天河新一代超级计算机在新冠药物筛选领域又立奇功
11月4日,美国计算机协会(ACM)公布,由中山大学药学院、海南大学药学院、国防科技大学计算学院、国家超级计算天津中心、中国海洋大学医药学院、美国肯塔基大学药学院等单位组成的联合团队,在天河新一代超级计算机上完成的“基于自由能微扰-绝对结合自由能方法(FEP)的大规模新冠药物虚拟筛选”工作成功入围2021年度的戈登贝尔新冠特别奖,这是我国首次入围该奖项。中山大学药学院罗海彬教授、肯塔基大学湛昌国教授、中国海洋大学王鑫教授为该论文的并列通讯作者;中山大学药学院李哲副教授、国防科技大学吴诚堃副研究员、李翊谁博士生、中山大学药学院刘润铎研究生为该论文共同第一作者。 该成果由中国科学院上海药物所陈凯先院士、北京航空航天大学钱德沛教授和荷兰阿姆斯特丹大学Hans Westerhoff教授提名推荐。研究通过利用天河新一代超级计算机的超大规模算力,使用国际领先的药物-靶标结合精准评价计算方法,实现了新冠应急药物(有效降低致死率和重症率......阅读全文
新冠药物,引发药物研发新变革
在新冠药物研发中,我国新药研发力量得到加强,实力渐显。五十余个新冠药物获批进入临床试验阶段,抗疫“三方”中药新药获批上市,我国首款抗新冠病毒药物获批上市……经过两年多的攻坚研发,中国原创新冠药物正在或即将参与到终结新冠大流行的战斗中。 国家药品监督管理局的最新统计数据显示:截至2022年2月底,
全面剖析人工智能寻找新冠病毒治疗靶点及药物筛选
SARS-CoV-2来势汹汹,目前没有特效药特异性的靶向SARS-CoV-2并将其“杀死”,治疗通常通过维持患者机体的稳态平衡,然后靠患者自身的免疫系统来杀灭新型冠状病毒。基于蛋白质结构的计算机虚拟筛选能够在极短时间内从化合物数据库中发现与抗病毒靶点之间可能存在相互作用的小分子化合物,能够为新药
新冠疫苗和药物
新冠疫苗和药物 中和抗体疗法在治疗和预防新冠肺炎方面取得突破 当地时间 1 月 26 号,礼来(Eli Lilly and Company)公司和再生元(Regeneron)公司分别宣布,各自的抗体组合疗法分别在防止新冠肺炎患者死亡和预防出现有症状感染方面达到 100% 的效力。 礼来公司
人肺类器官在COVID19新冠药物筛选中的运用(一)
2020年5月5日,由美国康奈尔医院的Yuling Han团队在生物学预印本bioRxiv中发表的题为《Identification of Candidate COVID-19 Therapeutics using hPSC-derived Lung Organoids》的文章,全球首次报道了用肺类
人肺类器官在COVID19新冠药物筛选中的运用(二)
研究人员将SARS-CoV-2伪病毒注射入移植体,24小时后检测到SP-B+AT2细胞荧光素酶(LUC)的表达显著高于对照组(图1j)。LPs诱导形成的肺异种移植体对SARS-CoV-2病毒感染同样敏感。 图1j SARS-CoV-2伪病毒感染肺异种移植体
天河新一代超级计算机在新冠药物筛选领域又立奇功
11月4日,美国计算机协会(ACM)公布,由中山大学药学院、海南大学药学院、国防科技大学计算学院、国家超级计算天津中心、中国海洋大学医药学院、美国肯塔基大学药学院等单位组成的联合团队,在天河新一代超级计算机上完成的“基于自由能微扰-绝对结合自由能方法(FEP)的大规模新冠药物虚拟筛选”工作成功入
药物动力学模拟新算法,将减少新冠药物开发时间
英国《自然》杂志近日在线发表一篇重磅研究。在美国华盛顿大学蛋白质设计研究所所长、2021年生命科学突破奖获得者戴维·贝克的带领下,研究人员创造了一种生产蛋白质药物的强大新方法。利用计算机,他们设计了可以针对体内重要蛋白质(如胰岛素受体,以及病毒的表面蛋白)的小分子结合蛋白。这一进展或有助于开发应对诸
科学家发表抗衰老药物筛选新框架
近日,电子科技大学医学院衰老中心副研究员鲜波课题组联合四川省人民医院神经内科以及北京市疾控中心的研究团队,聚焦于抗衰老药物的表型药物发现工作,构建了一个新的机器学习框架,为解决抗衰老药物开发中的复杂科学问题提供了全新的视角与解决方案。相关成果发表于《细胞衰老》上。尽管目前已鉴定出多个与寿命调控密切相
利用“数据+知识+AI”实现新靶标药物虚拟筛选
6月6日,中国科学院上海药物研究所郑明月课题组在《自然-机器智能》(Nature Machine Intelligence)上发表了题为Generic protein–ligand interaction scoring by integrating physical prior knowled
新抗新冠病毒药物潜在作用靶点—新冠病毒包膜蛋白
新冠病毒已经感染超过1.5亿人次,并导致300多万人死亡,然而迄今尚无用于新冠肺炎的特效药物。新靶点的发现和确证对于抗新冠病毒药物研发具有重要意义。 2021年6月10日,中科院上海药物所高召兵、李佳、沈敬山,以及武汉病毒所张磊砢、昆明动物所郑永唐联合研究团队在Cell Research 发表
国内还有哪些新冠治疗药物在研
国内新冠肺炎药物主要围绕抑制病毒复制、阻断病毒进入细胞、调节人体免疫系统3条技术路线,包括BRII-196和BRII-198中和抗体联合疗法、阿兹夫定、普克鲁胺、单克隆抗体BDB-001注射液、中和抗体JS016、中和抗体DXP604等重点药物。其中多款治疗药物有望在12月有新进展。中科院微生物所和
“兵分多路”搜寻抗击新冠病毒的药物
新冠肺炎疫情仍在持续,全球众多科研机构正全力以赴,寻找抗击病毒的有效药物。这场搜寻“兵分多路”,现有药物加紧筛选,特效药研发夜以继日,中医药对抗病毒的独特效果也受到关注。 “老药新用”可救急 作为一种新型病毒,科学界对新冠病毒了解仍十分有限,这在很大程度上限制了有针对性特效药的研发。筛选广谱
药物筛选的定义
广义:是针对特定的要求和目的,通过适当的方法和技术,主要的技术有基因组学、蛋白质组学、代谢组学、计算生物学、生物芯片技术、微流控芯片技术等方法,在一定的可选择范围内,进行药物优选的过程。因此,药物筛选包括新药研究过程中的处方筛选,根据特定目的选择符合要求的药物。狭义:筛选专指采用实验技术进行。
数据+知识+AI,科学家解锁新靶标药物虚拟筛选
6月6日,中国科学院上海药物研究所研究员郑明月课题组构建了一种通用蛋白质-配体相互作用评分方法EquiScore,在药物虚拟筛选场景和先导化合物优化场景中,EquiScore对训练未见的新靶标表现出了良好的泛化性能,其可解释性分析为基于结构的药物设计提供了有价值的线索。相关研究发表于《自然—机器智能
40款药物围剿新冠,谁才能终结疫情?
转眼间,新冠肺炎疫情已经发生近三年了。在这三年里,乔拜登取代了特朗普成为了总统,英国走完了脱欧的最后一程,“铁娘子”默克尔时代划下句点,东京奥运会在荒诞中落幕,北京冬奥会展示了雪上豪情,全球经济开始放缓……疫情时代,每个细微的动向似乎都可以变成新闻焦点。在新的历史条件下,新冠特效药和疫苗的相关研究
日本药物Avigan成为新冠肺炎“特效药”?
近期,在社交媒体上有消息称,日本就治疗新冠肺炎而新研制出了“特效药”Avigan。为此中新社记者采访了相关药企并综合该药在日本当前的使用情况,对该药进行解密。图片来源于网络 试验不能称为“特效药” 实际上,Avigan(通用名:法匹拉韦)对于新冠肺炎的效果正在研究,目前绝不能称为“特效药”,
药物高通量筛选技术
药物高通量筛选技术简单介绍一下关于药物高通量筛选技术的知识。一.概念高通量筛选(High throughputscreening,HTS)技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础,以微板形式作为实验工具载体,以自动化操作系统执行试验过程,以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据,以计算机对实验数
新冠药物:中和抗体DXP604取得重要进展
新冠肺炎疫情暴发后,我国立即布局药物研发任务,北京大学生物医学前沿中心谢晓亮团队利用单细胞测序技术取得了中和抗体研究的重要进展,研发的药物已经用于临床救治。利用单细胞测序技术,研发人员从恢复期患者血浆中筛选到对新冠病毒中和活性较好的抗体DXP604,很大程度上避免了病毒逃逸。北京大学谢晓亮团队介
应急批准-默沙东新冠药物Molnupiravir胶囊获得药监局批准
12月29日,国家药监局根据《药品管理法》相关规定,按照药品特别审批程序,进行应急审评审批,附条件批准默沙东公司新冠病毒治疗药物莫诺拉韦胶囊(商品名称:利卓瑞/LAGEVRIO)进口注册。 本品为口服小分子新冠病毒治疗药物,用于治疗成人伴有进展为重症高风险因素的轻至中度新型冠状病毒感染(COV
新冠疫情给癌症药物研发按下“暂停键”
由于医院将更多资源用于照顾新冠肺炎重症患者,临床研究已经中断。图片来源:Alberto Pizzoli/AFP/Getty 科学家们正急于启动针对冠状病毒的实验性疫苗和COVID-19治疗的临床试验。但是,由于医院面临COVID-19危重病人的冲击,全世界的实验室都被打乱,研究人员不得不搁置其他疾
日本:抗流感药物或可用于治疗新冠肺炎
日本厚生劳动大臣加藤胜信22日说,日本正在探讨使用抗流感药物Avigan治疗新型冠状病毒肺炎。 他当天做客一档电视节目时谈及Avigan,说目前日本没有应对新冠病毒感染病例的现成治疗方案。“我们将竭尽全力。国外传来的消息是一些用于治疗流感的药物或许有效。” 加藤说,厚生劳动省将检验数种抗流感
新冠药物研发应急项目2022年度指南
新型冠状病毒药物研发应急项目2022年度申报指南 按照国家重点研发计划“公共安全风险防控与应急技术装备”重点专项组织管理的相关要求发布,遴选项目择优支持。其中项目不下设课题、对项目负责人无限项要求。网上填报时间:2022 年 5 月 19 日 08:00 至 2022 年 6 月 6 日 16:0
中国国产新冠治疗药物不断取得新进展
国务院联防联控机制科研攻关组,中国积极推进新冠治疗药物研发,除了已获批的中和抗体、化学药物和中药外,还有多个药物在临床试验中显示出疗效,科技创新有效助力了疫情防控工作。 2021年12月,国家药监局应急批准了新冠病毒中和抗体联合治疗药物安巴韦单抗注射液(BRII-196)及罗米司韦单抗注射液(BR
BioCon-2021聚焦新冠热点:核酸疫苗与药物研发
分析测试百科网讯 2021年4月22-23日,BioCon 2021第八届国际生物药大会暨生物技术仪器设备与试剂展览会在上海宝华万豪酒店盛大开幕。在以“核酸疫苗与药物研发”为主题的分论坛上,生物医药产业大咖纷纷带来前沿的核酸疫苗研发进展,探讨了新冠疫苗的开发工艺和研发流程及现状,吸引了大批现场参
Cell:谢晓亮团队领衔筛选出中和抗体-或成为新冠强效药
《细胞》杂志5月17日刊发北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)主任谢晓亮团队领衔多家合作单位的成果。他们利用高通量单细胞测序技术,从新冠肺炎康复期患者血浆中成功筛选出多个高活性中和抗体。中和抗体由人体免疫系统产生,可以有效阻止病毒感染细胞。 目前,动物实验已证明该团队的中和抗体有
血清学筛选克隆新抗原/新基因——血清学筛选法
通过以血清的各种反应为中心的机体免疫反应和变态反应的研究体系来筛选新抗原和新基因。实验材料大肠杆菌试剂、试剂盒TBST 裂解液 血清 NZY top IPTG 一抗 二抗 SM 封闭液 MgSO4 LB AP BCIP-NBT 显色液仪器、耗材硝酸纤维素膜 滤纸 冰箱 培养箱 水浴锅 平板 脱色摇床
多个国产新冠药物进入临床试验-有望成抗疫“新利器”
记者日前从国务院联防联控机制科研攻关组获悉,我国已有自主研发的新冠药物完成Ⅲ期临床试验,正申请附条件上市。另有多个药物在国内外开展Ⅲ期临床试验,当前显示出积极疗效。 从恢复期患者血液分离得到的几百个抗体中,筛选出2株活性高、互补性强的抗体——清华大学、深圳市第三人民医院和腾盛博药团队研发的新冠
哪些筛选途径可以发现药物
一般是由天然药化或药物化学专业提取或合成的一系列化合物,送药理进行活性筛选,药理活性筛选一般由体外细胞实验开始,进行活性的初步筛选,一般过程是培养细胞-造成病理模型-给予化合物-检测指标。初步筛选的方法一般有MTT法,生化试剂盒。如果初步筛选有疗效,可以再进行一些其他的生化实验加以确证,如weste
高通量药物筛选的简介
1. 化合物样品库化合物样品主要有人工合成和从天然产物中分离纯化两个来源。其中,人工合成又可常规化学合成和组合化学合成两种方法。2.自动化的操作系统自动化操作系统利用计算机通过操作软件控制整个实验过程。操作软件采用实物图像代表实验用具,简洁明了的图示代表机器的动作。自动化操作系统的工作能力取决于系统
生物芯片用于药物筛选
利用基因芯片分析用药前后机体的不同组织、器官基因表达的差异。如果再cDNA表达文库得到的肽库制作肽芯片,则可以从众多的药物成分中筛选到起作用的部分物质。还有,利用RNA、单链DNA有很大的柔性,能形成复杂的空间结构,更有利与靶分子相结合,可将核酸库中的RNA或单链DNA固定在芯片上,然后与靶蛋白孵育