cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验（二）
11.用 mRNA 纯 化 试 剂 盒（Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 将 Poly.(A )+ RNA从总R N A 中分离出来（见注释5)。####（2） c D N A 文 库 的 构 建1.取1. 5 〜7. 5 μg poly (A )<sup>+</sup> R N A 做模板，用 带 有 一 个 Xho Ⅰ 位 点 的 oligo-(dT)<SUB>18</SUB>引物扩增，用 Superscript H (Invitrogen， Groningen, Netherlands) 反转录酶52°C 反 应 30 min合成第一链（见注释6)。2.第二链合成结束后，用 D N A 补 平 试 剂 盒（DNA Blunting Kit， TaKaRa Bio,Ohtsu， Japan) 将 cDNA末端补平，两端各加一......阅读全文
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验（二）
11.用 mRNA 纯 化 试 剂 盒（Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 将 Poly.(A )+ RNA从总R N A 中分离出来（见注释5)。####（2） c D N A 文 库 的 构 建1.取1. 5 〜7. 5 μg poly (A )+ R
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(二)
注意事项1.所有的试剂必须用电阻高于 17. 6 的双蒸水配制。2.提取 RNA 所用的玻璃器具必须于 180°C 烘烤至少 8 h 以灭活 RNase。除缓冲液外的所有溶液都要用 0 •1 % DEPC水 配 制（见注释 3)。 RNase 的污染主要来源于实验人员的手，所以进行 RN A 实验时
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验
实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基： I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基（GibcoBRL， Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料（Hypon
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验（一）
实验步骤 ##一、 cDNA 宏阵列的样品制备培养基： I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 养 基（GibcoBRL， Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料（Hyponex 10 : 5 : 10; Hyponex Japan
cDNA宏阵列方法分离拟南芥的臭氧应答基因实验(一)
除 cDNA 微阵列外，基于尼龙膜支持物的 cDNA 宏阵列方法是又一被广泛应用的大规模基因表达数据的收集方法。从新基因的发现到基因表达谱的分析， cDNA 宏阵列被应用于分子生物学研究领域的各个方面。尽 管 cDNA 宏阵列的点阵密度低于微阵列，但由于应用灵敏度较高的同位素标记的 cDNA 探针，
通过cDNA宏阵列和基因表达谱检测环境毒物毒理效应实验
本章主要介绍如何通过制备和使用 cDNA 宏阵列来检测环境毒物对基因表达的影响，同时具体介绍实验所用到的材料与方法。由于一些非传统模式的物种研究购买不到商业化的芯片，应用本章讲述的方法，研究人员可以自行设计和使用适合自己实验目的的芯片。我们有意略去了实验中统计分析方面的内容，因为统计分析的方法仍有待
通过cDNA宏阵列和基因表达谱检测－环境毒物的毒理效应...
实验步骤 一.材料1.扩增和制备克隆（1）甘 油 保 存 的E.coli, 质 粒 含 有 目 标 cDNA 插入片段。（2）Tag 聚合酶和缓冲液（New Englang Biolabs cat. no. M0267)。（3）10 mmol/L dNTP 混合物。（4）用来扩增载体中插入片段的引物
大规模－PCR－制作－cDNA－微阵列实验（二）
第 3 阶段：克隆的扩增与 PCR 产物的评估一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂DEPC 处理过的 H20TAE 缓冲液，1×（40 mmol/L Tris-乙酸盐，1 mmol/L EDTA，pH 约 8.5)DNA 点样缓冲液（200 g/LFicoll400，0.1mol/LNa2EDTA，pH
通－过－cDNA宏阵列和基因表达谱检测－环境毒物的毒理效应
实验步骤 一.材料 1.扩增和制备克隆 （1）甘 油 保 存 的E.coli, 质 粒 含 有 目 标 cDNA 插入片段。 （2）Tag 聚合酶和缓冲液（New Englang Biolabs cat. no. M0267
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验（二）
二、方法在开始任何微阵列实验之前，必须要选定合适的对照和时间点，这样获得的数据才有生物学意义。关于如何选择合适的对照，参见注释 1 和 2。1 总 R N A 的提取2 R N A 变性凝胶电泳（1）制备一块 1 % 的琼脂糖甲醛变性胶，浸没在 IXM OPS 缓冲液中，胶上的孔应被溶液完全没过。将
大规模－PCR－制作－cDNA－微阵列实验
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂 生物分子 酶和酶缓冲液 核酸和寡核苷酸 凝胶 仪器、耗材
大规模－PCR－制作－cDNA－微阵列实验
本方案描述了通过 PCR 扩增产物，来制作 cDNA 微阵列的实验步骤。本实验来源于 PCR 实验指南（第二版），作者：种康，瞿礼嘉。试剂、试剂盒缓冲液、溶液和试剂生物分子酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸凝胶仪器、耗材专用设备实验步骤第 1 阶段：影印铺板与工作库的制备一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂羧苄
大规模－PCR－制作－cDNA－微阵列实验（一）
试剂、试剂盒 缓冲液、溶液和试剂生物分子 酶和酶缓冲液核酸和寡核苷酸凝胶仪器、耗材 专用设备实验步骤 第 1 阶段：影印铺板与工作库的制备一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂羧苄西林（100ug/ml 储存溶液）乙醇（100%)甘油，45%(体积分数）LB 液体培养基。（1L LB 液体培养基含有 10
cDNA文库分离基因的相关介绍
如果手中有足够量可产生抗体的来源于真核细胞的蛋白质，可以通过双抗体免疫法分离出此蛋白的基因。 基本原理： 核糖体沿mRNA进行多肽链合成时形成多聚核糖核蛋白体，而具有不同长度的新生肽链在核糖体上不断延伸。 将从细胞匀浆液中制备出的多聚核糖核蛋白体同特定抗体一起保温，形成多聚核糖体同抗体的复
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验
实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级，或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品，包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌，在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验
近几年来， DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面，常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ，微阵列的应用尚未得到充分开展，而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说，制备一个新物种的 D N A 阵列或微
从拟南芥菜中分离叶绿体实验
实验材料叶组织 试剂、试剂盒研磨悬浮缓冲液 仪器、耗材烧杯
从拟南芥菜中分离叶绿体实验
实验材料叶组织试剂、试剂盒研磨悬浮缓冲液仪器、耗材烧杯Polytron 匀浆器实验步骤1. 组织匀浆(1) 收集 10 g 叶组织，放进一 400 ml 的烧杯中。(2) 加入 200 ml 冰冷的研磨悬浮缓冲液。在 4℃ 的房间中，用 Polytron 匀浆器进行 6~7 个 3 秒钟脉冲匀浆叶组
从拟南芥菜中分离叶绿体实验
实验材料 叶组织试剂、试剂盒 研磨悬浮缓冲液仪器、耗材 烧杯Polytron 匀浆器实验步骤 1. 组织匀浆(1) 收集 10 g 叶组织，放进一 400 ml 的烧杯中。(2) 加入 200 ml 冰冷的研磨悬浮缓冲液。在 4℃ 的房间中，用 Polytron 匀浆器进行 6~7 个 3 秒钟脉冲
从拟南芥菜中分离叶绿体实验
实验材料 叶组织 试剂、试剂盒 研磨悬浮缓冲液 仪器、耗材
比较分子生理基因组学－—cDNA阵列的异种杂交实验（一）
实验步骤 一、材料这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级，或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品，包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌，在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clontech购得。人 19K cDNA 阵列从Ontario 癌症研究所购得
cDNA文库组标准流程二:mRNA的分离
1.Oligotex mRNA Kits (QIAGEN）法 准备工作：1.将Oligotex Suspension 置于37℃水浴中，旋转混匀，溶解Oligotex.,然后置于室温。2.将OBB Buffer置于37℃水浴中，旋转混匀，重溶沉淀物，然后置于室温。3.将OEB Buffer 置于7
cDNA第二链的合成方法
cDNA第二链的合成方法有以下几种：（1）自身引导法。合成的单链eDNA3’端能够形成一短的发夹结构，这就为第二链的合成提供了现成的引物。当第一链合成反应产物的DNA—RNA杂交链变性后利用大肠杆菌DNA聚合酶I Klenow片段或反转录酶合成eDNA第二链，最后用对单链特异性的S1核酸酶消化该环，
cDNA－文库的构建（二）
7. 尽可能快地进行 cDNA 合成的下一步骤阶段 2:cDNA 第二链的合成材料缓冲液和溶液将贮存液稀释到合适浓度。氯仿EDTA(0.5mol/LpH8.0)乙醇MgCl2(1mol/L)(NH4)2SO4(1mol/L)将 1.3 g 固体硫酸铵溶解于终体积为 10 ml 的水中，溶液经滤膜过滤
生物芯片入门（一）：生物芯片及应用简介
生物芯片（biochip）是指采用光导原位合成或微量点样等方法，将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物（如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体）的表面，组成密集二维分子排列，然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交，通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或
用－cDNA－芯片分析人类基因表达实验
实验材料 母板试剂、试剂盒 细菌细胞中的标记LB 培养基氨苄青霉素乙醇Super 肉汤培养基 甘油96孔碱裂液T low E 缓冲液10 X PCR 缓冲液 20 X SSC琥拍酸酐仪器、耗材 96深孔板和V 形塑料细胞培养皿水平微量培养板离心96孔多位点复制针1 加仑储存袋多微孔的带层带孔的振荡器
树突细胞的分离实验（二）
1.将2 管 I m l 的 4000U /m l 胶 原 酶 D 稀 释（足够用于2 0 个脾脏）： Im l 加 入 9m l H B S S(稀 释 至 400U /m l ，步 骤 8 使用）， I m l 加 入 39m l 的 H B S S (稀 释 至 100U /ml)。置
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin反转录缓冲液仪器、耗材 PCR 管子 热循环仪实验步骤 一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物（20~40U/ml)(1034731，RocheAp
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒 二硫苏糖醇 dNTP 随机引物 来自方案 4 的 RNA 样品 RNasin 反转录缓冲液
cDNA－合成实验
试剂、试剂盒二硫苏糖醇dNTP随机引物来自方案 4 的 RNA 样品RNasin反转录缓冲液仪器、耗材PCR 管子热循环仪实验步骤一、材料1. 缓冲液、溶液和试剂0.1mol/L 二硫苏糖醇dNTP(每种 2.5 mmol/L)随机引物（20~40U/ml)(1034731，RocheApplied