为什么蛋白质保守丝氨酸位点是其磷酸化位点
磷酸化位点一般有丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸。其中,丝氨酸和苏氨酸是最常见的磷酸化位点,因为其结构末端含有羟基,羟基很活泼,可以与磷酸基团结合。磷酸化的过程就是传递磷酸基团。所以说,蛋白质中如果某个丝氨酸很保守的话,很大程度上就是磷酸化位点。......阅读全文
进入位点
中文名称进入位点英文名称entry site定 义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
方案7-用-ESIMS-确定丝氨酸、苏氨酸的磷酸化位点实验
实验材料丙烯酰胺凝胶条中放射性标记的目标磷酸化蛋白试剂、试剂盒乙腈烷化剂甲酸β-巯基乙醇nano-RP-HPLC 缓冲液蛋白酶溶液还原剂三氟乙酸仪器、耗材超声仪HPLC 泵HPLC 系统质谱仪、带有纳喷离子源的ESI-MSnano-HPLC 柱预柱预柱分流器SEQUEST 软件试管实验步骤一、磷酸化
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——IMAC-分离/富集磷酸肽
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤磷酸肽分析的常见困难是由磷酸化的低化学计量值导致的,样品中相同序列肽段的磷酸肽的含量要比非磷酸化肽段含量少得多,这种情况下即使 32p标记的 2D-PP 上的点,经全蛋白质水解及 HPLC 组分收集,已经确定磷酸肽存在,用质谱技术也难以鉴定磷酸肽。数据依赖的
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——RPHPLC-分离磷酸肽
实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤反相 HPLC 分段收集磷酸肽重现性好,简单,且不需要特殊装备。在 RP-HPLC 中,磷酸肽根据其疏水性被分离。分离后收集的组分经 Cerenkov计数检测。对 Cerenkov计数和时间作图,显示具放射性活性的组分的计数。纯化的磷酸肽用 MS 分析;可用不
nut-位点的定义
中文名称nut 位点英文名称nut site定 义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
什么是活性位点
者一般用在大分子化学中,活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少,发生有效碰撞的机率就少,也就是说反应比较单一,容易被控制
Cell子刊揭秘代谢转移反套路——三个磷酸化位点一台戏
【科研反套路】 一、研究背景 1. AMPK:全称为Adenosine 5’monophosphate-activated protein kinase,意为AMP依赖蛋白激酶,参与糖脂、蛋白质代谢,调控能量稳态。应激、饥饿、毒性作用等可以激活AMPK,促进分解代谢,减少合成代谢,从而增加
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的-DIA-解析1
引言 数据非依赖采集(Data-Independent Acquisition, DIA)是当前最热门的质谱采集技术之一,它以非目标的方式将质量范围分为若干窗口,依次并循环采集窗口内所有母离子的二级碎片[1,2]。DIA 与 SRM 类似,也是基于子离子(transition)定量,相比
磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——2DPP-分离磷酸肽
实验方法原理即使纳喷 MS/MS 技术已经成功用于直接分析蛋白酶解产生的磷酸肽但是出于以下一些原因,通常建议在质谱分析前作一些分离:(1) 磷酸肽在蛋白酶切产物中通常只占少数因此容易淹没在低率度离子产生的总背景中,肽分离技术可浓缩分析物,因此会提高信噪比。(2) 如果磷酸肽被放射性标记并具有相同比活
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的-DIA-解析3
结果显示,从 DIA 数据中提取、定量到 6401 条可信的磷酸化肽,占谱图库磷酸化肽总数(6505 条)的 98.4%(图 5)。磷酸化肽的丰度和离子化效率普遍较低,本实验如此高的解析成功率表明,基于 Orbitrap 的 DIA 数据具有极高的谱图质量和出色的灵敏度。 图5. DIA可
精确修饰位点谱图库的建立与磷酸化蛋白质组的-DIA-解析2
2. 磷酸化样本的 DDA 鉴定、可信度筛选和谱图库建立磷酸化样本信息和色谱质谱参数见实验条件部分。3 针 DDA 数据按磷酸化检索流程使用 Proteome Discoverer 2.0 软件搜库鉴定(S/T/Y+79.966 Da),并使用 ptmRS 模块对位点打分(图 2-1)。搜库完成
细胞化学词汇nut-位点
中文名称:nut 位点英文名称:nut site定 义:噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
无嘧啶位点的概念
中文名称无嘧啶位点英文名称apyrimidinic site定 义核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
阴离子位点显示实验
实验方法原理 实验材料 组织样品试剂、试剂盒 磷酸缓冲液阳离子化铁蛋白液体戊二醛锇酸实验步骤 1. 0.1 mol/L磷酸缓冲液配制阳离子化铁蛋白,浓度为0.2~0.5 mg/ml。2. 组织样品悬浮于阳离子化铁蛋白液体中,室温下反应30 min。3. 0.1 mol/L磷酸缓冲液充分漂洗。4. 3
加帽位点的概念
中文名称加帽位点英文名称cap site定 义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
无嘌呤位点的定义
中文名称无嘌呤位点英文名称apurinic site定 义核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
序列标签位点的定义
序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。
什么是序列标签位点?
序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。
无碱基位点的定义
中文名称无碱基位点英文名称abasic site定 义核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后,产生一个醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
序列标签位点的简介
任何DNA序列,只要知道它在基因组中的位置,都能被用作STS标签。作为基因组中的单拷贝序列,是新一代的遗传标记系统,其数目多,覆盖密度较大,达到平均每1kb一个STS或更密集。这种序列在染色体上只出现一次,其位置和碱基顺序都是已知的。在PCR反应中可以检测出STS来,STS适宜于作为人类基因组的一种
SNP位点的选择原则
1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上
核糖体结合位点
核糖体结合位点(ribosomebinding site,简称RBS),是指mRNA的起始AUG上游约8~13核苷酸处,存在一段由4~9个核苷酸组成的共有序列-AGGAGG-,可被16SrRNA通过碱基互补精确识别的序列。
降水监测降水采样点监测点位环境要求
①采样点应位于开阔、平坦的地区,测点周围的下垫面无裸露上壤,以免风沙扬尘的影响。②采样点应避开局地污染排放源,包括排放酸碱物质的烟尘、粉尘和生活排放源、废物堆积场、停车场以及交通T线等。③采样点周应无遮挡雨、雪的障碍物,其中包括房屋、桥梁、高大树木等。障碍物与采样器之间的水平距离不得小于该障碍物高度
位点专一诱变的概念
中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学词汇无嘌呤位点
中文名称:无嘌呤位点英文名称:apurinic site定 义:核酸中脱去嘌呤碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇加帽位点
中文名称:加帽位点英文名称:cap site定 义:mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学词汇进入位点
中文名称:进入位点英文名称:entry site定 义:特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
无嘌呤嘧啶位点的概念
所有细胞中都带有不同细胞类型,能识别受损核酸位点的糖苷水解酶,它能特异性切除受损核苷酸上的N-β糖苷键,在DNA链上形成去嘌呤或去嘧啶位点,统称为AP位点。
大脑RNA编辑位点“辞典”发布
美国西奈山伊坎医学院研究人员对大脑中的数千个位点进行了编目,在这些位点中,RNA在整个人类生命周期中被修饰,这个过程被称为腺苷到肌苷(A-to-I)编辑,其为理解大脑发育的细胞和分子机制以及它们如何影响健康和疾病提供了重要的新途径。在《细胞报告》上发表的论文中,研究团队描述了大脑中RNA编辑的速率如
位点专一诱变的定义
中文名称位点专一诱变英文名称site-specific mutagenesis;site-directed mutagenesis定 义使DNA分子中某一特定的核苷酸序列发生改变。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)