超100种拟南芥测序完成,又一生物理论受到冲击
自二十世纪上半叶以来,进化论一直认为突变是随机发生的。德国马克斯·普朗克生物研究所研究团队发现,DNA突变并不是随机的,揭示了一种非随机模式。该结果于近日发表在《Nature》上,题为:Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis thaliana。 研究人员对数百种,发现了超过100万个突变,这些突变发生在基因组功能受限区域的频率较低。与预期相反,在这些突变中,揭示了一种非随机模式。该研究发现了一些非随机且具有低突变率的基因组区域,这些区域的突变率比其他区域低三分之一。这些基因组中的重要区域对新突变的有害影响也很敏感。因此,DNA损伤修复在这些区域特别有效。此外,研究人员还发现,通过DNA包裹不同类型蛋白质的方式可以很好地预测基因是否会发生突变,这意味着可以预测哪些基因更有可能发生突变。 总之,该研究加深了我们对进化的理解,与表观基因组相关的突变偏向减少了拟......阅读全文
通过拟南芥揭示高温下植物基因突变的原理
团队以拟南芥为对象研究多代高温下植物基因突变的原理(扬州大学供图) 近日,扬州大学园植学院教授校金飚和农学院徐辰武在《基因组生物学》期刊在线发表题为“多代高温胁迫下拟南芥全基因组DNA突变研究”的最新研究成果。该研究首次从种群遗传谱系和单粒种子遗传谱系两个层面揭示了长期多代高温下植物的DN
拟南芥突变体纯合植株的获得
实验概要本实验利用农杆菌转化侵染野生型拟南芥获得变体纯合植株。实验材料拟南芥(Arabidopsis thaliana, Col-0),培养条件,长日照为16h光照/8h黑暗,22oC;短日照为8h光照/16h黑暗,22oC。实验步骤1. 拟南芥基因组的小量提取 1) 取0.2 g拟南芥叶片,
拟南芥转基因植株的鉴定
实验概要本实验介绍了拟南芥转基因植株的初步鉴定方法,包括:阳性苗的筛选,GUS基因表达分析,组织PCR和RT-PCR分析。主要试剂0.2%的Triton X-100,10%的次氯酸钠,含20 mg/L Hygromycin的MS培养基,X-Gluc,75%乙醇,0.25 N NaOH,0.25
拟南芥基因组DNA的提取
实验概要本实验介绍了用CTAB法提取拟南芥基因组DNA。主要试剂CTAB提取液(2%CTAB,50mMEDTA,50mM Tris-HCl,PH 8.0,0.84M NaCI,0.05%巯基乙醇),氯仿,无水酒精,70%的酒精主要设备1.5 mL离心管,65℃水浴锅,高速离心机,研钵实验材料拟南芥叶
拟南芥转基因植株PCs含量的测定
实验概要本实验测定了转基因拟南芥总谷胱甘肽(GSH)含量、非蛋白巯基(NPT)含量。主要试剂200 uM CdSO4,5% sulfosalicylic acid(含6. 3 mM diethylenetriaminepentaacetic acid ),Co-enzyme working
转基因拟南芥研究能提高作物生长速度
加拿大圭尔夫大学研究人员发现,在一种叫做拟南芥(Arabidopsis)的小花植物中插入一种特殊的玉米酶,会使其生长速度加倍,种子产量达到原来的4倍。 这一发现有望提高油菜籽、大豆等重要油料作物和生物燃料作物亚麻荠的产量,也会捕获更多大气二氧化碳,有可能给食用作物和生物燃料种植带来变革。
拟南芥sos突变体在盐胁迫下的离子流模式
SOS信号转导途径在植物离子平衡和耐盐中非常重要。SOS模型认为高Na+引起了胞内自由Ca2+的升高,激活了Ca2+结合蛋白编码的SOS3的表达,影响到下游的反应。SOS3激活了相连的SOS2(丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶),SOS2/SOS3复合体调节盐忍耐因子编码的SOS1(质膜Na+/H+反向转运体
拟南芥转化
实验概要本实验以拟南芥为试材介绍了转化及筛选的过程。主要试剂1. 渗透培养基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH调至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%琼脂PNS或水溶液2. 筛选培
基因突变
基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象叫做基因突变。基因突变是变异的主要来源,也是生物进化发展的根本原因之一。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在
拟南芥的转化
实验概要本实验采用花浸泡法利用农杆菌介导将目的基因转入拟南芥。主要试剂YEB液体培养基,LB培养基,0.1 M CaCl2,0.05 M MgSO4,花浸泡缓冲液(0.5XMS,5%蔗糖,0. 03%Silwet L-77 ),Rif,Kan主要设备摇床,离心机,培养钵,温室,托盘,塑料薄膜实验材料
拟南芥的培养
实验概要本实验方法就拟南芥的培养技术进行了简单介绍。主要试剂1. PNS营养液:每升含2.5m1 1M磷酸缓冲液(pH5.5)5ml 1M KN03,2m1 1M MgSO4.7H20,2m1 1M Ca(N03)a.4H20,2.5m1 20mM Fe.EDTA,1 ml MS微量兀素。2. 人
研究揭示拟南芥孤儿基因调节花粉发育的分子机制
开花植物中,花粉的形成以及随后的花粉管生长和受精在植物的育性中具有关键作用。花粉的适当发育和成熟对种子植物的遗传多样性具有重要影响,对农业作物生产产生重要作用。植物中孤儿基因的出现可能是植物不断适应环境的进化结果,其功能可能促进植物的生存。近年来,拟南芥特异性孤儿基因Qua Quine Starch
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验
实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hypon
基因定点突变知识
实验原理基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择30-35bp长度
基因突变的诱变机制移码突变
诱发移码突变的诱变剂种类较少,主要是吖啶类染料(图6)。这些染料分子能够嵌入DNA分子中,从而使DNA复制发生差错而造成移码突变。
基因突变的诱变机制自发突变
所谓自发突变是指未经诱变剂处理而出现的突变。从诱变机制的研究结果来看,自发突变的原因不外乎以下几种。①背景辐射和环境诱变。短波辐射在宇宙中随时都有,实验说明辐射的诱变作用不存在阈效应,即任何微弱剂量的辐射都具有某种程度的诱变作用,因此自发突变中可能有一小部分是短波辐射所诱发的突变,有人估计果蝇的这部
Nature:科学家揭示拟南芥的突变偏向反映出自然选择
自二十世纪上半叶以来,进化论一直认为突变是随机发生的。德国马克斯·普朗克生物研究所研究团队发现,DNA突变并不是随机的,揭示了一种非随机模式。该结果于近日发表在《Nature》上,题为:Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis
基因重组和基因突变区别
1、基因突变是基因的从无到有,突变产生新基因。基因重组是原有基因的重新组合,产生的是新基因型。2、发生的时间:基因重组发生的时期是:减数分裂中四分体时期同源染色体的非姐妹染色单体之间的局部交换和减数diyi次分裂后期非同源染色体的而重新组合;基因突变发生的时间是在有丝分裂和减数分裂的间期。
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)
11.用 mRNA 纯 化 试 剂 盒(Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 将 Poly.(A )+ RNA从总R N A 中分离出来(见注释5)。####(2) c D N A 文 库 的 构 建1.取1. 5 〜7. 5 μg poly (A )+ R
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)
注意事项1.所有的试剂必须用电阻高于 17. 6 的双蒸水配制。2.提取 RNA 所用的玻璃器具必须于 180°C 烘烤至少 8 h 以灭活 RNase。除缓冲液外的所有溶液都要用 0 •1 % DEPC水 配 制(见注释 3)。 RNase 的污染主要来源于实验人员的手,所以进行 RN A 实验时
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(一)
实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hyponex 10 : 5 : 10; Hyponex Japan
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(一)
除 cDNA 微阵列外,基于尼龙膜支持物的 cDNA 宏阵列方法是又一被广泛应用的大规模基因表达数据的收集方法。从新基因的发现到基因表达谱的分析, cDNA 宏阵列被应用于分子生物学研究领域的各个方面。尽 管 cDNA 宏阵列的点阵密度低于微阵列,但由于应用灵敏度较高的同位素标记的 cDNA 探针,
拟南芥基因研究显示:环境对遗传多样性影响巨大
一项针对多种拟南芥的基因研究表明,环境因素对物种遗传多样性和基因组的影响比之前人们预期的更大。相关论文发表在7月20日的《科学》杂志上。 除了实验室中科学家的“最爱”,世界各地还分布着多种野生拟南芥。它们的生长速度、叶子颜色以及发枝方式都是不同的。在最新的研究中,由德国马普发育生物学研究所(Max
基因定点突变step-by-step
本贴先讲最简单的一个点的定点突变技术,其它较长片段的突变,删除,插入技术以后会慢慢奉上:在做实验之前,我们首先要搞清楚实验的目的和实验的原理。实验的目的应该比较明确吧:就是要把自己的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。一般情况下我们会有几种可能使我们需要这样去做:第一:我们吊出来的基因有点突变,相信
基因定点突变step-by-step
本贴先讲最简单的一个点的定点突变技术,其它较长片段的突变,删除,插入技术以后会慢慢奉上:在做实验之前,我们首先要搞清楚实验的目的和实验的原理。实验的目的应该比较明确吧:就是要把自己的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。一般情况下我们会有几种可能使我们需要这样去做:第一:我们吊出来的基因有点突变,相信
基因突变的特性
随机性:基因突变的发生是随机的,没有固定的规律可循。 不定向性:基因突变可以影响DNA序列的任何部分,包括编码区和非编码区。 有害性:大多数基因突变对生物体是有害的,可能导致疾病或死亡。只有少数突变对生物体是有益的。 可逆性:一些基因突变是可以逆转的,例如DNA修复机制可以修复某些突变。
基因突变的发展
基因突变首先由T.H.摩尔根于1910年在果蝇中发现。H.J.马勒于1927年、L.J.斯塔德勒于1928年分别用X射线等在果蝇、玉米中最先诱发了突变。1947年C.奥尔巴克首次使用了化学诱变剂,用氮芥诱发了果蝇的突变。1943年S.E.卢里亚和M.德尔布吕克最早在大肠杆菌中证明对噬菌体抗性的出
知识分享:基因定点突变
实验原理 基因定点突变是指通过聚合酶链式反应(PCR)等方法改变目的基因的序列,包括碱基的插入、缺失、点突变等。基因定点突变是基因研究中比较常用的方法,可以短时间内研究目的DNA所表达的目的蛋白的性状及表征。 定点突变需要设计特定的突变引物。引物长度一般为25-45 bp,建议选择3
基因突变的概念
基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象(gene mutation)。从分子水平上看,基因突变是指基因在结构上发生碱基对组成或排列顺序的改变。基因虽然十分稳定,能在细胞分裂时精确地复制自己,但这种稳定性是相对的。在一定的条件下基因也可以从原来的存在形式突然改变成另一种新的存在形式,就是在一个
基因定点突变step-by-step
本文先讲最简单的一个点的定点突变技术,其它较长片段的突变,删除,插入技术以后会慢慢奉上: 在做实验之前,我们首先要搞清楚实验的目的和实验的原理。 实验的目的应该比较明确吧:就是要把自己的基因上面的一个碱基换成另外一个碱基。一般情况下我们会有几种可能使我们需要这样去做: 第一 我们吊出来的基因有点突变