非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展

非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。相关研究成果分别发表在Genomics和Open Biology上。 研究人员鉴定和注释了112个仿刺参miRNA家族,其中70个为新家族;提出了miRNA基因簇进化的“功能性表达”新模型,揭示了表达量控制和背景选择作用在miRNA基因簇形成中的重要作用,发现仿刺参表达量最高的新miRNA家族聚集在一个特殊的n2基因簇中,通过抑制RFP和CTBP进而激活Wnt通路促进肠道再生。在tRNA研究方面,发现各种tRNA的拷贝数与其翻译的特定氨基酸的转录组丰度成正比,提示二者之间通过协同进化提高翻译效率;其中参与快速响应的临时表达基因倾向于牺牲......阅读全文

miRNA-mimics-miRNA-inhibitor

miRNA mimics 是模拟生物体 内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。miRNA inhibitor 是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。近年来人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已经成功应用于沉默预期靶

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

miRNA海绵—长效抑制miRNA

随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困难得多。为什么

氨酰tRNA

中文名称氨酰tRNA英文名称aminoacyl tRNA定  义转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成,进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

甲硫氨酸tRNA

中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定  义真核生物的一种起始tRNA,携带甲硫氨酸进入核糖体,进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

tRNA的结构

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展

  非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究获进展

非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。相关

非编码RNA调控仿刺参肠道再生和皂苷合成研究新进展

  非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究较缺乏。中国科学院海洋研究所研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海参肠道再生和皂苷合成等生物学过程中的重要作用。

仿刺参肠道再生和皂苷合成研究取得重要进展

  非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究非常缺乏。  近日,记者从中科院海洋所了解到,该所实验海洋生物学重点实验室研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在海

仿刺参肠道再生和皂苷合成研究取得重要进展

   非编码RNA中的miRNA和tRNA在基因表达调控中扮演重要角色,然而在棘皮动物中相关研究非常缺乏。  近日,记者从中科院海洋所了解到,该所实验海洋生物学重点实验室研究员李富花课题组通过多组学数据整合分析,揭示了棘皮动物miRNA和tRNA基因的组织结构特点、进化历史和表达调控机制,以及它们在

tRNA测序,约吗?

  高通量RNA测序(RNA-seq)技术的使用让我们认识了细胞中无比精彩的RNA世界。然而,目前的方法无法检测高度修饰或大量折叠的RNA,如tRNA。近日,《Nature Methods》上的两种方法通过在文库制备前去除tRNA的修饰,解决了tRNA测序的技术难题。  尽管tRNA被认为是看家RN

tRNA的结构特征

tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁平状,长

tRNA的功能特点

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA的功能介绍

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA的结构基础

tRNA的二级结构如图1所示,其在原核生物和真核生物均相对保守。主要结构有D-loop(D环)、T(C)-loop(T环)、Anticodon-loop(反密码子环)、Accepter Arm(受体臂)、3'端CCA保守序列、Discriminator(识别碱基)、Variable-loop

tRNA转录加工过程

主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna

tRNA的结构介绍

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

miRNA研究

一、miRNA研究的基本问题和研究方法二、miRNA研究的综合解决方案1. miRNA微阵列芯片服务Agilent miRNA 芯片(21.0) Affymetrix miRNA 4.0 芯片2. miRNA测序服务  miRNA-seq文库构建流程  miRNA测序数据分析流程3. miRNA R

什么叫做外源性RNA和内源性RNA

核糖核酸(缩写为RNA,即RibonucleicAcid),存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。RNA由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

苯酚法制备酵母tRNA

试剂、试剂盒 DEAE 纤维素 二乙醇胺 (TEA) 溶液 0.lmol LTEA 缓冲液 0.lmol L 氯化钠含 0.lmoi. LTEA 缓冲液 12mol L 氯化钠含 0.lmol LTEA 缓冲液 lmol L 氯化钠含 0.lmol LTEA 缓冲液 乙醚 水饱和酚 乙醇仪器

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

苯酚法制备酵母tRNA

            试剂、试剂盒 DEAE 纤维素   二乙醇胺 (TEA) 溶液 0.lmol LTEA 缓冲液  0.lmol L 氯化钠含 0.lmoi. LTEA 缓冲液

同工tRNA的结构特点

同工tRNA(cognate tRNA):指几个代表相同氨基酸、能够被一个特殊的氨酰-tRNA合成酶识别的tRNA。

细胞化学词汇起始tRNA

起始tRNA initiation tRNA是指能特异性地认别mRNA上的起始密码子,是使蛋白质合成开始的tRNA。在细胞中有两种甲硫氨酸tRNA分子,其中的一种就起这种作用。在大肠杆菌中,已接受甲硫氨酸的tRNAfMet在被甲酰化之后,以其30S核糖体亚基与mRNA共同结合,使蛋白质合成开始。即使

关联tRNA的结构特点

中文名称关联tRNA英文名称cognate tRNA定  义由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

关于tRNA的功能简介

  作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当

细胞化学词汇阻抑tRNA

中文名称:阻抑tRNA英文名称:suppressor tRNA定  义:能够消除信使核糖核酸(mRNA)突变有害结果的突变转移RNA(tRNA)。生物体内蛋白质基因或mRNA的突变往往产生有害的结果,但它可被同一基因的第二次突变或其他基因(包括tRNA基因)的突变所消除。应用学科:生物化学与分子生物