中科院、复旦大学联合发文，推出糖基化解析工具pGlyco3
蛋白质位点特异性糖基化的精准解析对于研究蛋白质糖基化功能、发现疾病潜在标志物及药物靶标十分重要。大规模、高准确性完整糖肽解析一直是蛋白质后修饰分析领域极具挑战性的工作。近年来，完整糖肽解析在生物质谱分析及计算糖蛋白质组领域都取得了重要进展；然而，目前解析方法仍有明显的局限性：大部分工具无法对糖链鉴定进行质控，尤其是复杂的糖型；检索速度慢；无法对多个糖基化位点精准定位；无法鉴定含有修饰糖单元的完整糖肽等问题。 近日，北京中科院计算所曾文锋博士和上海复旦大学副研究员曹纬倩博士在Nature Methods期刊上在线发表了题为“Precise, Fast and Comprehensive Analysis of Intact Glycopeptides and Modified Saccharide Units with pGlyco3”的研究论文。文章介绍了一种可用于完整糖肽及修饰糖精准、快速解析的工具pGlyco3。该工具......阅读全文
中科院、复旦大学联合发文，推出糖基化解析工具pGlyco3
蛋白质位点特异性糖基化的精准解析对于研究蛋白质糖基化功能、发现疾病潜在标志物及药物靶标十分重要。大规模、高准确性完整糖肽解析一直是蛋白质后修饰分析领域极具挑战性的工作。近年来，完整糖肽解析在生物质谱分析及计算糖蛋白质组领域都取得了重要进展；然而，目前解析方法仍有明显的局限性：大部分工具无法对糖链
中科院Nature发文：甲型肝炎病毒全颗粒晶体结构被解析
来自中国科学院生物物理研究所、牛津大学等单位的科学研究人员经过多年紧密合作于2014年10月19日在Nature杂志上在线发表题为Hepatitis A virus and the origins of picornaviruses的论文，详细阐述了甲型肝炎病毒的独有的结构特性、极强的
厦大生科院联合发文解析miRNA在免疫系统的新作用
来自厦门大学生命科学学院的刘文贤、肖昌春和付国教授课题组在Journal of Experimental Medicine联合发表了题为“A miR-155-Peli1-c-Rel pathway controls the generation and function of T follicu
Promega推出ADCC检测新工具
抗体依赖性细胞介导的细胞毒性作用( ADCC )是抗体作用的一种机制， 病毒感染的细胞或其他病变细胞通过该机制被识别进而被细胞介导的免疫系统组分杀伤。Promega公司推出的ADCC Reporter Bioassay (ADCC 报告基因生物活性检测试剂盒 ) 应用生物发光法，通过测量
纳米孔测序“僵尸数据”困境破局！复旦大学联合新华医院推出LongBow算法
纳米孔测序技术凭借其长读长、可直接检测碱基修饰以及实时测序等优势，正在深刻改变生命科学与医学研究的格局。然而，在目前公开的超70万组数据中，约85%因缺乏关键元数据——特别是测序芯片类型与碱基识别配置信息——而成为难以有效利用的"僵尸数据"。近日，上海交通大学医学院附属新华医院与复旦大学合作开发的L
解析糖基化修饰及位点分析
经常听到糖基化修饰，今天带大家一探究竟。什么是糖基化修饰呢？糖基化是在糖基转移酶的控制下，蛋白质或脂质附加上糖类的过程，发生于内质网和高尔基体。糖基化修饰是一类非常重要的翻译后修饰，大部分膜蛋白和分泌蛋白均为糖蛋白，糖基化修饰不仅影响蛋白质的空间构象、活性、运输和定位，同时在信号转导、分子识别，
复旦杨芃原组等开发精准糖蛋白质组新分析方法
BioArt按：糖基化是最复杂的蛋白后修饰之一，具有多种重要的生物学功能。与其他蛋白后修饰相比，糖基化更为复杂，分析难度很大。目前已有的糖基化分析方法有明显的局限性：大部分方法仅能分析糖链或糖基化位点等不完整的糖基化信息，而基于糖肽的位点特异性分析方法则存在通量低，假阳性率高，数据质量难以评测等
Sigma推出qPCR引物设计工具
Sigma-Aldrich公司的生命科学部门近日宣布推出增强版的OligoArchitect™，这一免费的在线工具可自动设计实时定量PCR分析的引物和探针。由行业标准的Beacon Designer™平台所支持，OligoArchitect成为一种可靠、方便的工具，与Sigma qPCR产品
复旦大学《细胞》发文，为肿瘤治疗带来新突破
本报讯（记者唐闻佳）肿瘤免疫治疗有望迎来新的突破。近日，复旦大学上海医学院许杰团队在《细胞》（Cell）杂志发表研究论文，发现CD3的首个配体CD3L1，并揭示了CD3L1在肿瘤免疫逃逸与睾丸免疫豁免中的关键作用。这是肿瘤免疫治疗的全新靶点CD3L1抗体首次被报道。最新消息显示，CD3L1抗体治疗肿
新技术－|－可识别特定糖基化的新工具EXoO
约翰霍普金斯大学医学院的研究人员开发出一种他们称为EXoO的新分子工具，它可以解码蛋白质上的特定的糖的附着位点，而这种改变可能是由疾病导致的。该研究发表在Molecular systems Biology（《分子系统生物学》）上，介绍了该工具的开发过程及其在人体血液、肿瘤和免疫细胞上的成功应用。
中科院，南京大学Cell－Res发文－解析TCR复合物新调控机制
来自中科院生物化学与细胞生物学研究所的研究人员发表了题为“Lipid-dependent conformational dynamics underlie the functional versatility of T-cell receptor”的文章，揭示了TCR复合物胞内段的结构动态性，为
9405糖蛋白的糖基化分析指导原则解析，SCIEX助力糖基化精准分析
概述日前，国家药监局、国家卫生健康委联合发布《中国药典》（2020年版）第一增补本，将于2024年3月12日起施行。其中增加了《9405 糖蛋白的糖基化分析指导原则》，本指导原则详细阐述了糖蛋白糖基化分析的理念、方法及应用和验证的相关要求，适用于糖蛋白产品结构与稳定性的表征、批次放行检测和过程控制检
饰”不可挡系列专题研讨会——糖基化：重大疾病的“健康码”
糖基化是一种重要且广泛存在的蛋白质翻译后修饰方式，对人体维持正常的生理功能发挥举足轻重的作用，一直是修饰组学研究的焦点之一。在实际应用中，多种疾病诊断的生物标志物和蛋白质药物是糖蛋白，大量糖蛋白的特殊功能与疾病的相关性亟待深入解析。本期研讨会，景杰生物携手复旦大学陆豪杰教授，国家蛋白质科学中心 (北
华人学者推出CRISPR新设计工具
细菌一直在与病毒或入侵核酸进行斗争，为此它们演化出了多种防御机制，CRISPR/Cas适应性免疫系统就是其中之一。规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA的指引下，靶标并切割入侵者的遗传物质。 2012年研究者们利用这一特点，将CRISPR系统发展成了强大的
新西兰推出环保高空“胶囊”交通工具(图)
据日本《产经新闻》5月24日报道，位于新西兰北岛罗托路亚的一座游乐园近日推出一项名为“Shweeb”的游乐设施，游客可以乘坐在吊挂在轨道上的透明“胶囊”从空中疾驰而过。这一奇妙创意的灵感来源于日本的胶囊旅馆。 有媒体评论称，无需燃料的“Shweeb”胶囊可谓“未来的环保交通工具”。
Science解析热点基因组编辑工具
近来，Cas9酶作为一种有力的新基因组编辑工具，引起了人们极大的研究热情。现在加州大学伯克利分校的研究人员，首次成像了这种酶的精细三维结构，这一成果无疑会进一步提高Cas9的应用价值。文章于二月六日发表在Science杂志上。 加州大学的生化学家Jennifer Doudna和生物物理学家
中科院发文，拆穿韩国室温超导假象
7月22日，韩国Sukbae Lee等人在arXiv上传了两篇论文，称发现了“全球首个室温超导材料”，名为LK-99，论文中给出了LK-99的合成方法，合成门槛很低。文章曝光后引起了大量争论，因为很多小组在试图复制时确实观察到了电阻急剧下降的现象，但是并未降到零。曾有美国科学家怀疑这与其样本中含
牛校Cell发文解析miRNA与表观遗传
近期北京大学生命科学学院接连在Cell，Nature structural and molecular biology上发表文章，介绍了关于先天免疫信号转导通路中的重要接头及感应蛋白STING结构生物学研究成果，以及基因组稳定性方面的研究成果。 在“The structura
新型分析工具可面向蛋白磷酸化和糖基化
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/9/507978.shtm
陆豪杰：蛋白质糖基化的质谱解析
分析测试百科网讯 2020年9月14日，由中国质谱学会（中国物理学会质谱分会）主办，分析测试百科网和中国质谱学会网承办的2020年中国质谱学会质谱网络研讨会（2020 CMSS）正式开幕。本届质谱网络研讨会正值中国质谱学会成立40周年，按报告内容涉及领域包括生命科学与组学、药物药理毒理分析、元素
复旦大学Cancer文章解析治癌新方向
复旦大学肿瘤医院，德克萨斯大学等处的研究人员在《Cancer》杂志(影响因子：2.8)上发表了华蟾素的一期临床试验的结果，首次探索华蟾素剂量和毒性的关系。这个项目是德克萨斯大学Anderson博士和复旦大学肿瘤医院的一个合作项目。 华蟾素是一种中药，由干蟾皮提取而来，其抗癌作用在于干蟾皮中
复旦大学JBC解析p53信号调控子
来自复旦大学、东南大学的研究人员在新研究中揭示了Polycomb group(PcG)蛋白PHF1的一个新功能，证实其参与调控了p53介导的细胞生长阻滞和凋亡，相关论文发表在1月4日的《生物化学杂志》(JBC)上。 领导这一研究的是复旦大学生命科学学院的余龙(Long Yu)教授，
CollabRx公司:－推出分析工具角逐癌症基因测序市场
位于旧金山的生物技术公司 CollabRx宣布将要竞逐癌症基因测序市场，公司目前推出了一套Genetic Variant Annotation (GVA)的服务软件，能帮助研究人员分离定位并鉴定癌症基因。利用生物信息学确定癌症基因已经成为癌症研究人员研究的重要途径之一，因此也使得这个领域成为
人源七聚体Pannexin－1通道的冷冻电镜结构研究获进展
3月12日，Cell Research 期刊在线发表了题为《人源七聚体Pannexin 1通道的冷冻电镜结构》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室竺淑佳研究组与复旦大学生物医学研究院王磊课题组和中科院上海药
中科院，上海师范大学Nature－Genetics发文：
来自中科院植物生理生态研究所，上海师范大学生命与环境科学学院等处的研究人员发表了题为“Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wild rice”的文章，通过泛基因组分析揭示
CNNIC推出免费公共云解析服务（SDNS）
近日，中国互联网络信息中心(CNNIC)正式推出公共云解析服务(SDNS)，该服务将为广大网民提供安全、智能、高速的上网接入解析服务。 CNNIC作为国家域名注册管理机构，拥有近二十年的域名研究实践与域名解析运行经验，继2011年6月推出国家域名云解析(CDNS)，免费为国家域名用户提供域
广东医学院JBC发文解析线粒体自噬
广东医学院附属医院的研究团队解析了microRNA调控线粒体自噬的分子机制，文章于二月二十六日发表在The Journal of Biological Chemistry的网站上。 线粒体是细胞能量代谢的中心，是氧化磷酸化、ATP合成、脂肪酸氧化等代谢过程的发生地。线粒体也是细胞凋亡的
张宏Cell子刊发文－解析自噬降解
12月17日，中国科学院生物物理研究所张宏课题组和日本微生物化学所Nobuo N. Noda课题组合作，在国际刊物《分子细胞》（Molecular Cell）上，在线发表了题为Structural basis of the differential function of the two C.
中科院植物所揭示类黄酮糖基化分子机制
记者日前从中国科学院植物研究所获悉，该所研究员庞永珍研究组以类黄酮含量丰富的茶叶和百脉根为研究对象，对类黄酮未知生物合成机理，特别是类黄酮糖基化的分子机制展开研究。揭示了特异的糖基转移酶（UGT）基因亚家族在类黄酮糖基化中的意义以及在植物生长发育中的功能。相关成果在线发表在国际学术期刊《实验植
中科院植物所揭示类黄酮糖基化分子机制
从中国科学院植物研究所获悉，该所研究员庞永珍研究组以类黄酮含量丰富的茶叶和百脉根为研究对象，对类黄酮未知生物合成机理，特别是类黄酮糖基化的分子机制展开研究。揭示了特异的糖基转移酶（UGT）基因亚家族在类黄酮糖基化中的意义以及在植物生长发育中的功能。相关成果在线发表在国际学术期刊《实验植物学杂志（