关于基因表达系列分析的实验路线的介绍

(1) 以biotinylated oligo(dT)为引物反转录合成cDNA,以一种限制性内切酶(锚定酶 Anchoring Enzyme, AE)酶切。锚定酶要求至少在每一种转录物上有一个酶切位点,一般4碱基限制性内切酶能达到这种要求,因为大多数mRNA要长于256碱基(44)。通过链霉抗生物素蛋白珠收集cDNA3′端部分。对每一个mRNA只收集其polyA尾与最近的酶切位点之间的片段。 (2) 将cDNA等分为A和B两部分,分别连接接头A或接头B。每一种接头都含有标签酶(Tagging Enzyme TE)酶切位点序列(标签酶是一种Ⅱ类限制酶,它能在距识别位点约20碱基的位置切割DNA双链)。接头的结构为引物A/B序列+标签酶识别位点+锚定酶识别位点。 (3) 用标签酶酶切产生连有接头的短cDNA片段(约9~10碱基),混合并连接两个cDNA池的短cDNA片段,构成双标签后,以引物A和B扩增。 (4) 用锚定酶切......阅读全文

关于基因表达系列分析的实验路线的介绍

  (1) 以biotinylated oligo(dT)为引物反转录合成cDNA,以一种限制性内切酶(锚定酶 Anchoring Enzyme, AE)酶切。锚定酶要求至少在每一种转录物上有一个酶切位点,一般4碱基限制性内切酶能达到这种要求,因为大多数mRNA要长于256碱基(44)。通过链霉抗生

基因表达的系列分析实验

SAGE(Velculescuetal.1995) 是基于 PCR 技术的一种高灵敏度研究基因表达的方法,可得到 mRNA 文库的定性及定量信息。自 1995 年此技术产生以来,发表了大量的相关文章,表明 SAGE 可同时检测大量基因的表达水平的变化。实验材料玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒溶液与缓冲液引

基因表达的系列分析实验

实验材料 玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 一、一般原则若用于 SAGE 的 RNA 有足够的量,最好用 2.5~5 ug polyA+RNA, 可按实验方案 A 进行。这里我们还提供了实验方案 B,它在多

基因表达的系列分析实验

            实验材料 玻璃及塑料器皿 试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物

基因表达系列分析实验(SAGE)

实验材料感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · Cl仪器、耗材微量离心

基因表达的系列分析

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因表达系列分析实验(SAGE)(一)

实验方法原理 实验材料 感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒 糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder 聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · C

基因表达系列分析实验(SAGE)(二)

31. 乙醇沉淀:11.5 ml 样品10 ul SeeDNA100 ul 糖原5.1 ml 7.5 mol/L 乙酸铵38.3 ml 100% 乙醇干冰/甲醇浴 15 min。然后室温溶化 2 min。32. 轻轻涡旋混匀,台式离心机的吊桶转子室温约 3000 g (4000 r/min) 离心

基因表达系列分析实验(SAGE)(三)

58. 用 1:10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察,分出感兴趣的区带。59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中(用 21-G 针头刺的)。60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 ml 的硅烷化的离心管里

基因表达系列分析实验(SAGE)(四)

83. 用作测序的 2 ul PCR 产物(所需的确切用量取决于测序的方案,并应当优化)用下述方法处理:0.1 ul 外切核酸酶 I0.1 ul 虾碱性磷酸酶1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl,pH 8. 0加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。84. 在热循环仪上进行反应

基因表达系列分析简介

  1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术,能同时对上千个转录本进行研究。  SAGE是一种快速分析基因表达信息的技术,它通过快速和详细分析成千上万个表达序列标签(Expressed Sequenc

基因表达系列分析的优点和应用的介绍

  SAGE是一项快捷、有效的基因表达研究技术,任何具备PCR和手动测序器具的实验室都能使用这项技术,结合自动测序技术能够在3个小时内完成1000个转录物的分析。另外使用不同的锚定酶(识别5~20碱基的Ⅱ类核酸内切酶),使这项技术更具灵活性。  首先SAGE可应用于人类基因组研究。1995年 Vel

什么是基因表达的系列分析?

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因表达系列分析的原理简介

  第一、一个9~10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息,能够唯一确认一种转录物。例如,一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物(49),而人类基因组估计仅能编码80000种转录物,所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。  第二、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行

关于基因表达的介绍

  基因的表达过程是将DNA上的遗传信息传递给mRNA,然后再经过翻译将其传递给蛋白质。在翻译过程中tRNA负责与特定氨基酸结合,并将它们运送到核糖体,这些氨基酸在那里相互连接形成蛋白质。这一过程由tRNA合成酶介导,一旦出现问题就会生成错误的蛋白质,进而造成灾难性的后果。值得庆幸的是,tRNA分子

关于基因表达的折叠的介绍

  刚从mRNA序列翻译过来的蛋白质都是未折叠或无规卷曲的多肽,没有任何的三维结构。氨基酸彼此相互作用使得多肽从无规卷曲折叠成其特征性和功能性三维结构。氨基酸序列决定l了蛋白质的三维结构,且正确的三维结构对于功能至关重要,尽管功能蛋白的某些部分可能仍未展开。伴侣蛋白的酶有助于新形成的蛋白质获得折叠,

关于基因表达的转录机制介绍

  基因表达的转录过程由RNA聚合酶(RNAP)进行,以DNA为模板,产物为RNA。RNA聚合酶沿着一段DNA移动,留下新合成的RNA链。  基因组DNA由两条反向平行和反向互补链组成,每条链具有5'和3'末端。这两条链分别称为“模板链”(产生RNA转录物的模板)和“编码链”(含有转

关于基因表达载体的基本介绍

  基因表达载体的构建(即目的基因与运载体结合)是实施基因工程的第二步,也是基因工程的核心。其构建目的是使目的基因能在受体细胞中稳定存在,并且可以遗传给下一代,同时,使目的基因能够表达和发挥作用。  基因工程(genetic engineering)  构成:启动子、终止子、标记基因、目的基因  又

关于基因表达顺式作用的介绍

  顺式作用是生物体进行基因表达调节的方式之一,与“反式作用”相对。顺式作用指的是,调节因子是与被调节基因同处于一条DNA链上的另一端DNA片段而进行的调节。   以二倍体生物为例,对于某一位置的基因,两条同源染色体上会有一对等位基因和一对相应的顺式调节因子。如果其中一个顺式调节因子发生突变而产生

关于基因表达反式作用的介绍

  与“顺式作用”相对,反式作用指的是其作用范围可以影响到不同DNA链上的基因(顺式作用的调控仅限于同一条链上的基因),故名。  反式作用的调控原理是借助产生有调控功能的蛋白质而进行的。由于蛋白质合成之后的选择性结合不限于表达它的这条DNA链,所以相比于顺势作用,反式作用的调控范围更广。  例如,某

关于LacZ基因的时空表达介绍

  转基因小鼠实验系统已被广泛用于单一基因功能的研究,如组织特异表达和发育程序的调控。产生转基因小鼠最普遍的方法是将DNA通过显微注射注入受精卵的原核中。在研究小鼠胚胎发育过程中外源基因的时空表达方面,将融合基因注射进入小鼠受精卵原核中更是一条行之有效的途径。  通过上述方法,将SV40早期启动子和

关于基因表达的转录调控介绍

  基因表达的转录调控可分为三种主要途径:1)遗传调控(转录因子与靶标基因的直接相互作用);2)调控转录因子与转录机制相互作用,3)表观遗传调控(影响转录的DNA结构的非序列变化)。  通过转录因子直接调控靶标DNA表达是最简单和最直接的转录调控改变转录水平的方法。基因的编码区周围通常都具有几个蛋白

关于基因表达的折叠机制介绍

  基因表达机制:刚从mRNA序列翻译过来的蛋白质都是未折叠或无规卷曲的多肽,没有任何的三维结构。氨基酸彼此相互作用使得多肽从无规卷曲折叠成其特征性和功能性三维结构 [3]。氨基酸序列决定l了蛋白质的三维结构,且正确的三维结构对于功能至关重要,尽管功能蛋白的某些部分可能仍未展开 [4]。伴侣蛋白的酶

关于胀泡与基因表达的介绍

  在一种摇蚊 (C.pallidivittatus)唾腺前叶细胞的染色体4上,近着丝点处有巴尔比安尼环4,这些细胞能分泌特异的蛋白质颗粒。然而,在另一种摇蚊(C.tentanus)中则没有巴尔比安尼环4,也没有这种分泌颗粒。这两种动物的杂交试验表明,编码分泌颗粒蛋白质的结构基因位于染色体4的巴尔比

关于基因表达的基本信息介绍

  基因表达产物通常是蛋白质,但是非蛋白质编码基因如转移RNA(tRNA)或小核RNA(snRNA)基因的表达产物是功能性RNA。  所有已知的生命,无论是真核生物(包括多细胞生物)、原核生物(细菌和古细菌)或病毒,都利用基因表达来合成生命的大分子。  基因表达可以通过对其中的几个步骤,包括转录,R

关于蛋白表达系统的分析介绍

  原核蛋白表达系统既是最常用的表达系统,也是最经济实惠的蛋白表达系统。原核蛋白表达系统以大肠杆菌表达系统为代表,具有遗传背景清楚、成本低、表达量高和表达产物分离纯化相对简单等优点,缺点主要是蛋白质翻译后缺乏加工机制,如二硫键的形成、蛋白糖基化和正确折叠,得到具有生物活性的蛋白的几率较小。  酵母蛋

关于基因表达的机制RNA加工的介绍

  基因表达的机制:原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA),但真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优

关于DNA重组的基因表达载体的介绍

  将目的基因与运载体结合的过程,实际上是不同来源的DNA重新组合的过程。如果以质粒作为基因表达运载体,  首先要用一定的限制酶切割质粒,使质粒出现一个缺口,露出黏性末端。然后用同一种限制酶切断目的基因,使其产生相同的黏性末端(部分限制性内切酶可切割出平末端,拥有相同效果)。将切下的目的基因的片段插

关于基因表达的翻译机制的介绍

  成熟RNA是非编码RNA的最终基因表达产物 。但信使RNA(mRNA)则不同,它们是编码一种或多种蛋白质合成的遗传信息的载体。 每个mRNA由三部分组成:5'非翻译区(5'UTR),蛋白质编码区或开放阅读框(ORF)和3'非翻译区(3'UTR)。编码区携带由遗传密

关于myc基因的结构及表达的介绍

  c-myc基因是禽类髓细胞病毒(AMN)MC-29的V-myc的细胞同源序列,从MC-29病毒 中分离的V-myc是gag-myc融合体,它由1358个bp的gag基因与1568个bp的V-myc基因共 同组成.C-myc基因由3个外显子及2个内含子组成,第一个外显子不编码,只起调节作 用,只有