《基因组生物学》:孤独是一个分子
已经知道一个人的社交环境能够影响他的健康。与社会隔离的人往往死亡率较高。在最新一期的《Genome Biology》杂志上发表的首项此类研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员从慢性、严重孤独者的免疫细胞中发现了一种不同的基因表达模式。 这些发现揭示出社会孤立感与驱动炎症的基因活性改变有关。这项研究为了解社交因素为何与心脏病、病毒感染和癌症风险的增加有关。 此前已经知道孤独的人的死亡率要比一般人高。现在,研究人员试图确定出这种风险是由于社会资源(如身体或经济援助)的减少,还是因为社会孤立对人体功能产生生物学影响。 新的研究证明,社会隔离的生物学影响已经深入到一些我们最基本的基因相互作用过程。研究人员发现,免疫细胞基因表达的改变尤其与社会距离的主观经验有关。这种差异独立于其他已知的风险因子,如健康状况、年龄、体重和用药情况。这些改变甚至还独立于一个人社会网络的客观大小。 Cole和他的同事使用DNA芯片来分析1......阅读全文
细胞化学词汇孤独基因
中文名称:孤独基因外文名称:orphan gene类 型:单个分立基因特 点:成串重复序列衍生定 义:孤独基因是在成簇的基因家族中通过染色体重排而分散到其他位置上的成员。
TLP基因的表达模式分析
实验概要本实验对水稻、拟南芥及杨树的TLP基因表达模式进行了分析,为进一步研明植物中TLP基因的功能奠定基础。实验步骤1. 水稻TLP基因的RT-PCR分析 1) 植物材料选取水稻的根、茎、叶、花和种子的新鲜组织用于RNA的提取。水稻材料采集后,用液氮速冻,以保证RNA不被降解,然后冻存于-70
基因表达的调控模式介绍
转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白质结合位点,具有调
Nature揭示多变的基因表达模式
脊椎动物早期胚胎发育受到一些基因以及它们的“语法”控制。解译这一语法或许有助于了解畸形或癌症的形成,并开发出一些新的治疗药物。第一次,一项研究发现在斑马鱼的不同发育阶段基因表达过程中存在各种将DNA转录为RNA的机制。研究人员将这项研究发表在《自然》(Nature)杂志上。 在对几个基因组进
单身狗更爱生病,太残忍了
之前的研究已经早有结论,即孤独可能是一个潜在的健康风险,甚至会增加人们过早死亡的概率,具体原因尚未明确。一项发表在《PNAS》的研究已经显示,研究人员发现了孤独感可能会影响人们健康的一种方法:它可能会触发细胞层次的变化,从而可能会降低一个人的对抗病毒感染能力的。 在一项涉及到141老年人的研究
小桐子花芽中响应细胞分裂素的基因表达模式
能源植物小桐子(Jatropha curcas L.)为大戟科多年生木本植物,其种子含油量约40%,被认为是一种很有应用潜力的能源植物。然而,由于小桐子的雄花多、雌花少、产量低,生产成本高,阻碍了小桐子的产业化种植。因此,进行小桐子花发育调控机制的研究,有助于改良小桐子农艺性状、培育高产品种。
研究揭示细胞衰老过程中基因表达模式及变化规律
细胞衰老是一种细胞生长停滞状态,与生物体衰老密切相关。研究表明,衰老细胞的异常堆积,会通过分泌细胞衰老相关分泌表型(SASP)导致机体慢性炎症,引发各种衰老相关疾病,如癌症、阿尔兹海默症等。因此,探究细胞衰老过程中调控机制,或可为生物体衰老和相关疾病提供新的干预视角。 细胞衰老过程是一个由多种
-感觉孤独?也许你是生病了
曾有研究发现,孤独也许是一个健康威胁,它甚至能增加一个人早亡的风险,但科学家们尚未找到其中的缘由。现在,科学家们发现了孤独影响一个人健康的一种方式:孤独可能会导致细胞内的基因表达发生变化,降低一个人对抗病毒感染的能力。 在一项由141名老年人参与的研究中,研究人员们调查了孤独与白细胞(帮助身体
孤独基因的定义
孤独基因是在成簇的基因家族中通过染色体重排而分散到其他位置上的成员。
Cell挑战传统观点,提出基因表达新模式
与普遍的科学观点相反,来自荷兰乌特勒支大学医学中心(UMC)的Frank Holstege教授发现,许多的基因被默认开启。 个体之间的遗传差异可影响疾病的起因和治疗,这推动了科学家们去展开更大规模的遗传研究。然而,我们有时候却似乎缺乏最基本的遗传学认知。 Holstege研究小组证实
Cell挑战传统观点,提出基因表达新模式
与普遍的科学观点相反,来自荷兰乌特勒支大学医学中心(UMC)的Frank Holstege教授发现,许多的基因被默认开启。 个体之间的遗传差异可影响疾病的起因和治疗,这推动了科学家们去展开更大规模的遗传研究。然而,我们有时候却似乎缺乏最基本的遗传学认知。 Holstege研究小组证实
原核生物基因表达调控模式及其分子机制
原核生物基因的表达调控最重要的特点是操纵子模式,从调控水平来看主要在转录水平,即对RNA合成的调控,翻译水平次之。通常有两种方式:①起始调控,即启动子调控;②终止调控,即衰减子调控。原核基因组的调控机制:通过负调控和正调控因子所进行的复合调控,阻遏蛋白与操纵基因结合,妨碍RNApol与P结合形成开放
英研究发现孤独者大脑异于常人
英国伦敦大学学院的研究人员在最近一期《当代生物学》杂志上发表文章称,孤独者的大脑结构与常人不同,负责解析他人目光注视等社交线索的大脑区域内灰质较常人少,导致其难以判定他人发出的社交信号,进而不愿与他人交流。 在该项研究中,研究人员征招了108名身体健康的成年志愿者,通过一系列测试将他们的孤独程度进
《基因组生物学》:孤独是一个分子
已经知道一个人的社交环境能够影响他的健康。与社会隔离的人往往死亡率较高。在最新一期的《Genome Biology》杂志上发表的首项此类研究中,来自美国加州大学洛杉矶分校的研究人员从慢性、严重孤独者的免疫细胞中发现了一种不同的基因表达模式。 这些发现揭示出社会孤立感与驱动炎症的基因活性改变有关。
婴儿鼻、肺细胞的RNA表达模式显著相似
根据罗切斯特大学医学中心(URMC)最新的研究发现婴儿鼻细胞与肺部细胞非常类似,这一发现可使呼吸道合胞体病毒(RSV)和其他婴儿肺部疾病的诊断更精确。 患呼吸道疾病的婴儿十分脆弱,因此试图获取肺部样本是不安全的,该研究发表在科学报告上,为多年来受到挑战的医生提供了一条潜在诊断途径。然而,鼻细
细胞的分化与基因表达
细胞分化是个体发育过程中细胞之间产生稳定差异的过程。所以,细胞分化是指同源细胞通过分裂,发生形态、结构与功能特征稳定差异的过程。细胞分化的实质是基因选择性表达的结果,在个体发育过程中基因按照一定程序相继激活的现象,称为基因的差次表达(differential expression)或顺序表达(Seq
基因表达模式或可精准确定死者死亡时间
英国《自然·通讯》杂志近日发表的一篇遗传学论文称,欧洲科学家根据生物库的数据分析表明,死亡引起的不同组织的基因表达变化,将可用于估计死者的死亡时间。该研究认为,通过分析少量可用的组织(如肺或皮肤组织),即可精准确定死亡时间,这或将对法医鉴定产生一定影响。 人们现在已经知道,绝大多数常见的、与疾
《基因组生物学》:慢性孤独会降低人体免疫功能
美国科学家最近研究发现,孤独可能会改变体内基因的表达,慢性孤独(chronically lonely)的人体内免疫系统的防御功能会因此降低。这一研究一旦确证,将有助于医生更好地防治那些会因孤独而恶化的疾病,比如心脏病、感染、与年龄有关的痴呆以及某些种类的癌症等。相关论文发表在《基因组生物学》上。 生
免疫细胞的基因表达或能帮助预测机体对流感的易感性
近日,一项刊登在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中,来自斯坦福大学医学院的研究人员通过研究发现,免疫细胞的基因表达或许能够有效预测机体对流感的易感性,文章中,研究者表示,表达KLRD1的自然杀伤细胞或许能作为机体对流感易感性的特殊生物标志物。 研究者Erika Bongen说
单个脑细胞的基因表达谱
科研人员报告了一种根据基因表达谱为人类大脑的单个细胞分类的方法。人类大脑含有许多种类的细胞,它们的基因表达模式有差别。此前为这些细胞类型分类的方法一直限于使用几个基因或蛋白质标记物以及分析整个细胞群。Stephen Quake及其同事使用单细胞RNA测序分析了来自人类大脑组织的466个个体细胞的
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
昆明动物所成功揭示泛肿瘤存在基因表达紊乱共有模式
挖掘肿瘤大数据有助于识别和总结肿瘤发生、发展过程的分子变化规律。然而,肿瘤组织高度异质性、批次效应等因素是肿瘤数据分析的重要难题,而目前常用的转录组数据分析方法对于肿瘤离群值极度敏感,容易产生假阴性结果。针对此,中国科学院昆明动物研究所科研人员开发了一种新的不依赖均一化、非参的高维大数据分析算法
《自然·通讯》:基因表达模式或可精准确定死者死亡时间
英国《自然·通讯》杂志近日发表的一篇遗传学论文称,欧洲科学家根据生物库的数据分析表明,死亡引起的不同组织的基因表达变化,将可用于估计死者的死亡时间。 该研究认为,通过分析少量可用的组织(如肺或皮肤组织),即可精准确定死亡时间,这或将对法医鉴定产生一定影响。 人们现在已经知道,绝大多数常见的、
分子遗传学词汇孤独基因
中文名称:孤独基因外文名称:orphan gene定义:孤独基因是在成簇的基因家族中通过染色体重排而分散到其他位置上的成员。
建立茎尖细胞特异基因表达图谱
基因差异表达是细胞分化和不同细胞类型形式特异功能的基础。细胞特征的转录图谱对于了解不同类型细胞如何生长发育、响应环境至关重要。但植物细胞由细胞壁固着,不易分离,很难获得细胞类型特异的转录数据。 中国科学院遗传与发育生物学研究所焦雨铃研究组在之前的工作中建立了器官边界区的细胞特异表达图谱 (Ti
胞质杂种和重建细胞的基因表达
为了更直接地研究核、质相互作用对细胞核基因表达变化的作用,运用了“细胞质杂交”(cybridization)和细胞重建(细胞核移植)技术。胞质杂种是由一个无核细胞或去核细胞与一个完整细胞融合而成的,开始时这个混合细胞质内只含有一个细胞核。细胞核的遗传标记(如抗溴脱氧尿苷)和线粒体标记(如抗氯霉素)的
华人教授:细胞基因表达调控新见解
最近,康奈尔大学的研究人员,通过在纳米级的精密度上追踪蛋白质在活细胞中的运动,对细胞调节其基因表达的方式,获得了新的认识。 每个活细胞里的DNA都包含着“基因蓝图”,指导细胞制造所需要的蛋白质。当需要一种特定的蛋白质时,一个调节蛋白会结合到DNA链上适当的位置,从而导致相邻的基因被“表达”而制
外源基因在真核细胞表达技术
生化方法l 磷酸钙介导的质粒DNA转染真核细胞1. 转染前24 h,通过胰酶消化收集细胞,用适当的完全培养基以1×105至4×105细胞/cm2的密度平铺细胞于60 mm组织培养皿或12孔板上。于含5%~7% CO2的37℃温箱孵育20~24 h。转染前1 h换液。2.
Science:新型单细胞基因表达检测技术
发表在最新一期《科学》(Science)杂志上的一篇研究论文,证实了一种新型的大规模平行测序技术可借助于新一代测序(NGS)在单细胞水平上检测基因表达。 论文作者、来自Cellular Research, Inc公司的Christina Fan博士、Glenn Fu博士以及Stephen Fo
外源基因在真核细胞表达技术
生化方法* 磷酸钙介导的质粒DNA转染真核细胞转染前24 h,通过胰酶消化收集细胞,用适当的完全培养基以1×105至4×105细胞/cm2的密度平铺细胞于60 mm组织培养皿或12孔板上。于含5%~7% CO2的37℃温箱孵育20~24 h。转染前1 h换液。2.按照下属方法制备磷酸钙-DNA沉淀: