武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种,成为植物品种选育的有效手段。因此,开展葡萄基因组学研究,将极大地促进葡萄产业的发展。 中国科学院武汉植物园园艺作物学科组深入开展了葡萄基因组学研究,并取得一系列进展。该课题组研究人员首先构建了葡萄种间杂交F1群体,利用RAD-seq分子标记技术,构建了一张目前文献报道的最高密度遗传图谱。该图谱含有完整的序列信息SNP分子标记约4400个,全部19个连锁群总遗传距离约2000厘摩。该遗传图谱将用于葡萄关键农艺性状QTL定位,并开发与优异性状紧密连锁的分子标记,应于用葡萄分子标记辅助育种。 同时,该课题组研究人员还利用国际上公布的葡......阅读全文
利用分子成像揭示神经退行性疾病的生物标记物
进行脑研究的科学家们一直致力于寻找参与神经退行性疾病和认知紊乱疾病发生的可靶向细胞内过程。近日,在一项国际会议上,来自华盛顿大学的研究人员报告了他们的一项最新研究进展,他们将一种特殊的分子成像试剂结合到神经递质乙酰胆碱的转运蛋白上,对参与神经退行性疾病和认知紊乱疾病发生的细胞内过程进行了成像研究
科学家发现卵巢衰老分子标记物或延缓卵巢衰老
灵长类卵巢衰老高分辨率分子图谱研究衰老卵巢染色 卵巢是机体衰老过程中较早出现退行性变化的器官之一,其衰老表现为卵母细胞数量减少和质量下降,以及女性生殖力降低等。卵巢衰老还伴随着性激素分泌紊乱,这可能导致心血管病等老年病。 1月31日,《细胞》杂志在线发表论文,研究人员利用高精度单细胞转录组测序技
鲟鱼性别特异性分子标记开发方面取得新进展
中国水产科学研究院长江水产研究所鱼类生殖发育与细胞工程研究团队通过对施氏鲟雌雄群体进行基因组重测序以及比较分析,筛选到施氏鲟雌性性别特异性DNA片段,并通过引物设计和群体验证,表明所获得的雌性性别特异性DNA分子标记在鲟科鱼类中具有通用性。相关研究成果近期在国际期刊《Genomics》(2021
ISSR(intersimple-sequence-repeat)分子标记的实验原理及操作
ISSR标记ISSR(inter-simple sequence repeat)标记是一种类似RAPD,但利用包含重复序列并在 3’或5’锚定的单寡聚核酸引物对基因组进行扩增的标记系统,即用SSR引物来扩增重复序列之间的区域。其原理具体是,ISSR标记根据生物广泛存在 SSR的特点,利用在生
上海生科院等发现血管新生的特异标记分子
1月19日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌组与美国贝勒医学院教授Wythe,上海生科院生物化学与细胞生物学研究所研究员惠利健,营养所研究员方靖、余鹰及段胜仲等合作的最新研究进展:Genetic Targeting
Cell:单分子测序揭示惊人的基因组重排
科学家们发现,生活在池塘里的单细胞生物Oxytricha trifallax有一种非凡的能力,它们能在交配时将DNA打碎并快速重排这些片段。这项研究发表在上一期的Cell杂志上。 Oxytricha的基因重排是一个非常精密的过程,“这是大自然早期一种的复杂化尝试,”文章的资深作者,Prince
单分子测序改善微生物基因组组装
美国国家生物防卫分析和反制中心的研究人员近日在《Genome Biology》上发表文章,介绍了SMRT技术在微生物基因组组装上的应用。他们认为,单分子测序数据能降低测序费用,并带来更多完整的基因组,改善微生物基因组数据库的质量。 随着测序费用的不断下降,测序项目的数量也在不断上升。G
Cell:单分子测序揭示惊人的基因组重排
科学家们发现,生活在池塘里的单细胞生物Oxytricha trifallax有一种非凡的能力,它们能在交配时将DNA打碎并快速重排这些片段。这项研究发表在上一期的Cell杂志上。 Oxytricha的基因重排是一个非常精密的过程,“这是大自然早期一种的复杂化尝试,”文章的资深作者,Prince
山苍子基因组图谱揭秘精油合成分子机制
山苍子,是我国南方家喻户晓的一种香树,其果实有香气,无毒,可治疗急性肺炎,有抗病毒抗菌消炎作用。山苍子精油还是高级化妆品紫罗兰酮的原料。山苍子花 陈炳华摄 4月3日,《自然—通讯》在线发表中国林业科学研究院亚热带林业研究所(以下简称亚林所)研究员汪阳东团队的重要成果。该团队成功组装全球首个染色
全球研究人员致力于创造首个合成真核生物基因组
10年前,当遗传学家Ronald Davis首次提出,他的同事正在尝试创造人工酵母染色体,并将其放入活细胞时,Jef Boeke并没有太多想法。Davis就职于美国加州斯坦福大学医学院,是一个有远见的人。他提出,实验室酵母是当时合成生物学领域的下一个发展方向。不过,Boeke并不理
研究人员提出基因组结构变异检测和分型新方法
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
PCR扩增标记法探针标记
PCR扩增标记法探针标记 PCR扩增标记法的原理与普通的核酸PCR相同。即Taq DNA多聚酶以DNA为模板,在特异引物引导下,在PCR仪中合成cDNA探针。由于在反应体系中加入一定量的标记dNTP,因此扩增的同时又是一个标记过程。cDNA探针PCR扩增法标记原理
研究人员首次在自然界分子尺度上发现分形
近日,一项发表于《自然》的研究报道了细长聚球藻这种蓝细菌产生的一种酶——柠檬酸合酶,可以自我组装形成谢尔宾斯基三角形。这是一种在较小尺度上重复的数学分形。分形简单来讲就是一个几何形状,它可以分成数个部分,分出来的每一部分与这个几何形状整体缩小后的形状近似,即具有自相似性。宏观尺度的分形在自然界中普遍
美国研究人员从分子水平中破解了长期酗酒伤身秘密
长期酗酒会导致肌肉无力,美国研究人员21日在《细胞生物学杂志》上报告说,他们从分子水平上破解了酗酒伤身的秘密。长期酗酒会影响一种关键的线粒体蛋白,从而导致线粒体无法自我修复,并损害肌肉的再生能力。 线粒体主要为人体细胞提供能量。在多个组织的细胞中,受损的线粒体会通过与其他线粒体融合交换物质
研究人员研发高性能分子数量性状基因座定位方法
华南农业大学动物科学学院教授张哲团队与丹麦奥胡斯大学教授房灵昭团队合作,成功研发出基于线性混合模型的高性能分子数量性状基因座(分子QTL)定位方法OmiGA(官网:https://omiga.bio/)。近日,相关成果在线发表于《自然-通讯》。论文共同通讯作者张哲指出,该方法针对家养动物复杂亲缘关系
研究人员发展底物诱导组装大环超分子催化新策略
在酶催化过程中,当底物和酶相互接近时,能诱导酶的结构发生变化,使之与底物互相适应,进而促进相互结合。这种诱导-契合现象被认为是酶催化的重要特征之一,是酶催化具有高效率和高选择性的重要原因。与之相比,在人工催化体系中,对底物诱导-契合动态催化过程的研究较为少见。对上述过程的研究,可加深人们对催化过
研究人员首次在自然界分子尺度上发现分形
近日,一项发表于《自然》的研究报道了细长聚球藻这种蓝细菌产生的一种酶——柠檬酸合酶,可以自我组装形成谢尔宾斯基三角形。这是一种在较小尺度上重复的数学分形。分形简单来讲就是一个几何形状,它可以分成数个部分,分出来的每一部分与这个几何形状整体缩小后的形状近似,即具有自相似性。宏观尺度的分形在自然界中普遍
Nature子刊:研究人员开发出阻断感冒病毒的新分子
伦敦帝国学院(Imperial College)化学系的Edward Tate博士领导的科学家们在《Nature Chemistry》杂志以一篇题为“Fragment-Derived Inhibitors of Human N-Myristoyltransferase Block Capsid
中国学者葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种,成为植物品种选
武汉植物园葡萄基因组学研究取得新进展
葡萄是世界上第二大果树作物,鲜果及用其加工品葡萄酒一直广受消费者喜爱。随着社会对葡萄需求量进一步增加,如何高效快速地培育优良葡萄品种是目前葡萄产业发展的瓶颈。近年来,通过新一代测序技术和生物信息学手段相结合,对植物基因组结构和特点深入解析,将获得的信息应用于分子辅助或基因工程育种
新方法可放大检测超低浓度生物标记分子
本周《自然―纳米技术》介绍了一种检测方法,可让我们的肉眼有选择地判断一部分疾病生物标记分子的存在。该项研究发现将潜在地有助于资源受限国的疾病诊断。 医学诊断中经常用到的分析工具是一种传统的夹层酶联免疫吸附试验装置。 在该装置中,待检测的目标分子和固定在底物上的捕获抗体相结合,然后再与
多研究组Nature子刊解析血管新生特异标记分子
1月19日,国际学术期刊Nature Communications 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所周斌组与美国贝勒医学院教授Wythe,上海生科院生物化学与细胞生物学研究所研究员惠利健,营养所研究员方靖、余鹰及段胜仲等合作的最新研究进展:Genetic Targeting
分子标记在物种亲缘关系和系统分类中的应用
分子标记广泛存在于基因组的各个区域,通过对随机分布于整个基因组的分子标记的多态性进行比较,就能够全面评估研究对象的多样性,并揭示其遗传本质。利用遗传多样性的结果可以对物种进行聚类分析,进而了解其系统发育与亲缘关系。分子标记的发展为研究物种亲缘关系和系统分类提供了有力的手段。
新型分子标记物实现可预测的帕金森病细胞治疗结果
6月15日,The Journal of Clinical Investigation在线发表了题为《人类中脑多巴胺能神经细胞分化标志物预测帕金森病细胞治疗结果》的研究论文。该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、灵长类神经生物学重点实验室、上海脑科学与类脑研究中心陈跃
量子点标记技术实现分子马达在活细胞的示踪
基于量子点的单分子荧光示踪技术,对于体外研究分子马达在细胞骨架上的行走模式具有重要意义。目前对于细胞内分子马达运动特性的研究,是通过对内吞体、黑素体等细胞器的示踪而间接实现的。这些细胞器通过分子马达运输,因此,对细胞器的运动监测可间接分析分子马达的运动特性。巴黎第六大学Giovanni Capp
研究人员发布全基因组单核苷酸变异数据库
10月22日,国际学术期刊Genome Biology 以PGG.SNV: understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人员从从基因组水平揭示食肉目染色体进化规律
染色体进化是物种形成和演化的重要驱动因素。具有显着核型差异的食肉目动物为染色体进化研究提供了很好的研究素材。虽然前人通过比较染色体涂色法建立了食肉目内许多物种的染色体比较图谱,但这些研究的分辨率比较低,尚没有深入到精细的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物种间的共线性区块、染色体重排以
谢晓亮:当单分子遇上基因组学
当单分子遇上基因组学,它们会擦出什么样的火花?著名华人学者谢晓亮(Sunney Xie)博士围绕这个话题,在《美国医学会杂志》(JAMA)上发表了文章。谢博士现任哈佛大学化学及化学生物学系教授,也任北京大学生物动态成像中心主任。 谢博士写道,单分子成像和操作的进步导致了单分子生物学的出现。由于
基因组所抗癌药物分子机制研究获进展
近日,中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员雷红星及其研究组开展的“抗癌药物的分子机制研究”取得阶段性进展,其研究论文Early stage intercalation of doxorubicin to DNA fragments observed in mol
《基因组生物学》:孤独是一个分子
已经知道一个人的社交环境能够影响他的健康。与社会隔离的人往往死亡率较高。在最新一期的《Genome Biology》杂志上发表的首项此类研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员从慢性、严重孤独者的免疫细胞中发现了一种不同的基因表达模式。 这些发现揭示出社会孤立感与驱动炎症的基因活性改变有关。