Nature公布小麦基因组

利物浦大学、加州大学戴维斯分校等9所研究机构合作对小麦基因组进行了测序,他们的研究将于十一月二十九日在Nature杂志上发表,有望帮助人们增加小麦产量,培育更适应环境变化的品种。 到2050年,世界人口预计会从七十亿增加到九十亿,在可用耕地越来越少的情况下,要满足全球对粮食持续增长的需求,就要培育出高产量的主要农作物。“小麦、水稻和玉米是世界粮食供应的三大支柱,”文章的共同作者,加州大学戴维斯分校植物科学教授Jan Dvorak说。 普通小麦来源于三个祖先,其基因组是三个基因组的复合体,特别复杂,普通小麦的基因组大小是人类基因组的五倍。“小麦的基因组很庞大也很复杂,可能是迄今为止测序了的最复杂的基因组”利物浦大学Neil Hall教授说,庆幸的是科学家们现在使用的测序技术比当年人类基因组测序快上百倍。 研究人员采用全基因组“鸟枪测序”,生成了数十亿基因组随机片段,并将它们组装起来,总共测序了超过90......阅读全文

深度学习在基因表达谱分析上取得重要进展

  近日,一项刊登在国际杂志Bioinformatics上的研究论文中,来自加州大学尔湾分校和博德研究所的研究人员通过深度学习算法进行大规模基因表达预测,并在预测精度上获得了显着提升。  全基因组表达谱分析被广泛应用于描述细胞在不同生理病理条件下的活动状态,例如不同的癌组织细胞在各种给药条件下会产生

Nature-Genetics:多种技术解析草莓基因组

  近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。  一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道,可搭配出各种各样的美妙滋味。不过,对于草莓的基因组,你又了解多少?  世界各地广泛种植的凤梨草

遗传学大牛Nature-Methods发表新成果-用CRISPR打造DNA条码

  生物通报道:细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争,为此它们演化出了多种防御机制,CRISPR–Cas9适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合,可以在引导RNA的指引下,靶标并切割入侵者的遗传物质。2012年研究者们利用这一特点,将CRISPR系统制成

小麦野生远祖基因组测序完成

  11月15日出版的《自然》杂志刊登了一篇研究论文称,美国加州大学戴维斯分校科学家领导的国际团队,成功为小麦的一种野生远祖——节节麦(Aegilops tauschii)进行了基因组测序,向破解小麦基因组难题迈进了一步。  作为全球主要粮食作物,小麦为人类提供了超过20%碳水化合物和23%蛋白质等

加州大学研究显示:微生物占据人类身体过半区域

  据英国广播公司(BBC)报道,科学家表示,微生物占据人类身体的过半区域,人体细胞仅占全身细胞总数的43%。图片来源于网络  基于对人类身体中鲜为人知的部分,即微生物群的了解,人们对过敏和帕金森病的认识也有迅速的转变。同时,该研究领域甚至提出了“人类”意味着什么的问题,以及由此可能产生的创新疗法。

上海交大,加州大学联合发表Nature新论文

   上海交通大学海洋学院教师曹玲在国际顶级期刊《Nature》上,以共同通讯作者和共同指导作者的身份发表了题为《The Future of Food from the Sea》的长研究论文(Article)。该论文是与美国加州大学圣塔巴巴拉分校的教授Christopher Costello和智利天

加州大学伯克利分校教授孙崧加盟浙大“梦之队”

  据“浙江大学”微信公众号1月2日消息,加利福尼亚大学伯克利分校数学系正教授孙崧加盟浙江大学数学高等研究院任杜建英讲席教授,成为该院第五位永久成员。         孙崧  2002年进入中科大少年班,2006年赴美国留学进入威斯康辛大学麦迪逊分校,2010年获得博士学位,回国前为加利福尼亚大学伯

加州大学采取新型合成代谢途径增加生物燃料产量

  近日,美国加州大学洛杉矶分校化学工程系的研究人员开创了一种新的合成代谢途径分解葡萄糖,可以使生物燃料产量增加50%。这种新途径可以取代糖酵解途径。糖酵解可以将葡萄糖6个碳原子中的4个转化为2碳分子乙酰辅酶A,它是生产乙醇、丁醇、脂肪酸、氨基酸和很多药品的前体。但是,剩下的2个葡萄糖碳原子会因为生

加州大学洛杉矶分校研发首个太赫兹VCSEL激光器

在美国国家科学基金会(NSF)的资助下,加州大学洛杉矶分校(UCLA)亨利塞缪尔工程和应用科学学院研究人员已经发现了一种制备太赫兹频率半导体激光器的新方法。该课题组的论文《超材料腔表面激光器》已于近日发表在2015年最后一期《应用物理快报》期刊上(Luyao Xu et al, ’Metasurfa

安捷伦向加州大学戴维斯分校授予安捷伦思想领袖奖

  该校研究人员因在多肽类药物研发领域的开创性分析方法而获誉   2025年11月13日,北京——安捷伦科技公司日前宣布为加州大学戴维斯分校的Marie Heffern教授颁发“安捷伦思想领袖奖”,奖项由加州大学代为受领。该奖旨在表彰Heffern教授在靶向肠促胰岛素及相关通路的多肽及蛋白质治疗药物

清华大学颜宁与加州大学合作发表PNAS文章

  近期,来自加州大学洛杉矶分校、清华大学生科院与日本、比利时等处的研究人员,发表了题为“Crystal structure of a LacY–nanobody complex in a periplasmic-open conformation”的文章,报道了在无糖状态下一个LacY ww –N

加州大学洛杉矶分校开发“干细胞生肌术”战胜Duchenne

  加州大学洛杉矶分校(UCLA)的科学家开发了一种有效分离、成熟和移植人类多能干细胞生成骨骼肌细胞的新策略。这项研究为杜氏肌营养不良(Duchenne Muscular Dystrophy)等肌肉疾病的干细胞替代疗法提供了重要依据。  杜氏肌营养不良是最常见的致死性儿童遗传病,由于缺乏抗肌萎缩蛋白

造血干细胞纠正自身免疫综合征基因突变

  由DonaldKohn博士领导的加州大学洛杉矶分校研究人员已经发明了一种方法,通过改变造血干细胞来修复一种致命的自身免疫综合征的基因突变,这种综合征被称为IPEX。在小鼠身上测试的这种基因疗法类似于Kohn之前用于治疗另一种免疫疾病(严重联合免疫缺陷,简称SCID,也称为泡状婴儿病)患者的技术。

Science发布蛋白质组研究重大成果

  学家们在新研究中揭示了人类巨细胞病毒(HCMV)令人惊讶的、复杂蛋白质编码能力,该发现是朝着了解感染过程中这一病毒操控人类细胞的机制所迈出的重要的第一步。20多年前研究人员首次对HCMV基因组进行了测序,现在他们又对这一常见病原体的蛋白质组(proteome,整套的表达蛋白)进行了研究。   

Cell:绘制转移性癌症的互作网络图谱

   这一发表在8月4日《细胞》(Cell)杂志上的研究,是加州大学圣克鲁斯分校和加州大学洛杉矶分校研究小组的合作成果。他们一开始从致命转移前列腺癌患者尸体中获得的临床组织样本入手,随后完成了一系列复杂的分析以前所未有的细节确定了来自每位患者的癌细胞特征。对生成的数据集进行一种新颖的计算分析,绘制出

规模研究揭示印度人群50000年遗传史

  印度是世界上基因多样性最丰富的地区之一,然而在国际基因数据库中印度人却长期被忽视。研究人员分析了超过2700名印度各地民众的基因组数据,涵盖了大部分地理区域、语言群体和社区,揭示了现代印度人的基因可追溯至新石器时代的伊朗农民、欧亚大草原游牧民及南亚狩猎采集者。相关研究近日发表于《细胞》。  “这

美国研究人员揭示特种酶复制DNA新细节

  美国研究人员3月11日在《科学进展》杂志发表论文,揭示了Taq酶的新细节,这种酶由于其在聚合酶链式反应(PCR)中的应用而闻名。这项工作可用来开发改进版本的Taq酶,在复制DNA时花费更少的时间。这一发现是进入个性化医疗时代的一大飞跃,届时医生将能够根据患者个体的基因组设计治疗方案。  加州大学

美国研究团队发现两个变异基因与癌症复发相关

  一个美国研究团队在新一期《自然医学》上发表论文说,他们发现了两种变异基因,通过它们可预测因放射治疗儿童霍奇金淋巴瘤引发的复发性癌症。  美国芝加哥大学、南加州大学等机构的研究人员分析了178名儿童霍奇金淋巴瘤治愈患者的基因组,这些患者儿童时期患该病,并曾长期接受放疗和化疗。在治疗

Cell:转移性前列腺癌的磷酸化蛋白质组学研究

  癌症基因组学有望通过揭示驱动个体患者肿瘤细胞的遗传突变来实现个体化癌症治疗。但解读这一基因组数据仍然是个挑战。一些突变和其他遗传改变对癌细胞的影响,呈现在与细胞生长、增殖和其他癌症生物学标志相关的复杂分子互作(信号通路)网络中。通过绘制在前列腺癌细胞中活化的一些关键信号通路,研究人员能够确定可以

Nature-Methods:De-Novo基因组序列组装的新方法

  对于de novo人类基因组序列组装而言,短读长简直意味着不可能的任务。不过,加州大学旧金山分校、BioNano Genomics和10X Genomics的研究人员近日开发出一种新的组装方法,它将short-read测序与10X的linked-read测序相结合。这项成果于近日发表在《Natu

《Science》改良版CRISPR无需基因编辑,就可治疗多种疾病

  一项重要的新研究表明,CRISPR疗法可以在不切割DNA的前提下减少脂肪。 来自加州大学旧金山分校的研究人员利用改良版的CRISPR提高了某些基因的活性,可以帮助易肥胖体质的小鼠预防严重肥胖。更重要的是,研究人员还实现了长期的体重控制,并且无需进行基因组编辑。  这一研究成果公布在12月13日的

《Science》改良版CRISPR无需基因编辑,就可治疗多种疾病

  一项重要的新研究表明,CRISPR疗法可以在不切割DNA的前提下减少脂肪。  来自加州大学旧金山分校的研究人员利用改良版的CRISPR提高了某些基因的活性,可以帮助易肥胖体质的小鼠预防严重肥胖。更重要的是,研究人员还实现了长期的体重控制,并且无需进行基因组编辑。  这一研究成果公布在12月13日

三维染色质结构与基因组功能及进化的关系获揭示

  辣椒是世界上种植最广泛的蔬菜之一,也是重要的调味料作物。近日,华南农业大学园艺学院辣椒课题组研究揭示了辣椒三维染色质结构与基因组功能及进化的关系。相关研究发表于Nature Communications。  我国辣椒生产和消费量居全球之首,种植面积超过3000万亩,产量4000多万吨,年逾700

GEN:大数据挖掘对癌症治疗的四大影响

  2016年1月在瑞士达沃斯召开的世界经济论坛上的一个panel讨论中,美国副总统Joe Biden当场要求临床医生和研究者举例表示人类在抗击癌症中突破的障碍。当几个重要话题浮现时,最重要的议题是“大数据”,具体而言,即“大数据”的收集、分析和应用。  研究者表示:“大数据”是有效的,这是因为有重

PNAS:挖掘神秘基因簇的药用价值

  加州大学的科学家们开发了新型基因操作平台,直接克隆、重构和异源表达了一个沉默的生物合成通路,获得了新型抗生素taromycin A。这一技术发表在本周的美国国家科学院院刊PNAS杂志上,为开发天然药用化合物开辟了新的途径。   领导这项研究的Bradley S. Moore博士指出,这

科学家开发新的宏基因组分析工具

  对环境样品(如海水、医院表面和人类肠道)直接进行微生物测序,已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而,一个微生物物种可能存在遗传多样性,而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中,科学家们开发了一种新的工具,来检测细菌物种内的遗传差异,并

张锋可能因为输掉了这2个CRISPRZL权,损失近20亿人民币

  对于CRISPRZL,一直是加州大学及Broad研究所争论不休的症结,就是因为这个ZL,可能涉及到全球达数百亿美元的商业价值,如果谁能获胜,势必会对整个领域占尽优势。就在近期,加州大学获得了两项至关重要的ZL权,尤其是使用优化的指导RNA将CRISPR-Cas9核酸酶导向真核细胞中的靶DNAZL

NatureGenetics:最大规模精神分裂症全基因组扫描

――超过41,000位患者的全基因组扫描,揭示了携带精神疾病极大风险的“拷贝数变异”目前发现的许多增加精神分裂症患病风险的遗传变异都是罕见突变,因此很难分析其在疾病中的作用。为了解决这一问题,加州大学圣地亚哥分校的医学院Jonathan Sebat博士研究组完成了目前为止最大的全基因组研究,分析了超

-人类基因组的军备竞赛-不断自我进化

  北京时间9月30日消息,科学日报报道,近日美国加州大学圣克鲁斯分校的科学家们进行的最新发现表明,灵长类动物的基因组内竞争元素的进化军备竞赛驱动了复杂调控网络的进化,这一网络协调了人类内每个细胞的基因活动。  人类基因组的军备竞赛  这场军备竞赛是在名为逆转录转座子(retrotransposon

宏基因组测序揭示神秘的生命领域

  美国国家能源部Lawrence Berkeley实验室和加州大学伯克利分校的研究人员采用科罗拉多蓄水层的沉积物和地下水样本,通过宏基因组测序重建了二千五百多个微生物的基因组。这项研究发表在十月二十四日的Nature Communications杂志上,为人们揭示了地下世界惊人的生物学多样性,给生