科学家解析温带竹子分支系统发育关系

温带竹子分支(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约546种,主要分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)和东南亚地区,少数种类分布到印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加,以及北美洲东部的低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该分支近500种,是其多样化中心,中国西南特有种有180余种。温带竹子分支在分子系统学研究中被证明是一个单系类群,但类群内部之间的关系尚未得到澄清。中国科学院昆明植物研究所李德铢研究团队致力于温带竹类的分类和系统发育研究,在大量材料收集的基础上,基于8个叶绿体DNA片段的分析将温带竹类划分为10个主要支系;基于叶绿体DNA和核DNA片段的分析,发现第11个支系和第12个支系;基于叶绿体全基因组数据,对这些支系间的系统关系进行了探索,澄清了大部分支系间的关系,但这些主要支系内部的关系无法通过相对保守的叶绿体基因组序列来解决,而需要更多的核基因数据。 近日,昆明植物所科研人员利用一......阅读全文

科学家解析温带竹子分支系统发育关系

 温带竹子分支(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约546种,主要分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)和东南亚地区,少数种类分布到印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加,以及北美洲东部的低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该分支近500种,是其多样化中心,中国西南特有

昆明植物所探索解决温带木本竹子系统发育关系的SNP标记

  温带竹子支系(the temperate bamboo clade)包括23-32属,约600种,分布于东亚地区(特别是喜马拉雅)、东南亚部分地区、印度南部和斯里兰卡、非洲和马达加斯加以及北美洲东部的温带低海拔地区和热带或亚热带高山。东亚有该支系约500种,是其多样化中心,其中中国西南特有种

昆明植物所完成六种木本竹子叶绿体基因组全序列的测定

  竹亚科(Bambusoideae)隶属于禾本科(Poaceae),全世界共分布有一千余种。木本竹子因种类数目多,形态性状复杂多变及多年生一次性开花等原因而成为系统发育学研究难点。随着新一代测序技术的兴起,系统发育基因组学为解决这类困难类群的系统发育关系带来了曙光。  中国科学院昆明植物研究所李德

全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究

  禾本科(禾草)是被子植物最大科之一,约有12000种,是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源,也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时,禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科(竹子)是禾本科的12个亚科之一,与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP

中国农大团队构建首个苹果属图形泛基因组

中国农业大学教授韩振海团队基于30份苹果属植物高质量基因组,系统解析了苹果属数千万年的演化历程,并构建了首个苹果属图形泛基因组,发布了苹果属遗传多样性全景图。日前,相关研究成果发表于《自然-遗传学》。苹果属植物倍性复杂,分布横跨欧亚、美洲等多个地理区域,是研究基因组多倍化与杂交的重要木本植物类群。全

昆明植物所解析核心十字花科植物的系统发育关系

  十字花科(Brassicaceae或Cruciferae)植物约有351属3977种,是一个全球分布的自然类群,包括常见绿叶类蔬菜、油料作物油菜、园艺观赏植物香雪球等。该科有模式植物拟南芥,也是被子植物全基因组序列数据发表最多的科之一,为研究全基因组加倍、环境适应机制、基因功能进化等重要生物学问

科学家揭示木本竹类独特性状演化之谜

“竹子开花,立马搬家”——我国一些地区传言,竹子开花之后不就后死亡,预示着坏事发生。从科学的角度来看,传言不攻自破。竹子分为木本竹类和草本竹类,只有木本竹类开花后死亡。木本竹类茎秆高大,木质化程度高、营养生长几十甚至上百年,最长的可达120年,之后才开花死亡。相比之下,草本竹类一般仅几十厘米高,木质

科学家重建了薄唇蕨属植物系统发育关系-并做出新分类

  我国有古语“名不正则言不顺”,Pante等(2015)在综述整合分类学研究时曾参考此谚语写道“The first part of knowledge is getting the names right”。然而客观地认识并定义自然界的物种并非易事,分类研究过程中物种名称的变化以及由此表现出来的“

云南省禾本科种质资源与基因组学省创新团队通过认定

  6月6日,由云南省科技厅主持,邀请有关专家,对“中国科学院昆明植物研究所禾本科种质资源与基因组学省创新团队”进行认定,经专家组认真审查有关认定资料,听取了团队带头人李德铢的工作汇报。   专家组认为,该创新团队通过三年的实施培养,建立了有国际影响力的禾本科植物的比较功能基因组学与进化基因组学研

科学家在蔷薇科叶绿体系统发育基因组研究中取得进展

  系统发育基因组学是基因组学和系统发育生物学融合产生的一个交叉学科,主要用基因组水平的大规模分子数据解析生物之间的系统发育关系,并利用系统发育原理研究基因组进化机制。基因组大量的数据信息具有“缓冲”作用,能减少系统发育重建中的随机误差,使得引起基因树冲突的各种生物学因素被逐一分析,是当前重建生命之

科学家解析疱疹病毒与老年痴呆关系

 由于阿尔茨海默氏症进展缓慢,以及收集脑组织样本存在困难,人们对其病因了解仍不透彻。但近日发表在《神经元》杂志上的一项大规模研究报告称,美国西奈山伊坎医学院的研究人员分析了3个不同的大脑数据库,发现人类疱疹病毒在阿尔茨海默氏症患者的大脑中更丰富,可能影响遗传网络协调,这些网络被认为与该疾病有关

科学家解析疱疹病毒与老年痴呆关系

  由于阿尔茨海默氏症进展缓慢,以及收集脑组织样本存在困难,人们对其病因了解仍不透彻。但近日发表在《神经元》杂志上的一项大规模研究报告称,美国西奈山伊坎医学院的研究人员分析了3个不同的大脑数据库,发现人类疱疹病毒在阿尔茨海默氏症患者的大脑中更丰富,可能影响遗传网络协调,这些网络被认为与该疾病有关。这

科学家解析疱疹病毒与老年痴呆关系

  由于阿尔茨海默氏症进展缓慢,以及收集脑组织样本存在困难,人们对其病因了解仍不透彻。但近日发表在《神经元》杂志上的一项大规模研究报告称,美国西奈山伊坎医学院的研究人员分析了3个不同的大脑数据库,发现人类疱疹病毒在阿尔茨海默氏症患者的大脑中更丰富,可能影响遗传网络协调,这些网络被认为与该疾病有关。这

水生植物泽泻科系统发育基因组学研究获新进展

泽泻科(Alismataceae)为古老的单子叶水生植物类群,包含17个属约100个物种。该科植物在世界广泛分布,因其复杂的进化历史、较高的观赏价值和生态价值等,长期以来一直受到植物进化生物学家及生态学家的关注。然而,由于该科植物形态复杂多变以及先前研究所采用的分子标记和样本采集的局限性,该科属间及

研究推断出棕榈科植物系统发育关系

  近日,海南大学热带作物学院教授王华锋团队为了更好地了解棕榈目中棕榈科植物,分析比较了棕榈科的叶绿体基因组结构特征,推断出系统发育关系,估计出棕榈科的分歧时间,并对祖先性状特征进行重建等分析进行了研究。相关研究于9月27日在线发表于《植物科学前沿》。  棕榈科是在棕榈目中的一个具有物种丰富性的分支

研究推断出棕榈科植物系统发育关系

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/9/487011.shtm 近日,海南大学热带作物学院教授王华锋团队为了更好地了解棕榈目中棕榈科植物,分析比较了棕榈科的叶绿体基因组结构特征,推断出系统发育关系,估计出棕榈科的分歧时间,并对祖先性状特征进行

研究揭示竹子茎秆快速生长的遗传机制

  演化创新(evolutionary innovation)贯穿于整个生命之树(Tree of Life),如被子植物的花和鸟类的羽毛分别为植物和鸟类开拓和适应新的生态位提供了重要前提,其如何产生是演化与发育生物学研究的基本问题和主要挑战之一。越来越多研究表明,新基因是演化创新的主要驱动力之一。几

美国竹子协会学者与版纳园进行竹子苗木交换

  7月1日至3日,两位来自美国竹子协会的学者Clifford Sussman与Robert Saporito对中科院西双版纳热带植物园进行了为期3天的考察访问。   7月2日,Clifford Sussman与Robert Saporito对百竹园进行了实地考察,对版纳园收集保存的部

核基因和形态学证据揭示我国梨藤竹属的分类学谜团

  竹亚科是禾本科适应森林生境的主要分支之一,广泛分布于亚洲东南部、中南美洲和非洲地区,具有重要的经济、生态和文化价值。为适应多样的生存环境,竹子演化出了多种多样的植株类型,包括乔木状、灌木状和草本竹,其中,有一类竹子因具有攀爬或攀援习性,被称为“藤本竹”。在我国记录过具攀爬或攀缘习性的竹子有6个属

我国科学家揭示竹子茎秆快速生长的机制

  竹子是一种独特的禾本科植物,它的茎秆生长迅速,如毛竹的幼嫩茎秆(笋)一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争,从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期,我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其茎秆快速生长的遗传机制,相关研究

我国科学家揭示竹子茎秆快速生长的机制

  竹子是一种独特的禾本科植物,它的茎秆生长迅速,如毛竹的幼嫩茎秆(笋)一天生长可达1米。这种特性使其能够与其他树木竞争,从而适应森林环境。以往对竹子木本茎快速生长特性的研究主要集中在形态学、解剖学和生理学方面。近期,我国科学家开展了竹子新基因功能演化的研究,揭示了其茎秆快速生长的遗传机制,相关研究

浙江科学家成功克隆竹子部分成花基因

浙江林学院研究人员经过10多年研究,日前成功克隆到竹子的部分成花基因,在探究竹子开花奥秘的道路上迈出了重要一步。 竹子开花问题是竹子研究领域的世界性难题。竹子的开花周期可长达60年至120年,且难以预测,使得竹子的分类和杂交育种工作难以有效开展。另一方面,竹子一开花就意味着死亡,弄清竹子开花机理可

昆明动物所揭示鸡形目新的系统发育关系

  鸡形目是一个在世界范围里广布的种类。雉科在该目里成员最多,关系最复杂。中国拥有世界上雉科近1/3的种类,其中又有大约1/3是我国的特产种,有“雉类的王国”之称。该目包含了人们所熟悉以及有重要经济价值的家鸡,火鸡,鹌鹑等;也包含了很多稀有的观赏鸟类,比如红腹锦鸡,红腹角雉,白鹇等。由

我国揭示苏铁目下属间的分子系统发育关系

  苏铁属(Cycas)是现存现存苏铁类植物中分布最广、种类最多的一个属,且多数物种被列入IUCN红色名录,处于濒危状况。该属共有115种,主要分布在亚洲东部以及东南部、大洋洲以及周围岛屿、非洲东部及马达加斯加岛的热带亚热带区域。以往的系统学研究结果表明,苏铁属在苏铁类植物中最先分出,和苏铁目其他9

昆明植物所禾本科BEP分支及近缘物种比较研究取得进展

  BEP分支——即竹亚科 (Bambusoideae)、稻亚科 (Ehrhartoideae) 和早熟禾亚科 (Pooideae),是禾本科 (Poaceae) 重要组成部分之一。最近十几年以来,研究人员付出了巨大的努力,但是BEP分支的系统发育关系仍然存在争议。值得欣喜的是,近两年来,研

昆明植物所等在蔷薇类系统发育基因组学研究中取得进展

  蔷薇类(rosids)和菊类(asterids)是真双子叶植物的两个主干分支,其中蔷薇类包括17个目,140个科,约70,000个物种,呈现了丰富的形态多样性,并具有重要的经济价值。近十几年以来,对叶绿体基因序列的分析支持蔷薇类分为豆类分支和锦葵类分支。其中,豆类分支包括固氮支系(由葫芦目Cuc

昆明植物所在荨麻科分子系统发育框架研究中取得进展

  荨麻科(Urticaceae)是被子植物一个中等大小的科,约有54属,2000余种,广泛分布于两半球的热带地区,延伸至温带,其中热带的亚洲是该科的多样性分布中心。荨麻科的很多种类有重要的经济价值、药用价值和生态价值,但由于其很多重要分类性状极其微小,不易观察,因此自该科1789年成立以来,其科下

青藏高原松科植物外生菌根真菌群落构建机制被揭示

近日,中国科学院成都生物研究所尹华军研究团队在青藏高原松科植物外生菌根真菌群落构建机制方面取得进展。研究以青藏高原亚高山森林的11种松科植物(云杉属、冷杉属、松属)为对象,对其195个单优林分的外生菌根(EcM)真菌群落进行系统分析,相关研究成果发表在《植物生态学报》上。微生物群落构建机制是微生物生

昆明植物所解析九倍体木本竹基因组

竹子即竹亚科是禾本科的重要分支,广泛分布于亚洲、非洲和拉丁美洲,约有1,700种。作为一类生长快、多年生、可再生的森林资源,木本竹子越来越多被用作木材的替代品,具有重要的经济价值和生态价值。有研究发现,木本竹子均为异源多倍体,具有长时间营养生长、一次性开花等独特的生物学习性。多倍体是植物尤其是竹子进

昆明植物所开展分子系统学和生物地理学研究

  在国家基金项目(No.30770138)的资助下,中国科学院昆明植物研究所伊廷双研究员带领项目组员对间断分布于北温带漆树科(Anacardiaceae)的清香木属(Pistacia)、盐肤木属(Rhus)和黄栌属(Cotinus),利用多个核基因和叶绿体基因片段开展了分子