如何分析realtimePCR的数据结果

学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁.不同的处理方法得到不同的结果.做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法内参基因:对照组1、对照组2、对照组3实验组1、实验组2、实验组3目的基因:对照组1、对照组2、对照组3实验组1、实验组2、实验组3数据处理的时候,是先分别取内参、目的基因的三次平行实验的均值再拿相应均值相减得到还有对于内参基因的数据,如果所得Ct 值差值在1 以内,是否可以将所有的内参取平均,另外对于这个REAL-TIME PCR 的结果除了用EXCEL 处理之外有没有其他比较可信方便的内参基因: 18s for control, 18s for treatment sample目的基因: control sample, treatment sample复孔取平均值△ C......阅读全文

Realtime-PCR

实验概要The  exponential amplification via reverse transcription polymerase chain  reaction provides for a highly sensitive technique in which a very low

RealTime-or-Kinetic-PCR

The DNA Facility houses the “real-time” or kinetic PCR instrument, the Applied Biosystems Model 7700 sequence detection system (the TaqMan instrument)

Real-Time-PCR-Primer-Sets

Real Time PCR Primer SetsNOW OVER 300 PRIMER SETS!!!UPDATED: NOVEMBER 10th, 2003Quantitative RT-PCR is an important step for the validation of express

Real-Time-PCR—Cycleave-PCR法原理

■ CycleavePCR法原理 CycleavePCR法是由RNA和DNA构成的杂合Cycling 探针与RNase H组合使用的高灵敏度检测方法,能够高效率地检出目的基因。Cycling 探针内部夹有RNA部分,5′端标记荧光物质,3′端标记淬灭物质,当探针处于完整状态时,由于荧光淬灭作

RealTime-PCR实验流程

实验试剂Total RNA Kit :Omega:(Cat.No.R6834)First Strand cDNA Synthesis Kit:GeneCopoeia(Cat.No.C0210A)2xAllinOneTMQ-PCRMix:GeneCopoeia(cat.No.D0101A)Primer

实时定量PCR(Realtime-quantitative-PCR)

mRNA表达的研究 微小残留病变的检测 肿瘤耐药基因表达的研究 病毒感染的定量监测Vs普通PCR,RT-PCR的优势 采用封闭的检测模式,因此扩增产物导致污染的可能性比普通PCR要小得多 。 扩增产物的检测在PCR扩增过程中同时进行,并且数据的采集、分析全部由 仪器 自动完成,因此整个检测所 需的时

Real-time-PCR试剂质量的评价

临床使用PCR定量检测核酸,由于手工操作多、影响因素多,质量控制比较困难,在增强操作能力和仪器设备的基础上,选择好的PCR试剂是保证检测质量非常重要的关键。一、通过实时荧光PCR扩增曲线评价【扩增曲线图解读】实时荧光PCR由于每个循环要监测荧光信号值,因此都有拟合好的扩增曲线,通过扩增曲线可以很直观

Realtime-PCR-基础知识

理论基础 聚合酶链式反应作为一种革命性的方法在生物学研究的历史中占据了重要的地位。以此为基础发展出包括real-time PCR在内的多项应用技术。自诞生后real-time PCR技术持续发展,从简单的增扩到整个PCR过程,real-time PCR表现出比PCR更敏感、更明确的定量分析特

无需提取-直接检测——Real-Time-PCR

  针对客户对实验快速、高效率的需求,Takara不断努力探索。2019年6月,Takara推出无需从粪便、血液、细胞等样本中提取RNA,即可直接检测样本中目的基因的One Step Real Time PCR Premix试剂【PrimeDirect™ Probe RT-qPCR Mix】(Cod

Real-time-PCR-的标记方法介绍

 Real time PCR 的标记方法一般包括以下几类:荧光染料嵌合法(SYBR Green I)和荧光探针法(Taqman探针)和分子信标法。    SYBR Green I 法        Taqman探针法        分子信标法    

realtime-PCR体系的优化

实时定量PCR以其精确、快速、方便,越来越多的应用在科研、临床及检验检疫的各个领域。但是定量PCR是对精确性要求很高的实验,实验的条件对实验结果的影响非常大。在此谈谈体系优化的问题,希望对做相关试验研究的朋友有所帮助。1、基本参数的优化:1)MgCl2的浓度:在PCR反应中,MgCl2的浓度对酶的活

realtime-PCR-数据分析

无论所使用的real-time PCR是何种型号,正确的数据分析对于获得有效的实验结果都是至关重要的。这里介绍有关real-time PCR数据分析的知识。 在讨论基本分析过程之前,先介绍如何设计一个好的实验。如果你是自己设计的引物和探针,那有助于下一步的工作。但是在有些情况下,人们使用出版文献上的

RTPCR、QPCR、Realtime-PCR、realtime-RTPCR你真的区分的开吗?

多少同学能将 RT-PCR、Realtime-PCR、QPCR区分开?有多少同学还在犯晕?今儿这贴,师兄就带你区分区分,拨开那扇 PCR 迷雾。什么是 RT-PCR?RT-PCR就是逆转录 PCR(reverse transcription PCR)或者称反转录PCR(reverse transcr

REALTIME-PCR-WITH-SYBR-GREEN-I-PROTOCOL

1、反应体系 25ulCocktail 20 ul: Primer FP 1 ul + Primer RP 1u + 2 * SYBR GREEN I MIX 12.5 + H2O 5.5 ul cDNA 5 ul2、Primer 浓度,需要摸索,从200nM到700nm等,设置不同浓度。3、每个引

荧光染料Real-Time-PCR的引物设计

引物的设计相对于普通的PCR来说,还是有一些更为严格的要求:1、引物的退火温度要高,一般要在60度以上;2、引物的产物大小不要太大,一般在80-250bp之间都可;3、引物一般要设计在目的基因中跨内含子的位置,这样可以避免在存在DNA污染的情况下,对目的片断的额外的扩增;4、对于定量PCR来说,特别

realtime-PCR-常用仪器和探针

 1.SYBR Green I:一种DNA结合染料,能非特异性地与双链DNA结合,结合后发出荧光,价格便宜,但因无特异性,易受到非特异性扩增和引物二聚体地的影响,是定量结果不可靠。可用融解曲线分析区分特异性和非特异性扩增,引物的设计和反应条件的优化对消除非特异性荧光有很大帮助。2.Taqman探针:

Realtime-PCR实验注意事项

实验中的一些好习惯加入试剂之前,把它混匀一下,以免放置时间长了浓度不均移液枪用完之后要归到最大计量的位置,防止久而久之弹簧失去弹性一定要记着关水浴箱,切记切记多和大家讨论,同时多关注别人讨论的经验,这几乎是最快提高的捷径了所有的试剂都自己配,出了问题才好找原因防止RNA酶污染的措施1. 所有的玻璃器

如何分析real-time-PCR的数据结果

  学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁。。。不同的处理方法得到不同的结果。。。做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法内参基因:对照组1、对照组2

realtime-PCR-常用仪器和探针

SYBR Green I:一种DNA结合染料,能非特异性地与双链DNA结合,结合后发出荧光,价格便宜,但因无特异性,易受到非特异性扩增和引物二聚体地的影响,是定量结果不可靠。可用融解曲线分析区分特异性和非特异性扩增,引物的设计和反应条件的优化对消除非特异性荧光有很大帮助。 2.Taqman探针:

Realtime-PCR实验注意事项

Real-time PCR实验注意事项实验中的一些好习惯加入试剂之前,把它混匀一下,以免放置时间长了浓度不均移液枪用完之后要归到zui大计量的位置,防止久而久之弹簧失去弹性一定要记着关水浴箱,切记切记多和大家讨论,同时多关注别人讨论的经验,这几乎是zui快提高的捷径了所有的试剂都自己配,出了问题才好

如何分析real-time-PCR的数据结果

学习做Realtime PCR, 实验结果是出来了,得到的内参、目的基因的Ct 值在15-25 之间,熔融曲线基本上也是单峰,但不太会处理这个结果,对着数据发愁.不同的处理方法得到不同的结果.做的是相对定量,SYBR Green, 选用2^(-△ △ Ct)法内参基因:对照组1、对照组2、对照组3实

Realtime-PCR与RTPCR的区别

实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。1.内标在传统定量中的作用由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重

实时荧光定量PCR(RealTime-PCR)实验流程

一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录)不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在总rna的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2u

Real-time-PCR-跟RTPCR有什么区别

实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。1.内标在传统定量中的作用由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重

从RNA的提取到PCR——Realtime-PCR经验

一 引物的设计引物的设计对于这个实验至关重要,因为real time pcr的检测灵敏度比较高,所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道,还有几点必须注意:1,引物的错配率(引物错配形成引物二聚体,但是SYBR照样能嵌入进去,结果导致实验结果的误差很大,重复性也不好)。2,引物的特

realtime-PCR技术的原理及应用

一、实时荧光定量PCR原理(一)定义:在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法 。(二)实时原理1、常规PCR技术:对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量,无法对扩增反应实时检测。2、实时定量PC

Realtime-PCR-数据导出-——-ABI仪器篇

  1. Real-time PCR数据:Real-time PCR完成后,所有数据并非可以直接导出,由于每一次实验的情况都不相同,仪器的很多默认设定都会对最终数据结果造成重大偏差,所以在完成PCR过程后,需要人为对实验结果进行条件设置,才能提取到科学有效的实验结果,进而完成对实验结果的分析和判断。

实时荧光定量PCR(Quantitative-Realtime-PCR-,qPCR)技术介绍

荧光定量PCR也叫Real-Time PCR,是美国PE(Perkin Elmer)公司1995年研制出来的一种新的核酸定量技术。荧光定量PCR的发展史是一部ABI、罗氏和伯乐等巨头的荡气回肠的斗争史,感兴趣的可以去查查。该技术是目前最成熟,使用最广泛的半定量PCR技术。    荧光染料法(SYBR

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR负对照有信号问题分析

引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。 引物浓度不佳:适当降低引物的浓度,并注意上下游引物的浓度配比。 镁离子浓度过高:适当降低镁离子浓度,或选择更合适的 mix 试剂盒。 模板有基因组的污染:RNA 提取过程中避免基因组 DNA 的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。