全基因组分析,来确定导致既定类型白血病的细胞类型。这一方法对白血病的诊疗具有重要作用。相关研究发表在《自然—通讯》杂志上。 每种癌症都始于一个单细胞的异变。知道了癌细胞的起源细胞,研究人员就可以分析出癌症的亚型

患者基因组的3D结构促进膀胱癌和儿童脑部肿瘤发生

  儿童高级别胶质瘤(pHGGs,Pediatric high-grade gliomas)包括多形性胶质细胞瘤(GBM)和扩散型内因性脑桥神经胶质瘤(DIPG,diffuse intrinsic pontine glioma),其均是病态的脑部肿瘤;即使患者经过治疗,其生存率仍然很低,这就使得pH

国自然研究热点—eccDNA的前世今生

  ​1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?   2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生

Science:癌基因之父的豪赌—癌症干细胞

  麻省理工的Robert Weinberg是世界上最著名的癌症生物学家之一。他发现了第一个人类癌基因Ras和第一个抑癌基因Rb,其杰出工作已经成为肿瘤研究领域乃至整个医学生物学领域的重要里程碑。“我在这一行已经四十年了,我们研究的许多东西最终在临床上都没什么用,” Weinberg说。但现在,这位

关于环状混合痔的鉴别诊断介绍

  息肉痔:为直肠下端所生之息肉,质薄嫩,根蒂细,色鲜红。一般单发,偶有一连串二、三十个之多,状如葡萄。大便时可能脱出肛门外,多见于儿童。  锁肛痔:肿物不能脱出于肛外,触诊其质坚硬而凹凸不平。肛门狭窄,大便变细,或大便如痢,次数增多,里急后重,时流臭秽败浆污水。多见于40岁以上的中老年人。  肛裂

研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构

  近日,纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章,发现染色体外环状DNA驱动神

研究人员绘制出首张儿童癌症环状DNA图谱

  随着时间推移,癌症的发生往往与DNA缺陷的逐渐积累有关,因此,癌症通常会被认为是一种年龄相关的疾病,那么为何儿童也会患癌呢?近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告中,来自德国夏洛蒂—洪堡大学和柏林自由大学附属医学中心等机构的科学家们通过研究发现,染色体外环状DNA或会

传说中的抑癌基因竟然促进癌症扩散

  来自浙江大学医学院、中科院脑科学与智能技术卓越创新中心的研究人员证实,背外侧大脑脚盖 (laterodorsal tegmentum, LDT) 中间神经元亚型调控了嗅觉信号诱导的先天性恐惧。这项研究工作发布在1月4日的《自然神经科学》(Nature Neuroscience)杂志上。

转座因子驱动癌基因在人类癌症中广泛表达

  近日,华盛顿大学医学院等科研人员在Nature Genetics上发表了题为“Transposable elements drive widespread expression of oncogenes in human cancers”的文章,发现转座因子驱动癌基因在人类癌症中的广泛表达。  

国自然研究热点——eccDNA的前世今生(一)

1. eccDNA为什么火?它到底是何方神圣?2019年11月,顶尖国际学术期刊《Nature》和《Cell》相继发表了关于染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA,eccDNA)的重要研究,彻底颠覆了人们对癌基因的传统认知,同时也迅速引爆了整个生物医学

简述脉络膜视网膜环状萎缩的诊断

  脉络膜视网膜环状萎缩的诊断标准包括:近视、夜盲、白内障、进行性脉络膜多形态萎缩灶,ERG波幅降低或消失、常染色体隐性遗传、血鸟氨酸浓度超过400μmol/L和OKT活性明显下降。本病可通过检测患者和携带者血浆尿氨酸水平或培养的表皮成纤维细胞中OAT的活性来确立诊断。由于正常人血清中鸟氨酸含量极低

关于环状肉芽肿的诊断治疗介绍

  一、诊断  根据病史、家族史、临床表现及组织病理学检查结果可诊断。  二、治疗  1.原发病的治疗  患者患有结核病、糖尿病史,或昆虫叮咬、外伤、日光暴晒史。要去除原发病,比如针对糖尿病可通过局部或病灶内注射糖皮质激素进行治疗,严重者可使用氨苯砜治疗。  2.其他  包括液氮冷冻术、光能疗法、羟

染色质,解锁癌症表观遗传学的钥匙

  表观遗传学指基因序列不变化的前提下,基因表达发生了可遗传的变化,包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色质改型调控基因表达的过程,涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。  众多研究已经证明,染色体畸变和染色质异

肿瘤细胞中ecDNA新机制在斯坦福大学致癌基因研究应用1

文章导读eccDNA是染色体外的一种特殊的环状DNA,从它的出现至今已长达数年,但在起初的很长一段时间里并未得到人们的重视。随着高通量技术的发展,eccDNA(extrachromosomal circular DNAs,eccDNAs)作为染色体外的环状DNA的研究也进一步深入。在国际学术

Nature-Genetics揭示eccDNA新功能—驱动神经母细胞瘤基因组重..

1. 神经母细胞瘤eccDNA整体统计研究人员联合eccDNA-seq和RNA-seq(云序生物提供此服务)技术,与开创性的生物信息学算法相结合,首次在神经母细胞瘤(一种主要发生在儿童的致命肿瘤)中进行详细的环状DNA序列分析。本研究中分析了93名儿童的神经母细胞瘤组织样本,结果显示,每个组织样本平

《JCB》:P53抑癌基因关闭侵袭性癌症细胞

  报道:Ras是人类癌症基因中最容易突变的基因之一,因此发展以Ras信号转导通路为靶点的抗肿瘤抑制剂具有很好的药学前景。在所有的人类肿瘤细胞中,Ras基因的变异占20%~30%,Ras变异发生率最高的是胰腺癌(90%),其次为结肠癌(50%)和肺癌(30%)。推荐阅读:新晋院士Cell解析致癌基因

《英国癌症杂志》:科学家鉴别出儿童脑癌基因

将有助科学家开发出更有效的、副作用更少的药物 英国科学家近日鉴别出了三个与室鼓膜瘤(ependymoma,儿童脑癌的常见形式)有关的基因。这一研究对室鼓膜瘤遗传学提出了更详细的理解,并将有助科学家开发出更有效的、副作用更少的药物。相关论文发表在《英国癌症杂志》(British Journal of

癌症诊断技术进展

2016年2月24日 讯 /生物谷BIOON/ --长期以来,癌症诊断领域都是全球科学家们研究关注的重点,近些年来随着研究的深入,许多新型的癌症检测技术不断涌现,比如癌症液体活检技术、microRNA检测工具、成像追踪技术等。利用癌症血液检测新技术就可以发现血液样本中存在的肿瘤DNA通。例如,去年6

癌症的伴随诊断

  在临床试验中,利用伴随诊断来指导治疗,可鉴定出最有可能响应特定疗法的患者群体,从而改善治疗反应。这些检测不仅能指示分子靶点的存在,还能提示治疗的脱靶效应,预测与药物相关的毒性和副作用。  伴随诊断(Companion diagnostics,CDx)是指体外诊断的设备或成像工具,能够为相

染色体“绝缘区域”的改变或将激活致癌基因的表达

  近日,刊登在Science上的一项研究报告中,来自怀特黑德研究所的研究人员通过研究发现,名为“绝缘领域”(insulated neighborhoods)的环状染色体结构可以激活癌基因表达促进恶性肿瘤的生长。  研究者Richard Young表示,对癌基因错误调节的染色体结构角色的理解或可帮助