基因诊断的聚合酶链反应方法介绍
21世纪,基因分析和基因工程技术有了革命性的突破,这主要归功于聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的发展和应用。应用PCR技术可以使特定的基因或DNA片段在短短的2-3小时内体外扩增数十万至百万倍。扩增的片段可以直接通过电泳观察,也可用于进一步的分析。这样,少量的单拷贝基因不需通过同位素提高其敏感性来观察,而通过扩增至百万倍后直接观察到,而且原先需要一、二周才能作出的诊断可以缩短至数小时。 首先应按照欲检测的DNA的5’和3’端的碱基顺序各合成一段长约17-20余个碱基的寡核苷酸作为引物(primer),其次是将待检测的DNA变性后,加入四种单核苷酸(dNTP)、引物和耐热聚合酶。在较低的温度,引物将与待扩增的DNA链复性结合,然后的聚合酶的作用下,利用溶液中的核苷酸原料,不断延伸合成新互补链,这样,一条DNA双链就变成了两条双链。若继续按照变性(92-95℃)→复性(40-60℃)→......阅读全文
逆转录聚合酶链反应的技术应用
RT-PCR使RNA检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。
反转录聚合酶链反应的功能和特点
RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。首先经反转录酶的作用,从RNA合成cDNA,再以cDNA为模板,在DNA聚合酶作用下扩增合成目的片段。RT—PCR
聚合酶链反应(PCR)-技术引物的最终评估
当我们经过初次筛选和二次筛选后得到的那对引物便可以用于合成,合成后我们经过 PCR扩增可以对引物进行最终的评估。一是PCR扩增的特异性和效率。经过PCR条件优化后能否获得特异性条带,即无目的条带之外的多余条带。另外,PCR产物的量是否足够,即无不出带和条带很弱的现象。二是以DNA为模板设计引物时,P
逆转录聚合酶链反应的操作步骤
1. 总RNA的提取:见相关内容。2. cDNA第一链的合成:试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScript Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试
聚合酶链反应技术的临床应用及现状
PCR是英文Polymerase chain reaction的缩写,翻译过来,称为聚合酶链反应。PCR自1983年由美国加利福尼亚的Cetus公司的Mullis博士发明到现在,虽只短短的二十多年,但其在生命科学研究和临床分子诊断中,已毫无争议的成为“支点”工具。如果没有PCR,人类基因组计
反向聚合酶链反应的原理和应用特点
中文名称反向聚合酶链反应英文名称inverse PCR;iPCR定 义用于扩增已知序列的DNA旁侧未知序列的方法。即先用在已知DNA序列上没有识别位点的限制内切酶,切出包含已知DNA、而两端带有未知序列的区段,将切出的DNA区段环化,然后再按已知的DNA序列设计一对引物进行扩增。应用学科细胞生物学
实时逆转录聚合酶链反应的简介
逆转录-聚合酶链反应 (Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。再以cDNA为模板进行PCR扩增,而
实时聚合酶链反应的原理和应用特点
中文名称实时聚合酶链反应英文名称real-time PCR定 义一种定量测定样品中特定DNA序列的聚合酶链反应。即使用标记(最常用是荧光标记)的PCR引物,因而能够通过荧光监测到每一次PCR循环后扩增所得DNA产物的量,从连续监控下获得的反应动力学曲线,可推导得样品中被扩增模板DNA的原初含量。应
逆转录聚合酶链反应所需试剂
1.RMA提取试剂2.第一链cDNA合成试剂盒3.dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM4.Taq DNA聚合酶
聚合酶链反应(PCR)详细实验操作步骤
一、实验原理 聚合酶链反应(PCR)技术是在体外进行的由引物介导的酶促DNA扩增反应。PCR的原理是在模板DNA、PCR引物、四种脱氧核糖核苷酸(dNTP)及适当浓度的Mg2+存在的条件下,依赖于DNA聚合酶的体外酶促合成反应。两个引物分别位于靶序列两端,同两条模板的3’端互补,由此限定扩增片
何谓实时荧光聚合酶链反应定量检测?
在普通PCR扩增系统中,加入一个与靶基因序列特异互补的双荧光标记探针。5′端标记荧光发射集团,3′端标记荧光淬灭集团,当探针完整时,后者抑制前者而不发光。有靶基因存在时,在PCR复性阶段,探针与靶基因互补,PCR延伸中,由于Taq酶有5′-3′的外切酶活性,引物沿模板延伸至标记探针结合处,将5′端报
反转录聚合酶链反应(RTPCR)方法中常见的污染问题...
反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法中常见的污染问题及对策反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)是一种体外核酸扩增技术,它具有特异、敏感、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点,能在几个小时内完成从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的目的产物供分析研究和检测鉴定,所以近年来RT-PCR技
聚合酶链反应(PCR)技术的发展和应用1
第一节 概述 聚合酶链反应或多聚酶链反应(Polymerase Chain Reaction, PCR),又称无细胞克隆技术(“free bacteria”cloning technique),是一种对特定的DNA片段在体外进行快速扩增的新方法。该方法一改传统分子克隆技术的模式,不通过活细胞,操作
逆转录聚合酶链反应的注意事项
1. 在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。2. 为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。3. 内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免RNA定
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水
反转录聚合酶链反应的操作注意事项
1、合成cDNA的引物:合成cDNA引物时,通常采用随机六核苷酸引物能够有效地指导从RNA有效地合成第一链cDNA:2、避免RNA酶的污染:在合成cDNA第一链时,应使用RNA酶抑制剂,进行RT-PCR时,用于合成cDNA第一链的RNA不会对PCR有影响,因此没有必要用碱或RNA酶处理;3、不同来源
实时逆转录聚合酶链反应的操作步骤
1. 总RNA的提取:见相关内容。 2. cDNA第一链的合成:试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。现以GIBICOL公司提供的SuperScript Preamplification System for First Strand cDNA Synthes
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验
差异显示聚合酶链反应(PCR) 可促进在诸多物种中与污染暴露相关的新分子标志物的鉴定。至今,已有多种差异显示方法被详细描述。这里,我们描述了一种改良的RNA 随机引物触发的 PCR 方 法(RNAarbitrarily primed PCR, RAP-PCR) , 主要涉及通过 罗 丹 明(rhod
聚合酶链反应(PCR)技术的发展和应用2
第五节 PCR各处应用模式 一、兼并引物(Degenerate Primer)PCR 密码子具有兼并性,如表22-4,单以氨基酸顺序推测编码的DNA序列是不精确的,但可以设计成对兼并引物,扩增所有编码已知顺序的核酸序列。用兼并引物时寡核苷酸中核苷酸序列可以改变,但核苷酸的数量应相同。兼并度越低,
聚合酶链反应的四种脱氧三磷酸核苷酸介绍
四种脱氧三磷酸核苷酸(4×dNTPs) 在PCR反体系中dNTP终浓度高于50mmol/L会抑制Taq酶的活性,使用低浓度dNTP可以减少在非靶位置启动和延伸时核苷酸错误掺入,高浓度dNTPs易产生错误掺入,而浓度太低,势必降低反应物的产量。PCR常用的浓度为50~200μmol/L,不能低于
聚合酶链反应检测幽门螺杆菌70例
聚合酶链反应检测幽门螺杆菌70例1990年Hoshina等首行应用聚合酶链反应(PCR)成功检出胃粘膜活检标本内的Hp。我院从今年1995的1月份开始,在短短3个月中对70例胃镜受检者应用PCR检测幽门螺杆菌,并采用目前广泛使用的快速尿素酶试验作了对比,收到满意效果,报告如下。1 材料和方法1.1
核酸扩增检测仪临床应用
1.聚合酶链反应 可用于检测由基因点突变、获得启动子、基因易位、重排、扩增等导致的癌基因的异常激活、抑癌基因的失活及检测外源性肿瘤病毒。此外,检测致癌基因的表达水平对选择化疗方案也具有一定的指导意义。 2.聚合酶链反应直接测序 从最直观的核酸序列水平研究癌基因突变,为肿瘤的早期诊断及基因治
基因突变检测的检测方法及临床应用
常见检测方法 1.焦磷酸测序法 测序法的基本原理是双脱氧终止法,是进行基因突变检测的可靠方法,也是使用最多的方法。但其过程繁琐、耗时长,灵敏度不高,对环境和操作者有危害,故在临床应用中存在一定的限制。 2.单链构象异构多态分析技术 依据单链DNA在某一种非变性环境中具有其特定的第二构象,
酵母菌基因组转座子的诱变实验—-小载体聚合酶链反应
实验材料诱变转座子基因组文库质粒DNA试剂、试剂盒锚定囊泡引物1和2 、1 mol L MgCl2、普通小载体(UV)和mTn引物、转座子诱变酵母菌株、合适的限制性内切核酸酶(如AZmI或DraI)和缓冲液、10×T4 DNA连接酶缓冲液、5 mmol L ATP、400 U μL T4 DNA连接
剪接重叠延伸聚合酶链反应的原理和应用特点
中文名称剪接重叠延伸聚合酶链反应英文名称splicing overlapping extension PCR;SOE-PCR定 义利用一系列聚合酶链反应,使产物两端彼此重叠,以便剪接成长片段,其间越过某段序列可使之缺失的PCR方法。一些基因工程抗体就是用此法制备的。应用学科生物化学与分子生物学(一
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(一)
实验步骤 ##一、 从组织和培养细胞中分离RNA1.TRIzol试 剂(Invitrogen)。该试剂含有苯酚和硫氰酸盐化合物,操作时应穿实验服,戴手套,存放于 4°C 。2.氯仿。3.异丙醇。4.乙醇。5.焦炭酸二乙酯(DEPC) 处理的水。6.无DNA试剂盒(Ambion)。贮存于一 20°C
聚合酶链反应(PCR)-技术引物的二次筛选
引物的二次筛选是指在初次筛选出的几对引物中进一步筛选出适合我们进行特异、高效PCR扩增的那对引物。本步应注意以下两点,一是得到的一系列引物分别在Genebank中进行回检。也就是把每条引物在比对工具(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/) 的blast nr中进行同源
实时逆转录聚合酶链反应的注意事项
1、在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂。 2、为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。 3、内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。其目的在于避免R
荧光RNA随机引物触发的聚合酶链反应实验(二)
##六、从组织或培养细胞提取 RNARNA可以从各种来源的样本包括培养的细胞(例如神经元细胞、肝细胞等)和组织中分离得到(见 注 释 1) 。 mRNA 的 纯 化 对 FRAP-PCR 方法来说并不需要,因为mRNA 仅占细胞总 R N A 的 3 % 〜5 % (13)。因而在本章所描述
聚合酶链反应(PCR)-技术引物设计的注意事项
扩增已知基因时经过初次筛选和二次筛选后得到的引物基本上能够满足要求,但是当运用比较基因组学分离新基因时,设计引物还应注意以下两点:① 模板的选择。如果以DNA为模板设计引物, 首先在Genebank中找到与待分离新基因同源的其它物种的该基因。利用工具把已检索到的基因进行同源性比较,根据比较基因组定位