直接RNA测序、串联质谱法揭示新冠转录组和蛋白质组特征
此前，南开大学高山、阮吉寿等在中国预印本ChinaXiv网站发表论文，称新冠病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点。近日，发表在预印本网站bioRxiv上的一篇论文使用直接RNA测序和串联质谱法表明了SARS-CoV-2的转录组和蛋白质组的特征，揭示了细胞通道在去除了疑似Furin 蛋白酶切位点的S蛋白中诱导的框内缺失突变的证据。研究人员使用Oxford Nanopore的纳米孔DNA测序仪MinION进行直接RNA测序，确定了生长在Vero E6细胞中的SARS-CoV-2的转录组特征。该细胞系被广泛用于新型冠状病毒的增殖。研究揭示了病毒转录的模式(即亚基因组mRNAs)，通常符合冠状病毒的复制和转录预测模型。在编码S蛋白的亚基因组mRNAs中检测到24nt的框内缺失。这一特征在一半以上的转录本中被确认，并被预测将从S蛋白中移除一个疑似的Furin蛋白酶切位点。此前的研究表明，Furin蛋白酶切位点的存在是新冠病毒的一个重要......阅读全文
赛默飞在ASMS发布Orbitrap－Eclipse质谱－激活高端蛋白质组研究
分析测试百科网讯 2019年6月3日，赛默飞在ASMS 2019大会推出全新的Orbitrap Eclipse三合一超高分辨质谱仪，通过智能数据采集最大化获取研究信息并提高效率，其扩展的分析功能可重新激活高端蛋白质研究。Orbitrap Eclipse 三合一超高分辨质谱仪 面对日益复杂的学术
基于质谱的蛋白质组学，揭示不老分子的抗衰奥秘
——清华大学蛋白质化学与组学平台主管邓海腾教授专访 近年来， NAD+的前体NMN作为抗衰老保健品成为京东最畅销的商品，这是因为NAD+可能和每个人的健康寿命都有关系。这激励着更多科学家们开展研究，探索NAD+多靶标抗衰老的功效和机理。基于质谱的蛋白质组学研究方法也在NAD+的研究中发挥重要作
谭敏佳：色谱质谱双翼护航－助力蛋白质组学新突破
分析测试百科网讯 2021年9月23日，赛默飞双重新品线上直播发布会召开，重磅推出了Thermo Scientific™ TSQ™ Plus 三重四极杆质谱仪和Vanquish Neo UHPLC 系统，为蛋白质组学、精准医学、制药和生物制药、临床研究、转化研究等领域提供了从色谱到质谱的高效、高
ASMS－2023丨布鲁克质谱新品继续引领单细胞蛋白质组学
MS/MS扫描速度提升至300Hz的timsTOF Ultra，进一步推进空间蛋白质组学和单细胞多组学；新型离子源和微升流喷雾针、采集方法和软件带来更稳定、更灵敏、更快速的4D-蛋白质组学 01.timsTOF Ultra 质谱仪 timsTOF Ultra PASEF扫描速度提高至300
吴立刚研究组研发微量小RNA深度测序技术
中科院上海生科院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心（上海）吴立刚研究组与上海市计划生育研究所施惠娟研究组合作，优化建立了适用于微量样本的小RNA深度测序文库构建方法，并系统解析了小鼠早期胚胎发育过程中小RNA的动态变化及其生物学功能。相关研究成果日前在线发表于《科学进展》。 目前小
岛津携手质谱专家，北京共话组学发展 ——2023北京质谱专家沙龙组学专题会议
2023年8月17日，岛津企业管理（中国）有限公司举办的“2023质谱专家沙龙-组学专题会议”在北京成功召开。会议旨在促进质谱及组学行业专业人士交流、学习与合作。来自于国内各大高校及科研院所的四十余位专家学者参加了本次会议。 会议现场 主持人 岛津企业管理（中国）有限公司，分析计测事业部营业部，北京
首张人类蛋白质组测序草图绘成
据物理学家组织网19日报道，在人类基因组图谱（人类生命的基因“蓝图”）发布20年后，国际人类蛋白质组组织宣布，他们绘制出了人类蛋白质组首张测序草图，有望帮助科学家更好地理解生命并治疗疾病。 研究发表于最新一期《自然·通讯》杂志。研究成员之一、加拿大英属哥伦比亚大学血液研究中心的克里斯托弗·奥威尔
Nature－Methods－|－朝思暮想：单细胞蛋白质组测序之梦
近期，Nature Methods 杂志技术编辑Vivien Marx发表文章 A dream of single-cell proteomics，探讨了单细胞蛋白组学的发展，提出了该技术有可能会面对的问题和潜在解决方案。单细胞蛋白质组测序的梦想并不遥远（Credit: S. Larochell
质谱检测法与蛋白质分析
在生命科学研究工作中有一个重要问题，就是发现、鉴定蛋白质并弄清楚它们的一级结构。知道了蛋白质的氨基酸序列信息，我们就可以通过遗传密码将其与编码序列对应起来，从原则上来说，也就将细胞的生理学与遗传学联系起来了。发现、鉴定出了一个蛋白质就好像给我们打开了一扇窗，透过这个窗口，我们就能够对复杂的细胞调控网
质谱检测法与蛋白质分析
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。 在生命科学研究工作中有一个重要问
双RNA测序技术
在发表于《自然》（Nature）杂志上的一篇研究论文中， 由来自德国、奥地利和美国的研究人员组成的一个研究小组发现，采用一种允许在感染过程中同时研究细菌与宿主小RNA的新技术，可以揭示出两者转录谱的改变。该研究小组描绘了他们的技术、该技术如何更多地帮助了解细菌感染机制，以及在研究中获得的重要发现
1200万！南京农业大学采购单细胞蛋白质组学质谱
近日，南京农业大学发布2022年11月政府采购意向，计划以1200万元预算采购单细胞蛋白质组学质谱。详情如下：单细胞蛋白质组学质谱项目所在采购意向：南京农业大学2022年11月政府采购意向采购单位：南京农业大学采购项目名称：单细胞蛋白质组学质谱预算金额：1200.000000万元(人民币)采购品目：
暨大研发另类质谱鉴定算法，大幅提高蛋白质组鉴定能力
暨南大学的研究人员利用翻译组测序(RNC-seq)数据作为稳态细胞内蛋白质的“标准答案”，并另辟蹊径，提出了蛋白水平上的一种简单有效的多算法结果整合策略，不用做额外的实验，零成本轻松提高蛋白质组鉴定数量，同时有效降低假阳性率。 鸟枪法质谱(shotgun mass spectrometry)是
杨芃原：色谱质谱联用中的保留时间校正和蛋白质组定量
2014年4月20日上午，第十届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会大会报告在威海盛大召开。来自复旦大学的杨芃原教授作为本次大会的嘉宾，带来了题为《色谱-质谱联用中的保留时间校正和蛋白质组定量》的报告。 复旦大学 杨芃原教授 杨芃原教授首先说道现今蛋白质组的色谱分离和分析已经产
CASMS分论坛：Topdown蛋白质组学和原位质谱新进展
分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日，首届美国华人质谱学会（CASMS）学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在12日“New Advances in Top-down Proteomics and Native Mass Spectrometry”分论坛中，加
《Nature》：新方法提高单细胞蛋白质组学质谱定量准确度
单细胞蛋白质组学在蛋白丰度检测、转录修饰和翻译后修饰方面填补了单细胞转录组学的空白。单细胞蛋白质组学质谱（SCoPE-MS）是近年来兴起的一种定量分析多功能单细胞蛋白质组的方法，这种方法采用同位素标记和载体蛋白质组学来分析单个细胞【1】。同位素标记具有相同质量的化学标签，其中包含了独特的质量条码
南开大学张新星质谱团队新成果揭示隐藏雾霾成因
二氧化硫氧化产生硫酸是大气化学中的关键过程，这是因为硫酸是酸雨的主要成分之一，同时由于其具有高吸湿性，也是有效的云凝结核，能够形成云雾从而进一步影响空气质量、人类健康和气候。特别值得注意的是，中国华北地区雾霾成分的很大特点之一在于其含有质量分数极大的硫酸根。尽管已有大量旨在了解硫酸根形成原因的研究，
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
单细胞基因组测序测的是什么dna还是rna
深度测序的read指的是高通量中双端测序得到的一条条序列，如测序前将dna打成小的片段，测序是从这个片段的两端测的，即会产生两条reads。至于是mapping到基因组还是dna基因组，这要看你做什么了，一般基因组是指生物个体的全基因组。并不是所有测序都要rna反转，这其实要看你想做什么分析，如做转
用质谱数据对肽段从头测序实验
方案一 方案二 方案三 实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALD
sanger、endman、串联质谱测序三者优缺点
SANGER是直接对DNA分子进行测序,优点是测序结果直观、便于分析,适用于已知序列的验证测序、文库筛选、克隆鉴定、PCR重测序等.缺点是必须有已经序列设计测序引物,对于未知序列必须构建克隆后才能测序,难以实现基因组水平的大规模测序.ENDMAN、串联质谱是进行蛋白测序的,前者主要是用的色谱分析,能
临床质谱检测:或超过基因测序领头精准医疗
精准医疗指一个人基因组信息为基础，结合蛋白质组、代谢组等相关内环境信息，为病人量身设计出最佳治疗方案，以期达到治疗效果最大化和副作用最小化的专门定制医疗模式。精准医疗代表着未来医学诊断的发展方向，基因检测作为精准医疗不可或缺的一环，已经开始渗透进我们的生活并逐步扩大化，第三代测序技术的问世使基因测序
用质谱数据对肽段从头测序实验
实验方法原理 单级质谱测序是分析肽段的阶梯序列，即相邻肽段间相差一个氨基酸残基，用质谱分析肽阶梯，通常用 MALDI-TOF,MS 分析。 MS/MS 测序用的是上文所述用于数据库检索的 CID 谱，但碎片离子由人工完全解析。用于MS 序列分析的肽阶梯是由化学或酶法降解肽段产生，由 C 未端或N未端
质谱检测法与蛋白质分析（二）
离子回旋加速器与轨道离子阱质谱仪 随着功能强大的带有外部离子源的傅里叶变换-离子回旋加速器(FT-ICR)质谱仪的出现以及商业化，我们在质谱仪的分辨率与准确性方面取得了质的飞跃。有了这种新型的质谱仪，我们现在可以对ppm级乃至亚ppm级的样品进行分析了。该质谱仪的高分辨率特性不仅提高了数
质谱检测法与蛋白质分析（二）
传统的和最新的蛋白质组学研究策略虽然到目前为止，还没有一种蛋白质组学研究策略能够对某个蛋白质组进行常规的、完整的分析，但是现在的技术已经非常强大，我们相信，很快就能进行全蛋白质组学研究了。而且，对某个亚蛋白质组（比如某个细胞器或亚细胞结构的蛋白质组）进行研究早就已经不是什么难题了，这已经成为了一种常
质谱研究蛋白质相互作用（一）
质谱技术已经成为了蛋白质组学研究的主力。这种技术方法能精确的检测多肽，从而帮助研究人员识别并测序多肽分子，分析它们的特征，了解它们如何进行化学修饰的。 但大多数蛋白质并不是单独行动的，一些关键的生物学过程，如DNA 复制、转录、翻译、细胞分裂和能量生成都依赖于大型蛋白复合物的行为，这些蛋白复合
质谱检测法与蛋白质分析（三）
Protein(s)：待测蛋白质样品;Enz. Digestion：酶解;Pep. Mixture：裂解产物混合物; MS Analysis：质谱检测分析;DB Search：数据库比对搜索;Identities：鉴定; Prot.DB ：蛋白质数据库;Proteom
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋白质
质谱检测法与蛋白质分析（一）
质谱分析法是蛋白质研究领域和生物大分子研究领域中最重要的分析技术。由于我们对蛋白质鉴定、定量和分析的要求越来越高，希望检测技术的灵敏度也越来越高，同时能够对更为复杂的样品进行分析处理，因此推动了质谱检测技术的发展，出现了一大批新兴的质谱分析方法和仪器。本文将对近几年质谱技术的发展以及质谱技术在蛋